RAPGEF2

RAPGEF2
Идентификаторы
Псевдонимы	RAPGEF2 , CNrasGEF, NRAPGEP, PDZ-GEF1, PDZGEF1, RA-GEF, RA-GEF-1, Rap-GEP, nRap GEP, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rap 2, RAGEF
Внешние идентификаторы	Опустить : 609530 ; МГИ : 2659071 ; Гомологен : 35477 ; GeneCards : RAPGEF2 ; OMA : RAPGEF2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	159,360,174 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	79,193,824 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Brodmann area 23; ; middle temporal gyrus; ; endothelial cell; ; frontal pole; ; postcentral gyrus; ; orbitofrontal cortex; ; tibia; ; Brodmann area 10; ; Brodmann area 46; ; entorhinal cortex;
	Top expressed in
	olfactory tubercle; ; subdivision of hippocampus; ; Region I of hippocampus proper; ; subiculum; ; piriform cortex; ; lateral septal nucleus; ; temporal lobe; ; primary motor cortex; ; amygdala; ; anterior amygdaloid area;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; protein binding; diacylglycerol binding; signal transducer activity; guanyl-nucleotide exchange factor activity; WW domain binding; phosphatidic acid binding; PDZ domain binding; cAMP binding; cGMP binding; beta-1 adrenergic receptor binding; GTPase activator activity;
Cellular component	cell-cell junction; endocytic vesicle; synapse; integral component of plasma membrane; apical plasma membrane; bicellular tight junction; endosome; cell junction; neuron projection; neuronal cell body; cytoplasm; cytosol; late endosome; membrane; plasma membrane; perinuclear region of cytoplasm; protein-containing complex; intracellular anatomical structure;
Biological process	positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway; cellular response to cGMP; ventricular system development; positive regulation of protein binding; forebrain neuron development; regulation of cell junction assembly; protein localization to plasma membrane; positive regulation of neuron projection development; adenylate cyclase-activating adrenergic receptor signaling pathway; nervous system development; neuron migration; neuropeptide signaling pathway; multicellular organism development; G protein-coupled receptor signaling pathway; negative regulation of melanin biosynthetic process; cellular response to nerve growth factor stimulus; cell differentiation; positive regulation of cAMP-mediated signaling; intracellular signal transduction; cellular response to cAMP; nerve growth factor signaling pathway; regulation of cell population proliferation; Rap protein signal transduction; small GTPase mediated signal transduction; negative regulation of cell population proliferation; blood vessel development; positive regulation of dendritic cell apoptotic process; positive regulation of vasculogenesis; microvillus assembly; negative regulation of dendrite morphogenesis; regulation of synaptic plasticity; neuron projection development; establishment of endothelial intestinal barrier; positive regulation of cAMP-dependent protein kinase activity; positive regulation of neuron migration; positive regulation of protein kinase activity; establishment of endothelial barrier; signal transduction; MAPK cascade; positive regulation of GTPase activity; cAMP-mediated signaling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9693
	76089
	ENSG00000109756
	ENSMUSG00000062232
	Q9Y4G8
	Q8CHG7
showНМ_014247 ; НМ_001351724 ; НМ_001351725 ; НМ_001351726 ; НМ_001351727 ;
	NM_001351728; NM_001394067
	НМ_001099624 ; НМ_001310536
showНП_055062 ; НП_001338653 ; НП_001338654 ; НП_001338655 ; НП_001338656 ;
	NP_001338657
	НП_001093094 ; НП_001297465
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов рэп-гуанина 2 — это белок , который у человека кодируется RAPGEF2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

RAPGEF2 представляет собой белок, связывающий циклический АМФ . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Функция

Члены RAS подсемейства GTPases функционируют в передаче сигнала как GTP/GDP-регулируемые переключатели, которые циклически переключаются между неактивным GDP и активным состояниями, связанными с GTP . Факторы обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF), такие как RAPGEF2, служат активаторами RAS, способствуя приобретению GTP для поддержания активного состояния, связанного с GTP, и являются ключевым связующим звеном между рецепторами клеточной поверхности и активацией RAS. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RAPGEF2 взаимодействует с RAP1A. ^{[ 6 ]} и РАЛГДС . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109756 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062232 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (сентябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Рез . 4 (2): 141–50. дои : 10.1093/dnares/4.2.141 . ПМИД 9205841 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ребхун Дж. Ф., Кастро А. Ф., Куильям Л. А. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация факторов обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для Rap1 GTPase. Регулирование MR-GEF посредством взаимодействия M-Ras-GTP» . J Биол Хим . 275 (45): 34901–8. дои : 10.1074/jbc.M005327200 . ПМИД 10934204 .
^ «Ген Энтрез: RAPGEF2 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rap (GEF) 2» .
^ Фам Н., Чеглаков И., Кох К.А., де Хоог С.Л., Моран М.Ф., Ротин Д. (май 2000 г.). «Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов CNrasGEF активирует ras в ответ на цАМФ и цГМФ» . Курс. Биол . 10 (9): 555–8. Бибкод : 2000CBio...10..555P . дои : 10.1016/S0960-9822(00)00473-5 . ПМИД 10801446 . S2CID 16896523 .
^ Эмери AC, Эйден М.В., Мустафа Т., Эйден Л.Е. (2013). «Rapgef2 соединяет GPCR-опосредованные сигналы цАМФ с активацией ERK в нейрональных и эндокринных клетках» . Научный сигнал . 6 (281): ра51. дои : 10.1126/scisignal.2003993 . ПМЦ 3932028 . ПМИД 23800469 .
^ Спааргарен М., Бишофф-младший (декабрь 1994 г.). «Идентификация стимулятора диссоциации гуаниновых нуклеотидов Ral как предполагаемой эффекторной молекулы R-ras, H-ras, K-ras и Rap» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (26): 12609–13. Бибкод : 1994PNAS...9112609S . дои : 10.1073/pnas.91.26.12609 . ПМК 45488 . ПМИД 7809086 .

Дальнейшее чтение

Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю. и др. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Оцука Т., Хата Ю., Иде Н. и др. (1999). «nRap GEP: новый нейронный белок GDP/GTP для небольшого G-белка rap1, который взаимодействует с молекулой синаптического каркаса (S-SCAM)». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 265 (1): 38–44. дои : 10.1006/bbrc.1999.1619 . ПМИД 10548487 .
Ляо И., Кария К., Ху С.Д. и др. (2000). «RA-GEF, новый фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rap1A, содержащий Ras/Rap1A-ассоциирующий домен, консервативен между нематодами и людьми» . Ж. Биол. Хим . 274 (53): 37815–20. дои : 10.1074/jbc.274.53.37815 . PMID 10608844 .
де Рой Дж., Боэнинк Н.М., ван Трист М. и др. (2000). «PDZ-GEF1, фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, специфичный для Rap1 и Rap2» . Ж. Биол. Хим . 274 (53): 38125–30. дои : 10.1074/jbc.274.53.38125 . PMID 10608883 .
Чикуми Х., Фукухара С., Гуткинд Дж.С. (2002). «Регуляция факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с G-белком, для Rho, PDZ-RhoGEF и LARG путем фосфорилирования тирозина: доказательства роли киназы фокальной адгезии» . Ж. Биол. Хим . 277 (14): 12463–73. дои : 10.1074/jbc.M108504200 . ПМИД 11799111 .
Вистов Г., Бернштейн С.Л., Вятт М.К. и др. (2002). «Анализ выраженных меток последовательности хрусталика взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Вис . 8 : 171–84. ПМИД 12107413 .
Аурандт Дж., Викис Х.Г., Гуткинд Дж.С. и др. (2002). «Плексин-B1 рецептора семафорина передает сигналы посредством прямого взаимодействия с Rho-специфичным фактором обмена нуклеотидов, LARG» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (19): 12085–90. Бибкод : 2002PNAS...9912085A . дои : 10.1073/pnas.142433199 . ПМК 129402 . ПМИД 12196628 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Хисата С., Сакисака Т., Баба Т. и др. (2007). «Rap1-PDZ-GEF1 взаимодействует с рецептором нейротрофина на поздних эндосомах, что приводит к устойчивой активации Rap1 и ERK и росту нейритов» . Дж. Клеточная Биол . 178 (5): 843–60. дои : 10.1083/jcb.200610073 . ПМК 2064548 . ПМИД 17724123 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109756 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062232 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9205841-5] Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (сентябрь 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Рез . 4 (2): 141–50. дои : 10.1093/dnares/4.2.141 . ПМИД 9205841 .

[pmid10934204-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ребхун Дж. Ф., Кастро А. Ф., Куильям Л. А. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация факторов обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) для Rap1 GTPase. Регулирование MR-GEF посредством взаимодействия M-Ras-GTP» . J Биол Хим . 275 (45): 34901–8. дои : 10.1074/jbc.M005327200 . ПМИД 10934204 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: RAPGEF2 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rap (GEF) 2» .

[pmid10801446-8] Фам Н., Чеглаков И., Кох К.А., де Хоог С.Л., Моран М.Ф., Ротин Д. (май 2000 г.). «Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов CNrasGEF активирует ras в ответ на цАМФ и цГМФ» . Курс. Биол . 10 (9): 555–8. Бибкод : 2000CBio...10..555P . дои : 10.1016/S0960-9822(00)00473-5 . ПМИД 10801446 . S2CID 16896523 .

[pmid23800469-9] Эмери AC, Эйден М.В., Мустафа Т., Эйден Л.Е. (2013). «Rapgef2 соединяет GPCR-опосредованные сигналы цАМФ с активацией ERK в нейрональных и эндокринных клетках» . Научный сигнал . 6 (281): ра51. дои : 10.1126/scisignal.2003993 . ПМЦ 3932028 . ПМИД 23800469 .

[pmid7809086-10] Спааргарен М., Бишофф-младший (декабрь 1994 г.). «Идентификация стимулятора диссоциации гуаниновых нуклеотидов Ral как предполагаемой эффекторной молекулы R-ras, H-ras, K-ras и Rap» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (26): 12609–13. Бибкод : 1994PNAS...9112609S . дои : 10.1073/pnas.91.26.12609 . ПМК 45488 . ПМИД 7809086 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]