Jump to content

Аполипопротеин L1

(Перенаправлено с APOL1 )

АПОЛЛОН1
Доступные структуры
ПДБ Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы APOL1 , APO-L, APOL, APOL-I, FSGS4, аполипопротеин L1
Внешние идентификаторы Опустить : 607254 , 603743 ; Генные карты : APOL1 ; ОМА : APOL1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

н/д

RefSeq (белок)

НП_001130012
НП_001130013
НП_003652
НП_663318
НП_001349856

н/д

Местоположение (UCSC) Чр 22: 36,25 – 36,27 Мб н/д
в PubMed Поиск [ 2 ] н/д
Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Аполипопротеин L1 — это белок , который у человека кодируется APOL1 геном . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] два варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы . Для этого гена были обнаружены [ 6 ]

Распространение видов

[ редактировать ]

Этот ген обнаружен только у людей, африканских зеленых мартышек и горилл. [ 7 ] [ 8 ]

Структура

[ редактировать ]

Ген, кодирующий белок APOL1, имеет длину 14 522 пары оснований и находится на 22 хромосоме человека, на длинном плече в положении 13,1 от пары оснований 36 253 070 до пары оснований 36 267 530. [ 4 ] [ 9 ]

Белок представляет собой белок, состоящий из 398 аминокислот. Он состоит из 5 функциональных доменов:

Недавно были идентифицированы два варианта кодирования, G1 и G2, имеющие отношение к фенотипам человека. G1 представляет собой пару из двух несинонимичных однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) с почти полным неравновесием по сцеплению. G2 представляет собой делецию двух аминокислотных остатков в рамке считывания, N388 и Y389. [ 10 ]

Аполипопротеин L1 (apoL1) представляет собой второстепенный аполипопротеиновый компонент холестерина ЛПВП , который синтезируется в печени, а также во многих других тканях, включая поджелудочную железу, почки и мозг. APOL1 обнаруживается в эндотелии сосудов, печени, сердце, легких, плаценте, [ 7 ] подоциты, проксимальные канальцы и артериальные клетки. [ 11 ] Белок в секретируемой форме, позволяющей ему циркулировать в крови. Он образует комплекс, известный как литический фактор трипаносомы (TLF). [ 12 ] с частицами липопротеина высокой плотности 3 (HDL3), которые также содержат аполипопротеин A1 (APOA1) и гемоглобинсвязывающий белок, родственный гаптоглобину (HPR). Белок APOL1 выступает в качестве основного литического компонента в этом комплексе. [ 12 ] После поглощения трипаносомой комплекс попадает в кислые эндосомы, где белок APOL1 может встраиваться в мембрану эндосомы. Если эндосома затем возвращается в плазматическую мембрану, где она оказывается в условиях нейтрального pH, APOL1 может образовывать катион-селективные каналы. [ 13 ]

APOL1 является членом семейства аполипопротеинов, которое также включает шесть других белков, и является членом генов bcl2, которые участвуют в аутофагической гибели клеток. Фактически, избыток APOL1 внутри клетки приводит к аутофагии. [ 14 ]

APOL1 может играть роль в воспалительной реакции. Провоспалительные цитокины интерферон-γ (IFN), фактор некроза опухоли-α (TNF-α) и p53 могут увеличивать экспрессию APOL1. [ 14 ]

APOL1 играет роль во врожденном иммунитете, защищая от инфекции Trypanosoma brucei , паразита, передающегося мухой цеце . Трипаносомы эндоцитируют секретируемую форму APOL1; APOL1 образует поры на лизосомальных мембранах трипаносом, что вызывает приток хлоридов, набухание лизосомы и лизис трипаносомы. [ 5 ] [ 15 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Африканский трипаносомоз (сонная болезнь)

[ редактировать ]

Хотя его внутриклеточная функция не выяснена, apoL1, циркулирующий в плазме, обладает способностью убивать трипаносому Trypanosoma brucei , вызывающую сонную болезнь . Недавно было показано, что два варианта кодирующей последовательности APOL1 связаны с заболеванием почек рецессивным образом и в то же время обеспечивают устойчивость к Trypanosoma brucei rhodesiense . [ 16 ] Эта устойчивость частично обусловлена ​​снижением связывания вариантов APOL1 G1 и G2 с T. b. фактор вирулентности rhodesiense , сывороточный белок, ассоциированный с резистентностью (SRA), в результате С-концевого полиморфизма. [ 17 ] Люди, у которых есть хотя бы одна копия варианта G1 или G2, устойчивы к заражению трипаносомами, но люди, у которых есть две копии любого варианта, подвергаются повышенному риску развития недиабетического заболевания почек.

Болезнь почек

[ редактировать ]

Распределение вариантов, наиболее связанных с риском заболевания почек, было проанализировано в африканских популяциях и оказалось, что они более распространены в популяциях западной Африки по сравнению с популяциями северо-восточной Африки и отсутствуют в Эфиопии. [ 18 ] согласуется с сообщениями о защите от форм заболеваний почек, которые, как известно, связаны с вариантами APOL1. [ 19 ] У народа йоруба в Нигерии (Западная Африка) распространенность аллелей риска G1 и G2 составляет 40% и 8% соответственно. [ 16 ] [ 20 ] Африканские страны с высокой частотой аллелей риска APOL1 также имеют большие популяции трипаносом, что позволяет предположить, что аллели риска подверглись положительному отбору в качестве защитного механизма. Существование этих вариантов обнаружено только на африканских хромосомах и существует у людей недавнего африканского происхождения (<10 000 лет).

Многие афроамериканцы являются потомками жителей западноафриканских стран и, следовательно, также имеют высокую распространенность аллелей риска APOL1, а также заболеваний почек, связанных с APOL1. Частота аллелей риска у афроамериканцев составляет более 30%. [ 16 ] Было показано, что существование этих аллелей увеличивает риск развития таких заболеваний, как фокальный сегментарный гломерулосклероз (ФСГС), заболевание почек в конечной стадии, связанное с гипертонией (ESKD) и ВИЧ-ассоциированная нефропатия (ВИЧАН).

Распространенность аллелей риска у афроамериканцев с этими заболеваниями почек, показанная в недавних исследованиях, составляет 67% при ВИЧАН, 66% при ФСГС и 47% при ТХБП, связанной с гипертензией. [ 21 ] [ 22 ] Латиноамериканское население, такое как доминиканцы и пуэрториканцы, демонстрирует смесь генетических влияний, включая африканское происхождение, что также приводит к преобладанию вариантов APOL1. [ 23 ] Исследования также определили распространенность каждого отдельного аллеля в случаях ФСГС.

Фокальный сегментарный гломерулосклероз (ФСГС)

[ редактировать ]

Распространенность аллеля риска G1 у афроамериканцев с ФСГС составляет 52%, а у лиц без ФСГС — 18–23%. Распространенность аллеля риска G2 у афроамериканцев с ФСГС составляет 23% и 15% у лиц без ФСГС. [ 16 ] [ 22 ] ФСГС — это заболевание почек, которое поражает молодых людей, поэтому его последствия немного отличаются от эффектов общей недиабетической ТХПН. В недавнем исследовании средний возраст начала ФСГС у афроамериканцев с 2, 1 и 0 аллелями риска APOL1 составил 32 года, 36 лет и 39 лет соответственно. Варианты APOL1 также имеют тенденцию проявляться ФСГС в относительно молодом возрасте; ФСГС начинается в возрасте от 15 до 39 лет у 70% людей с двумя аллелями риска APOL1 и у 42% людей с 0 или 1 аллелями риска. [ 22 ]

Патогенез

[ редактировать ]

Хотя наличие вариантов риска APOL1 увеличивает восприимчивость к недиабетическому заболеванию почек, не у всех людей, обладающих этими вариантами, развивается заболевание почек, что указывает на то, что другой фактор может инициировать прогрессирование заболевания почек. [ 24 ] Аналогично и у ВИЧ-положительных пациентов, хотя большинство афроамериканских пациентов с ВИЧАН имеют два аллеля риска APOL1, другие пока неизвестные факторы у хозяина, включая варианты генетического риска, а также факторы окружающей среды или вирусы, могут влиять на развитие этого заболевания у пациентов с ВИЧ-позитивными пациентами. ноль или один аллель риска APOL1. Почки Int. Август 2012 г.;82(3):338-43. У афроамериканского населения общий пожизненный риск развития ФСГС составляет 0,8%. Для людей с 0 аллелями риска риск развития ФСГС составляет 0,2%, 0,3% с 1 аллелем риска, 4,25% с 2 аллелями риска и 50% вероятность развития ВИЧАН для нелеченных ВИЧ-инфицированных лиц. [ 22 ]

Люди с этими аллельными вариантами, у которых развивается ТХБП, начинают диализ в более раннем возрасте, чем пациенты с ТХБП без аллелей риска. В среднем пациенты с двумя аллелями риска начинают диализ примерно на 10 лет раньше, чем пациенты с ТХБП без вариантов риска. [ 23 ] [ 25 ] Средний возраст начала диализа у афроамериканских пациентов с ТХБП с двумя аллелями риска, одним аллелем риска или отсутствием аллелей риска составляет примерно 48 лет, 53 года и 58 лет соответственно. [ 23 ] [ 25 ] По сравнению с афроамериканскими пациентами с ТХБП, латиноамериканские пациенты с ТХБП с двумя вариантами риска APOL1 начинают диализ в более раннем возрасте - 41 год.

Хотя при одном аллеле риска возраст начала диализа более ранний, этот эффект наблюдается только у пациентов с вариантом G1. В исследовании ~ 96% пациентов с двумя аллелями риска начали диализ в возрасте до 75 лет по сравнению с 94% для гетерозигот G1 и 84% для пациентов без аллелей риска. [ 23 ]

В почках доноров, содержащих два варианта APOL1, происходит отторжение аллотрансплантата быстрее, чем у доноров с вариантами 0 или 1. [ 26 ] Реципиенты почек, которые имеют копии вариантов риска APOL1, но не получают почки от доноров с вариантами риска, не имеют снижения показателей выживаемости донорских почек. [ 27 ] В совокупности эти наблюдения позволяют предположить, что генотип донора влияет только на выживаемость аллотрансплантата.

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100342 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ Дюшато П.Н., Пуллинджер Ч.Р., Орельяна Р.Э., Кунитаке С.Т., Ная-Винь Дж., О'Коннор П.М. и др. (октябрь 1997 г.). «Аполипопротеин L, новый человеческий аполипопротеин липопротеина высокой плотности, экспрессируемый поджелудочной железой. Идентификация, клонирование, характеристика и распределение аполипопротеина L в плазме» . Журнал биологической химии . 272 (41): 25576–82. дои : 10.1074/jbc.272.41.25576 . ПМИД   9325276 .
  4. ^ Перейти обратно: а б Пейдж Н.М., Батлин Д.Д., Ломтайсонг К., Лоури П.Дж. (май 2001 г.). «Кластер генов аполипопротеина L человека: идентификация, классификация и места распространения». Геномика . 74 (1): 71–8. дои : 10.1006/geno.2001.6534 . ПМИД   11374903 .
  5. ^ Перейти обратно: а б Перес-Морга Д., Ванхоллебеке Б., Патурио-Ханок Ф., Нолан Д.П., Линс Л., Хомбле Ф. и др. (июль 2005 г.). «Аполипопротеин LI способствует лизису трипаносом, образуя поры в лизосомальных мембранах». Наука . 309 (5733): 469–72. Бибкод : 2005Sci...309..469P . дои : 10.1126/science.1114566 . ПМИД   16020735 . S2CID   33189804 .
  6. ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтреза: аполипопротеин L APOL1, 1» .
  7. ^ Перейти обратно: а б Монаджеми Х., Фонтейн Р.Д., Паннекук Х., Хорревоец А.Дж. (апрель 2002 г.). «Кластер генов аполипопротеина L появился недавно в эволюции и экспрессируется в сосудистой ткани человека». Геномика . 79 (4): 539–46. дои : 10.1006/geno.2002.6729 . ПМИД   11944986 .
  8. ^ Поелворде П., Ванхамм Л., Ван Ден Аббиле Дж., Свитцер В.М., Пэйс Э. (март 2004 г.). «Распределение аполипопротеина LI и литической активности трипаносом среди сывороток приматов». Молекулярная и биохимическая паразитология . 134 (1): 155–7. doi : 10.1016/j.molbiopara.2003.11.006 . ПМИД   14747153 .
  9. ^ Дюшато П.Н., Пуллинджер Ч.Р., Чо М.Х., Энг С., Кейн Дж.П. (апрель 2001 г.). «Семейство генов аполипопротеина L: тканеспецифическая экспрессия, сплайсинг, промоторные области; открытие нового гена» . Журнал исследований липидов . 42 (4): 620–30. дои : 10.1016/S0022-2275(20)31171-8 . ПМИД   11290834 .
  10. ^ Дженовезе Дж., Фридман Дж., Росс М.Д., Лекордье Л., Узуро П., Фридман Б.И. и др. (август 2010 г.). «Связь трипанолитических вариантов ApoL1 с заболеванием почек у афроамериканцев» . Наука . 329 (5993): 841–845. Бибкод : 2010Sci...329..841G . дои : 10.1126/science.1193032 . ПМЦ   2980843 . ПМИД   20647424 .
  11. ^ Мадхаван С.М., О'Тул Дж.Ф., Конечковски М., Ганесан С., Брюггеман Л.А., Седор Дж.Р. (ноябрь 2011 г.). «Локализация APOL1 при нормальных и недиабетических заболеваниях почек» . Журнал Американского общества нефрологов . 22 (11): 2119–28. дои : 10.1681/ASN.2011010069 . ПМК   3231786 . ПМИД   21997392 .
  12. ^ Перейти обратно: а б Рэпер Дж., Фунг Р., Гисо Дж., Нуссенцвейг В., Томлинсон С. (апрель 1999 г.). «Характеристика нового литического фактора трипаносом из сыворотки человека» . Инфекция и иммунитет . 67 (4): 1910–6. дои : 10.1128/IAI.67.4.1910-1916.1999 . ПМК   96545 . ПМИД   10085035 .
  13. ^ Томсон Р., Финкельштейн А (март 2015 г.). «Человеческий трипанолитический фактор APOL1 образует pH-зависимые катион-селективные каналы в плоских липидных бислоях: значение для лизиса трипаносом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (9): 2894–9. Бибкод : 2015PNAS..112.2894T . дои : 10.1073/pnas.1421953112 . ПМЦ   4352821 . ПМИД   25730870 .
  14. ^ Перейти обратно: а б Ван Г, Чжаоригету С, Лю З, Кайни Р, Цзян З, Ху Калифорния (август 2008 г.). «Аполипопротеин L1, новый белок, гомологичный домену Bcl-2, связывающий только липиды 3, индуцирует аутофагическую гибель клеток» . Журнал биологической химии . 283 (31): 21540–9. дои : 10.1074/jbc.M800214200 . ПМК   2490785 . ПМИД   18505729 .
  15. ^ Ванхамм Л., Патурио-Ханок Ф., Пулворде П., Нолан Д.П., Линс Л., Ван Ден Аббиле Дж. и др. (март 2003 г.). «Аполипопротеин LI является литическим фактором трипаносом сыворотки человека». Природа . 422 (6927): 83–7. Бибкод : 2003Natur.422...83V . дои : 10.1038/nature01461 . ПМИД   12621437 . S2CID   4310920 .
  16. ^ Перейти обратно: а б с д Дженовезе Дж., Фридман Дж., Росс М.Д., Лекордье Л., Узуро П., Фридман Б.И. и др. (август 2010 г.). «Связь трипанолитических вариантов ApoL1 с заболеванием почек у афроамериканцев» . Наука . 329 (5993): 841–845. Бибкод : 2010Sci...329..841G . дои : 10.1126/science.1193032 . ПМЦ   2980843 . ПМИД   20647424 .
  17. ^ Томсон Р., Дженовезе Г., Кэнон С., Ковачич Д., Хиггинс М.К., Кэррингтон М. и др. (май 2014 г.). «Эволюция трипанолитического фактора APOL1 приматов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (20): Е2130–Е2139. Бибкод : 2014PNAS..111E2130T . дои : 10.1073/pnas.1400699111 . ПМК   4034216 . ПМИД   24808134 .
  18. ^ Цур С., Россет С., Шемер Р., Юдковский Г., Селиг С., Тарекегн А. и др. (сентябрь 2010 г.). «Миссенс-мутации в гене APOL1 тесно связаны с риском терминальной стадии заболевания почек, ранее приписываемым гену MYH9» . Генетика человека . 128 (3): 345–50. дои : 10.1007/s00439-010-0861-0 . ПМЦ   2921485 . ПМИД   20635188 .
  19. ^ Бехар Д.М., Шлаш Л.И., Маор С., Лорбер М., Скорецки К. (январь 2006 г.). «Отсутствие ВИЧ-ассоциированной нефропатии у эфиопов». Американский журнал заболеваний почек . 47 (1): 88–94. дои : 10.1053/j.ajkd.2005.09.023 . ПМИД   16377389 .
  20. ^ Россет С., Цур С., Бехар Д.М., Вассер В.Г., Скорецки К. (июнь 2011 г.). «Популяционная генетика хронической болезни почек: данные локуса MYH9-APOL1». Обзоры природы. Нефрология . 7 (6): 313–26. дои : 10.1038/nrneph.2011.52 . ПМИД   21537348 . S2CID   23728209 .
  21. ^ Фридман Б.И., Лангефельд К.Д., Лу Л., Дайверс Дж., Комо М.Э., Копп Дж.Б. и др. (июнь 2011 г.). «Дифференциальное влияние вариантов риска MYH9 и APOL1 на ассоциацию FRMD3 с диабетической ТПН у афроамериканцев» . ПЛОС Генетика . 7 (6): е1002150. дои : 10.1371/journal.pgen.1002150 . ПМК   3116917 . ПМИД   21698141 .
  22. ^ Перейти обратно: а б с д Копп Дж.Б., Нельсон Г.В., Сампат К., Джонсон Р.К., Дженовезе Дж., Ан П. и др. (ноябрь 2011 г.). «Генетические варианты APOL1 при фокально-сегментарном гломерулосклерозе и ВИЧ-ассоциированной нефропатии» . Журнал Американского общества нефрологов . 22 (11): 2129–37. дои : 10.1681/ASN.2011040388 . ПМЦ   3231787 . ПМИД   21997394 .
  23. ^ Перейти обратно: а б с д Цур С., Россет С., Скорецки К., Вассер В.Г. (апрель 2012 г.). «Аллельные варианты APOL1 связаны с более низким возрастом начала диализа и, следовательно, увеличением продолжительности диализа у афро- и латиноамериканцев с недиабетической терминальной стадией заболевания почек» . Нефрология, Диализ, Трансплантация . 27 (4): 1498–505. дои : 10.1093/ndt/gfr796 . ПМИД   22357707 .
  24. ^ Фридман Б.И., Лангефельд С.Д., Тернер Дж., Нуньес М., Хай К.П., Спейнхур М. и др. (октябрь 2012 г.). «Ассоциация вариантов APOL1 с легким заболеванием почек у родственников первой степени родства афроамериканских пациентов с недиабетической терминальной стадией заболевания почек» . Почки Интернешнл . 82 (7): 805–11. дои : 10.1038/ki.2012.217 . ПМЦ   3443536 . ПМИД   22695330 .
  25. ^ Перейти обратно: а б Канджи З., Пау С.Э., Венгер Дж.Б., Хуанг С., Анкерс Э., Салливан Д.А. и др. (ноябрь 2011 г.). «Генетические вариации APOL1 связаны с более молодым возрастом начала гемодиализа» . Журнал Американского общества нефрологов . 22 (11): 2091–7. дои : 10.1681/ASN.2010121234 . ПМК   3231784 . ПМИД   21997398 .
  26. ^ Ривз-Дэниел А.М., ДеПальма Дж.А., Блейер А.Дж., Рокко М.В., Муреа М., Адамс П.Л. и др. (май 2011 г.). «Ген APOL1 и выживаемость аллотрансплантата после трансплантации почки» . Американский журнал трансплантологии . 11 (5): 1025–30. дои : 10.1111/j.1600-6143.2011.03513.x . ПМК   3083491 . ПМИД   21486385 .
  27. ^ Ли Б.Т., Кумар В., Уильямс Т.А., Абди Р., Бернхарди А., Дайер С. и др. (июль 2012 г.). «Генотип APOL1 афроамериканских реципиентов почки не влияет на 5-летнюю выживаемость аллотрансплантата» . Американский журнал трансплантологии . 12 (7): 1924–8. дои : 10.1111/j.1600-6143.2012.04033.x . ПМЦ   3387301 . ПМИД   22487534 .
[ редактировать ]

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 91a031cc617f41c5ced38b557191eca4__1719894420
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/91/a4/91a031cc617f41c5ced38b557191eca4.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Apolipoprotein L1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)