ПДКД6

ПДКД6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2ZN8, 2ZN9, 2ZND, 2ZNE, 2ZRS, 2ZRT, 3AAJ, 3AAK, 3WXA
Идентификаторы
Псевдонимы	PDCD6 , ALG-2, PEF1B, ALG2, запрограммированная гибель клеток 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 601057 ; МГИ : 109283 ; Гомологен : 7880 ; GeneCards : PDCD6 ; OMA : PDCD6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	314,974 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	74,465,699 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; mucosa of transverse colon; ; right adrenal cortex; ; prefrontal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; rectum; ; Brodmann area 9; ; gonad; ; anterior pituitary;
	Top expressed in
	jejunum; ; duodenum; ; ileum; ; epithelium of small intestine; ; right kidney; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; Epithelium of choroid plexus; ; vestibular sensory epithelium; ; endocardial cushion; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein dimerization activity; protein-membrane adaptor activity; calcium-dependent protein binding; metal ion binding; calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; protein binding; identical protein binding; molecular adaptor activity; magnesium ion binding; calcium ion binding; protein homodimerization activity; protein-macromolecule adaptor activity;
Cellular component	cytoplasm; endosome; endoplasmic reticulum membrane; membrane; endoplasmic reticulum; extracellular exosome; nucleus; Golgi membrane; COPII vesicle coat; Cul3-RING ubiquitin ligase complex; endoplasmic reticulum exit site; ER to Golgi transport vesicle membrane; cytoplasmic vesicle;
Biological process	negative regulation of protein kinase B signaling; cellular response to heat; vascular endothelial growth factor receptor-2 signaling pathway; positive regulation of endothelial cell proliferation; negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; positive regulation of angiogenesis; positive regulation of endothelial cell migration; response to calcium ion; negative regulation of TOR signaling; positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; angiogenesis; apoptotic signaling pathway; intracellular protein transport; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; apoptotic process; proteolysis; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; neural crest formation; neural crest cell development; COPII vesicle coating; positive regulation of protein monoubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10016
	18570
	ENSG00000249915
	ENSMUSG00000021576
	О75340
	P12815
	НМ_001267556 ; НМ_001267557 ; НМ_001267558 ; НМ_001267559 ; НМ_013232
	НМ_011051 ; НМ_001359996
	НП_001254485 ; НП_001254486 ; НП_001254487 ; НП_001254488 ; НП_037364
	НП_035181 ; НП_001346925
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 6 программируемой клеточной смерти — это белок , который у человека кодируется PDCD6 геном . ^{[ 5 ]}

Этот ген кодирует кальций-связывающий белок, принадлежащий к семейству белков пента-EF-hand. Связывание кальция важно для гомодимеризации и конформационных изменений, необходимых для связывания с другими белками-партнерами. Этот генный продукт участвует в запрограммированной гибели клеток, индуцированной Т-клеточными рецепторами, Fas- и глюкокортикоидами. Однако у мышей с дефицитом этого генного продукта апоптоз не блокировался, что позволяет предположить, что этот генный продукт функционально избыточен. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PDCD6 взаимодействует с ASK1 . ^{[ 7 ]} PDCD6IP , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Фас-рецептор , ^{[ 10 ]} ANXA11 ^{[ 9 ]} и ПЭФ1 . ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000249915 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021576 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Вито П., Лакана Э., Д'Адамио Л. (февраль 1996 г.). «Вмешательство в апоптоз: Са(2+)-связывающий белок ALG-2 и ген болезни Альцгеймера ALG-3» . Наука . 271 (5248): 521–5. Бибкод : 1996Sci...271..521V . дои : 10.1126/science.271.5248.521 . ПМИД 8560270 . S2CID 22286752 .
^ «Ген Энтрез: гибель клеток, запрограммированная PDCD6 6» .
^ Хван, Ин-Сик; Юнг Ён-Сэм; Ким Ынхи (октябрь 2002 г.). «Взаимодействие ALG-2 с ASK1 влияет на локализацию ASK1 и последующую активацию JNK». ФЭБС Летт . 529 (2–3). Нидерланды: 183–7. Бибкод : 2002FEBSL.529..183H . дои : 10.1016/S0014-5793(02)03329-X . ISSN 0014-5793 . ПМИД 12372597 . S2CID 9264865 .
^ Вито, П; Пеллегрини Л; Гийет С; Д'Адамио Л. (январь 1999 г.). «Клонирование AIP1, нового белка, который связывается с связанным с апоптозом геном ALG-2 в Ca2+-зависимой реакции» . Ж. Биол. Хим . 274 (3). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 1533–1540 гг. дои : 10.1074/jbc.274.3.1533 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9880530 .
^ Jump up to: ^а ^б Сато, Хирокадзу; Сибата Хидеки; Накано Ёшими; Китаура Ясуюки; Маки Масатоши (март 2002 г.). «ALG-2 взаимодействует с аминоконцевым доменом аннексина XI Ca(2+)-зависимым образом». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 291 (5). США: 1166–72. дои : 10.1006/bbrc.2002.6600 . ISSN 0006-291X . ПМИД 11883939 .
^ Юнг, Ю.С.; Ким КС; Ким К.Д.; Лим Дж.С.; Ким Дж.В.; Ким Э (октябрь 2001 г.). «Связанный с апоптозом ген 2 связывается с доменом смерти Fas и диссоциирует от Fas во время Fas-опосредованного апоптоза в клетках Jurkat». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 288 (2). США: 420–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5769 . ISSN 0006-291X . ПМИД 11606059 .
^ Китаура, Ю; Мацумото С; Сато Х; Хитоми К; Маки М (апрель 2001 г.). «Пефлин и ALG-2, члены семейства белков пента-EF-hand, образуют гетеродимер, который диссоциирует Ca2+-зависимым образом» . Ж. Биол. Хим . 276 (17). США: 14053–8. дои : 10.1074/jbc.M008649200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11278427 .

Дальнейшее чтение

Кребс Дж., Клеменц Р. (2001). «Комплекс ALG-2/AIP, модулятор на стыке между пролиферацией клеток и их гибелью? Гипотеза». Биохим. Биофиз. Акта . 1498 (2–3): 153–61. дои : 10.1016/S0167-4889(00)00091-4 . ПМИД 11108958 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки И., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Вито П., Пеллегрини Л., Гие С., Д'Адамио Л. (1999). «Клонирование AIP1, нового белка, который связывается с связанным с апоптозом геном ALG-2 в Ca2+-зависимой реакции» . Ж. Биол. Хим . 274 (3): 1533–40. дои : 10.1074/jbc.274.3.1533 . ПМИД 9880530 .
Тарабыкина С., Мёллер А.Л., Дюруссель И. и др. (2000). «Две формы связанного с апоптозом белка ALG-2 с разным сродством к Ca (2+) и распознаванием мишени» . Ж. Биол. Хим . 275 (14): 10514–8. дои : 10.1074/jbc.275.14.10514 . ПМИД 10744743 .
Чен Б., Боринштейн С.С., Гиллис Дж. и др. (2000). «Связанный с глиомой белок SETA взаимодействует с AIP1/Alix и ALG-2 и модулирует апоптоз в астроцитах» . Ж. Биол. Хим . 275 (25): 19275–81. дои : 10.1074/jbc.M908994199 . ПМИД 10858458 .
Китаура Ю., Мацумото С., Сато Х. и др. (2001). «Пефлин и ALG-2, члены семейства белков пента-EF-hand, образуют гетеродимер, который диссоциирует Ca2+-зависимым образом» . Ж. Биол. Хим . 276 (17): 14053–8. дои : 10.1074/jbc.M008649200 . ПМИД 11278427 .
Сузуки Х., Фукуниси Ю., Кагава И. и др. (2001). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши» . Геном Рез . 11 (10): 1758–65. дои : 10.1101/гр.180101 . ПМК 311163 . ПМИД 11591653 .
Юнг Ю.С., Ким К.С., Ким К.Д. и др. (2001). «Связанный с апоптозом ген 2 связывается с доменом смерти Fas и диссоциирует от Fas во время Fas-опосредованного апоптоза в клетках Jurkat». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 288 (2): 420–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5769 . ПМИД 11606059 .
Китаура Ю., Сато Х., Такахаши Х. и др. (2002). «И ALG-2, и пефлин, белки пента-EF-руки (PEF), стабилизируются путем димеризации через их пятую область EF-руки». Арх. Биохим. Биофиз . 399 (1): 12–8. дои : 10.1006/abbi.2001.2736 . ПМИД 11883899 .
Сато Х., Сибата Х., Накано Ю. и др. (2002). «ALG-2 взаимодействует с аминоконцевым доменом аннексина XI Ca(2+)-зависимым образом». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 291 (5): 1166–72. дои : 10.1006/bbrc.2002.6600 . ПМИД 11883939 .
Шателлар-Косс С., Блот Б., Кристина Н. и др. (2002). «Аликс (белок X, взаимодействующий с ALG-2), белок, участвующий в апоптозе, связывается с эндофилинами и индуцирует цитоплазматическую вакуолизацию» . Ж. Биол. Хим . 277 (32): 29108–15. дои : 10.1074/jbc.M204019200 . ПМИД 12034747 .
Хван И.С., Юнг Ю.С., Ким Э (2002). «Взаимодействие ALG-2 с ASK1 влияет на локализацию ASK1 и последующую активацию JNK». ФЭБС Летт . 529 (2–3): 183–7. Бибкод : 2002FEBSL.529..183H . дои : 10.1016/S0014-5793(02)03329-X . ПМИД 12372597 . S2CID 9264865 .
Сато Х., Накано Ю., Сибата Х., Маки М. (2002). «Домен пента-EF-hand ALG-2 взаимодействует с аминоконцевыми доменами как аннексина VII, так и аннексина XI Ca2+-зависимым образом». Биохим. Биофиз. Акта . 1600 (1–2): 61–7. дои : 10.1016/S1570-9639(02)00445-4 . ПМИД 12445460 .
Кребс Дж., Саремаслани П., Кадафф Р. (2002). «ALG-2: белок-модулятор, связывающий Ca2+, участвующий в пролиферации и гибели клеток». Биохим. Биофиз. Акта . 1600 (1–2): 68–73. дои : 10.1016/S1570-9639(02)00446-6 . ПМИД 12445461 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Томсиг Дж.Л., Снайдер С.Л., Крейц К.Э. (2003). «Идентификация мишеней для передачи сигналов кальция через семейство белков копина. Характеристика спирально-спирального мотива, связывающего копин» . Ж. Биол. Хим . 278 (12): 10048–54. дои : 10.1074/jbc.M212632200 . ПМИД 12522145 .
Хансен С., Тарабыкина С., Ла Кур Ж.М. и др. (2003). «Белки семейства PEF сорцин и гранкальцин взаимодействуют in vivo и in vitro». ФЭБС Летт . 545 (2–3): 151–4. Бибкод : 2003FEBSL.545..151H . дои : 10.1016/S0014-5793(03)00518-0 . ПМИД 12804766 . S2CID 42572647 .

Внешние ссылки

PDCD6 Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека PDCD6 в браузере генома UCSC .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000249915 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021576 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8560270-5] Вито П., Лакана Э., Д'Адамио Л. (февраль 1996 г.). «Вмешательство в апоптоз: Са(2+)-связывающий белок ALG-2 и ген болезни Альцгеймера ALG-3» . Наука . 271 (5248): 521–5. Бибкод : 1996Sci...271..521V . дои : 10.1126/science.271.5248.521 . ПМИД 8560270 . S2CID 22286752 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: гибель клеток, запрограммированная PDCD6 6» .

[pmid12372597-7] Хван, Ин-Сик; Юнг Ён-Сэм; Ким Ынхи (октябрь 2002 г.). «Взаимодействие ALG-2 с ASK1 влияет на локализацию ASK1 и последующую активацию JNK». ФЭБС Летт . 529 (2–3). Нидерланды: 183–7. Бибкод : 2002FEBSL.529..183H . дои : 10.1016/S0014-5793(02)03329-X . ISSN 0014-5793 . ПМИД 12372597 . S2CID 9264865 .

[pmid9880530-8] Вито, П; Пеллегрини Л; Гийет С; Д'Адамио Л. (январь 1999 г.). «Клонирование AIP1, нового белка, который связывается с связанным с апоптозом геном ALG-2 в Ca2+-зависимой реакции» . Ж. Биол. Хим . 274 (3). СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ: 1533–1540 гг. дои : 10.1074/jbc.274.3.1533 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9880530 .

[pmid11883939-9] Jump up to: ^а ^б Сато, Хирокадзу; Сибата Хидеки; Накано Ёшими; Китаура Ясуюки; Маки Масатоши (март 2002 г.). «ALG-2 взаимодействует с аминоконцевым доменом аннексина XI Ca(2+)-зависимым образом». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 291 (5). США: 1166–72. дои : 10.1006/bbrc.2002.6600 . ISSN 0006-291X . ПМИД 11883939 .

[pmid11606059-10] Юнг, Ю.С.; Ким КС; Ким К.Д.; Лим Дж.С.; Ким Дж.В.; Ким Э (октябрь 2001 г.). «Связанный с апоптозом ген 2 связывается с доменом смерти Fas и диссоциирует от Fas во время Fas-опосредованного апоптоза в клетках Jurkat». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 288 (2). США: 420–6. дои : 10.1006/bbrc.2001.5769 . ISSN 0006-291X . ПМИД 11606059 .

[pmid11278427-11] Китаура, Ю; Мацумото С; Сато Х; Хитоми К; Маки М (апрель 2001 г.). «Пефлин и ALG-2, члены семейства белков пента-EF-hand, образуют гетеродимер, который диссоциирует Ca2+-зависимым образом» . Ж. Биол. Хим . 276 (17). США: 14053–8. дои : 10.1074/jbc.M008649200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11278427 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]