Геранилгеранилтрансфераза типа 1
белок геранилгеранилтрансфераза типа I | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Номер ЕС. | 2.5.1.59 | ||
Номер CAS. | 135371-29-8 | ||
Базы данных | |||
ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
КЕГГ | КЕГГ запись | ||
МетаЦик | метаболический путь | ||
ПРЯМОЙ | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
|
α-субъединица GGTase 1 ( фарнезилтрансфераза, CAAX-бокс ) | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | ФНТА | ||
ген NCBI | 2339 | ||
HGNC | 3782 | ||
МОЙ БОГ | 134635 | ||
ПДБ | 1С64 | ||
RefSeq | НМ_002027 | ||
ЮниПрот | P49354 | ||
Другие данные | |||
Номер ЕС | 2.5.1.59 | ||
Локус | Хр. 8 п11.21 | ||
|
β-субъединица ГГТазы 1 (белок геранилгеранилтрансфераза типа I, β-субъединица) | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | ПГГТ1Б | ||
ген NCBI | 5229 | ||
HGNC | 8895 | ||
МОЙ БОГ | 602031 | ||
ПДБ | 1С64 | ||
RefSeq | НМ_005023 | ||
ЮниПрот | P53609 | ||
Другие данные | |||
Номер ЕС | 2.5.1.59 | ||
Локус | 5 q23.1 | ||
|
Геранилгеранилтрансфераза типа 1 или просто геранилгеранилтрансфераза — один из трех ферментов группы пренилтрансфераз . Говоря конкретнее, геранилгеранилтрансфераза (GGTase 1) добавляет изопреноид с 20 атомами углерода, называемый геранилгеранильной группой, к белкам, несущим мотив CaaX: последовательность из четырех аминокислот на карбоксильном конце белка. Ингибиторы геранилгеранилтрансферазы исследуются в качестве противораковых средств. [ 1 ]
Функция
[ редактировать ]Пренилтрансферазы, включая геранилгеранилтрансферазу, посттрансляционно модифицируют белки путем добавления изопреноидного липида, называемого пренильной группой, к карбоксильному концу целевого белка. Этот процесс, называемый пренилированием , приводит к тому, что пренилированные белки становятся связанными с мембраной из-за гидрофобной природы пренильной группы. Большинство пренилированных белков участвуют в клеточной передаче сигналов, при этом мембранная ассоциация имеет решающее значение для функционирования. [ 1 ]
Структура
[ редактировать ]Геранилгеранилтрансфераза содержит две субъединицы , α и β, которые кодируются генами FNTA и PGGT1B соответственно. Обе субъединицы состоят в основном из альфа-спиралей . Геранилгеранилтрансфераза координирует катион цинка на его β-субъединице на краю активного центра. Геранилгеранилтрансфераза имеет гидрофобный карман для связывания геранилгеранилдифосфата , молекулы-донора липидов. Все субстраты геранилгеранилтрансферазы неизменно содержат цистеин в качестве предпоследнего остатка. Этот цистеин, координируемый цинком, участвует в атаке типа SN2 на геранилгеранилдифосфат, вытесняя дифосфат. [ 2 ] [ 3 ]
См. также
[ редактировать ]- Фарнезилтрансфераза
- Пренилирование
- Rab-геранилгеранилтрансфераза - геранилгеранилтрансфераза типа 2
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Лейн КТ, Биз Л.С. (апрель 2006 г.). «Серия тематических обзоров: посттрансляционные модификации липидов. Структурная биология белков фарнезилтрансферазы и геранилгеранилтрансферазы типа I» . Дж. Липид Рес . 47 (4): 681–99. doi : 10.1194/jlr.R600002-JLR200 . ПМИД 16477080 .
- ^ Рид Т.С., Терри К.Л., Кейси П.Дж., Биз Л.С. (октябрь 2004 г.). «Кристаллографический анализ пренилтрансфераз CaaX в комплексе с субстратами определяет правила селективности белковых субстратов». Дж. Мол. Биол . 343 (2): 417–33. дои : 10.1016/j.jmb.2004.08.056 . ПМИД 15451670 .
- ^ Лонг С.Б., Кейси П.Дж., Биз Л.С. (октябрь 2002 г.). «Путь реакции протеина фарнезилтрансферазы при атомном разрешении». Природа . 419 (6907): 645–50. Бибкод : 2002Natur.419..645L . дои : 10.1038/nature00986 . ПМИД 12374986 . S2CID 4412580 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Истман Р.Т., Бакнер Ф.С., Ёкояма К., Гелб М.Х., Ван Вурхис У.К. (февраль 2006 г.). «Серия тематических обзоров: посттрансляционные модификации липидов. Борьба с паразитарными заболеваниями путем блокирования фарнезилирования белков» . Дж. Липид Рес . 47 (2): 233–40. doi : 10.1194/jlr.R500016-JLR200 . ПМИД 16339110 .
- Эль Уалид Ф., Коэн Л.Х., ван дер Марель Г.А., Оверхэнд М. (2006). «Ингибиторы белка: геранилгеранилтрансферазы». Курс. Мед. Хим . 13 (20): 2385–427. дои : 10.2174/092986706777935078 . ПМИД 16918362 .