ДДХ10

ДДХ10
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2PL3
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX10 , HRH-J8, геликаза DEAD-box 10, Dbp4
Внешние идентификаторы	Опустить : 601235 ; МГИ : 1924841 ; Гомологен : 20922 ; Генные карты : DDX10 ; ОМА : DDX10 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11q22.3 Start 108,665,058 bp End 108,940,999 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 9 (mouse) Band 9|9 A5.3 Start 53,009,935 bp End 53,159,353 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in sural nerve testicle Achilles tendon right testis left testis gonad ganglionic eminence ventricular zone kidney tubule left uterine tube Top expressed in tail of embryo otic placode saccule genital tubercle Gonadal ridge epiblast primitive streak otic vesicle hair follicle maxillary prominence More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function RNA helicase activity nucleotide binding hydrolase activity ATP binding helicase activity nucleic acid binding RNA binding Cellular component nucleolus cytoplasm Biological process RNA secondary structure unwinding anterior head development Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 1662 77591 Вместе ENSG00000178105 ENSMUSG00000053289 ЮниПрот Q13206 Q80Y44 RefSeq (мРНК) НМ_004398 НМ_029936 RefSeq (белок) НП_004389 НП_084212 Местоположение (UCSC) Чр 11: 108,67 – 108,94 Мб Чр 9: 53.01 – 53.16 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX10 представляет собой фермент , который у человека кодируется DDX10 геном .

Белки DEAD-бокса , характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), представляют собой предполагаемые РНК-хеликазы. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК , таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также сборка рибосом и сплайсосом . Судя по характеру распределения, некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенезе , сперматогенезе , а также росте и делении клеток . Этот ген кодирует белок DEAD-бокса и может участвовать в сборке рибосомы. Слияние этого гена и нуклеопорина гена NUP98 инверсии 11 (p15q22) путем транслокации хромосомы обнаружено у пациентов с de novo или миелоидными злокачественными новообразованиями, связанными с терапией.

Дальнейшее чтение

• Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД   17081983 . S2CID   7827573 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Ван С.К., Лиен Х.К., Ся В. и др. (2004). «Связывание и трансактивация промотора ЦОГ-2 ядерным тирозинкиназным рецептором ErbB-2» . Раковая клетка . 6 (3): 251–61. дои : 10.1016/j.ccr.2004.07.012 . ПМИД   15380516 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Курс. Биол . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД   11790298 . S2CID   14132033 .
• Накао К., Нишино М., Такеучи К. и др. (2000). «Слияние гена нуклеопорина, NUP98, и предполагаемого гена РНК-хеликазы, DDX10, путем транслокации хромосомы инверсии 11 (p15q22) у пациента с миелодиспластическим синдромом, связанным с этопозидом» . Стажер. Мед . 39 (5): 412–5. doi : 10.2169/internalmedicine.39.412 . ПМИД   10830185 .
• Зубер Дж., Черница О.И., Хинцманн Б. и др. (2000). «Полногеномное исследование целей трансформации РАС». Нат. Жене . 24 (2): 144–52. дои : 10.1038/72799 . ПМИД   10655059 . S2CID   21887748 .
• Икеда Т., Икеда К., Сасаки К. и др. (1999). «Хромосомная транслокация inv (11) (p15q22) при миелодисплазии, связанной с терапией, со слитыми транскриптами NUP98-DDX10 и DDX10-NUP98». Межд. Дж. Гематол . 69 (3): 160–4. ПМИД   10222653 .
• Лян В.К., Кларк Дж.А., Фурнье М.Дж. (1997). «Функция обработки рРНК малой ядрышковой РНК дрожжей U14 может быть восстановлена ​​с помощью консервативного белка, подобного РНК-хеликазе» . Мол. Клетка. Биол . 17 (7): 4124–32. дои : 10.1128/mcb.17.7.4124 . ПМК   232266 . ПМИД   9199348 .
• Арай Ю., Хосода Ф., Кобаяши Х. и др. (1997). «Транслокация хромосомы inv(11)(p15q22) de novo и связанных с терапией миелоидных злокачественных новообразований приводит к слиянию гена нуклеопорина, NUP98, с предполагаемым геном РНК-хеликазы, DDX10» . Кровь . 89 (11): 3936–44. дои : 10.1182/blood.V89.11.3936 . ПМИД   9166830 .