ЖМО7

ЖМО7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EAQ
Идентификаторы
Псевдонимы	LMO7 , FBX20, FBXO20, LOMP, домен LIM 7, LMO7b
Внешние идентификаторы	Опустить : 604362 ; МГИ : 1353586 ; Гомологен : 83924 ; Генные карты : LMO7 ; ОМА : LMO7 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	75,859,870 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	101,934,710 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; apex of heart; ; right lung; ; upper lobe of left lung; ; right auricle; ; Achilles tendon; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; Ileal epithelium; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; primary oocyte; ; corneal stroma; ; interventricular septum; ; left lung lobe; ; conjunctival fornix; ; right lung lobe;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; DNA-binding transcription factor activity;
Cellular component	cytoplasm; ubiquitin ligase complex; nucleus; focal adhesion; cytosol; nuclear envelope; cell surface; apical plasma membrane;
Biological process	regulation of cell adhesion; protein ubiquitination; regulation of signaling; protein polyubiquitination; post-translational protein modification; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4008
	380928
	ENSG00000136153
	ENSMUSG00000033060
	Q8WWI1
	н/д
	НМ_001306080 ; НМ_005358 ; НМ_015842 ; НМ_015843 ; НМ_001330583
	НМ_201529 ; НМ_001347628
showНП_001293009 ; НП_001317512 ; НП_005349 ; НП_056667 ; НП_001353561 ;
	NP_001353562; NP_001353563; NP_001353565; NP_001293009.1
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 7 только домена LIM представляет собой белок , который у человека кодируется LMO7 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует белок, содержащий домен гомологии кальпонина (CH), домен PDZ и домен LIM . Домен F-box (FBX) присутствует в альтернативных вариантах сплайсинга. Члены семейства белков LIM несут домен LIM, уникальный богатый цистеином цинк-связывающий домен. Члены семейства белков FBX участвуют в белок-белковых взаимодействиях. Кодируемый белок может участвовать в белок-белковых взаимодействиях. Описано множество альтернативных вариантов сплайсинга, но их полноразмерные последовательности не определены. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136153 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033060 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Путилина Т., Яворски Дж., Джентльмен С., Макдональд Б., Кадири М., Вонг П. (декабрь 1998 г.). «Анализ кДНК человека, содержащей тканеспецифичный альтернативно сплайсированный домен LIM» . Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 252 (2): 433–9. дои : 10.1006/bbrc.1998.9656 . ПМИД 9826547 .
^ Сенчарелли К., Чиаур Д.С., Гуардаваккаро Д., Паркс В., Видал М., Пагано М. (декабрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Курр Биол . 9 (20): 1177–9. Бибкод : 1999CBio....9.1177C . дои : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . ПМИД 10531035 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: LMO7 LIM-домен 7» .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х. и др. (2003). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA» . ДНК Рез . 9 (3): 99–106. дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (6): 355–64. дои : 10.1093/dnares/5.6.355 . ПМИД 10048485 .
Розенблюм Э., Вахтеристо П., Сандберг Т. и др. (2002). «Геномная карта области размером 6 МБ в районе 13q21-q22, участвующей в развитии рака: идентификация и характеристика генов-кандидатов» . Хм. Жене . 110 (2): 111–21. дои : 10.1007/s00439-001-0646-6 . ПМИД 11935316 . S2CID 21371347 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Бензингер А., Мустер Н., Кох Х.Б. и др. (2005). «Целевой протеомный анализ сигмы 14-3-3, эффектора p53, который обычно подавляется при раке» . Мол. Клетка. Протеомика . 4 (6): 785–95. дои : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . ПМИД 15778465 .
Ким Дж., Бхинг А.А., Морган XC, Айер В.Р. (2005). «Картирование ДНК-белковых взаимодействий в больших геномах с помощью анализа последовательностей геномного обогащения». Нат. Методы . 2 (1): 47–53. дои : 10.1038/nmeth726 . ПМИД 15782160 . S2CID 6135437 .
Ким Дж.Э., Танненбаум С.Р., White FM (2005). «Глобальный фосфопротеом клеток аденокарциномы толстой кишки человека HT-29». J. Протеом Рез . 4 (4): 1339–46. дои : 10.1021/pr050048h . ПМИД 16083285 .
Ивабути К., Канеко Т., Кикуяма М. (2006). «Ионный механизм механовосприятия у Characeae» . Физиол растительной клетки . 46 (11): 1863–71. дои : 10.1093/pcp/pci204 . ПМИД 16192285 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
Холаска Дж. М., Раис-Бахрами С., Уилсон К. Л. (2007). «Lmo7 представляет собой белок, связывающий эмерин, который регулирует транскрипцию эмерина и многих других генов, связанных с мышцами» . Хм. Мол. Жене . 15 (23): 3459–72. дои : 10.1093/hmg/ddl423 . ПМИД 17067998 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 13 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136153 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033060 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9826547-5] Путилина Т., Яворски Дж., Джентльмен С., Макдональд Б., Кадири М., Вонг П. (декабрь 1998 г.). «Анализ кДНК человека, содержащей тканеспецифичный альтернативно сплайсированный домен LIM» . Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 252 (2): 433–9. дои : 10.1006/bbrc.1998.9656 . ПМИД 9826547 .

[pmid10531035-6] Сенчарелли К., Чиаур Д.С., Гуардаваккаро Д., Паркс В., Видал М., Пагано М. (декабрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков F-бокса человека» . Курр Биол . 9 (20): 1177–9. Бибкод : 1999CBio....9.1177C . дои : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . ПМИД 10531035 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: LMO7 LIM-домен 7» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]