Апип

Апип
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4M6R
Идентификаторы
Псевдонимы	APIP , APIP2, CGI29, MMRP19, HCGI-29, APAF1 взаимодействующий белок
Внешние идентификаторы	Омим : 612491 ; MGI : 1926788 ; Гомологен : 6277 ; GeneCards : Apip ; OMA : APIP - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	34,916,379 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	102,922,989 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	C1 segment; ; muscle of thigh; ; right adrenal gland; ; corpus callosum; ; right adrenal cortex; ; monocyte; ; skeletal muscle tissue; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	right ventricle; ; interventricular septum; ; zygote; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; muscle of thigh; ; secondary oocyte; ; right kidney; ; digastric muscle; ; temporal muscle; ; brown adipose tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; metal ion binding; lyase activity; identical protein binding; methylthioribulose 1-phosphate dehydratase activity; zinc ion binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol;
Biological process	methionine biosynthetic process; negative regulation of apoptotic process; cellular amino acid biosynthetic process; regulation of ERK1 and ERK2 cascade; apoptotic process; pyroptosis; protein homotetramerization; L-methionine salvage from methylthioadenosine; L-methionine salvage from S-adenosylmethionine;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51074
	56369
	ENSG00000149089
	Ensmusg00000010911
	Q96GX9
	Q9WVQ5
	NM_015957
	NM_019735 ; NM_001355473 ; NM_001355474
	NP_057041
	NP_062709 ; NP_001342402 ; NP_001342403
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Белок APAF1-взаимодействующий -это белок , который у людей кодируется APIP геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Это фермент с метилтиорибулозой 1- фосфатдегидратазой ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} который участвует в пути спасения метионина .

Дефицит APIP связан с гибелью клеток ^{[ 10 ]} и рак.

Взаимодействия

Было показано, что APIP взаимодействует с APAF1 . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000149089 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000010911 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Lai CH, Chou Cy, Chang Ly, Liu CS, Lin W (август 2000). «Идентификация новых генов человека эволюционно консервативно сохранена у Caenorhabditis elegans по сравнительной протеомике» . Геном Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Чо Д.Х., Хонг Ю.М., Ли Х.Дж., Ву Х.Н., Пё Дж.О., Мак -Т.В., Юнг Юк (сентябрь 2004 г.). «Индуцированное ингибирование ишемического/гипоксического повреждения APIP, новым белком APAF-1-взаимодействующего» . J Biol Chem . 279 (38): 39942–50. doi : 10.1074/jbc.m405747200 . PMID 15262985 .
^ «Ген Entrez: APIP APAF1 взаимодействующий белок» .
^ Мэри С., Доук П., Саллерон Л., Тинц П., Буман Д., Байрох А., Лейн Л. (2012). Di Cunto F (ред.). «Функциональная идентификация APIP как человеческого MTNB, ключевого фермента в пути спасения метионина» . Plos один . 7 (12): E52877. BIBCODE : 2012PLOSO ... 752877M . doi : 10.1371/journal.pone.0052877 . PMC 3532061 . PMID 23285211 .
^ Кан В., Хонг Ш., Ли Х.М., Ким Н.Ю., Лим Ю.К., Ле Ле Т.М., Лим Б., Ким Х.К., Ким Т.Ю., Ашида Х., Йокота А., Хах С.С., Чун К.К., Юнг Й.К., Ян Дж.К. (2014). «Структурная и биохимическая основа для ингибирования гибели клеток APIP, метионинового спасательного фермента» . Труды Национальной академии наук . 111 (1): E54-61. Bibcode : 2014pnas..111e..54k . doi : 10.1073/pnas.1308768111 . PMC 3890807 . PMID 24367089 .
^ KO DC, Gamazon ER, Shukla KP, Pfuetzner RA, Whittington D, Holden TD, Brittnacher MJ, Fong C, Radey M, Ogohara C, Stark AL, Akey JM, Dolan ME, Wurfel MM, Miller Si (2012). «Функциональный генетический экран человеческого разнообразия показывает, что фермент спасения метионина регулирует гибель воспалительных клеток» . Труды Национальной академии наук . 109 (35): E2343 - E2352. doi : 10.1073/pnas.1206701109 . PMC 3435171 . PMID 22837397 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома APIP и APIP страница сведений генов в браузере UCSC Genome .

Дальнейшее чтение

Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю., Ота Т., Ямашита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исиии С., Сайто К, Сайто Соно Й, Ири Р., Кушида Н., Йонима Т., Оцука Р., Канда K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Kikuchi H, Nakai K, I Sogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупная идентификация И характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов » Enome Res . 16 (1): 55–65. : 10.1101 /GR.4039406 . PMC 1356129. . PMID 1634560 DOI
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сиропа Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смолььяр А, Босак С., Проявление Р, поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand Po, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Gheldur J, Hopf C, Huhse B, Manano R, Michon AM, Schirle J, Scherg M, Stein MA, Bauer A, Casar G, Drews G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kustre B, Superti-Furga G (2004). «Физическая и функциональная карта человеческого пути передачи сигнала TNF-ALHA/NF-KAPPA B» НАТ Клеточная биол 6 (2): 97–1 Doi : 10.1038/ ncb1 PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 11 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000149089 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000010911 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10810093-5] Lai CH, Chou Cy, Chang Ly, Liu CS, Lin W (август 2000). «Идентификация новых генов человека эволюционно консервативно сохранена у Caenorhabditis elegans по сравнительной протеомике» . Геном Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .

[pmid15262985-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Чо Д.Х., Хонг Ю.М., Ли Х.Дж., Ву Х.Н., Пё Дж.О., Мак -Т.В., Юнг Юк (сентябрь 2004 г.). «Индуцированное ингибирование ишемического/гипоксического повреждения APIP, новым белком APAF-1-взаимодействующего» . J Biol Chem . 279 (38): 39942–50. doi : 10.1074/jbc.m405747200 . PMID 15262985 .

[entrez-7] «Ген Entrez: APIP APAF1 взаимодействующий белок» .

[8] Мэри С., Доук П., Саллерон Л., Тинц П., Буман Д., Байрох А., Лейн Л. (2012). Di Cunto F (ред.). «Функциональная идентификация APIP как человеческого MTNB, ключевого фермента в пути спасения метионина» . Plos один . 7 (12): E52877. BIBCODE : 2012PLOSO ... 752877M . doi : 10.1371/journal.pone.0052877 . PMC 3532061 . PMID 23285211 .

[structure-9] Кан В., Хонг Ш., Ли Х.М., Ким Н.Ю., Лим Ю.К., Ле Ле Т.М., Лим Б., Ким Х.К., Ким Т.Ю., Ашида Х., Йокота А., Хах С.С., Чун К.К., Юнг Й.К., Ян Дж.К. (2014). «Структурная и биохимическая основа для ингибирования гибели клеток APIP, метионинового спасательного фермента» . Труды Национальной академии наук . 111 (1): E54-61. Bibcode : 2014pnas..111e..54k . doi : 10.1073/pnas.1308768111 . PMC 3890807 . PMID 24367089 .

[10] KO DC, Gamazon ER, Shukla KP, Pfuetzner RA, Whittington D, Holden TD, Brittnacher MJ, Fong C, Radey M, Ogohara C, Stark AL, Akey JM, Dolan ME, Wurfel MM, Miller Si (2012). «Функциональный генетический экран человеческого разнообразия показывает, что фермент спасения метионина регулирует гибель воспалительных клеток» . Труды Национальной академии наук . 109 (35): E2343 - E2352. doi : 10.1073/pnas.1206701109 . PMC 3435171 . PMID 22837397 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]