HLA-DQ6
Тип полимера | MHC класса II , DQ антиген клеточной поверхности | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Редкие гаплотипы | |||||||||||||||||||||||||
|
HLA-DQ6 (DQ6) представляет собой человеческого лейкоцитарного антигена серотип в группе серотипов HLA-DQ (DQ). Серотип определяется антителом, распознающим β. 6 подмножество β-цепей DQ. β-цепь изоформ DQ кодируется локусом HLA-DQB1 , а DQ6 кодируется локусом HLA-DQB1. *06 группа аллелей. Эта группа в настоящее время содержит много общих аллелей, DQB1. *0602 является наиболее распространенным. HLA-DQ6 и DQB1 *06 почти синонимы по смыслу. β-цепи DQ6 объединяются с α-цепями, кодируемыми генетически связанными аллелями HLA-DQA1 , образуя изоформы цис - гаплотипа . Однако для DQ6 спаривание цис-изоформ происходит только с DQ1 α-цепями . Существует множество гаплотипов DQ6.
Серология
[ редактировать ]ДК6 | ДК1 | ДК5 | Н | |
аллель | % | % | % | размер (Н) |
*0601 | 64 | 23 | 675 | |
*0602 | 67 | 30 | 1 | 5151 |
*0603 | 62 | 23 | 2 | 2807 |
*0604 | 59 | 27 | 2 | 1592 |
*0605 | 76 | 13 | 358 | |
*0609 | 48 | 32 | 3 | 149 |
Аллели
[ редактировать ]частота | ||
исх. | Население | (%) |
[ 2 ] | Индиг. Австралийский Кейп-Йорк | 31.3 |
Индиг. Австралийская Кимберли | 30.5 | |
Науру | 28.4 | |
Фиджи – Вити-Леву | 26.3 | |
Индия Бомбей | 26.3 | |
Папуа-Новая Гвинея, низменность | 26.0 | |
Китай Гуйчжоу, пров. Мяо | 25.9 | |
Папуа-Новая Гвинея Маданг | 23.1 | |
Кирибати | 22.6 | |
Япония | 22.0 | |
Индонезия, Нуса-Тенгара | 19.2 | |
Индия Северные индусы | 18.7 | |
Япония Хоккайдо Ваджин | 17.0 | |
Уттар-Прадеш индуистский | 15.1 | |
PNG Лоуленд Уосера | 14.1 | |
Западное Самоа и Северное | 13.7 | |
Пакистан Калаш | 13.0 | |
Индия Лакнау | 12.9 | |
Китай Ухань | 12.8 | |
Южная Корея (4) | 11.4 | |
PNG Хайленд | 10.9 | |
Индия Дели | 9.0 | |
Иран Белудж | 8.0 | |
Монгольская Халха | 5.5 | |
Ливан Юхмур | 4.3 | |
Тунис Ганнуш | 4.3 | |
Польша Великая Польша | 4.0 | |
Мексика Масатеканы | 3.5 | |
Испания Восточная Андалусия | 2.0 | |
Италия Центральная | 1.9 | |
Юго-Восток Франции | 1.6 | |
Англия европеоидная | 1.1 | |
Ирландия Южная | 0.2 | |
Италия Сардиния | 0.1 | |
Бразильская гуарани Кайова | 0.0 | |
Камерун Саа | 0.0 |
DQB1*0601
[ редактировать ]DQB1*0601 обычно связан с DQA1*0103 как гаплотип 6.1 . Этот гаплотип чаще встречается в Японии и других частях Восточной Азии.
частота | ||
исх. | Население | (%) |
[ 2 ] | Испания Пас-Вэлли | 31.5 |
Камерун Саа | 30.8 | |
Конго Киншаса банту | 30.0 | |
PNG Э. Хайлендс Горока | 29.8 | |
Сибирский кет Нижний Енисей | 29.4 | |
Испания Северное Кабуэрниго | 28.9 | |
Russia Arkhangelsk Pomors | 24.7 | |
Испания Северная Кантабрия | 24.7 | |
Ирландия Южная | 19.6 | |
Бельгийский (2) | 19.4 | |
Siberia Kushun Buryat | 18.0 | |
Финляндия | 17.1 | |
Сибирь Кетский поселок Суламай | 17.0 | |
Польша Великая Польша | 16.9 | |
немецкая еда | 16.7 | |
СП. Баскская долина Арратия | 16.7 | |
Дания | 16.6 | |
Франция Цеф | 15.7 | |
Кения | 14.6 | |
Англия европеоидная | 14.4 | |
Швеция | 14.1 | |
Франция Ренн | 13.8 | |
Тунис Берберский вопрос | 11.7 | |
Джордан Амман | 10.7 | |
Япония Хоккайдо Ваджин | 10.0 | |
Сауди А. Гурайат и Хайль | 8.4 | |
Центральная Япония | 8.2 | |
Науру | 8.2 | |
Грузия Сванетия Сваны | 8.1 | |
Юго-Восток Франции | 8.0 | |
Эфиопия Амхара | 7.7 | |
Алжир Оран | 7.6 | |
Словения | 7.5 | |
Южная Корея (1) | 7.4 | |
Япония Фукуока | 6.4 | |
Пакистан Калаш | 5.8 | |
Китай Синьцзян-Уйгурский | 5.4 | |
Папуа-Новая Гвинея, низменность | 5.2 | |
Монголия Халх Улан-Батор | 4.9 | |
Испания Мурсия | 4.8 | |
Индия Бомбей | 4.2 | |
Япония | 4.0 | |
Греция (2) | 3.3 | |
Израильские арабы | 2.3 | |
Вьетнам Ханой Кинь | 2.0 | |
Израильские евреи | 1.5 | |
Монголия Хотон Тариалан | 1.2 | |
США, коренные жители Аляски юпики | 0.8 | |
Мексика Микстек Оахака | 0.5 | |
Италия Сардиния pop2 | 0.1 |
DQB1*0602
[ редактировать ]DQB1*0602 обычно соединяется с DQA1*0102, образуя гаплотип 6.2 . DQ6.2 распространен от Центральной Азии до Западной Европы, *0602 также связан с DQA1*0103 в некоторых частях Азии.
частота | ||
исх. | Население | (%) |
[ 2 ] | Грузия Сванетия Сваны | 14.4 |
Франция Запад | 11.0 | |
Нидерланды | 10.6 | |
немецкая еда | 9.2 | |
Чешская Республика | 9.0 | |
Испания Мурсия | 8.7 | |
Словакия | 8.4 | |
Дания | 8.3 | |
Индия Лакнау | 8.3 | |
Джордан Амман | 8.3 | |
Франция Ренн | 8.1 | |
Польша Великая Польша | 8.0 | |
Саудовская Аравия Гурайат и Хайль | 8.0 | |
Тунис Джерба Бербер | 7.8 | |
Угандийские братья Братья | 7.4 | |
Испания Северная Кантабрия | 7.2 | |
Финляндия | 7.1 | |
Франция Юг | 6.9 | |
Китай Синьцзян-Уйгурский | 6.5 | |
Россия Северо-Западный Славянский | 6.0 | |
Ирландия Донегол | 5.3 | |
Греция (3) | 5.2 | |
Северная Ирландия (2) | 4.9 | |
Италия Рим | 4.0 | |
АВТОМОБИЛЬ, он же Пигмеи | 3.6 | |
Ливан у моста Кафар | 3.2 | |
Швеция | 2.5 | |
Таиланд | 2.1 | |
Китай Ухань | 1.7 | |
Япония (2) | 1.0 | |
Южная Корея (3) | 0.9 | |
Малайзия | 0.6 |
DQB1*0603
[ редактировать ]DQB1*0603 обычно связан с DQA1*0103 как 6.3 и распространен от Центральной Азии до Западной Европы, *0603 также связан с DQA1*0102 в некоторых частях Азии. В Европе наиболее распространен в Нидерландах.
частота | ||
исх. | Население | (%) |
[ 2 ] | Эфиопия Амхара | 10.7 |
Руанда Кигали Хуту и тутси | 10.7 | |
Эфиопия Оромо | 10.2 | |
Япония | 8.0 | |
Саудовская Аравия Гурайат и Хайль | 8.0 | |
Иран Йезд Зороастрийцы | 6.9 | |
АВТОМОБИЛЬ, он же Пигмеи | 6.5 | |
Южная Корея (2) | 6.5 | |
Швеция | 6.1 | |
Нидерланды | 5.6 | |
Угандийские братья Братья | 5.3 | |
Ливан Ниха-эль-Шуфф | 4.9 | |
Дания | 4.6 | |
Франция Ренн | 4.6 | |
Израиль Газа Палестинцы | 3.9 | |
Китай Синьцзян-Уйгурский | 3.8 | |
Алжир1 | 3.5 | |
Россия Северо-Западный Славянский | 3.5 | |
Англия европеоидная | 3.1 | |
немецкая еда | 2.6 | |
Чешская Республика | 2.4 | |
Греция | 2.0 | |
Индия Дели | 1.8 | |
Науру | 1.5 | |
Финляндия | 1.4 | |
Гамбия | 0.7 |
DQB1*0604
[ редактировать ]DQB1*0604 встречается с более высокими частотами в некоторых частях Африки и Азии и связан почти исключительно с DQA1*0102 как 6,4 . Этот гаплотип наиболее часто встречается в Евразии в Японии.
частота | ||
исх. | Население | (%) |
[ 2 ] | Руанда Кигали Хуту и тутси | 5.7 |
Кения | 5.3 | |
Угандийские братья Братья | 5.3 | |
Конго Киншаса банту | 4.4 | |
Гамбия | 4.4 | |
Монгольский Цаатан | 4.2 | |
Южная Корея (3) | 3.7 | |
Камерун Саа | 3.5 | |
Словения | 3.0 | |
Тунис | 3.0 | |
Зимбабве Хараре Шона | 2.2 | |
Вьетнам Ханой Кинь | 2.0 | |
Нидерланды | 1.7 | |
Саудовская Аравия Гурайат и Хайль | 1.6 | |
Алжир Оран | 1.5 | |
Греция (2) | 1.2 | |
Таиланд (2) | 1.2 | |
Тунис Берберский вопрос | 1.2 | |
Италия Рим | 1.0 | |
Испания Гранада | 0.7 | |
Италия Бергамо | 0.6 | |
Ирландия Южная | 0.2 | |
Китай Урумчи Уйгурский | 0.0 | |
США, коренные жители Аляски юпики | 0.0 |
DQB1*0609
[ редактировать ]DQB1*0609 встречается в Африке и ближайших регионах Евразии.
Гаплотипы и болезни
[ редактировать ]восприимчивость к инфекции лептоспироза связана с недифференцированным DQ6. Было обнаружено, что [ 3 ] В то время как DQ6 защищал от смерти (или необходимости трансплантации печени) при первичном склерозирующем холангите . [ 4 ]
ДК6.1
[ редактировать ]DQA1*0103:DQB1*0601 (DQ6.1) чаще встречается в Азии и почти отсутствует в Западной Европе. Дает защиту от нарколепсии , [ 5 ] ювенильный диабет , [ 6 ] [ 7 ] Vogt-Koyanagi-Harada (VKH) syndrome, [ 8 ] пузырчатка обыкновенная , [ 9 ] рассеянный склероз , [ 10 ] миастения гравис .
ДК6.2
[ редактировать ]DQ6.2 (DQA1 *0102 : DQB1 *0602 ) обычно связан с DR15 и поэтому является частью гаплотипа HLA B7-DR15-DQ6 . Этот гаплотип считается самым длинным мультигенным гаплотипом, известным в геноме человека, поскольку он охватывает более 4,7 миллиона нуклеотидов. Гаплотип DR15-DQ6.2 является наиболее распространенным гаплотипом DR-DQ в Европе, и примерно 30% американцев являются носителями как минимум DQ6.2. Гаплотип еще более распространен в Центральной Азии.
Связь DQ6.2 с заболеванием
[ редактировать ]При миастении gravis распознавание α34-49 AChR увеличивалось с DQ6.2. [ 11 ] DQA1 *0102 увеличивает риск рака шейки матки . [ 12 ] [ 13 ] При рассеянном склерозе DQA1 *0102 был наиболее частым аллелем и DQB1. *0602 значительно увеличился у пациентов с рассеянным склерозом. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]
Защитные эффекты DQ6.2
[ редактировать ]При первичном билиарном циррозе DQ6.2, по-видимому, имеет отрицательную связь с заболеванием. [ 17 ] DQ6.2 также оказывает защитное действие при ювенильном диабете . [ 18 ] [ 19 ] DQ6.2 также защищает от детских спазмов у метисов. [ 20 ]
ДК6.3
[ редактировать ]DQ6.3 (DQA1 *0103 : DQB1 *0603 ) встречается в северо-центральной Европе с умеренной частотой, он защищает от многих аутоиммунных заболеваний. Это также обеспечивает некоторую защиту от ВИЧ-инфекции. [ 21 ]
ДК6.4
[ редактировать ]DQ6.4 (DQA1 *0102 : DQB1 *0604 ) может быть связано с миастенией, вызванной тимомой. [ 22 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Jump up to: а б с д и Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .
- ^ Лингаппа Дж., Каффнер Т., Тапперо Дж., Уитворт В., Мизе А., Кайзер Р., МакНиколл Дж. (май 2004 г.). «HLA-DQ6 и употребление зараженной воды: возможное взаимодействие генов и окружающей среды при вспышке лептоспироза». Гены Иммунитет . 5 (3): 197–202. дои : 10.1038/sj.gene.6364058 . ПМИД 15014429 . S2CID 1771348 .
- ^ Боберг К.М., Спуркланд А., Рокка Г., Эгеланд Т., Сааринен С., Митчелл С., Бруме У., Чепмен Р., Олеруп О (август 2001 г.). «Гетерозиготный генотип HLA-DR3,DQ2 связан с ускоренным прогрессированием первичного склерозирующего холангита». Скан. Дж. Гастроэнтерол . 36 (8): 886–890. дои : 10.1080/003655201750313441 . ПМИД 11495087 .
- ^ Хонг С.К., Лин Л., Ло Б., Чжон Дж., Шин Ю., Ким С., Квеон Ю., Чжан Дж., Эйнен М. (2007). «DQB1*0301 и DQB1*0601 модулируют предрасположенность к нарколепсии у корейцев». Хм. Иммунол . 68 (1): 59–68. дои : 10.1016/j.humimm.2006.10.006 . ПМИД 17207713 .
- ^ Санг Ю, Ян С, Чжу С, Ни Г (2001). «Связь между аллелями HLA-DRB1 и DQ и генетической предрасположенностью к диабету 1 типа». Подбородок. Мед. Дж . 114 (4): 407–9. ПМИД 11780465 .
- ^ Сарухан-Дирескенели Г., Уяр Ф.А., Бас Ф., Гюнёз Х., Бундак Р., Сака Н., Даренделилер Ф. (2000). «Ассоциации HLA-DR и -DQ с инсулинозависимым сахарным диабетом у населения Турции». Хм. Иммунол . 61 (3): 296–302. дои : 10.1016/S0198-8859(99)00182-2 . ПМИД 10689119 .
- ^ Ким М.Х., Сон MC, Квак Н.Х., Ю Дж.С., Ха В., Ким Т.Г., Хан Х. (2000). «Ассоциация HLA с синдромом Фогта-Коянаги-Харады у корейцев». Являюсь. Дж. Офтальмол . 129 (2): 173–177. дои : 10.1016/S0002-9394(99)00434-1 . ПМИД 10682969 .
- ^ Ниидзеки Х, Иноко Х, Мизуки Н, Инамото Н, Ватабабе К, Хасимото Т, Нисикава Т (1994). «Генотипирование HLA-DQA1, -DQB1 и -DRB1 у пациентов с японской пузырчаткой обыкновенной методом ПЦР-ПДРФ». Тканевые антигены . 44 (4): 248–251. дои : 10.1111/j.1399-0039.1994.tb02390.x . ПМИД 7871526 .
- ^ Амирзаргар А., Митилинеос Дж., Юсефипур А., Фарджадиан С., Шерер С., Опельц Г., Гадери А. (1998). «HLA класса II (DRB1, DQA1 и DQB1), связанная с генетической предрасположенностью у иранских пациентов с рассеянным склерозом (РС)» . Евро. Дж. Иммуногенет . 25 (4): 297–301. дои : 10.1046/j.1365-2370.1998.00101.x . ПМИД 9777330 .
- ^ Дейтикер П.Р., Осима М., Смит Р.Г., Мозье Д.Р., Атасси М.З. (2006). «Незначительные различия в связанной с гаплотипом HLA DQ презентации пептидов альфа-цепи AChR могут быть достаточными для опосредования миастении гравис». Аутоиммунитет . 39 (4): 277–288. дои : 10.1080/08916930600738581 . ПМИД 16891216 . S2CID 23462117 .
- ^ Гадери М., Никитина Л., Пикок К.С., Хьельмстрем П., Холманс Г., Виклунд Ф., Леннер П., Блэквелл Дж.М., Диллнер Дж. (октябрь 2000 г.). «Фактор некроза опухоли a-11 и гаплотип DR15-DQ6 (B*0602) повышают риск развития цервикальной интраэпителиальной неоплазии у серопозитивных женщин с вирусом папилломы человека 16 в Северной Швеции» . Эпидемиол рака. Биомаркеры Пред . 9 (10): 1067–70. ПМИД 11045789 .
- ^ Шифф М.А., Эппл Р.Дж., Лин П., Нельсон Дж.Л., Уилер К.М., Беккер Т.М. (2005). «Аллели HLA и риск цервикальной интраэпителиальной неоплазии среди женщин юго-западных американских индейцев». Хм. Иммунол . 66 (10): 1050–1056. дои : 10.1016/j.humimm.2005.09.002 . ПМИД 16386646 .
- ^ Колстад А, Ханнестад К, Вандвик Б, Вартдал Ф (май 1989 г.). «Пациенты с рассеянным склерозом имеют высокую частоту бета-эпитопа HLA-DQ, определяемого гибридомным антителом человека-человека». Тканевые антигены . 33 (5): 546–549. дои : 10.1111/j.1399-0039.1989.tb01706.x . ПМИД 2477915 .
- ^ Амирзаргар А.А., Табаси А., Хосрави Ф., Херадвар А., Резаи Н., Наруейнежад М., Ансарипур Б., Моради Б., Никбин Б. (2005). «Неврит зрительного нерва, рассеянный склероз и человеческий лейкоцитарный антиген: результаты 4-летнего последующего исследования». Евро. Дж. Нейрол . 12 (1): 25–30. дои : 10.1111/j.1468-1331.2004.00901.x . ПМИД 15613143 . S2CID 11114806 .
- ^ Фернандес О, Фернандес В, Алонсо А, Кабальеро А, Луке Г, Браво М, Леон А, Майорга С, Лейва Л (2004). «Аллель DQB1*0602 демонстрирует сильную связь с рассеянным склерозом у пациентов в Малаге, Испания». Дж. Нейрол . 251 (4): 440–444. дои : 10.1007/s00415-004-0350-2 . ПМИД 15083289 . S2CID 6388921 .
- ^ Малларки М.Э., Стивенс А.М., Макдоннелл В.М., Лубьер Л., Бракенсик Дж., Панг Дж., Портер А., Галлоуэй Д., Нельсон Дж. (2005). «Аллели человеческого лейкоцитарного антигена класса II у женщин европеоидной расы с первичным билиарным циррозом». Тканевые антигены . 65 (2): 199–205. дои : 10.1111/j.1399-0039.2005.00351.x . ПМИД 15713222 .
- ^ Рейнер М.Л., Келли М.А., Мийович Ч.Г., Барнетт А.Х. (март 2002 г.). «Секвенирование второго экзона аллелей DQ6 MHC класса II у пациентов с диабетом 1 типа». Аутоиммунитет . 35 (2): 155–157. дои : 10.1080/08916930290016637 . ПМИД 12071438 . S2CID 46348916 .
- ^ Посьо Ф, Макдермотт МФ (август 2002 г.). «Генетика сахарного диабета 1 типа». Гены Иммунитет . 3 (5): 235–249. дои : 10.1038/sj.gene.6363875 . ПМИД 12140742 . S2CID 19983853 .
- ^ Суастеги Р.А., Де Ла Роуз Дж., Карранса Х.М., Гонсалес-Астиазаран А., Городецкий С. (февраль 2001 г.). «Вклад антигенов MHC класса II в этиологию инфантильных спазмов у мексиканских метисов» . Эпилепсия . 42 (2): 210–215. дои : 10.1046/j.1528–1157.2001.22700.x . ПМИД 11240591 .
- ^ Аккорд А.П., Льюис Р.Э., Брэкин М.Н., Хендерсон Х., Круз Дж.М. (1996). «Связь заболевания ВИЧ-1 с антигенами HLA-DQ у афроамериканцев и европеоидов». Патобиология . 64 (4): 204–208. дои : 10.1159/000164049 . ПМИД 9031330 .
- ^ Виейра М., Кайя-Зукман С., Гайдос П., Коэн-Камински С., Кастер А., Бах Дж. (1993). «Идентификация путем геномного типирования генов HLA класса II, не относящихся к DR3, связанных с миастенией гравис». J Нейроиммунол . 47 (2): 115–122. дои : 10.1016/0165-5728(93)90021-П . ПМИД 8370765 . S2CID 3771373 .