CDKAL1

CDKAL1
Идентификаторы
Псевдонимы	CDKAL1 , белок 1, подобный 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5
Внешние идентификаторы	Опустить : 611259 ; МГИ : 1921765 ; Гомологен : 9830 ; Генные карты : CDKAL1 ; OMA : CDKAL1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	21,232,404 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	30,039,657 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; Achilles tendon; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; testicle; ; gonad; ; muscle of thigh; ; gastrocnemius muscle; ; epithelium of colon; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; ascending aorta; ; spermatid; ; aortic valve; ; muscle of thigh; ; triceps brachii muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; zygote; ; seminiferous tubule; ; temporal muscle;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; N6-threonylcarbomyladenosine methylthiotransferase activity; iron-sulfur cluster binding; metal ion binding; protein binding; catalytic activity; tRNA (N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))-methylthiotransferase; 4 iron, 4 sulfur cluster binding;
Cellular component	integral component of membrane; rough endoplasmic reticulum; endoplasmic reticulum membrane; membrane; endoplasmic reticulum;
Biological process	maintenance of translational fidelity; tRNA methylthiolation; tRNA processing; tRNA modification; biological process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	54901
	68916
	ENSG00000145996
	ENSMUSG00000006191
	Q5VV42
	Q91WE6
	НМ_017774
	НМ_144536 ; НМ_001308486
	НП_060244
	НП_001295415 ; НП_653119
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

CDKAL1 ( регуляторно-ассоциированный белок 1-подобный Cdk5 1 ) представляет собой ген семейства метилтиотрансфераз . Полная физиологическая функция и ее последствия до конца не определены. Известно, что CDKAL1 кодирует CDK5, белок 1, связанный с регуляторной субъединицей. ^{[ 5 ]} Этот белок 1, ассоциированный с регуляторной субъединицей CDK5 , широко распространен в различных типах тканей, включая нейрональные ткани и бета-клетки поджелудочной железы. ^{[ 6 ]} Предполагается, что CDKAL1 участвует в пути CDK5/p35, в котором p35 является активатором CDK5, который регулирует несколько функций нейронов. ^{[ 7 ]}

Структура и функции

Структурно CDKAL1 содержит два кластера железа (Fe) серы (S), поэтому его функция может быть снижена за счет ингибирования биосинтеза кластера Fe-S. ^{[ 8 ]} Ферментативно CDKAL1 катализирует метилтиолирование N 6-треонилкарбамоиладенозина 37 (t6A37) в цитозольной тРНК, что, как было установлено, стабилизирует взаимодействия антикодон-кодон во время трансляции. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Клиническое значение

Установлено, что у людей CDKAL1 участвует в развитии диабета II типа . Мутации CDKAL1 и TCF7L2 связаны с низкой выработкой инсулина. ^{[ 11 ]} Некоторые исследования показывают, что варианты CDKAL1 модифицируют тРНК, что приводит к увеличению риска развития диабета II типа, а также ожирения . ^{[ 12 ]} Вариации CDKAL1 также объясняются различиями в регуляции энергии. Анализ однонуклеотидного полиморфизма привел к открытию механизма реакций глюкозы и инсулина, продемонстрированного на рисунке. На основании этой взаимосвязи была выдвинута гипотеза, что регуляторные гены CDKAL1 и GIP ( глюкозозависимый инсулинотропный полипептид ) связаны с избирательностью к окружающей среде и адаптивным иммунитетом. ^{[ 13 ]}

Полногеномные исследования ассоциаций связали однонуклеотидные полиморфизмы в интроне хромосомы 6 с предрасположенностью к диабету 2 типа . [предоставлено RefSeq, май 2010 г.]. ^{[ 14 ]}

Исследования на животных

У мышей нарушение CDKAL1 снижает способность мышей поддерживать гомеостаз глюкозы и вызывает гипертрофию островков поджелудочной железы или поражения поджелудочной железы. ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145996 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006191 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чинг Ю.П., Панг А.С., Лам В.Х., Ци Р.З., Ван Дж.Х. (май 2002 г.). «Идентификация нейронального активатора Cdk5-связывающего белка как ингибитора Cdk5» . Журнал биологической химии . 277 (18): 15237–40. дои : 10.1074/jbc.C200032200 . ПМИД 11882646 .
^ Вэй Ф.Ю., Нагасима К., Осима Т., Сахеки Ю., Лу Ю.Ф., Мацусита М. и др. (октябрь 2005 г.). «Cdk5-зависимая регуляция глюкозо-стимулируемой секреции инсулина» . Природная медицина . 11 (10): 1104–8. дои : 10.1038/нм1299 . ПМИД 16155576 . S2CID 23702471 .
^ Такасуги Т., Минегиши С., Асада А., Сайто Т., Кавахара Х., Хисанага С. (февраль 2016 г.). «Два пути деградации субъединицы активации p35 Cdk5 (циклин-зависимой киназы), зависимые и независимые от убиквитинирования» . Журнал биологической химии . 291 (9): 4649–57. дои : 10.1074/jbc.M115.692871 . ПМЦ 4813488 . ПМИД 26631721 .
^ Сантос М.К., Андерсон К.П., Нешен С., Зумбреннен-Буллоу К.Б., Ромни С.Дж., Кале-Стефан М. и др. (январь 2020 г.). «Irp2 регулирует выработку инсулина посредством опосредованной железом модификации тРНК, катализируемой Cdkal1» . Природные коммуникации . 11 (1): 296. Бибкод : 2020NatCo..11..296S . дои : 10.1038/s41467-019-14004-5 . ПМК 6962211 . ПМИД 31941883 .
^ Сантос М.К., Андерсон К.П., Нешен С., Зумбреннен-Буллоу К.Б., Ромни С.Дж., Кале-Стефан М. и др. (январь 2020 г.). «Irp2 регулирует выработку инсулина посредством опосредованной железом модификации тРНК, катализируемой Cdkal1» . Природные коммуникации . 11 (1): 296. Бибкод : 2020NatCo..11..296S . дои : 10.1038/s41467-019-14004-5 . ПМК 6962211 . ПМИД 31941883 .
^ Харрис К.А., Бобей Б.Г., Сарачан К.Л., Симс А.Ф., Билбилль И., Дойч С. и др. (август 2015 г.). «Структурный анализ треонилкарбамоил-АМФ-синтазы и ее субстратных взаимодействий на основе ЯМР» . Журнал биологической химии . 290 (33): 20032–43. дои : 10.1074/jbc.M114.631242 . ПМЦ 4536411 . ПМИД 26060251 .
^ Кирхгоф К., Мачикао Ф., Хаупт А., Шефер С.А., Чриттер О., Штайгер Х. и др. (апрель 2008 г.). «Полиморфизмы генов TCF7L2, CDKAL1 и SLC30A8 связаны с нарушением конверсии проинсулина» . Диабетология . 51 (4): 597–601. дои : 10.1007/s00125-008-0926-y . ПМИД 18264689 .
^ Палмер С.Дж., Брукнер Р.Дж., Пауло Дж.А., Казак Л., Лонг Дж.З., Мина А.И. и др. (октябрь 2017 г.). «Cdkal1, ген предрасположенности к диабету 2 типа, регулирует функцию митохондрий в жировой ткани» . Молекулярный метаболизм . 6 (10): 1212–1225. doi : 10.1016/j.molmet.2017.07.013 . ПМЦ 5641635 . ПМИД 29031721 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чанг CL, Цай Джей-Джей, Хуан С.Ю., Ченг П.Дж., Чуэ ХИ, Сюй С.Ю. (15 сентября 2014 г.). «Адаптивные варианты человеческого CDKAL1 лежат в основе изменений гормонального ответа на энтероинсулярной оси» . ПЛОС ОДИН . 9 (9): е105410. Бибкод : 2014PLoSO...9j5410C . дои : 10.1371/journal.pone.0105410 . ПМК 4164438 . ПМИД 25222615 .
^ «Ген Энтрез: белок 1, подобный 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5» . Проверено 12 марта 2012 г.
^ Вэй Ф.Ю., Сузуки Т., Ватанабэ С., Кимура С., Кайцука Т., Фудзимура А. и др. (сентябрь 2011 г.). «Дефицит модификации тРНК(Lys) с помощью Cdkal1 вызывает развитие диабета 2 типа у мышей» . Журнал клинических исследований . 121 (9): 3598–608. дои : 10.1172/JCI58056 . ПМК 3163968 . ПМИД 21841312 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома CDKAL1 и страница сведений о гене CDKAL1 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Зеггини Э. , Уидон М.Н., Линдгрен К.М., Фрейлинг Т.М., Эллиотт К.С., Ланго Х. и др. (июнь 2007 г.). «Репликация общегеномных ассоциативных сигналов в образцах из Великобритании выявляет локусы риска диабета 2 типа» . Наука . 316 (5829). Консорциум по контролю за делами Wellcome Trust (WTCCC): 1336–41. Бибкод : 2007Sci...316.1336Z . дои : 10.1126/science.1142364 . ПМЦ 3772310 . ПМИД 17463249 .
Паско Л., Тура А., Патель С.К., Ибрагим И.М., Ферраннини Е., Зеггини Е. и др. (декабрь 2007 г.). «Распространенные варианты новых генов диабета 2 типа CDKAL1 и HHEX/IDE связаны со снижением функции бета-клеток поджелудочной железы» . Диабет . 56 (12): 3101–4. дои : 10.2337/db07-0634 . ПМИД 17804762 .
Хорикоши М., Хара К., Ито С., Шодзима Н., Нагай Р., Уэки К. и др. (декабрь 2007 г.). «Вариации гена HHEX связаны с повышенным риском развития диабета 2 типа у населения Японии» . Диабетология . 50 (12): 2461–6. дои : 10.1007/s00125-007-0827-5 . ПМИД 17928989 .
Вольф Н., Куаранта М., Прескотт Н.Дж., Аллен М., Смит Р., Берден А.Д. и др. (февраль 2008 г.). «Псориаз связан с локусами плейотропной восприимчивости, выявленными при диабете II типа и болезни Крона». Журнал медицинской генетики . 45 (2): 114–6. дои : 10.1136/jmg.2007.053595 . ПМИД 17993580 . S2CID 23285801 .
Омори С., Танака Ю., Такахаши А., Хиросе Х., Кашиваги А., Каку К. и др. (март 2008 г.). «Ассоциация CDKAL1, IGF2BP2, CDKN2A/B, HHEX, SLC30A8 и KCNJ11 с предрасположенностью к диабету 2 типа в японской популяции» . Диабет . 57 (3): 791–5. дои : 10.2337/db07-0979 . ПМИД 18162508 .
Коши С., Проенса С., Шоке Х., Гаже С., Де Грав Ф., Марре М. и др. (март 2008 г.). «Анализ новых локусов риска диабета 2 типа среди населения Франции в целом: исследование DESIR». Журнал молекулярной медицины . 86 (3): 341–8. дои : 10.1007/s00109-007-0295-x . ПМИД 18210030 . S2CID 21785287 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145996 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006191 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Чинг Ю.П., Панг А.С., Лам В.Х., Ци Р.З., Ван Дж.Х. (май 2002 г.). «Идентификация нейронального активатора Cdk5-связывающего белка как ингибитора Cdk5» . Журнал биологической химии . 277 (18): 15237–40. дои : 10.1074/jbc.C200032200 . ПМИД 11882646 .

[6] Вэй Ф.Ю., Нагасима К., Осима Т., Сахеки Ю., Лу Ю.Ф., Мацусита М. и др. (октябрь 2005 г.). «Cdk5-зависимая регуляция глюкозо-стимулируемой секреции инсулина» . Природная медицина . 11 (10): 1104–8. дои : 10.1038/нм1299 . ПМИД 16155576 . S2CID 23702471 .

[7] Такасуги Т., Минегиши С., Асада А., Сайто Т., Кавахара Х., Хисанага С. (февраль 2016 г.). «Два пути деградации субъединицы активации p35 Cdk5 (циклин-зависимой киназы), зависимые и независимые от убиквитинирования» . Журнал биологической химии . 291 (9): 4649–57. дои : 10.1074/jbc.M115.692871 . ПМЦ 4813488 . ПМИД 26631721 .

[8] Сантос М.К., Андерсон К.П., Нешен С., Зумбреннен-Буллоу К.Б., Ромни С.Дж., Кале-Стефан М. и др. (январь 2020 г.). «Irp2 регулирует выработку инсулина посредством опосредованной железом модификации тРНК, катализируемой Cdkal1» . Природные коммуникации . 11 (1): 296. Бибкод : 2020NatCo..11..296S . дои : 10.1038/s41467-019-14004-5 . ПМК 6962211 . ПМИД 31941883 .

[9] Сантос М.К., Андерсон К.П., Нешен С., Зумбреннен-Буллоу К.Б., Ромни С.Дж., Кале-Стефан М. и др. (январь 2020 г.). «Irp2 регулирует выработку инсулина посредством опосредованной железом модификации тРНК, катализируемой Cdkal1» . Природные коммуникации . 11 (1): 296. Бибкод : 2020NatCo..11..296S . дои : 10.1038/s41467-019-14004-5 . ПМК 6962211 . ПМИД 31941883 .

[10] Харрис К.А., Бобей Б.Г., Сарачан К.Л., Симс А.Ф., Билбилль И., Дойч С. и др. (август 2015 г.). «Структурный анализ треонилкарбамоил-АМФ-синтазы и ее субстратных взаимодействий на основе ЯМР» . Журнал биологической химии . 290 (33): 20032–43. дои : 10.1074/jbc.M114.631242 . ПМЦ 4536411 . ПМИД 26060251 .

[11] Кирхгоф К., Мачикао Ф., Хаупт А., Шефер С.А., Чриттер О., Штайгер Х. и др. (апрель 2008 г.). «Полиморфизмы генов TCF7L2, CDKAL1 и SLC30A8 связаны с нарушением конверсии проинсулина» . Диабетология . 51 (4): 597–601. дои : 10.1007/s00125-008-0926-y . ПМИД 18264689 .

[12] Палмер С.Дж., Брукнер Р.Дж., Пауло Дж.А., Казак Л., Лонг Дж.З., Мина А.И. и др. (октябрь 2017 г.). «Cdkal1, ген предрасположенности к диабету 2 типа, регулирует функцию митохондрий в жировой ткани» . Молекулярный метаболизм . 6 (10): 1212–1225. doi : 10.1016/j.molmet.2017.07.013 . ПМЦ 5641635 . ПМИД 29031721 .

[:02-13] Перейти обратно: ^а ^б Чанг CL, Цай Джей-Джей, Хуан С.Ю., Ченг П.Дж., Чуэ ХИ, Сюй С.Ю. (15 сентября 2014 г.). «Адаптивные варианты человеческого CDKAL1 лежат в основе изменений гормонального ответа на энтероинсулярной оси» . ПЛОС ОДИН . 9 (9): е105410. Бибкод : 2014PLoSO...9j5410C . дои : 10.1371/journal.pone.0105410 . ПМК 4164438 . ПМИД 25222615 .

[entrez-14] «Ген Энтрез: белок 1, подобный 1, связанный с регуляторной субъединицей CDK5» . Проверено 12 марта 2012 г.

[15] Вэй Ф.Ю., Сузуки Т., Ватанабэ С., Кимура С., Кайцука Т., Фудзимура А. и др. (сентябрь 2011 г.). «Дефицит модификации тРНК(Lys) с помощью Cdkal1 вызывает развитие диабета 2 типа у мышей» . Журнал клинических исследований . 121 (9): 3598–608. дои : 10.1172/JCI58056 . ПМК 3163968 . ПМИД 21841312 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]