Jump to content

HLA-DQ6

HLA-DQ6
Иллюстрация HLA-DQ со связанным пептидом
Тип полимера MHC класса II , DQ антиген клеточной поверхности
Цис-гаплотип Гаплотип
изоформа подтип DQA1 DQB1
ДК α 1.3 б 6.1 ДК6.1 *0103 *0601
ДК α 1.2 б 6.2 ДК6.2 *0102 *0602
ДК α 1.3 б 6.3 ДК6.3 *0103 *0603
ДК α 1.2 б 6.4 ДК6.4 *0102 *0604
Редкие гаплотипы
Цис-гаплотип Гаплотип
изоформа подтип DQA1 DQB1
ДК α 1.2 б 6.3 DQ6.3v *0102 *0603
ДК α 1.3 б 6.2 DQ6.2v *0103 *0602
ДК α 1.2 б 6.9 ДК6.9 *0102 *0609

HLA-DQ6 (DQ6) представляет собой человеческого лейкоцитарного антигена серотип в группе серотипов HLA-DQ (DQ). Серотип определяется антителом, распознающим β. 6 подмножество β-цепей DQ. β-цепь изоформ DQ кодируется локусом HLA-DQB1 , а DQ6 кодируется локусом HLA-DQB1. *06 группа аллелей. Эта группа в настоящее время содержит много общих аллелей, DQB1. *0602 является наиболее распространенным. HLA-DQ6 и DQB1 *06 почти синонимы по смыслу. β-цепи DQ6 объединяются с α-цепями, кодируемыми генетически связанными аллелями HLA-DQA1 , образуя изоформы цис - гаплотипа . Однако для DQ6 спаривание цис-изоформ происходит только с DQ1 α-цепями . Существует множество гаплотипов DQ6.

Серология

[ редактировать ]
Распознавание DQ6, DQ1 и DQ5 некоторых некоторых аллелей DQB1* [ 1 ]
ДК6 ДК1 ДК5 Н
аллель % % % размер (Н)
*0601 64 23 675
*0602 67 30 1 5151
*0603 62 23 2 2807
*0604 59 27 2 1592
*0605 76 13 358
*0609 48 32 3 149
Частоты HLA DQB1*0601
частота
исх. Население (%)
[ 2 ] Индиг. Австралийский Кейп-Йорк 31.3
Индиг. Австралийская Кимберли 30.5
Науру 28.4
Фиджи – Вити-Леву 26.3
Индия Бомбей 26.3
Папуа-Новая Гвинея, низменность 26.0
Китай Гуйчжоу, пров. Мяо 25.9
Папуа-Новая Гвинея Маданг 23.1
Кирибати 22.6
Япония 22.0
Индонезия, Нуса-Тенгара 19.2
Индия Северные индусы 18.7
Япония Хоккайдо Ваджин 17.0
Уттар-Прадеш индуистский 15.1
PNG Лоуленд Уосера 14.1
Западное Самоа и Северное 13.7
Пакистан Калаш 13.0
Индия Лакнау 12.9
Китай Ухань 12.8
Южная Корея (4) 11.4
PNG Хайленд 10.9
Индия Дели 9.0
Иран Белудж 8.0
Монгольская Халха 5.5
Ливан Юхмур 4.3
Тунис Ганнуш 4.3
Польша Великая Польша 4.0
Мексика Масатеканы 3.5
Испания Восточная Андалусия 2.0
Италия Центральная 1.9
Юго-Восток Франции 1.6
Англия европеоидная 1.1
Ирландия Южная 0.2
Италия Сардиния 0.1
Бразильская гуарани Кайова 0.0
Камерун Саа 0.0

DQB1*0601 обычно связан с DQA1*0103 как гаплотип 6.1 . Этот гаплотип чаще встречается в Японии и других частях Восточной Азии.

Частоты HLA DQB1*0602
частота
исх. Население (%)
[ 2 ] Испания Пас-Вэлли 31.5
Камерун Саа 30.8
Конго Киншаса банту 30.0
PNG Э. Хайлендс Горока 29.8
Сибирский кет Нижний Енисей 29.4
Испания Северное Кабуэрниго 28.9
Russia Arkhangelsk Pomors 24.7
Испания Северная Кантабрия 24.7
Ирландия Южная 19.6
Бельгийский (2) 19.4
Siberia Kushun Buryat 18.0
Финляндия 17.1
Сибирь Кетский поселок Суламай 17.0
Польша Великая Польша 16.9
немецкая еда 16.7
СП. Баскская долина Арратия 16.7
Дания 16.6
Франция Цеф 15.7
Кения 14.6
Англия европеоидная 14.4
Швеция 14.1
Франция Ренн 13.8
Тунис Берберский вопрос 11.7
Джордан Амман 10.7
Япония Хоккайдо Ваджин 10.0
Сауди А. Гурайат и Хайль 8.4
Центральная Япония 8.2
Науру 8.2
Грузия Сванетия Сваны 8.1
Юго-Восток Франции 8.0
Эфиопия Амхара 7.7
Алжир Оран 7.6
Словения 7.5
Южная Корея (1) 7.4
Япония Фукуока 6.4
Пакистан Калаш 5.8
Китай Синьцзян-Уйгурский 5.4
Папуа-Новая Гвинея, низменность 5.2
Монголия Халх Улан-Батор 4.9
Испания Мурсия 4.8
Индия Бомбей 4.2
Япония 4.0
Греция (2) 3.3
Израильские арабы 2.3
Вьетнам Ханой Кинь 2.0
Израильские евреи 1.5
Монголия Хотон Тариалан 1.2
США, коренные жители Аляски юпики 0.8
Мексика Микстек Оахака 0.5
Италия Сардиния pop2 0.1

DQB1*0602 обычно соединяется с DQA1*0102, образуя гаплотип 6.2 . DQ6.2 распространен от Центральной Азии до Западной Европы, *0602 также связан с DQA1*0103 в некоторых частях Азии.

Частоты HLA DQB1*0603
частота
исх. Население (%)
[ 2 ] Грузия Сванетия Сваны 14.4
Франция Запад 11.0
Нидерланды 10.6
немецкая еда 9.2
Чешская Республика 9.0
Испания Мурсия 8.7
Словакия 8.4
Дания 8.3
Индия Лакнау 8.3
Джордан Амман 8.3
Франция Ренн 8.1
Польша Великая Польша 8.0
Саудовская Аравия Гурайат и Хайль 8.0
Тунис Джерба ​​Бербер 7.8
Угандийские братья Братья 7.4
Испания Северная Кантабрия 7.2
Финляндия 7.1
Франция Юг 6.9
Китай Синьцзян-Уйгурский 6.5
Россия Северо-Западный Славянский 6.0
Ирландия Донегол 5.3
Греция (3) 5.2
Северная Ирландия (2) 4.9
Италия Рим 4.0
АВТОМОБИЛЬ, он же Пигмеи 3.6
Ливан у моста Кафар 3.2
Швеция 2.5
Таиланд 2.1
Китай Ухань 1.7
Япония (2) 1.0
Южная Корея (3) 0.9
Малайзия 0.6

DQB1*0603 обычно связан с DQA1*0103 как 6.3 и распространен от Центральной Азии до Западной Европы, *0603 также связан с DQA1*0102 в некоторых частях Азии. В Европе наиболее распространен в Нидерландах.

Частоты HLA DQB1*0604
частота
исх. Население (%)
[ 2 ] Эфиопия Амхара 10.7
Руанда Кигали Хуту и ​​тутси 10.7
Эфиопия Оромо 10.2
Япония 8.0
Саудовская Аравия Гурайат и Хайль 8.0
Иран Йезд Зороастрийцы 6.9
АВТОМОБИЛЬ, он же Пигмеи 6.5
Южная Корея (2) 6.5
Швеция 6.1
Нидерланды 5.6
Угандийские братья Братья 5.3
Ливан Ниха-эль-Шуфф 4.9
Дания 4.6
Франция Ренн 4.6
Израиль Газа Палестинцы 3.9
Китай Синьцзян-Уйгурский 3.8
Алжир1 3.5
Россия Северо-Западный Славянский 3.5
Англия европеоидная 3.1
немецкая еда 2.6
Чешская Республика 2.4
Греция 2.0
Индия Дели 1.8
Науру 1.5
Финляндия 1.4
Гамбия 0.7

DQB1*0604 встречается с более высокими частотами в некоторых частях Африки и Азии и связан почти исключительно с DQA1*0102 как 6,4 . Этот гаплотип наиболее часто встречается в Евразии в Японии.

Частоты HLA DQB1*0609
частота
исх. Население (%)
[ 2 ] Руанда Кигали Хуту и ​​тутси 5.7
Кения 5.3
Угандийские братья Братья 5.3
Конго Киншаса банту 4.4
Гамбия 4.4
Монгольский Цаатан 4.2
Южная Корея (3) 3.7
Камерун Саа 3.5
Словения 3.0
Тунис 3.0
Зимбабве Хараре Шона 2.2
Вьетнам Ханой Кинь 2.0
Нидерланды 1.7
Саудовская Аравия Гурайат и Хайль 1.6
Алжир Оран 1.5
Греция (2) 1.2
Таиланд (2) 1.2
Тунис Берберский вопрос 1.2
Италия Рим 1.0
Испания Гранада 0.7
Италия Бергамо 0.6
Ирландия Южная 0.2
Китай Урумчи Уйгурский 0.0
США, коренные жители Аляски юпики 0.0

DQB1*0609 встречается в Африке и ближайших регионах Евразии.

Гаплотипы и болезни

[ редактировать ]

восприимчивость к инфекции лептоспироза связана с недифференцированным DQ6. Было обнаружено, что [ 3 ] В то время как DQ6 защищал от смерти (или необходимости трансплантации печени) при первичном склерозирующем холангите . [ 4 ]

DQA1*0103:DQB1*0601 (DQ6.1) чаще встречается в Азии и почти отсутствует в Западной Европе. Дает защиту от нарколепсии , [ 5 ] ювенильный диабет , [ 6 ] [ 7 ] Vogt-Koyanagi-Harada (VKH) syndrome, [ 8 ] пузырчатка обыкновенная , [ 9 ] рассеянный склероз , [ 10 ] миастения гравис .

DQ6.2 (DQA1 *0102 : DQB1 *0602 ) обычно связан с DR15 и поэтому является частью гаплотипа HLA B7-DR15-DQ6 . Этот гаплотип считается самым длинным мультигенным гаплотипом, известным в геноме человека, поскольку он охватывает более 4,7 миллиона нуклеотидов. Гаплотип DR15-DQ6.2 является наиболее распространенным гаплотипом DR-DQ в Европе, и примерно 30% американцев являются носителями как минимум DQ6.2. Гаплотип еще более распространен в Центральной Азии.

Связь DQ6.2 с заболеванием

[ редактировать ]

При миастении gravis распознавание α34-49 AChR увеличивалось с DQ6.2. [ 11 ] DQA1 *0102 увеличивает риск рака шейки матки . [ 12 ] [ 13 ] При рассеянном склерозе DQA1 *0102 был наиболее частым аллелем и DQB1. *0602 значительно увеличился у пациентов с рассеянным склерозом. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ]

Защитные эффекты DQ6.2

[ редактировать ]

При первичном билиарном циррозе DQ6.2, по-видимому, имеет отрицательную связь с заболеванием. [ 17 ] DQ6.2 также оказывает защитное действие при ювенильном диабете . [ 18 ] [ 19 ] DQ6.2 также защищает от детских спазмов у метисов. [ 20 ]

DQ6.3 (DQA1 *0103 : DQB1 *0603 ) встречается в северо-центральной Европе с умеренной частотой, он защищает от многих аутоиммунных заболеваний. Это также обеспечивает некоторую защиту от ВИЧ-инфекции. [ 21 ]

DQ6.4 (DQA1 *0102 : DQB1 *0604 ) может быть связано с миастенией, вызванной тимомой. [ 22 ]

  1. ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
  2. ^ Jump up to: а б с д и Миддлтон Д., Менчака Л., Руд Х., Комерофски Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей» . Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД   12753660 .
  3. ^ Лингаппа Дж., Каффнер Т., Тапперо Дж., Уитворт В., Мизе А., Кайзер Р., МакНиколл Дж. (май 2004 г.). «HLA-DQ6 и употребление зараженной воды: возможное взаимодействие генов и окружающей среды при вспышке лептоспироза». Гены Иммунитет . 5 (3): 197–202. дои : 10.1038/sj.gene.6364058 . ПМИД   15014429 . S2CID   1771348 .
  4. ^ Боберг К.М., Спуркланд А., Рокка Г., Эгеланд Т., Сааринен С., Митчелл С., Бруме У., Чепмен Р., Олеруп О (август 2001 г.). «Гетерозиготный генотип HLA-DR3,DQ2 связан с ускоренным прогрессированием первичного склерозирующего холангита». Скан. Дж. Гастроэнтерол . 36 (8): 886–890. дои : 10.1080/003655201750313441 . ПМИД   11495087 .
  5. ^ Хонг С.К., Лин Л., Ло Б., Чжон Дж., Шин Ю., Ким С., Квеон Ю., Чжан Дж., Эйнен М. (2007). «DQB1*0301 и DQB1*0601 модулируют предрасположенность к нарколепсии у корейцев». Хм. Иммунол . 68 (1): 59–68. дои : 10.1016/j.humimm.2006.10.006 . ПМИД   17207713 .
  6. ^ Санг Ю, Ян С, Чжу С, Ни Г (2001). «Связь между аллелями HLA-DRB1 и DQ и генетической предрасположенностью к диабету 1 типа». Подбородок. Мед. Дж . 114 (4): 407–9. ПМИД   11780465 .
  7. ^ Сарухан-Дирескенели Г., Уяр Ф.А., Бас Ф., Гюнёз Х., Бундак Р., Сака Н., Даренделилер Ф. (2000). «Ассоциации HLA-DR и -DQ с инсулинозависимым сахарным диабетом у населения Турции». Хм. Иммунол . 61 (3): 296–302. дои : 10.1016/S0198-8859(99)00182-2 . ПМИД   10689119 .
  8. ^ Ким М.Х., Сон MC, Квак Н.Х., Ю Дж.С., Ха В., Ким Т.Г., Хан Х. (2000). «Ассоциация HLA с синдромом Фогта-Коянаги-Харады у корейцев». Являюсь. Дж. Офтальмол . 129 (2): 173–177. дои : 10.1016/S0002-9394(99)00434-1 . ПМИД   10682969 .
  9. ^ Ниидзеки Х, Иноко Х, Мизуки Н, Инамото Н, Ватабабе К, Хасимото Т, Нисикава Т (1994). «Генотипирование HLA-DQA1, -DQB1 и -DRB1 у пациентов с японской пузырчаткой обыкновенной методом ПЦР-ПДРФ». Тканевые антигены . 44 (4): 248–251. дои : 10.1111/j.1399-0039.1994.tb02390.x . ПМИД   7871526 .
  10. ^ Амирзаргар А., Митилинеос Дж., Юсефипур А., Фарджадиан С., Шерер С., Опельц Г., Гадери А. (1998). «HLA класса II (DRB1, DQA1 и DQB1), связанная с генетической предрасположенностью у иранских пациентов с рассеянным склерозом (РС)» . Евро. Дж. Иммуногенет . 25 (4): 297–301. дои : 10.1046/j.1365-2370.1998.00101.x . ПМИД   9777330 .
  11. ^ Дейтикер П.Р., Осима М., Смит Р.Г., Мозье Д.Р., Атасси М.З. (2006). «Незначительные различия в связанной с гаплотипом HLA DQ презентации пептидов альфа-цепи AChR могут быть достаточными для опосредования миастении гравис». Аутоиммунитет . 39 (4): 277–288. дои : 10.1080/08916930600738581 . ПМИД   16891216 . S2CID   23462117 .
  12. ^ Гадери М., Никитина Л., Пикок К.С., Хьельмстрем П., Холманс Г., Виклунд Ф., Леннер П., Блэквелл Дж.М., Диллнер Дж. (октябрь 2000 г.). «Фактор некроза опухоли a-11 и гаплотип DR15-DQ6 (B*0602) повышают риск развития цервикальной интраэпителиальной неоплазии у серопозитивных женщин с вирусом папилломы человека 16 в Северной Швеции» . Эпидемиол рака. Биомаркеры Пред . 9 (10): 1067–70. ПМИД   11045789 .
  13. ^ Шифф М.А., Эппл Р.Дж., Лин П., Нельсон Дж.Л., Уилер К.М., Беккер Т.М. (2005). «Аллели HLA и риск цервикальной интраэпителиальной неоплазии среди женщин юго-западных американских индейцев». Хм. Иммунол . 66 (10): 1050–1056. дои : 10.1016/j.humimm.2005.09.002 . ПМИД   16386646 .
  14. ^ Колстад А, Ханнестад К, Вандвик Б, Вартдал Ф (май 1989 г.). «Пациенты с рассеянным склерозом имеют высокую частоту бета-эпитопа HLA-DQ, определяемого гибридомным антителом человека-человека». Тканевые антигены . 33 (5): 546–549. дои : 10.1111/j.1399-0039.1989.tb01706.x . ПМИД   2477915 .
  15. ^ Амирзаргар А.А., Табаси А., Хосрави Ф., Херадвар А., Резаи Н., Наруейнежад М., Ансарипур Б., Моради Б., Никбин Б. (2005). «Неврит зрительного нерва, рассеянный склероз и человеческий лейкоцитарный антиген: результаты 4-летнего последующего исследования». Евро. Дж. Нейрол . 12 (1): 25–30. дои : 10.1111/j.1468-1331.2004.00901.x . ПМИД   15613143 . S2CID   11114806 .
  16. ^ Фернандес О, Фернандес В, Алонсо А, Кабальеро А, Луке Г, Браво М, Леон А, Майорга С, Лейва Л (2004). «Аллель DQB1*0602 демонстрирует сильную связь с рассеянным склерозом у пациентов в Малаге, Испания». Дж. Нейрол . 251 (4): 440–444. дои : 10.1007/s00415-004-0350-2 . ПМИД   15083289 . S2CID   6388921 .
  17. ^ Малларки М.Э., Стивенс А.М., Макдоннелл В.М., Лубьер Л., Бракенсик Дж., Панг Дж., Портер А., Галлоуэй Д., Нельсон Дж. (2005). «Аллели человеческого лейкоцитарного антигена класса II у женщин европеоидной расы с первичным билиарным циррозом». Тканевые антигены . 65 (2): 199–205. дои : 10.1111/j.1399-0039.2005.00351.x . ПМИД   15713222 .
  18. ^ Рейнер М.Л., Келли М.А., Мийович Ч.Г., Барнетт А.Х. (март 2002 г.). «Секвенирование второго экзона аллелей DQ6 MHC класса II у пациентов с диабетом 1 типа». Аутоиммунитет . 35 (2): 155–157. дои : 10.1080/08916930290016637 . ПМИД   12071438 . S2CID   46348916 .
  19. ^ Посьо Ф, Макдермотт МФ (август 2002 г.). «Генетика сахарного диабета 1 типа». Гены Иммунитет . 3 (5): 235–249. дои : 10.1038/sj.gene.6363875 . ПМИД   12140742 . S2CID   19983853 .
  20. ^ Суастеги Р.А., Де Ла Роуз Дж., Карранса Х.М., Гонсалес-Астиазаран А., Городецкий С. (февраль 2001 г.). «Вклад антигенов MHC класса II в этиологию инфантильных спазмов у мексиканских метисов» . Эпилепсия . 42 (2): 210–215. дои : 10.1046/j.1528–1157.2001.22700.x . ПМИД   11240591 .
  21. ^ Аккорд А.П., Льюис Р.Э., Брэкин М.Н., Хендерсон Х., Круз Дж.М. (1996). «Связь заболевания ВИЧ-1 с антигенами HLA-DQ у афроамериканцев и европеоидов». Патобиология . 64 (4): 204–208. дои : 10.1159/000164049 . ПМИД   9031330 .
  22. ^ Виейра М., Кайя-Зукман С., Гайдос П., Коэн-Камински С., Кастер А., Бах Дж. (1993). «Идентификация путем геномного типирования генов HLA класса II, не относящихся к DR3, связанных с миастенией гравис». J Нейроиммунол . 47 (2): 115–122. дои : 10.1016/0165-5728(93)90021-П . ПМИД   8370765 . S2CID   3771373 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: adaac0badc553943e9fe53ffa87b7a1e__1706312520
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ad/1e/adaac0badc553943e9fe53ffa87b7a1e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
HLA-DQ6 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)