ТБЛ1Х

ТБЛ1Х
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2XTC, 2XTD, 2XTE
Идентификаторы
Псевдонимы	TBL1X , EBI, SMAP55, TBL1, трансдуцин (бета)-подобный 1X-связанный, бета-трансдуцин-подобный 1X-связанный, бета-трансдуцин-подобный 1 X-связанный, CHNG8
Внешние идентификаторы	Опустить : 300196 ; МГИ : 1336172 ; Гомологен : 4128 ; Генные карты : TBL1X ; ОМА : TBL1X — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	9,741,037 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	76,706,589 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tail of epididymis; ; seminal vesicula; ; corpus epididymis; ; renal medulla; ; caput epididymis; ; buccal mucosa cell; ; optic nerve; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve; ; inferior olivary nucleus; ; secondary oocyte;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; ascending aorta; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; atrium; ; aortic valve; ; efferent ductule; ; left lung lobe; ; calvaria;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	beta-catenin binding; transcription corepressor activity; protein domain specific binding; histone binding; transcription factor binding; protein C-terminus binding; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	histone deacetylase complex; transcription repressor complex; nucleoplasm; spindle microtubule; nucleus; mitotic spindle;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; hearing; transcription, DNA-templated; proteolysis; positive regulation of transcription, DNA-templated; histone deacetylation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; regulation of lipid metabolic process; positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; protein stabilization; regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6907
	21372
	ENSG00000101849
	ENSMUSG00000025246
	О60907
	Q9QXE7
	НМ_001139466 ; НМ_001139467 ; НМ_001139468 ; НМ_005647
	НМ_020601
	НП_001132938 ; НП_001132939 ; НП_001132940 ; НП_005638
	НП_065626
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Трансдуцин (бета)-подобный 1X-связанный , также известный как TBL1X , представляет собой белок , который у человека кодируется TBL1X геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, имеет сходство последовательности с членами семейства белков, содержащих повторы WD40 . Группа WD40 представляет собой большое семейство белков, которые, по-видимому, выполняют регуляторную функцию. Считается, что повторы WD40 опосредуют белок-белковые взаимодействия, а члены этого семейства участвуют в передаче сигналов , процессинге РНК, регуляции генов , везикулярном транспорте, сборке цитоскелета и могут играть роль в контроле цитотипической дифференцировки. Этот кодируемый белок обнаруживается в виде субъединицы в комплексе корепрессора SMRT (медиатора молчания ретиноидных и тиреоидных рецепторов) вместе с белком гистондеацетилазы 3. Этот ген расположен рядом с геном глазного альбинизма и, как полагают, участвует в патогенезе глазного альбинизма с поздним началом с фенотипом нейросенсорной глухоты . Этот ген очень похож на ген TBL1Y Y-хромосомы. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что TBL1X взаимодействует с:

GPS2 , ^{[ 6 ]} и
HDAC3 , ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}
НКОА1 , ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и
НКОА2 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101849 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025246 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: TBL1X-трансдуцин (бета)-подобный 1X-связанный» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Чжан Дж., Калкум М., Чайт Б.Т., Редер Р.Г. (март 2002 г.). «Корепрессорный комплекс ядерного рецептора N-CoR-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2» . Мол. Клетка . 9 (3): 611–23. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00468-9 . ПМИД 11931768 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Гюнтер М.Г., Лейн В.С., Фишле В., Вердин Э., Лазар М.А., Шихаттар Р. (май 2000 г.). «Основной корепрессорный комплекс SMRT, содержащий HDAC3 и TBL1, белок с повторами WD40, связанный с глухотой» . Генс Дев . 14 (9): 1048–57. дои : 10.1101/gad.14.9.1048 . ПМК 316569 . ПМИД 10809664 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуан ZQ, Ли Дж., Фонделл Дж.Д., Цинь Дж., Вонг Дж. (март 2003 г.). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роль HDAC3, TBL1 и TBLR1» . ЭМБО Дж . 22 (6): 1336–46. дои : 10.1093/emboj/cdg120 . ПМК 151047 . ПМИД 12628926 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж., Вонг Дж. (август 2000 г.). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3» . ЭМБО Дж . 19 (16): 4342–50. дои : 10.1093/emboj/19.16.4342 . ПМК 302030 . ПМИД 10944117 .
^ Гюнтер М.Г., Ю Дж., Као Г.Д., Йен Т.Дж., Лазар М.А. (декабрь 2002 г.). «Для сборки комплекса репрессии SMRT-гистондеацетилазы 3 требуется кольцевой комплекс TCP-1» . Генс Дев . 16 (24): 3130–5. дои : 10.1101/gad.1037502 . ПМК 187500 . ПМИД 12502735 .

Дальнейшее чтение

Басси М.Т., Рамесар Р.С., Качиотти Б., Уиншип ИМ, Де Гранди А., Рибони М., Таунс П.Л., Бейтон П., Баллабио А., Борсани Дж. (1999). «Х-сцепленная нейросенсорная глухота с поздним началом, вызванная делецией, включающей OA1, и новым геном, содержащим повторы WD-40» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 64 (6): 1604–16. дои : 10.1086/302408 . ПМЦ 1377903 . ПМИД 10330347 .
Гюнтер М.Г., Лейн В.С., Фишле В., Вердин Э., Лазар М.А., Шихаттар Р. (2000). «Основной корепрессорный комплекс SMRT, содержащий HDAC3 и TBL1, белок с повторами WD40, связанный с глухотой» . Генс Дев . 14 (9): 1048–57. дои : 10.1101/gad.14.9.1048 . ПМК 316569 . ПМИД 10809664 .
Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж., Вонг Дж. (2000). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3» . ЭМБО Дж . 19 (16): 4342–50. дои : 10.1093/emboj/19.16.4342 . ПМК 302030 . ПМИД 10944117 .
Мацудзава С.И., Рид Дж.К. (2001). «Siah-1, SIP и Ebi сотрудничают в новом пути деградации бета-катенина, связанном с ответами p53» . Мол. Клетка . 7 (5): 915–26. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00242-8 . ПМИД 11389839 .
Чжан Дж., Калкум М., Чайт Б.Т., Редер Р.Г. (2002). «Корепрессорный комплекс ядерного рецептора N-CoR-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2» . Мол. Клетка . 9 (3): 611–23. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00468-9 . ПМИД 11931768 .
Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуан ZQ, Ли Дж., Фонделл Дж.Д., Цинь Дж., Вонг Дж. (2003). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роль HDAC3, TBL1 и TBLR1» . ЭМБО Дж . 22 (6): 1336–46. дои : 10.1093/emboj/cdg120 . ПМК 151047 . ПМИД 12628926 .
Юн Х.Г., Чан Д.В., Рейнольдс А.Б., Цинь Дж., Вонг Дж. (2003). «N-CoR опосредует зависимую от метилирования ДНК репрессию через метил-CpG-связывающий белок Kaiso» . Мол. Клетка . 12 (3): 723–34. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . ПМИД 14527417 .
Перисси В., Аггарвал А., Гласс С.К., Роуз Д.В., Розенфельд М.Г. (2004). «Обменный комплекс корепрессор/коактиватор, необходимый для активации транскрипции ядерными рецепторами и другими регулируемыми факторами транскрипции» . Клетка . 116 (4): 511–26. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00133-3 . ПМИД 14980219 . S2CID 18807923 .
Юн Х.Г., Чой Ю., Коул П.А., Вонг Дж. (2005). «Чтение и функция гистонового кода, участвующего в нацеливании корепрессорных комплексов на репрессию» . Мол. Клетка. Биол . 25 (1): 324–35. дои : 10.1128/MCB.25.1.324-335.2005 . ПМЦ 538779 . ПМИД 15601853 .
Герлиц Г., Дархин Э., Джорджио Г., Франко Б., Райнер О. (2005). «Новые функциональные особенности домена Lis-H: роль в димеризации белка, периоде полураспада и клеточной локализации» . Клеточный цикл . 4 (11): 1632–40. дои : 10.4161/cc.4.11.2151 . ПМИД 16258276 .

Эта статья о гене человека Х-хромосомы и/или связанном с белке незавершена . ним Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000101849 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025246 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: TBL1X-трансдуцин (бета)-подобный 1X-связанный» .

[pmid11931768-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Чжан Дж., Калкум М., Чайт Б.Т., Редер Р.Г. (март 2002 г.). «Корепрессорный комплекс ядерного рецептора N-CoR-HDAC3 ингибирует путь JNK через интегральную субъединицу GPS2» . Мол. Клетка . 9 (3): 611–23. дои : 10.1016/s1097-2765(02)00468-9 . ПМИД 11931768 .

[pmid10809664-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с Гюнтер М.Г., Лейн В.С., Фишле В., Вердин Э., Лазар М.А., Шихаттар Р. (май 2000 г.). «Основной корепрессорный комплекс SMRT, содержащий HDAC3 и TBL1, белок с повторами WD40, связанный с глухотой» . Генс Дев . 14 (9): 1048–57. дои : 10.1101/gad.14.9.1048 . ПМК 316569 . ПМИД 10809664 .

[pmid12628926-8] Перейти обратно: ^а ^б Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуан ZQ, Ли Дж., Фонделл Дж.Д., Цинь Дж., Вонг Дж. (март 2003 г.). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роль HDAC3, TBL1 и TBLR1» . ЭМБО Дж . 22 (6): 1336–46. дои : 10.1093/emboj/cdg120 . ПМК 151047 . ПМИД 12628926 .

[pmid10944117-9] Перейти обратно: ^а ^б Ли Дж., Ван Дж., Ван Дж., Наваз З., Лю Дж. М., Цинь Дж., Вонг Дж. (август 2000 г.). «Оба корепрессорных белка SMRT и N-CoR существуют в больших белковых комплексах, содержащих HDAC3» . ЭМБО Дж . 19 (16): 4342–50. дои : 10.1093/emboj/19.16.4342 . ПМК 302030 . ПМИД 10944117 .

[pmid12502735-10] Гюнтер М.Г., Ю Дж., Као Г.Д., Йен Т.Дж., Лазар М.А. (декабрь 2002 г.). «Для сборки комплекса репрессии SMRT-гистондеацетилазы 3 требуется кольцевой комплекс TCP-1» . Генс Дев . 16 (24): 3130–5. дои : 10.1101/gad.1037502 . ПМК 187500 . ПМИД 12502735 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]