РНФ4

РНФ4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EA6, 2XEU, 4PPE
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF4 , SLX5, SNURF, RES4-26, белок 4 безымянного пальца
Внешние идентификаторы	Опустить : 602850 ; МГИ : 1201691 ; Гомологен : 37711 ; Генные карты : RNF4 ; ОМА : RNF4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	2,625,320 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	34,512,973 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	thymus; ; oocyte; ; middle temporal gyrus; ; epithelium of colon; ; tonsil; ; secondary oocyte; ; bone marrow cells; ; lymph node; ; beta cell; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	seminiferous tubule; ; zygote; ; lactiferous gland; ; cumulus cell; ; Ileal epithelium; ; secondary oocyte; ; ankle joint; ; yolk sac; ; spermatid; ; epiblast;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; ubiquitin protein ligase activity; DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; androgen receptor binding; identical protein binding; nucleosome binding; transferase activity; transcription factor binding; SUMO polymer binding; zinc ion binding; nuclear receptor coactivator activity;
Cellular component	cytoplasm; PML body; nucleoplasm; nucleus;
Biological process	androgen receptor signaling pathway; regulation of transcription, DNA-templated; protein K63-linked ubiquitination; response to arsenic-containing substance; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription, DNA-templated; protein K11-linked ubiquitination; regulation of kinetochore assembly; protein K48-linked ubiquitination; protein K6-linked ubiquitination; protein ubiquitination; regulation of spindle assembly; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein autoubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6047
	19822
	ENSG00000063978
	ENSMUSG00000029110
	P78317
	Q9QZS2
	НМ_002938 ; НМ_001185009 ; НМ_001185010
	НМ_011278 ; НМ_001304269 ; НМ_001304270
	НП_001171938 ; НП_001171939 ; НП_002929
	НП_001291198 ; НП_001291199 ; НП_035408
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 4 безымянного пальца — это белок , который у человека кодируется RNF4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белок, кодируемый этим геном, содержит домен RING-пальца и действует как фактор транскрипции . Было показано, что этот белок взаимодействует и ингибирует активность TRPS1 , супрессора транскрипции GATA-опосредованной транскрипции. Обнаружено, что репрессор транскрипции ZNF278/ PATZ1 взаимодействует с этим белком и, таким образом, снижает усиление андроген -зависимой транскрипции, опосредованной этим белком. Исследования на мышах и крысах показали роль этого белка в сперматогенезе . ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RNF4 взаимодействует с TCF20 . ^{[ 7 ]} ПАТЗ1 ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и рецептор андрогенов . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

См. также

Домен RING на пальце

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000063978 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029110 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кьяриотти Л., Бенвенуто Дж., Феделе М., Санторо М., Симеоне А., Фуско А., Бруни CB (январь 1998 г.). «Идентификация и характеристика нового картирования гена RING-пальца (RNF4) на участке 4p16.3». Геномика . 47 (2): 258–65. дои : 10.1006/geno.1997.5105 . ПМИД 9479498 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 4 безымянного пальца RNF4» .
^ Люнгсё К., Бутейллер Г., Дамгаард К.К., Риом Д., Санчес-Муньос С., Норби П.Л., Бонвен Б.Дж., Йоргенсен П. (август 2000 г.). «Взаимодействие между фактором транскрипции SPBP и положительным кофактором RNF4. Взаимодействие между белками, связывающими цинковые пальцы» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26144–9. дои : 10.1074/jbc.M003405200 . ПМИД 10849425 .
^ Феделе М, Бенвенуто Дж, Перо Р, Маджелло Б, Баттиста С, Лембо Ф, Воллоно Е, Дэй ПМ, Санторо М, Лания Л, Бруни CB, Фуско А, Кьяриотти Л (март 2000 г.). «Новый член семейства BTB/POZ, PATZ, связывается с белком RING-пальца RNF4 и действует как репрессор транскрипции» . Журнал биологической химии . 275 (11): 7894–901. дои : 10.1074/jbc.275.11.7894 . ПМИД 10713105 .
^ Jump up to: ^а ^б Перо Р., Лембо Ф., Палмьери Э.А., Витиелло С., Феделе М., Фуско А., Бруни С.Б., Кьяриотти Л. (февраль 2002 г.). «PATZ ослабляет RNF4-опосредованное усиление транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов» . Журнал биологической химии . 277 (5): 3280–5. дои : 10.1074/jbc.M109491200 . ПМИД 11719514 .
^ Мойланен А.М., Пукка Х., Карвонен У., Хакли М., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка RING Finger в качестве корегулятора транскрипции генов, опосредованной стероидными рецепторами» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (9): 5128–39. дои : 10.1128/mcb.18.9.5128 . ПМК 109098 . ПМИД 9710597 .
^ Пукка Х., Аарнисало П., Сантти Х., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (январь 2000 г.). «Корегулятор малого ядерного белка RING Finger (SNURF) усиливает транскрипцию, опосредованную Sp1 и стероидными рецепторами, с помощью различных механизмов» . Журнал биологической химии . 275 (1): 571–9. дои : 10.1074/jbc.275.1.571 . ПМИД 10617653 .

Дальнейшее чтение

Мойланен А.М., Пукка Х., Карвонен У., Хакли М., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка RING Finger в качестве корегулятора транскрипции генов, опосредованной стероидными рецепторами» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (9): 5128–39. дои : 10.1128/mcb.18.9.5128 . ПМК 109098 . ПМИД 9710597 .
Хадано С., Исида Ю., Икеда Дж.Э. (июнь 1998 г.). «Первичная структура и геномная организация пяти новых транскриптов, расположенных рядом с геном болезни Хантингтона на хромосоме 4p16.3 человека» . Исследование ДНК . 5 (3): 177–86. дои : 10.1093/dnares/5.3.177 . ПМИД 9734812 .
Пукка Х., Аарнисало П., Сантти Х., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (январь 2000 г.). «Корегулятор малого ядерного белка RING Finger (SNURF) усиливает транскрипцию, опосредованную Sp1 и стероидными рецепторами, с помощью различных механизмов» . Журнал биологической химии . 275 (1): 571–9. дои : 10.1074/jbc.275.1.571 . ПМИД 10617653 .
Феделе М, Бенвенуто Дж, Перо Р, Маджелло Б, Баттиста С, Лембо Ф, Воллоно Е, Дэй ПМ, Санторо М, Лания Л, Бруни CB, Фуско А, Кьяриотти Л (март 2000 г.). «Новый член семейства BTB/POZ, PATZ, связывается с белком RING-пальца RNF4 и действует как репрессор транскрипции» . Журнал биологической химии . 275 (11): 7894–901. дои : 10.1074/jbc.275.11.7894 . ПМИД 10713105 .
Галили Н., Наяк С., Эпштейн Дж.А., Бак Калифорния (май 2000 г.). «Rnf4, белок RING, экспрессируемый в развивающейся нервной и репродуктивной системах, взаимодействует с Gscl, геном в критической области ДиДжорджа» . Динамика развития . 218 (1): 102–11. doi : 10.1002/(SICI)1097-0177(200005)218:1<102::AID-DVDY9>3.0.CO;2-A . ПМИД 10822263 .
Люнгсё К., Бутейллер Г., Дамгаард К.К., Риом Д., Санчес-Муньос С., Норби П.Л., Бонвен Б.Дж., Йоргенсен П. (август 2000 г.). «Взаимодействие между фактором транскрипции SPBP и положительным кофактором RNF4. Взаимодействие между белками, связывающими цинковые пальцы» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26144–9. дои : 10.1074/jbc.M003405200 . ПМИД 10849425 .
Хакли М., Карвонен У., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (июнь 2001 г.). «Белок RING-пальца SNURF представляет собой бифункциональный белок, обладающий ДНК-связывающей активностью» . Журнал биологической химии . 276 (26): 23653–60. дои : 10.1074/jbc.M009891200 . ПМИД 11319220 .
Сэвилл Б., Пукка Х., Вормке М., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж., Стоунер М., Самудио И., Сейф С. (январь 2002 г.). «Кооперативная коактивация альфа-рецептора эстрогена в клетках рака молочной железы человека ZR-75 с помощью SNURF и ТАТА-связывающего белка» . Журнал биологической химии . 277 (4): 2485–97. дои : 10.1074/jbc.M109021200 . ПМИД 11696545 .
Перо Р., Лембо Ф., Палмьери Э.А., Витиелло С., Феделе М., Фуско А., Бруни С.Б., Кьяриотти Л. (февраль 2002 г.). «PATZ ослабляет RNF4-опосредованное усиление транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов» . Журнал биологической химии . 277 (5): 3280–5. дои : 10.1074/jbc.M109491200 . ПМИД 11719514 .
Ян В., Хирвонен-Сантти С.Дж., Палвимо Дж.Дж., Топпари Дж., Янне О.А. (октябрь 2002 г.). «Экспрессия ядерного белка RING-пальца SNURF/RNF4 во время развития семенников крыс предполагает его роль в созревании сперматид» . Механизмы развития . 118 (1–2): 247–53. дои : 10.1016/S0925-4773(02)00261-7 . ПМИД 12351196 . S2CID 15579434 .
Перо Р., Лембо Ф., Чиффи П., Дель Поццо Г., Феделе М., Фуско А., Бруни С.Б., Кьяриотти Л. (сентябрь 2003 г.). «Регуляция трансляции нового специфичного для семенников транскрипта RNF4». Молекулярное воспроизводство и развитие . 66 (1): 1–7. дои : 10.1002/mrd.10322 . ПМИД 12874792 . S2CID 6206480 .
Кайзер Ф.Дж., Мёрой Т., Чанг Г.Т., Хорстемке Б., Людеке Х.Дж. (октябрь 2003 г.). «Белок RING-пальца RNF4, корегулятор транскрипции, взаимодействует с транскрипционным фактором TRPS1» . Журнал биологической химии . 278 (40): 38780–5. дои : 10.1074/jbc.M306259200 . ПМИД 12885770 .
Лин Д.И., Фанг Х.И., Ма А.Х., Хуан Ю.С., Пу Ю.С., Дженстер Дж., Кунг Х.Дж., Ши Х.М. (декабрь 2004 г.). «Негативная модуляция транскрипционной активности андрогенных рецепторов с помощью Daxx» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (24): 10529–41. дои : 10.1128/MCB.24.24.10529-10541.2004 . ПМК 533990 . ПМИД 15572661 .

Внешние ссылки

RNF4 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000063978 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029110 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9479498-5] Кьяриотти Л., Бенвенуто Дж., Феделе М., Санторо М., Симеоне А., Фуско А., Бруни CB (январь 1998 г.). «Идентификация и характеристика нового картирования гена RING-пальца (RNF4) на участке 4p16.3». Геномика . 47 (2): 258–65. дои : 10.1006/geno.1997.5105 . ПМИД 9479498 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 4 безымянного пальца RNF4» .

[pmid10849425-7] Люнгсё К., Бутейллер Г., Дамгаард К.К., Риом Д., Санчес-Муньос С., Норби П.Л., Бонвен Б.Дж., Йоргенсен П. (август 2000 г.). «Взаимодействие между фактором транскрипции SPBP и положительным кофактором RNF4. Взаимодействие между белками, связывающими цинковые пальцы» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26144–9. дои : 10.1074/jbc.M003405200 . ПМИД 10849425 .

[pmid10713105-8] Феделе М, Бенвенуто Дж, Перо Р, Маджелло Б, Баттиста С, Лембо Ф, Воллоно Е, Дэй ПМ, Санторо М, Лания Л, Бруни CB, Фуско А, Кьяриотти Л (март 2000 г.). «Новый член семейства BTB/POZ, PATZ, связывается с белком RING-пальца RNF4 и действует как репрессор транскрипции» . Журнал биологической химии . 275 (11): 7894–901. дои : 10.1074/jbc.275.11.7894 . ПМИД 10713105 .

[pmid11719514-9] Jump up to: ^а ^б Перо Р., Лембо Ф., Палмьери Э.А., Витиелло С., Феделе М., Фуско А., Бруни С.Б., Кьяриотти Л. (февраль 2002 г.). «PATZ ослабляет RNF4-опосредованное усиление транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов» . Журнал биологической химии . 277 (5): 3280–5. дои : 10.1074/jbc.M109491200 . ПМИД 11719514 .

[pmid9710597-10] Мойланен А.М., Пукка Х., Карвонен У., Хакли М., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка RING Finger в качестве корегулятора транскрипции генов, опосредованной стероидными рецепторами» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (9): 5128–39. дои : 10.1128/mcb.18.9.5128 . ПМК 109098 . ПМИД 9710597 .

[pmid10617653-11] Пукка Х., Аарнисало П., Сантти Х., Янне О.А., Палвимо Дж.Дж. (январь 2000 г.). «Корегулятор малого ядерного белка RING Finger (SNURF) усиливает транскрипцию, опосредованную Sp1 и стероидными рецепторами, с помощью различных механизмов» . Журнал биологической химии . 275 (1): 571–9. дои : 10.1074/jbc.275.1.571 . ПМИД 10617653 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]