Allorhizobium Vitis

Allorhizobium Vitis
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Pseudomonadota
Сорт:	Alphaproteobacteria
Заказ:	Hyphomicrobiales
Семья:	Rhizobiaceae
Род:	Allorhizobium
Разновидность:	A. Vine
Биномиальное название
	Allorhizobium Vitis ; (Ophel and Kerr 1990) Mousavi and Al 2016
Синонимы
	Agrobacterium vitis Ophel и Kerr 1990 ; Rhizobium Vitis (Ophel and Kerr 1990) Young et al . 2001 ;

Allorhizobium Vitis - это растительный патоген, который заражает виноградные лозы . Вид наиболее известен тем, что вызывает опухоль , известную как заболевание коронки желчих заболеваний. ^{[ 5 ]} Один из вирулентных штаммов, A. vitis S4, отвечает как за коронку на виноградных лозах, так и за вызывание гиперчувствительного ответа у других видов растений. ^{[ 6 ]} Виноградные лозы, на которые затронула болезнь коронки желчих заболеваний, производит меньше винограда, чем незатронутые растения. ^{[ 7 ]} Хотя не все штаммы A. vitis являются онкогенными, большинство штаммов могут повредить хозяева растения. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}

A. Vitis разделяет многие генетические и морфологические характеристики с несколькими видами Agrobacterium , включая A. tumefaciens . ^{[ 9 ]} Два вида имеют перекрывающиеся диапазоны хозяина, и A. vitis и A. tumefaciens могут снизить выход инфицированных культур. ^{[ 9 ]} По этой причине исследования A. Vitis фокусируются на передаче и методах контроля.

Биология

Идентификация

A. Vitis -это грамотрицательная бактерия с тонким пептидогликаном в ее клеточной стенке . ^{[ 10 ]} Вид аэробный и мезофильный , с отдельными клетками, которые имеют стержень и подвижный. ^{[ 10 ]} На культуре колонии круглые, белые и полупрозрачные. ^{[ 9 ]}

Диапазон и окружающая среда

Присутствие A. vitis было подтверждено в Германии, Франции, Австрии, Венгрии, Южной Африке и Соединенных Штатах. ^{[ 6 ]} Вспышки болезней-короны в Европе и Северной Америке в середине 1980-х годов были связаны с A. Vitis , и этот вид продолжал выжить в этих регионах. ^{[ 6 ]} Кроме того, опрос, проведенный в Китае с 2003 по 2009 год, выявил штаммы A. vitis на разрушенных банановых растениях. ^{[ 11 ]}

Генетические черты

Хромосома и плазмиды

Геном A. vitis состоит из двух круглых хромосом и пяти плазмид. ^{[ 8 ]} Он длиной 6,32 МБ и кодирует 5549 белков. ^{[ 10 ]} Четыре оперона рРНК были идентифицированы. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]} Окружные штаммы содержат плазмиду Ti (PTI) . ^{[ 9 ]} Плазмиды Ti в желчных, которые производят различные рецепты , которые затем секретируются из желчи. ^{[ 6 ]} В Vitis PTI кодирует осьминоги и/или огумопин. ^{[ 12 ]} Огненные штаммы также содержат плазмиду, которая позволяет бактерии использовать тартрат . ^{[ 9 ]}

Классификация

A. Vitis ранее назывался Agrobacterium Biovar III. ^{[ 8 ]} Первоначально виды включали только штаммы Biovar III, найденные в виноградных хозяевах. ^{[ 6 ]} С тех пор A. vitis был переопределен, чтобы включить все штаммы Biovar III. ^{[ 11 ]} Его можно отличить от Biovars I и II, A. tumefaciens и A. hrizogenes , на основе его хозяев и патогенности. ^{[ 8 ]} Анализ жирных кислот также выявляет различия между A. vitis и другими штаммами онкогенных бактерий. ^{[ 6 ]}

A. Vitis также был классифицирован в роду Rhizobium . ^{[ 4 ]} Исследование 1999 года показало, что A. vitis более тесно связан с Rhizobium Galegae, чем с другими видами Agrobacterium , на основе сравнения генетических последовательностей. ^{[ 6 ]} В 2001 году Young et al. предположил, что A. vitis был реклассифицирован как ризобий -вит . ^{[ 4 ]} Совсем недавно A. vitis был перенесен в род Allorhizobium . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Патогенность

Хозяева

Виноградные лозы являются растениями, наиболее часто зараженными A. vitis . ^{[ 6 ]} Хотя A. vitis может вызывать гиперчувствительный ответ у других видов растений, заболевание коронки желчих заболеваний, вызванное онкогенной A. vitis, является уникальной для виноградной лозы. ^{[ 8 ]} Все штаммы A. vitis корня винограда индуцируют некроз . ^{[ 9 ]} Поскольку A. Vitis может оставаться скрытым, не все инфицированные растения показывают симптомы. ^{[ 9 ]}

Внутренний таксон A. vitis был выделен из банановых листьев в Китае. ^{[ 11 ]} A. Vitis также может заразить растения томата , и было показано, что он вызывает коллапс листовой панели в табаке . ^{[ 12 ]}

Передача инфекции

Плазмида Ti отвечает за передачу заболеваний коронки желчих заболеваний у растений, инфицированных A. vitis . ^{[ 9 ]} Онкогенный A. Vitis передает свою плазмиду Ti в другие бактерии и переносит T-ДНК в растения. ^{[ 6 ]} Гены вирулентности, кодируемые плазмидой Ti, генерируют одноцепочечные молекулы T-ДНК, которые, в свою очередь, передаются здоровым хозяевам. ^{[ 5 ]} Деорганизованное клеточное деление возникает у инфицированных хозяев, что приводит к развитию газеты, а не к образованию здоровой сосудистой ткани. ^{[ 9 ]}

Распространение больного древесины часто передает A. vitis . ^{[ 7 ]} Травмы виноградной лозы, вызванной резкой или замораживанием, также могут сделать растение более восприимчивым к инфекции желтого корона. ^{[ 6 ]} Тем не менее, галлы растут только на стволах или трости, и не появляются на корнях зараженных растений. ^{[ 9 ]}

В сельском хозяйстве

Коронный желчный болезнь

Когда A. Vitis вызывает заболевание короны желчих заболеваний, для выявления его присутствия можно использовать несколько симптомов и тестов. На виноградных лозах молодые желчные цветы кажутся мягкими зелеными ударами, которые позже становятся коричневыми и грубыми. ^{[ 7 ]} Желлы не появляются на всех виноградных лозах, в которых A. vitis . присутствует ^{[ 7 ]}

Можно предпринять шаги для контроля заболевания короны и снижения риска инфекции. Пострадавшие участки на виноградных лозах, такие как те, которые вызваны замораживанием или сокращением травм, особенно подвержены инфекции. ^{[ 6 ]} Поэтому следует избегать посадки в склонных к морозам или областям с плохим дренажом. ^{[ 7 ]} Сокращение других стрессоров виноградной лозы, таких как лишение питательных веществ и низкий pH почвы, также ограничивает восприимчивость. ^{[ 7 ]} Кроме того, некоторые сорта устойчивы к болезням коронки желчи. Vitis Vinifera , как правило, восприимчив к заболеванию короны желчих заболеваний, но устойчивые виды винограда могут быть посажены преимущественно. ^{[ 7 ]}

Другие заболевания

Некроз винограда является распространенным симптомом инфекции A. vitis , вызванной как онкогенной, так и некамозгенной бактерий штаммов. ^{[ 9 ]} Обрушение панели листьев табака может быть вызвано нехотеновым штаммом F2/5 A. vitis . ^{[ 13 ]} В то время как штамм A. vitis, обнаруженная в виноградной ловле, A. vitis pv. Vitis , отвечает за большинство заболеваний, банановые листья были связаны с A. vitis pv. Муса . ^{[ 11 ]}

Непатогенные штаммы

Штаммы бактерий могут использоваться в качестве биологических контрольных агентов для ограничения роста патогенного A. vitis . Корни виноградной лозы, которые были пропитаны в суспензии, содержащей ингибирующую штамм, менее восприимчивы, чем те, которые нет. ^{[ 9 ]}^{[ 12 ]} Несколько видов, продуцирующих деаминазу ACC , обнаруженные в ризосфере , ингибируют A. Производство опухоли Vitis у растений томата. ^{[ 12 ]} Было показано , что непухолевые штаммы A. vitis (F2/5, ARK-1 и VAR03-1) ограничивают образование коронки желчих галлов. ^{[ 9 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} В исследованиях с участием этих штаммов F2/5 все еще индуцировал некроз, а ARK-1-нет. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Mousavi SA, österman J, Wahlberg N, Nesme X, Lavire C, Vial L, Paulin L, De Lajudie P, Lindström K (2014). «Филогения Rhizobium - Allorhizobium - Agrobacterium clade поддерживает разграничение Neorhizobium Gen. Nov». Syst Appl Microbiol . 37 (3): 208–15. doi : 10.1016/j.syapm.2013.12.007 . PMID 24581678 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Mousavi SA, Willems A, Nesme X, De Lajudie P, Lindström K (2015). «Пересмотренная филогения Rhizobiaceae: предложение об определении Pararhizobium Gen. Nov. И 13 новых видов комбинаций». Syst Appl Microbiol . 38 (2): 84–90. doi : 10.1016/j.syapm.2014.12.003 . PMID 25595870 .
^ Офель, К; Керр, А (1990). « Agrobacterium vitis sp. Nov. Для штаммов Agrobacterium biovar 3 от виноградной лозы» . Int J Syst Evol Microbiol . 40 (3): 236–241. doi : 10.1099/00207713-40-3-236 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Янг, JM; Kuykendall, Ld; Мартинес-Ромеро, E; Керр, а; Савада, Х (2001). «Пересмотр ризобиума (Frank 1889), с поэтапным описанием рода и включением всех видов Agrobacterium (Conn 1942) и Allorhizobium undicola (de lajudie et al . 1998) как новые комбинации: Rhizobium radiobacter , R. Rhizogenes , R. Rubi , R. undicola и R. Vitis » . Int J Syst Evol Microbiol . 51 (1): 89–103. doi : 10.1099/00207713-51-1-89 . PMID 11211278 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Гельвин, S (2010). «Растительные белки, участвующие в Agrobacterium генетической трансформации, опосредованной ». Annu Rev Phytopathol . 48 (1): 45–68. doi : 10.1146/annurev-phyto-080508-081852 . PMID 20337518 . S2CID 207698902 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м Burr, t; Otten, L (1999). «Коронный галл винограда: биология и лечение болезней». Annu Rev Phytopathol . 37 (1): 53–80. doi : 10.1146/annurev.phyto.37.1.53 . PMID 11701817 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин «Коронный галл ( agrobacterium vitis )» . Правительство Британской Колумбии . Британская Колумбия Министерство сельского хозяйства. Январь 2009 . Получено 16 ноября 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Слейтер, SC; Goldman, BS; Гуднер, б; Setubal, JC; Фарран, С.К.; Нестер, EW; Burr, TJ; Банта, L; Дикерман, AW; Паулсен, я; Otten, l; Суен, г; Уэлч, R; Алмейда, NF; Арнольд, F; Бертон, ОТ; Du, z; Юинг, а; Боже, е; Хейзель, с; Houmiel, KL; Jhaveri, J; Лу, J; Миллер, Нью -Йорк; Нортон, S; Чен, Q; Phoolcharoen, w; Ohlin, V; Ondrusek, D; Гордость, н; Стриклин, SL; Солнце, J; Wheeler, C; Уилсон, L; Чжу, ч; Вуд, DW (2009). «Последовательности генома трех Agrobacterium Biovars помогают выяснить эволюцию мультичромосомных геномов у бактерий» . Журнал бактериологии . 191 (8): 2501–2511. doi : 10.1128/jb.01779-08 . PMC 2668409 . PMID 19251847 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м Мартинсон, т; Burr, T (2012). "Насколько близко мы к короне без желчного питомника?" (PDF) . Колледж сельского хозяйства и наук о жизни Корнелльского университета . Аппетляция Корнелл . Получено 16 ноября 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Обзор организма: Agrobacterium Vitis » . Национальный центр информации о биотехнологии . Национальная библиотека медицины США. 28 сентября 2015 года . Получено 9 ноября 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Huang, S; Долго, м; Fu, g; Лин, S; Цинь, L; Ху, С; Cen, z; Лу, J; Ли, Q (2015). «Характеристика нового патовара агробактерий вита, вызывающая панирование банановых листьев в Китае». J Basic Microbiol . 55 (1): 129–134. doi : 10.1002/jobm.201300113 . PMID 23828501 . S2CID 19264540 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Toklikishvili, n; Dandurishvili, n; Vainstein, A; Тедиашвили, м; Giorgobiani, n; Lurie, S; Szegedi, E; Глик, Br; Чернин Л. (2010). «Ингибирующее влияние бактерий, продуцирующих деаминазой, на образование коронки, у растений томата, инфицированных agrobacterium tumefaciens или A. vitis » . Патология растений . 59 (6): 1023–1030. doi : 10.1111/j.1365-3059.2010.02326.x .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Herlache, TC; Чжан, HS; Ried, cl; Карл, SA; Басаран, P; Thaker, M; Берр, в; Burr, TJ (2001). «Мутации, которые влияют на некроз винограда, вызванный Agrobacterium Vitis, также изменяют его способность вызывать гиперчувствительный ответ на табак» . Фитопатология . 91 (10): 966–972. doi : 10.1094/phyto.2001.91.10.966 . PMID 18944123 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Kawaguchi, A (2013). «Биологический контроль над коронкой желтой на виноградной лозе и колонизации корней с помощью непатогенного штамма ризобия Vitis ark-1» . Микробы и среды . 28 (3): 306–311. doi : 10.1264/jsme2.me13014 . PMC 4070965 . PMID 23708779 .
^ Кавагучи, а; Иноуэ, k; Ichinose, Y (2008). «Биологический контроль короны галльи виноградной лозы, розы и томата с помощью непатогенного штамма Agrobacterium Vitis var03-1» . Фитопатология . 98 (11): 1218–1225. doi : 10.1094/phyto-98-11-1218 . PMID 18943411 .

Внешние ссылки

Штамм типа аллорхизобий вита при бактериальном див .

Дальнейшее чтение

Кавагучи, Акира (31 июля 2014 г.). «Снижение популяций патогенов в участках раны виноградной лозы связано с механизмом, лежащим в основе биологического контроля коронки желчной, с помощью штамма Rhizobium vitis ark-1» . Микробы и среды . 29 (3): 296–302. doi : 10.1264/jsme2.me14059 . PMC 4159041 . PMID 25077443 .

Медина-Боливар, Фабрио (4 декабря 2013 г.). «Антиоксидантная активность выбранных стильбеноидов и их биопродукция в волосатых корневых культурах винограда мускадина (Vitis rotundifolia Michx.)». Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 61 (48): 11744–11758. doi : 10.1021/jf400760k . PMID 23668830 .

[Mousavi1-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Mousavi SA, österman J, Wahlberg N, Nesme X, Lavire C, Vial L, Paulin L, De Lajudie P, Lindström K (2014). «Филогения Rhizobium - Allorhizobium - Agrobacterium clade поддерживает разграничение Neorhizobium Gen. Nov». Syst Appl Microbiol . 37 (3): 208–15. doi : 10.1016/j.syapm.2013.12.007 . PMID 24581678 .

[Mousavi2-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Mousavi SA, Willems A, Nesme X, De Lajudie P, Lindström K (2015). «Пересмотренная филогения Rhizobiaceae: предложение об определении Pararhizobium Gen. Nov. И 13 новых видов комбинаций». Syst Appl Microbiol . 38 (2): 84–90. doi : 10.1016/j.syapm.2014.12.003 . PMID 25595870 .

[cite1-3] Офель, К; Керр, А (1990). « Agrobacterium vitis sp. Nov. Для штаммов Agrobacterium biovar 3 от виноградной лозы» . Int J Syst Evol Microbiol . 40 (3): 236–241. doi : 10.1099/00207713-40-3-236 .

[cite2-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Янг, JM; Kuykendall, Ld; Мартинес-Ромеро, E; Керр, а; Савада, Х (2001). «Пересмотр ризобиума (Frank 1889), с поэтапным описанием рода и включением всех видов Agrobacterium (Conn 1942) и Allorhizobium undicola (de lajudie et al . 1998) как новые комбинации: Rhizobium radiobacter , R. Rhizogenes , R. Rubi , R. undicola и R. Vitis » . Int J Syst Evol Microbiol . 51 (1): 89–103. doi : 10.1099/00207713-51-1-89 . PMID 11211278 .

[cite6-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Гельвин, S (2010). «Растительные белки, участвующие в Agrobacterium генетической трансформации, опосредованной ». Annu Rev Phytopathol . 48 (1): 45–68. doi : 10.1146/annurev-phyto-080508-081852 . PMID 20337518 . S2CID 207698902 .

[cite5-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м Burr, t; Otten, L (1999). «Коронный галл винограда: биология и лечение болезней». Annu Rev Phytopathol . 37 (1): 53–80. doi : 10.1146/annurev.phyto.37.1.53 . PMID 11701817 .

[cite8-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин «Коронный галл ( agrobacterium vitis )» . Правительство Британской Колумбии . Британская Колумбия Министерство сельского хозяйства. Январь 2009 . Получено 16 ноября 2015 года .

[cite4-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон Слейтер, SC; Goldman, BS; Гуднер, б; Setubal, JC; Фарран, С.К.; Нестер, EW; Burr, TJ; Банта, L; Дикерман, AW; Паулсен, я; Otten, l; Суен, г; Уэлч, R; Алмейда, NF; Арнольд, F; Бертон, ОТ; Du, z; Юинг, а; Боже, е; Хейзель, с; Houmiel, KL; Jhaveri, J; Лу, J; Миллер, Нью -Йорк; Нортон, S; Чен, Q; Phoolcharoen, w; Ohlin, V; Ondrusek, D; Гордость, н; Стриклин, SL; Солнце, J; Wheeler, C; Уилсон, L; Чжу, ч; Вуд, DW (2009). «Последовательности генома трех Agrobacterium Biovars помогают выяснить эволюцию мультичромосомных геномов у бактерий» . Журнал бактериологии . 191 (8): 2501–2511. doi : 10.1128/jb.01779-08 . PMC 2668409 . PMID 19251847 .

[cite7-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м Мартинсон, т; Burr, T (2012). "Насколько близко мы к короне без желчного питомника?" (PDF) . Колледж сельского хозяйства и наук о жизни Корнелльского университета . Аппетляция Корнелл . Получено 16 ноября 2015 года .

[cite3-10] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Обзор организма: Agrobacterium Vitis » . Национальный центр информации о биотехнологии . Национальная библиотека медицины США. 28 сентября 2015 года . Получено 9 ноября 2015 года .

[cite11-11] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Huang, S; Долго, м; Fu, g; Лин, S; Цинь, L; Ху, С; Cen, z; Лу, J; Ли, Q (2015). «Характеристика нового патовара агробактерий вита, вызывающая панирование банановых листьев в Китае». J Basic Microbiol . 55 (1): 129–134. doi : 10.1002/jobm.201300113 . PMID 23828501 . S2CID 19264540 .

[cite9-12] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Toklikishvili, n; Dandurishvili, n; Vainstein, A; Тедиашвили, м; Giorgobiani, n; Lurie, S; Szegedi, E; Глик, Br; Чернин Л. (2010). «Ингибирующее влияние бактерий, продуцирующих деаминазой, на образование коронки, у растений томата, инфицированных agrobacterium tumefaciens или A. vitis » . Патология растений . 59 (6): 1023–1030. doi : 10.1111/j.1365-3059.2010.02326.x .

[cite10-13] Jump up to: ^а ^{беременный} Herlache, TC; Чжан, HS; Ried, cl; Карл, SA; Басаран, P; Thaker, M; Берр, в; Burr, TJ (2001). «Мутации, которые влияют на некроз винограда, вызванный Agrobacterium Vitis, также изменяют его способность вызывать гиперчувствительный ответ на табак» . Фитопатология . 91 (10): 966–972. doi : 10.1094/phyto.2001.91.10.966 . PMID 18944123 .

[cite12-14] Jump up to: ^а ^{беременный} Kawaguchi, A (2013). «Биологический контроль над коронкой желтой на виноградной лозе и колонизации корней с помощью непатогенного штамма ризобия Vitis ark-1» . Микробы и среды . 28 (3): 306–311. doi : 10.1264/jsme2.me13014 . PMC 4070965 . PMID 23708779 .

[cite13-15] Кавагучи, а; Иноуэ, k; Ichinose, Y (2008). «Биологический контроль короны галльи виноградной лозы, розы и томата с помощью непатогенного штамма Agrobacterium Vitis var03-1» . Фитопатология . 98 (11): 1218–1225. doi : 10.1094/phyto-98-11-1218 . PMID 18943411 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]