✖


Jump to content

Джозеф ДеРизи

Джозеф ДеРизи
Национальность Американский
Альма-матер Стэнфордский университет , Калифорнийский университет, Санта-Круз
Известный ViroChip, работа по идентификации вируса атипичной пневмонии , экспрессия генов в Plasmodium falciparum
Научная карьера
Поля Биология
Учреждения Калифорнийский университет, Медицинский институт Говарда Хьюза в Сан-Франциско
Диссертация Анализ полногеномной экспрессии генов почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae .   (1999)
Докторантура Патрик О. Браун

Джозеф Лайман ДеРизи — американский биохимик , специализирующийся на молекулярной биологии , паразитологии , геномике , вирусологии и вычислительной биологии .

Ранняя жизнь и образование

[ редактировать ]

ДеРизи вырос в Кармайкле, Калифорния , где окончил среднюю школу Дель Кампо . [1] Он получил степень бакалавра биохимии и молекулярной биологии в 1992 году в Калифорнийском университете в Санта-Крус . [2]

ДеРизи получил докторскую степень. получил степень бакалавра биохимии в Стэнфордском университете в 1999 году. Работая в лаборатории Патрика О. Брауна , он разработал методы производства и использования микрочипов ДНК в молекулярной биологии, а его диссертация была посвящена полногеномному анализу экспрессии почкующихся дрожжей S. cerevisiae. . [3] [4] [5] По окончании учебы ДеРизи принял должность научного сотрудника Сэндлера в Калифорнийском университете в Сан-Франциско . [2] [6]

Карьера и исследования

[ редактировать ]

ДеРизи является преподавателем кафедры биохимии и биофизики UCSF с 1999 года. По состоянию на 2022 год он является профессором биохимии и биофизики, а также директором программы Сэндлера UCSF по прорывным биомедицинским исследованиям. [2] [6]

ДеРизи известен тем, что напечатал первый массив экспрессий целого генома . [7] проведение первого широкого анализа дифференциальной экспрессии генов в раковых клетках, [8] профилирование экспрессии генов на протяжении всего жизненного цикла малярию , вызывающих простейших Plasmodium falciparum , [9] геномная характеристика вируса SARS -CoV-1, [10] и новаторское открытие вирусов с использованием массивов гибридизации генов и технологий секвенирования ДНК. [11]

В начале своей карьеры ДеРизи был пионером в области микрочипов , а также разработал и создал аппаратное и программное обеспечение для микрочипов. Он был сторонником открытого доступа к технологии микрочипов. [5] и поддерживал веб-сайт с программным обеспечением и протоколами для операций с микрочипами. [4] Он также является сторонником публикации в открытом доступе . [12]

В 2002 году ДеРизи и его научный сотрудник Дэвид Ванг разработали ViroChip — микрочип ДНК, который можно использовать для быстрой идентификации вирусов в образце крови или ткани. [13] Он использовал этот инструмент, чтобы идентифицировать вирус SARS-CoV-1 в 2003 году. В 2004 году ДеРизи был назначен стипендиатом Макартура за его работу с ViroChip и методами геномной диагностики. [12] [14]

ДеРизи стал исследователем Медицинского института Говарда Хьюза (HHMI) в 2005 году и получил финансовую поддержку от HHMI для своих исследований. [6] [15] Он оставался следователем до 2016 года. [16]

ДеРизи и его коллеги используют метагеномное секвенирование нового поколения (mNGS) для различных приложений, в том числе для идентификации возбудителей в случаях инфекционного энцефалита и менингита, а также для различения аутоиммунных и инфекционных причин, диагностируя случаи, которые трудно расшифровать с помощью традиционных клинических лабораторных методов. [13] [17] Используя метагеномное секвенирование, ДеРизи идентифицировал вирусы, вызывающие заболевания у людей и животных, от попугаев и корелл до медоносных пчел и удавов. [13] [18] Он и его исследовательский партнер Дон Ганем выявили паразита Nosema ceranae , который, по-видимому, ответственен за разрушение колоний медоносных пчел. [19] Он также развенчал связь вирусов с некоторыми видами рака человека. [20]

ДеРизи и его коллега доктор Майкл Уилсон использовали фаговый дисплей для скрининга образцов антител от пациентов с аутоиммунными симптомами с библиотекой человеческих белков, что позволило им идентифицировать ассоциированный с раком аутоантиген , который является причиной симптомов. [20] [21]

Лаборатория ДеРизи в Калифорнийском университете в Сан-Франциско также проводит исследования, чтобы понять генетику возбудителя Plasmodium малярии falciparum , возбудителя самой смертельной формы малярии у человека. [12] [22] Группа ДеРизи разработала лекарства-кандидаты для лечения малярии. [23] 2011 году группа определила функцию апикопласта, уникальной органеллы апикомплексов В , определив мишень противомалярийного препарата, который был кандидатом на доклинические испытания . [24] [25]

В 2016 году ДеРизи стал сопрезидентом недавно созданного CZ Biohub вместе со Стивеном Квейком . [26] Присоединившись к CZ Biohub, ДеРизи сформировал команду разработчиков для создания облачной метагеномной диагностической платформы на основе кода из своей лаборатории в UCSF. Платформа, которая тогда называлась IDSeq, первоначально была запущена для тестирования небольшой группой в 2018 году. [27] [17] Затраты на разработку и вычисления были поддержаны Инициативой Чана Цукерберга и CZ Biohub. [17] Платформа используется для быстрой идентификации патогенов на основе данных метагеномного секвенирования . [28] а с 2022 года известен как CZ-ID. [29]

В 2020 году, в начале пандемии COVID-19 , ДеРизи возглавил команду, которая за восемь дней превратила пустое лабораторное помещение, примыкающее к CZ Biohub, в сертифицированный CLIA центр тестирования на COVID-19 . [30] [31] CLIAhub стал одним из ведущих центров тестирования на COVID-19 в стране, обрабатывая тысячи тестов в день и став образцом для нации. [32] [33] [34] Раннее предупреждение ДеРизи о пандемии и разработке технологии быстрого тестирования было задокументировано Майклом Льюисом в его книге «Предчувствие: история пандемии» . [35] [36] В то же время ДеРизи стал активным сторонником разработки национальной системы эпиднадзора за COVID-19 для выявления и мониторинга мутаций вируса COVID-19. [37] [38] [33]

Награды и почести

[ редактировать ]

Членство в научных организациях будет включать:

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ «Доктор Джо Дериси» . Образовательный фонд Сан-Хуана . Проверено 17 октября 2022 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с д «Программа Сэндлера по прорывным биомедицинским исследованиям: наше лидерство» . Программа UCSF Sandler по прорывным биомедицинским исследованиям . Проверено 28 октября 2022 г.
  3. ^ ДеРизи, Джозеф Л. (1999). Анализ полногеномной экспрессии генов почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae . SearchWorks Стэнфорд (Диссертация). ОСЛК   80580640 . Проверено 18 октября 2022 г.
  4. ^ Перейти обратно: а б Кан, Дженнифер (2 декабря 2006 г.). «Новые чипы на блоке» (PDF) . Ежеквартальный журнал Economist Technology . Проверено 12 октября 2022 г.
  5. ^ Перейти обратно: а б Адамс, Эми. «Выпускник докторантуры Джо ДеРизи приносит инновации в массы» . Стэнфордский медицинский журнал . Том. Лето 2002 года . Проверено 18 октября 2022 г.
  6. ^ Перейти обратно: а б с Хопкин, Карен (20 ноября 2005 г.). «ТОРС, малярия и микроматрица» . Журнал Ученый . Проверено 17 октября 2022 г.
  7. ^ ДеРизи, Дж.Л.; Айер, ВР; Браун, ПО (1997). «Изучение метаболического и генетического контроля экспрессии генов в геномном масштабе». Наука . 278 (5338): 680–6. Бибкод : 1997Sci...278..680D . CiteSeerX   10.1.1.335.7937 . дои : 10.1126/science.278.5338.680 . ПМИД   9381177 .
  8. ^ ДеРизи, Дж; Пенленд, Л; Браун, ПО; Биттнер, МЛ; Мельцер, П.С.; Рэй, М; Чен, Ю; Су, Ю.А.; Трент, Дж. М. (1996). «Использование микрочипа кДНК для анализа закономерностей экспрессии генов при раке человека». Нат Жене . 14 (4): 457–60. дои : 10.1038/ng1296-457 . ПМИД   8944026 . S2CID   23091561 .
  9. ^ Ллинас, Мануэль; Боздеч, Збинек; Вонг, Эдит Д.; Адай, Алекс Т.; Дериси, Джозеф Л. (2006), «Сравнительный полногеномный транскриптомный анализ трех штаммов Plasmodium falciparum», Nucleic Acids Research , 34 (4): 1166–73, doi : 10.1093/nar/gkj517 , PMC   1380255 , PMID   16493140
  10. ^ Рота, Пол А.; Оберсте, М. Стивен; Монро, Стефан С.; Никс, В. Аллан; Кампаньоли, Рэй; Айсногл, Джозеф П.; Пенаранда, Сильвия; Банкамп, Беттина; Махер, Кайя; Беллини, Уильям Дж. (2003), «Характеристика нового коронавируса, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом», Science , 300 (5624): 1394–9, Bibcode : 2003Sci...300.1394R , doi : 10.1126/science.1085952 , PMID   12730500
  11. ^ Ван, Д; Коской, Л; Зильберберг, М; Авила, ПК; Буши, штат Ха; Ганем, Д; ДеРизи, Дж.Л. (2002). «Микрочиповое обнаружение и генотипирование вирусных возбудителей» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (24): 15687–92. Бибкод : 2002PNAS...9915687W . дои : 10.1073/pnas.242579699 . ПМЦ   137777 . ПМИД   12429852 .
  12. ^ Перейти обратно: а б с Рассел, Сабин (28 сентября 2004 г.). «ГРАНТЫ МАКАРТУРА: ПРОФИЛИ ОБЛАСТИ ЗАЛИВА / Его быстрая работа над атипичной пневмонией дала решающие ответы» . Ворота СФ . Проверено 28 октября 2022 г.
  13. ^ Перейти обратно: а б с Кан, Дженнифер (3 июня 2021 г.). «Детектив болезни» . Нью-Йорк Таймс . ISSN   0362-4331 . Проверено 12 октября 2022 г.
  14. ^ «Джозеф ДеРизи» . Фонд Макартура . Проверено 1 ноября 2022 г.
  15. ^ О'Брайен, Дженнифер (22 марта 2005 г.). «Два учёных UCSF назначены исследователями Медицинского института Говарда Хьюза | Калифорнийский университет в Сан-Франциско» . УКСФ . Проверено 31 октября 2022 г.
  16. ^ «Джозеф Л. ДеРизи» (Текст) . ХХМИ . Проверено 31 октября 2022 г.
  17. ^ Перейти обратно: а б с Йонг, Эд (16 октября 2018 г.). «Простой способ разобраться в загадочных заболеваниях в бедных странах» . Атлантика . Проверено 1 ноября 2022 г.
  18. ^ Дубей, Дивяншу; Мандель-Брем, Кейли (4 июля 2019 г.). «Антитела к Кельх-подобному белку 11 при паранеопластическом энцефалите, связанном с семиномой» . Медицинский журнал Новой Англии . 381 (1): 47–54. дои : 10.1056/NEJMoa1816721 . ПМК   6800027 . ПМИД   31269365 .
  19. ^ «Сыщики UCSF идентифицируют подозреваемых в тайне исчезновения медоносных пчел» . UCSF.com . 25 апреля 2007 года . Проверено 28 октября 2022 г.
  20. ^ Перейти обратно: а б Эллдей, Эрин (15 июля 2019 г.). «Открытие редкой болезни: антитела, борющиеся с раком, продолжают атаковать мозг» . sfchronicle.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  21. ^ Мандель-Брем, Кейли; Дубей, Дивяншу; Крайзер, Томас Дж.; О'Донован, Брайан Д.; Тран, Бауен; Васкес, Сара Э.; Сэмпл, Ханна А.; Зорн, Келси К.; Хан, Лилиан М.; Бледсо, Ян О.; МакКеон, Эндрю; Удовольствие, Сэмюэл Дж.; Леннон, Ванда А.; ДеРизи, Джозеф Л.; Уилсон, Майкл Р.; Питток, Шон Дж. (4 июля 2019 г.). «Антитела к Кельх-подобному белку 11 при паранеопластическом энцефалите, связанном с семиномой» . Медицинский журнал Новой Англии . 381 (1): 47–54. дои : 10.1056/NEJMoa1816721 . ISSN   0028-4793 . ПМК   6800027 . ПМИД   31269365 . Проверено 1 ноября 2022 г.
  22. ^ Уэйд, Николас (12 августа 2003 г.). «Новая брешь в броне малярийного паразита» . Нью-Йорк Таймс . ISSN   0362-4331 . Проверено 1 ноября 2022 г.
  23. ^ Хименес-Диас, Мария; Эберт, Дэниел (1 декабря 2014 г.). «(+)-SJ733, клинический кандидат на лечение малярии, который действует через АТФ4, вызывая быстрое опосредованное хозяином выведение плазмодия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (50): Е5455-62. Бибкод : 2014PNAS..111E5455J . дои : 10.1073/pnas.1414221111 . ПМЦ   4273362 . ПМИД   25453091 .
  24. ^ Палка, Джо (30 августа 2011 г.). «Остаток водорослей малярийного паразита может доказать свою слабость» . ЭНЕРГЕТИЧЕСКИЙ ЯДЕРНЫЙ РЕАКТОР . Проверено 1 ноября 2022 г.
  25. ^ Да, Эллен; ДеРизи, Джозеф Л. (30 августа 2011 г.). «Химическое спасение малярийных паразитов, лишенных апикопласта, определяет функцию органелл в Plasmodium falciparum на стадии крови» . ПЛОС Биология . 9 (8): –1001138. дои : 10.1371/journal.pbio.1001138 . ISSN   1545-7885 . ПМК   3166167 . ПМИД   21912516 .
  26. ^ ДеФранческо, Лаура (11 сентября 2020 г.). «Создание Биохаба» . Природная биотехнология . 38 (10): 1116–1120. дои : 10.1038/s41587-020-0685-y . ISSN   1546-1696 . ПМИД   32918057 . S2CID   221637469 .
  27. ^ Молтени, Меган (10 марта 2020 г.). «Система отслеживания заболеваний, поддерживаемая Гейтсом и Цукербергом, борется с Covid-19» . Проводной . ISSN   1059-1028 . Проверено 1 ноября 2022 г.
  28. ^ Калантар, Катрина Л; Карвалью, Тьяго; де Бурси, Шарль Ф.А.; Димитров, Борис; Дингл, Грег; Эггер, Ребекка; Хан, Джули; Холмс, Оливия Б; Хуан, Юн-Фан; Кинг, Райан; Кислюк, Андрей (октябрь 2020 г.). «IDseq — облачный конвейер и служба анализа с открытым исходным кодом для обнаружения и мониторинга метагеномных патогенов» . ГигаСайенс . 9 (10). doi : 10.1093/gigascience/giaa111 . ISSN   2047-217X . ПМЦ   7566497 . ПМИД   33057676 .
  29. ^ Мик, Эран; Цициклис, Александра; Споттисвуд, Наташа; Кальдера, Сахара; Серпа, Паула Хаякава; Детвейлер, Анджела М.; Нефф, Норма; Писко, Анджела Оливейра; Ли, Люси М.; Реталлак, Ханна; Ратнасири, Калани; Уильямсон, Кайла М.; Соесанто, Виктория; Симойнс, Эрик А.Ф.; Смит, Кристиана; Абуоги, Лиза; Кистлер, Эми; Вагнер, Брэнди Д.; ДеРизи, Джозеф Л.; Амброджио, Лиллиам; Мурани, Питер М.; Ланжелье, Чарльз Р. (08 июля 2022 г.). «Экспрессия генов верхних дыхательных путей демонстрирует более устойчивый адаптивный иммунный ответ на SARS-CoV-2 у детей» . Природные коммуникации . 13 (1): 3937. Бибкод : 2022NatCo..13.3937M . дои : 10.1038/s41467-022-31600-0 . ISSN   2041-1723 . ПМЦ   9263813 . ПМИД   35803954 .
  30. ^ «Модель для нации: создание лаборатории по тестированию на COVID-19 всего за восемь дней» . chanzuckerberg.com . 21 октября 2020 г. . Проверено 1 мая 2021 г.
  31. ^ Льюис, Майкл (16 апреля 2020 г.). «Тестовая лаборатория Covid, которая может спасти Америку» . Bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  32. ^ Льюис, Майкл (8 мая 2020 г.). «Охотники на Covid, вооруженные тампонами, преследуют свою добычу» . Bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  33. ^ Перейти обратно: а б Льюис, Майкл (21 июня 2020 г.). «Новое оружие в войне с Covid-19» . Bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  34. ^ Льюис, Майкл (7 апреля 2020 г.). «В Беркли охотятся за туалетной бумагой и уклоняются от туристов» . Bloomberg.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  35. ^ Исповедник Николай (06.05.2021). «Майкл Льюис рассказывает историю Кассандр Ковида» . Нью-Йорк Таймс . ISSN   0362-4331 . Проверено 1 ноября 2022 г.
  36. ^ О'Коннелл, Марк (5 мая 2021 г.). «Обзор Майкла Льюиса «Предчувствие» — история пандемии» . Хранитель . ISSN   0261-3077 . Проверено 1 ноября 2022 г.
  37. ^ Данн, Лорен (8 января 2021 г.). «Поскольку британский вариант распространяется в США, ученые предупреждают, что страна делает недостаточно для отслеживания штаммов Covid» . NBCNews.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  38. ^ Эллдей, Эрин (23 января 2021 г.). «Внутренняя история того, как был обнаружен вариант коронавируса в районе Залива» . sfchronicle.com . Проверено 1 мая 2021 г.
  39. ^ «Премия Джона Дж. Карти за развитие науки» . Национальная академия наук . 2014 . Проверено 18 ноября 2022 г.
  40. ^ «Калифорнийская академия наук приветствует новых научных сотрудников и вручает ежегодные награды» . www.calacademy.org . 4 октября 2013 года . Проверено 1 мая 2021 г.
  41. ^ «65 членов избраны в Американскую академию микробиологии» . asm.org . 16 февраля 2021 г. . Проверено 1 мая 2021 г.
  42. ^ «Джозеф Л. ДеРизи» . Американская академия искусств и наук . Проверено 18 ноября 2022 г.
  43. ^ Избраны члены Национальной академии наук и иностранные сотрудники , Новости Национальной академии наук, Национальная академия наук , 3 мая 2016 г., заархивировано из оригинала 6 мая 2016 г. , получено 14 мая 2016 г.
  44. ^ Бай, Нина (17 октября 2016 г.). «3 преподавателя UCSF избраны в Национальную медицинскую академию на 2016 год» . ucsf.edu . Проверено 1 мая 2021 г.
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Joseph_DeRisi&oldid=1220683964"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 8c104605c2d9233a55712e30b2c17b16__1714022640
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/8c/16/8c104605c2d9233a55712e30b2c17b16.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Joseph DeRisi - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)