Калуменин

Дюйм
Идентификаторы
Псевдонимы	CALUКурс
Внешние идентификаторы	Омим : 603420 ; MGI : 1097158 ; Гомологен : 936 ; GeneCards : Calu ; Ома : Калу - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 7 (human) Band 7q32.1 Start 128,739,292 bp End 128,773,400 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 6 (mouse) Band 6|6 A3.3 Start 29,348,068 bp End 29,377,109 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in stromal cell of endometrium smooth muscle tissue tendon of biceps brachii thoracic aorta ascending aorta right coronary artery Achilles tendon Descending thoracic aorta left coronary artery popliteal artery Top expressed in gastrula calvaria dermis efferent ductule molar stroma of bone marrow belly cord body of femur atrium Gonadal ridge More reference expression data BioGPS More reference expression data
showДжин Онтология Molecular function calcium ion binding metal ion binding protein binding Cellular component Golgi apparatus endoplasmic reticulum membrane membrane melanosome sarcoplasmic reticulum extracellular region endoplasmic reticulum sarcoplasmic reticulum lumen endoplasmic reticulum lumen Biological process post-translational protein modification biological process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 813 12321 Набор ENSG00000128595 Ensmusg00000029767 Uniprot O43852 O35887 Refseq (мРНК) showNM_001130674 NM_001199671 NM_001199672 NM_001199673 NM_001199674 NM_001219 NM_001285412 NM_007594 NM_184053 Refseq (белок) NP_001124146 NP_001186600 NP_001186601 NP_001186602 NP_001210 NP_001272341 NP_031620 NP_908942 Расположение (UCSC) Chr 7: 128,74 - 128,77 МБ CHR 6: 29,35 - 29,38 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Калуменин - это белок , который у людей кодируется калу геном .

Калуменин (CALU) представляет собой кальций-связывающий белок, локализованный в эндоплазматическом ретикулуме (ER), и участвует в таких функциях ER, как белка сворачивание и сортировку . Калуменин является членом суперсемейства EF-Hand в аппарате ER и Golgi по имени Cerc. Cerc является аббревиатурой для членов семьи Cab-45, ретикулокальбин , ERC-55 ( RCN2 ) и калуменина. Ген Calu кодирует выведенный белок 315-аминокислот, содержащий 6 мотивов EF-руки, 1 потенциальный сайт N-гликозилирования и сигнал удержания C-концевого ER. Белки калу человека и мыши и идентичны на 98%. МРНК CALU повсеместно экспрессируется в тканях человека и карты до 7Q32.

Внешние ссылки

• человека Местоположение генома и страница детали генов Calu в браузере UCSC Genome .

Дальнейшее чтение

• Yabe D, Nakamura T, Kanazawa N, et al. (1997). «Калуменин, Ca2+-связывающий белок, удерживаемый в эндоплазматической ретикулуме с новой карбоксиловой терминальной последовательности, HDEF» . Дж. Биол. Химический ​ 272 (29): 18232–9. doi : 10.1074/jbc.272.29.18232 . PMID   9218460 .
• Vorum H, Liu X, Madsen P, et al. (1998). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей человеческий калуменин, экспрессия в Escherichia coli и анализ его активности Ca2+-связывающей». Биохим. Биофиз. Акт . 1386 (1): 121–31. doi : 10.1016/s0167-4838 (98) 00089-2 . PMID   9675259 .
• Hseu MJ, Yen CH, Tzeng MC (1999). «Крокалбин: новый кальцийсвязывающий белок, который также является связывающим белком для кротоксина, нейротоксической фосфолипазы А2» . Фебс Летт . 445 (2–3): 440–4. doi : 10.1016/s0014-5793 (99) 00177-5 . PMID   10094503 . S2CID   40129100 .
• Vorum H, Hager H, Christensen BM, et al. (1999). «Человеческий калуменин локализуется в секреторном пути и секретируется среды». Эксплуат Ячейка . 248 (2): 473–81. doi : 10.1006/excr.1999.4431 . PMID   10222138 .
• Vorum H, Jacobsen C, Honoré B (2000). «Калуменин взаимодействует с сывороточным амилоидным компонентом P». Фебс Летт . 465 (2–3): 129–34. doi : 10.1016/s0014-5793 (99) 01734-2 . PMID   10631319 . S2CID   1943508 .
• Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Геном Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC   310948 . PMID   11076863 .
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «На пути к каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC   311072 . PMID   11230166 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC   139241 . PMID   12477932 .
• Basrur V, Yang F, Kushimoto T, et al. (2003). «Протеомный анализ ранних меланосом: идентификация новых меланосомных белков». J. Proteome Res . 2 (1): 69–79. doi : 10.1021/pr0255562r . PMID   12643545 .
• Gevaert K, Goethals M, Martens L, et al. (2004). «Изучение протеомов и анализ обработки белка с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». НАТ Биотехнол . 21 (5): 566–9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID   12665801 . S2CID   23783563 .
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald Jr, et al. (2003). «Человеческая хромосома 7: последовательность ДНК и биология» . Наука . 300 (5620): 767–72. Bibcode : 2003sci ... 300..767S . doi : 10.1126/science.1083423 . PMC   2882961 . PMID   12690205 .
• Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID   14702039 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC   528928 . PMID   15489334 .
• Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). «От Orfeome до биологии: функциональный конвейер геномики» . Геном Res . 14 (10b): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC   528930 . PMID   15489336 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). «На пути к масштабе протеома карты взаимодействия белкового белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005natur.437.1173r . doi : 10.1038/nature04209 . PMID   16189514 . S2CID   4427026 .
• Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). «Последовательность сигнала и ловушка ключевых слов в Silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго» . ДНК Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID   16303743 .
• Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). «База данных LIFEDB в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Res . 34 (проблема базы данных): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC   1347501 . PMID   16381901 .
• Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). «Основанный на вероятности подход для высокопроизводительного анализа фосфорилирования белка и локализации сайта». НАТ Биотехнол . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID   16964243 . S2CID   14294292 .
• Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, et al. (2007). «Протеомная и биоинформатическая характеристика биогенеза и функции меланосом». J. Proteome Res . 5 (11): 3135–44. doi : 10.1021/pr060363j . PMID   17081065 .