ДНКПечать Геномика
 | Судя по всему, основной автор этой статьи тесно связан с ее предметом. ( Ноябрь 2021 г. ) |
 | |
| Тип компании | Общественный |
|---|---|
| Экспертный рынок : DNAG | |
| Промышленность | Геномика , Судебная медицина |
| Штаб-квартира | Сарасота, Флорида |
Ключевые люди | Ричард Габриэль (генеральный директор) Гектор Дж. Гомес , главный медицинский директор Тони Фрудакис, сооснователь и главный научный сотрудник |
| Продукты | Фармакогеномика , Геномное профилирование , Генотипирование |
| Веб-сайт | www.dnaprint.com |
DNAPrint Genomics была генетической компанией, предлагающей широкий спектр продуктов, связанных с генетическим профилированием. Они были первой компанией, представившей продукты для судебно-медицинской экспертизы и потребительской геномики, которые были разработаны сразу после публикации первого полного проекта генома человека в начале 2000-х годов. Они исследовали, разработали и продали первый в истории потребительский продукт геномики, основанный на «информативных маркерах происхождения», которые они использовали для правильного определения биогеографического происхождения (BGA) человека на основе образца его ДНК. Они также исследовали, разработали и продали первый в истории продукт судебно-медицинской геномики - DNAWITNESS, который использовался для создания физического профиля доноров ДНК с места преступления. Компания достигла пика выручки примерно в 3 миллиона долларов в год, но прекратила деятельность в феврале 2009 года. [ 1 ] [ 2 ]
Потребительские приложения
[ редактировать ]Флагманским продуктом DNAPrint Genomics был «AncestryByDNA», ДНК-тест для потребителей, который определяет процентное происхождение клиента на основе информационных маркеров предков (полиморфизмов SNP) их ДНК. AncestryByDNA был историческим продуктом, представляющим собой первый потребительский продукт в области геномики, когда-либо разработанный и продававшийся в США и, возможно, во всем мире. Он рекламировался как инструмент для личных генеалогических исследований и для усыновленных, желающих узнать больше о своей генеалогии. [ 3 ]
Криминалистические приложения
[ редактировать ]Самым противоречивым предложением DNAPrint стал «DNAWitness», продукт, который использует одни и те же информационные маркеры происхождения для судебно-медицинских целей, а также полиморфизмы человеческого гена OCA2 и других генов, чтобы сделать выводы о радужной оболочке (глазах), цвете волос и кожи. DNAPrint была первой компанией, которая исследовала и опубликовала связи между полиморфизмами OCA2 и цветом глаз человека, и объединив их с теми же информативными маркерами происхождения, которые использовались в потребительских тестах BGA для анализа с доказательствами ДНК с мест преступлений, DNAPrint Genomics смогла помочь сузить круг вопросов. подозреваемых на основе построения «созданного in-silco и основанного на базе данных» профиля физических признаков или фенотипа. [ 4 ] [ 5 ]
В 2006 году Скотланд-Ярд Лондона и столичная полиция объявили, что они будут расследовать использование DNAWitness для сужения круга подозреваемых в поисках давней попытки поймать серийного насильника, известного как Минстедский насильник . [ 6 ]
DNAWitness использовался в 2007 году, чтобы помочь сузить круг подозреваемых в расследовании убийства Пэм Кинамор в 2002 году. Хотя полицейская сеть первоначально искала белых подозреваемых, основываясь на показаниях одного из первых очевидцев, компания DNAPrint Genomics позже заключила контракт на тестирование образца ДНК и пришла к выводу, что подозреваемый имел «существенное африканское происхождение». [ 7 ] Следователи перенаправили свое расследование, чтобы сосредоточиться на лицах, подходящих под это описание, и вскоре после этого опознали Деррика Тодда Ли , который впоследствии был признан виновным в этом преступлении, а также в серии других подобных убийств в районе Батон-Руж, штат Луизиана. Это применение судебно-медицинского фенотипирования, при котором физические характеристики выводятся из ДНК на месте преступления и используются для перенаправления и помощи в раскрытии преступления, освещалось в газетах The New York Times , Wired журнале , Popular Science , US News & World Report , Sarasota Herald Tribune . Программы вечерних новостей ABC и CBS, программы новостей Австралии и Германии, а также эпизод «Файлы судебно-медицинской экспертизы», озаглавленный «Плотно подходящие гены». [ 8 ] как историческое событие.
После дела Ли этот продукт использовался в десятках других дел о серийных убийствах с успешными результатами.
Родословная по ДНК
[ редактировать ]AncestrybyDNA была изобретена доктором Тони Фрудакисом в 2002 году компанией DNAPrint Genomics. AncestrybyDNA — это онлайн-сервис тестирования ДНК для обычного человека, который определяет биогеографическое происхождение человека посредством аутосомного тестирования ДНК. [ 9 ] ДНК-тестирование — это процесс, который использует информацию ДНК для точного определения чьего-либо происхождения примерно до 10 поколений. После этого количество общей ДНК становится настолько малым, что ее становится значительно труднее идентифицировать. [ 10 ] Тестирование аутосомной ДНК — это особый тип генетического тестирования, который проводится путем изучения подмножества участков ДНК в аутосомных хромосомах (неполовых хромосомах), составляющих подавляющую часть генома. Большинство тестов аутосомной ДНК исследуют около миллиона генетических маркеров , чтобы собрать информацию о происхождении и родстве донора ДНК. Генетические маркеры — это гены или последовательности ДНК, расположение которых на хромосоме известно. Генетические маркеры и гены, расположенные близко друг к другу на хромосоме, имеют тенденцию наследоваться вместе; следовательно, генетические маркеры могут помочь идентифицировать близлежащий ген. Генетические маркеры у людей включают одиночные нуклеотиды полиморфизма ( SNP ), полиморфизмы длины рестрикционных фрагментов ( RFLP ), переменное количество тандемных повторов (VNTR ), микросателлиты и варианты числа копий ( CNV ). [ 11 ] Благодаря известному местоположению маркеры можно использовать для идентификации особей или видов, а также для определения родства между видами. Обычно эти маркеры считаются «наблюдаемыми вариациями» из-за того, что вариации могут располагаться в ДНК. [ 12 ]
Аутосомные тесты ДНК, такие как AncestrybyDNA, используются для выявления людей, с которыми донор ДНК имеет общие предки. Этот процесс включает в себя идентификацию больших, общих участков ДНК между людьми. Эти «общие фрагменты» являются индикаторами своего рода относительно недавнего совместного наследования. [ 10 ] Редко когда фрагмент ДНК сохраняется у двух людей от общего предка, жившего более десяти поколений (около 300 лет) в прошлом. За пределами десяти поколений доля предков, которые внесли непосредственный вклад в тестируемую ДНК, невероятно мала из-за событий генетического кроссинговера и присущей процессу передачи ДНК от родителя к потомству случайности. [ 10 ] Хотя общие фрагменты ДНК являются убедительными индикаторами родства, определить точный возраст предков донора ДНК за пределами четырех поколений сложно. [ 10 ] Кроме того, не существует однозначного способа определить точную связь между донором ДНК и предполагаемым предком. [ 10 ] Хотя генетическое тестирование ДНК часто дает хорошее приближение к родству со старшими предками, оно вряд ли является окончательным.
И AncestrybyDNA, и DNAPrint Genomics являются элементами более широкого разговора о генетической основе расы. В частности, предоставление информации среднестатистическому потребителю в виде процентов расового происхождения оказалось несколько вводящим в заблуждение. Несколько компаний предлагают услуги генетического тестирования, аналогичные AncestrybyDNA, например CRI Genetics, AncestryDNA (не путать с AncestrybyDNA) и 23andMe . [ 13 ] Каждая из этих компаний возвращает различные генетические результаты в виде процентов. Это происходит по нескольким причинам. Во-первых, каждая компания использует разные генетические базы данных для генетического сравнения. [ 10 ] Во-вторых, образцы ДНК, используемые в базах данных, классифицируются по-разному. [ 10 ] Наконец, каждая компания использует уникальные алгоритмы для оценки времени и приблизительной степени родства донора ДНК с его предками. [ 10 ] Количественная оценка расового состава ДНК донора ДНК предполагает, что между человеческими популяциями существуют четкие различия. [ 14 ] Проще говоря, закономерности родства — это гибкие оценки. Предполагать, что людей легко классифицировать, неверно.
Помимо проблемы процента, такие процессы генетического тестирования, как AncestrybyDNA, особенно в контексте выявления расового происхождения, связаны с увековечиванием мифа о расе . Как заявили в Национальном институте исследования генома человека,
«Раса — это изменчивое понятие, используемое для группировки людей по различным факторам, в том числе по наследственному происхождению и социальной идентичности. Раса также используется для группировки людей, которые имеют набор видимых характеристик, таких как цвет кожи и черты лица. Хотя эти видимые черты Под влиянием генов подавляющее большинство генетических вариаций существует внутри расовых групп, а не между ними. Раса — это идеология, и по этой причине многие ученые считают, что расу следует точнее описывать как социальную, а не биологическую конструкцию. [ 15 ] «В целом, раса снова и снова оказывается социальной конструкцией, а не биологическим фактом. [ 14 ]
Историческая значимость
[ редактировать ]В начале 2000-х годов под руководством основателя, а затем генерального директора Тони Н. Фрудакиса, доктора философии, DNAPrint создала зарождающийся рынок потребительской генетики/геномики и судебно-медицинского фенотипирования. В середине-конце 2000-х годов многие журналисты и ученые резко критиковали применение DNAPrint исследований геномики для потребительских и судебно-медицинских целей, но к началу 2000-х годов криминалистические приложения анализа примесей BioGeographical Ancestry (BGA) для вывода BGA и некоторых антропометрических фенотипы, такие как оттенок кожи, цвет глаз/волос, стали прочно укорениться, и к 2019 году рынок этих типов продуктов вырос до размера более 500 миллионов долларов в год. По состоянию на 2019 год различные производители капиллярного электрофореза (например, Applied Biosystems), а также платформы для секвенирования нового поколения и производители расходных материалов представили продукты для идентификации человека, сочетающие классические (соответствующие CODIS) наборы маркеров для профилирования STR с уникальными AIMS на основе SNP для определения BGA и фенотипа (например, ForenSeq из «Верогена» Illumina). Также появились различные частные и государственные лаборатории, предоставляющие услуги судебно-медицинского фенотипирования (например, Parabon Nanolabs).
В середине 2000-х годов Фрудакис написал основополагающий учебник, в котором представил применение на криминалистическом и потребительском рынке маркерных панелей, полученных из генома. [ 16 ]
В середине-конце 2000-х годов, еще до того, как компания полностью освоила эти новые рынки, хедж-фонд, поддерживающий DNAPrint, ликвидировал компанию и продал ее интеллектуальную собственность и ноу-хау компании DNA Diagnostics Company (DDC). Незадолго до ликвидации компании другие компании выпустили аналогичные продукты на потребительский рынок геномной генеалогии (например, 23andMe и Ancestry.com). К 2018 году эти компании значительно расширили сферу науки, создав еще более крупные геномные базы данных и позволив делать более тонкие и даже совершенно новые выводы. Например, в криминалистике более 70 дел о серийных убийствах (включая убийцу из Золотого штата) были раскрыты с помощью генетической генеалогии, обеспечиваемой типами потребительских геномных баз данных DNAPrint, которые были первыми, кто представил их. В этих случаях выявляются потенциальные родственники лиц, сдавших ДНК на место преступления. Благодаря генеалогии потребителей члены семьи теперь могут быть идентифицированы и воссоединены посредством сопоставления баз данных, а клиенты теперь могут точно определить даже внутриконтинентальное и региональное происхождение семьи, используя типы баз данных потребительской геномики, которые DNAPrint представила первой.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Генетический специалист по генеалогии | DNAPrint Genomics прекращает деятельность
- ^ | Ежедневные новости GenomeWeb | ГеномВеб
- ^ Гамильтон, Анита (5 июля 2005 г.). «Может ли ДНК раскрыть ваши корни?» . Время. Архивировано из оригинала 6 июля 2005 года . Проверено 5 октября 2007 г.
- ^ «Молекулярная фотоподборка: предсказание происхождения и фенотипа по ДНК» . Эльсивер Академик Пресс. 5 октября 2007 г. Архивировано из оригинала 24 сентября 2019 г. . Проверено 7 сентября 2007 г. Альтернативный URL
- ^ Человек-невидимка: Охота на серийного убийцу, которому сошло с рук десятилетие убийств . Беркли. 6 июня 2006 г. ISBN. 0425208877 .
- ^ «Ученый-геномик DNAprint провел презентацию для детективов Нью-Скотланд-Ярда» . Рыночная проволока. 5 апреля 2006 г. Проверено 5 октября 2007 г.
- ^ «Неудобная наука о профилировании расовой ДНК» . Проводной журнал. 5 октября 2007 г. Архивировано из оригинала 25 февраля 2009 г. Проверено 5 октября 2007 г.
- ^ «Файлы судебно-медицинской экспертизы, 10 сезон, 15 серия «Плотно подобранные гены» » . Судебно-медицинские файлы. 14 сентября 2005 г. Архивировано из оригинала 6 ноября 2019 г. Проверено 14 сентября 2005 г.
- ^ «AncestrybyDNA — ISOGG Wiki» . isogg.org . Проверено 11 мая 2022 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час ЛЧ (13 февраля 2019 г.). «Понимание генетического тестирования предков» . Отделение биологических наук UCL . Проверено 11 мая 2022 г.
- ^ www.cancer.gov . 20 июля 2012 г. https://www.cancer.gov/publications/dictionaries/genetics-dictionary/def/genetic-marker . Проверено 11 мая 2022 г.
{{cite web}}: Отсутствует или пусто|title=( помощь ) - ^ «Генетический маркер» , Arc.Ask3.Ru , 17 марта 2022 г. , получено 11 мая 2022 г.
- ^ «Бесплатный обзор тестов ДНК на происхождение | Генетический дайджест» . сайт GeneticsDigest.com . Проверено 11 мая 2022 г.
- ^ Jump up to: а б Чоу, Вивиан (18 апреля 2017 г.). «Как наука и генетика меняют расовые дебаты в 21 веке» . Гарвардский университет . Проверено 11 мая 2022 г.
- ^ "Раса" . Genome.gov . Проверено 11 мая 2022 г.
- ^ «Молекулярная фотоподборка: предсказание происхождения и фенотипа по ДНК» . Эльсивер Академик Пресс. 5 октября 2007 г. Проверено 7 сентября 2007 г.