ПРОСТОЙ8

ПРОСТОЙ8
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1XT9, 2BKQ, 2BKR
Идентификаторы
Псевдонимы	SENP8 , DEN1, NEDP1, PRSC2, член семейства SUMO/сентрин-пептидаз, специфичный для NEDD8, член семейства пептидаз SUMO, специфичный для NEDD8
Внешние идентификаторы	Опустить : 608659 ; МГИ : 1918849 ; Гомологен : 14084 ; Генные карты : SENP8 ; OMA : SENP8 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	72,143,692 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	59,657,993 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; gonad; ; secondary oocyte; ; testicle; ; right testis; ; left testis; ; muscle of thigh; ; islet of Langerhans; ; gastrocnemius muscle; ; ventricular zone;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; zygote; ; primary oocyte; ; lumbar spinal ganglion; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; hand; ; otolith organ; ; facial motor nucleus; ; utricle;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	peptidase activity; cysteine-type peptidase activity; hydrolase activity; NEDD8-specific protease activity; endopeptidase activity;
Cellular component	cytosol; nucleus;
Biological process	proteolysis; protein deubiquitination; protein desumoylation; post-translational protein modification;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	123228
	71599
	ENSG00000166192
	ENSMUSG00000051705
	Q96LD8
	Q9D2Z4
	НМ_001166340 ; НМ_001172109 ; НМ_001172110 ; НМ_001172111 ; НМ_145204
	НМ_001172068 ; НМ_001172069 ; НМ_001172070 ; НМ_001172071 ; НМ_027838
	NP_001159812 ; НП_001165580 ; НП_001165581 ; НП_001165582 ; НП_660205
	НП_001165539 ; НП_001165540 ; НП_001165541 ; НП_001165542 ; НП_082114
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Сентрин-специфическая протеаза 8 — это фермент , который у человека кодируется SENP8 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

NEDD8 (MIM 603171) представляет собой убиквитин -подобный белок, который конъюгируется с субъединицей куллина (см. CUL1 ; MIM 603134) нескольких убиквитинлигаз . Эта конъюгация, называемая неддилированием , необходима для оптимальной активности убиквитинлигазы. NEDD8-специфичные денеддилазы, такие как NEDP1 или DEN1, необходимы для процессинга пропептида NEDD8 по C-концевому диглициновому мотиву и для удаления NEDD8 из куллинов (Gan-Erdene et al., 2003). [предоставлено OMIM] ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166192 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051705 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мендоса Х.М., Шен Л.Н., Боттинг С., Льюис А., Чен Дж., Инк Б., Хэй RT (июль 2003 г.). «NEDP1, высококонсервативная цистеиновая протеаза, которая деNEDDилирует Каллинза» . J Биол Хим . 278 (28): 25637–43. дои : 10.1074/jbc.M212948200 . ПМИД 12730221 .
^ Ган-Эрдэне Т., Нагамаллесвари К., Инь Л., Ву К., Пан ZQ, Уилкинсон К.Д. (июль 2003 г.). «Идентификация и характеристика DEN1, денеддилазы семейства ULP» . J Биол Хим . 278 (31): 28892–900. дои : 10.1074/jbc.M302890200 . ПМИД 12759362 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: SENP8 SUMO/член семейства 8 специфичных для сентрина пептидаз» .

Дальнейшее чтение

Миколайчик Дж., Драг М., Бекеш М., Цао Дж.Т., Ронай З., Салвесен Г.С. (2007). «Малые протеазы, специфичные для модификатора убиквитина (SUMO): описание особенностей и активности SENP человека» . Ж. Биол. Хим . 282 (36): 26217–24. дои : 10.1074/jbc.M702444200 . ПМИД 17591783 .
Драг М., Миколайчик Дж., Кришнакумар И.М., Хуанг З., Салвесен Г.С. (2008). «Профилирование активности человеческих деСУМОилирующих ферментов (SENP) с синтетическими субстратами предполагает неожиданную специфичность двух недавно охарактеризованных членов семейства». Биохим. Дж . 409 (2): 461–9. дои : 10.1042/BJ20070940 . ПМИД 17916063 . S2CID 12234952 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ву К., Ямоа К., Долиос Г. и др. (2003). «DEN1 представляет собой протеазу с двойной функцией, способную обрабатывать С-конец Nedd8 и деконъюгировать гипернеддилированный CUL1» . Ж. Биол. Хим . 278 (31): 28882–91. дои : 10.1074/jbc.M302888200 . ПМИД 12759363 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Ксиродимас Д.П., Сэвилл М.К., Бурдон Дж.К. и др. (2004). «Mdm2-опосредованная NEDD8-конъюгация р53 ингибирует его транскрипционную активность» . Клетка . 118 (1): 83–97. дои : 10.1016/j.cell.2004.06.016 . ПМИД 15242646 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ревертер Д., Ву К., Эрдене Т.Г. и др. (2005). «Структура комплекса между Nedd8 и членом семейства протеаз Ulp/Senp Den1». Дж. Мол. Биол . 345 (1): 141–51. дои : 10.1016/j.jmb.2004.10.022 . ПМИД 15567417 .
Шен Л.Н., Лю Х., Донг С. и др. (2005). «Структурная основа дискриминации убиквитина NEDD8 деNEDDилирующим ферментом NEDP1» . ЭМБО Дж . 24 (7): 1341–51. дои : 10.1038/sj.emboj.7600628 . ПМЦ 1142549 . ПМИД 15775960 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q96LD8 (Sentrin-специфическая протеаза 8) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 15 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166192 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051705 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12730221-5] Мендоса Х.М., Шен Л.Н., Боттинг С., Льюис А., Чен Дж., Инк Б., Хэй RT (июль 2003 г.). «NEDP1, высококонсервативная цистеиновая протеаза, которая деNEDDилирует Каллинза» . J Биол Хим . 278 (28): 25637–43. дои : 10.1074/jbc.M212948200 . ПМИД 12730221 .

[pmid12759362-6] Ган-Эрдэне Т., Нагамаллесвари К., Инь Л., Ву К., Пан ZQ, Уилкинсон К.Д. (июль 2003 г.). «Идентификация и характеристика DEN1, денеддилазы семейства ULP» . J Биол Хим . 278 (31): 28892–900. дои : 10.1074/jbc.M302890200 . ПМИД 12759362 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: SENP8 SUMO/член семейства 8 специфичных для сентрина пептидаз» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]