ССР1

ССР1
Идентификаторы
Псевдонимы	SSR1 , TRAPA, субъединица 1 рецептора сигнальной последовательности
Внешние идентификаторы	Опустить : 600868 ; МГИ : 105082 ; Гомологен : 2368 ; GeneCards : SSR1 ; ОМА : SSR1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p24.3 Start 7,268,306 bp End 7,347,446 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 13 (mouse) Band 13|13 A3.3 Start 38,150,581 bp End 38,178,193 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in corpus epididymis caput epididymis trabecular bone parotid gland tibia skin of hip tail of epididymis mucosa of sigmoid colon germinal epithelium gums Top expressed in calvaria molar cumulus cell lacrimal gland dermis gastrula abdominal wall condyle efferent ductule fossa More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein binding Cellular component integral component of membrane endoplasmic reticulum membrane membrane endoplasmic reticulum Biological process IRE1-mediated unfolded protein response cotranslational protein targeting to membrane positive regulation of cell population proliferation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6745 107513 Вместе ENSG00000124783 ENSMUSG00000021427 ЮниПрот P43307 Q9CY50 RefSeq (мРНК) НМ_001292008 НМ_003144 НМ_025965 НМ_001360842 RefSeq (белок) НП_001278937 НП_003135 НП_080241 НП_001347771 Местоположение (UCSC) Чр 6: 7,27 – 7,35 Мб Чр 13: 38,15 – 38,18 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица альфа-связанного с транслоконом белка представляет собой белок , который у человека кодируется SSR1 геном .

Рецептор сигнальной последовательности (SSR) представляет собой гликозилированный эндоплазматического ретикулума (ER), рецептор мембраны связанный с транслокацией белка через мембрану ER. SSR состоит из двух субъединиц: гликопротеина массой 34 кДа , кодируемого этим геном, и гликопротеина массой 22 кДа. Этот ген генерирует несколько видов мРНК в результате сложного альтернативного полиаденилирования . Этот ген необычен тем, что использует массивы сигнальных последовательностей полиА, которые являются исключительно неканоническими.

Дальнейшее чтение

• Вэй М.Л., Крессвелл П. (1992). «Молекулы HLA-A2 в мутантной клетке, процессирующей антиген, содержат пептиды, полученные из сигнальной последовательности». Природа . 356 (6368): 443–6. Бибкод : 1992Natur.356..443W . дои : 10.1038/356443a0 . ПМИД   1557127 . S2CID   4310708 .
• Фогель Ф, Хартманн Э, Герлих Д, Рапопорт Т.А. (1991). «Сегрегация белка-рецептора сигнальной последовательности в мембране грубой эндоплазматической сети». Евро. Дж. Клеточная Биол . 53 (2): 197–202. ПМИД   1964414 .
• Хартманн Э., Герлих Д., Костка С. и др. (1993). «Тетрамерный комплекс мембранных белков эндоплазматической сети» (PDF) . Евро. Дж. Биохим . 214 (2): 375–81. дои : 10.1111/j.1432-1033.1993.tb17933.x . hdl : 11858/00-001M-0000-0015-3BD2-F . ПМИД   7916687 .
• Хартманн Э., Прен С. (1994). «N-концевая область альфа-субъединицы комплекса TRAP имеет консервативный кластер отрицательных зарядов». ФЭБС Летт . 349 (3): 324–6. дои : 10.1016/0014-5793(94)00693-8 . ПМИД   8050590 . S2CID   42968119 .
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД   8125298 .
• Ху Т, Гуань Т, Джераче Л (1996). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, совокупности гликопротеинов комплекса ядерных пор» . Дж. Клеточная Биол . 134 (3): 589–601. дои : 10.1083/jcb.134.3.589 . ПМК   2120945 . ПМИД   8707840 .
• Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД   9373149 .
• Хирама Т., Миллер К.В., Коффлер Х.П. (1999). «Транслокон-ассоциированный белок альфа-транскрипты индуцируется колониестимулирующим фактором гранулоцитов-макрофагов и демонстрирует сложное альтернативное полиаденилирование». ФЭБС Летт . 455 (3): 223–7. дои : 10.1016/S0014-5793(99)00885-6 . ПМИД   10437777 . S2CID   9426244 .
• Ван Л., Добберштейн Б. (1999). «Олигомерные комплексы, участвующие в транслокации белков через мембрану эндоплазматической сети» . ФЭБС Летт . 457 (3): 316–22. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01075-3 . ПМИД   10471800 . S2CID   22341517 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (2003). «Идентификация и количественная оценка N-связанных гликопротеинов с использованием гидразидной химии, мечения стабильными изотопами и масс-спектрометрии». Нат. Биотехнология . 21 (6): 660–6. дои : 10.1038/nbt827 . ПМИД   12754519 . S2CID   581283 .
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД   14574404 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД   16169070 . S2CID   8235923 .
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевых слов in silico для отбора полноразмерных кДНК человека, кодирующих секреторные или мембранные белки из библиотек кДНК с олигокепками» . ДНК Рез . 12 (2): 117–26. дои : 10.1093/dnares/12.2.117 . ПМИД   16303743 .
• Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД   17081983 . S2CID   7827573 .