SF1 (ген)

СФ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1K1G, 1O0P, 1OPI, 2M09, 4FXW, 4FXX
Идентификаторы
Псевдонимы	SF1 , BBP, D11S636, MBBP, ZCCHC25, ZFM1, ZNF162, фактор сплайсинга 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601516 ; МГИ : 1095403 ; Гомологен : 138518 ; Генные карты : SF1 ; ОМА : SF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	64,778,786 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; left ovary; ; tibial nerve; ; gastric mucosa; ; right ovary; ; right lobe of thyroid gland; ; left uterine tube; ; canal of the cervix; ; right hemisphere of cerebellum; ; left lobe of thyroid gland;
	n/a
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transcription corepressor activity; zinc ion binding; metal ion binding; protein binding; nucleic acid binding; identical protein binding; pre-mRNA branch point binding; RNA binding;
Cellular component	ribosome; spliceosomal complex; nucleus; nucleoplasm; nuclear body;
Biological process	negative regulation of smooth muscle cell proliferation; regulation of transcription, DNA-templated; Leydig cell differentiation; mRNA processing; regulation of steroid biosynthetic process; male sex determination; transcription, DNA-templated; spliceosomal complex assembly; mRNA 3'-splice site recognition; RNA splicing; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; mRNA splicing, via spliceosome; nuclear body organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7536
	22668
	ENSG00000168066
	ENSMUSG00000024949
	Q15637
	Q64213
showНМ_001178030 ; НМ_001178031 ; НМ_004630 ; НМ_201995 ; НМ_201997 ;
	NM_201998; NM_001346363; NM_001346364; NM_001346409; NM_001346410; NM_001378956; NM_001378957
	НМ_001110791 ; НМ_011750
showНП_001171501 ; НП_001171502 ; НП_001333292 ; НП_001333293 ; НП_001333338 ;
	NP_001333339; NP_004621; NP_973724; NP_973726; NP_973727; NP_001365885; NP_001365886
showНП_001104261 ; НП_035880 ; НП_001347322 ; НП_001390363 ; НП_001390364 ;
	NP_001390365; NP_001390368; NP_001390369; NP_001390370; NP_001390371; NP_001390372; NP_001390373; NP_001390374; NP_001390375; NP_001390376; NP_001390377; NP_001390378
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор сплайсинга 1, также известный как белок 162 цинковых пальцев ( ZFM162 ), представляет собой белок , который у человека кодируется SF1 геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Фактор сплайсинга SF1 участвует в АТФ-зависимом формировании сплайсосомного комплекса. ^{[ 7 ]} Ген SF1 необходим для создания бипотенциальной гонады; но хотя уровни SF1 снижаются в генитальном гребне XX эмбрионов мышей, ген SF1 остается в развивающихся семенниках. SF 1 (фактор транскрипции), по-видимому, активен в маскулинизации как клеток Лейдига, так и клеток Сертоли. В клетках Сертоли белок SOX9 повышает уровень транскрипции АМГ. В клетках Лейдига он активирует ген, кодирующий фермент, вырабатывающий гормон тестостерон.

Взаимодействия

Было показано, что SF1 (ген) взаимодействует с областью 1 точки разрыва саркомы Юинга , ^{[ 8 ]} У2АФ2 , ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Фактор, определяющий яички , ^{[ 12 ]} и регулятор элонгации транскрипции 1 . ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000168066 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Тода Т., Иида А., Мива Т., Накамура Ю., Имаи Т. (июль 1994 г.). «Выделение и характеристика нового гена, кодирующего ядерный белок в локусе (D11S636), тесно связанном с множественной эндокринной неоплазией типа 1 (MEN1)». Хум Мол Жене . 3 (3): 465–70. дои : 10.1093/hmg/3.3.465 . ПМИД 7912130 .
^ Крамер А., Квентин М., Мулхаузер Ф. (июнь 1998 г.). «Различные способы альтернативного сплайсинга человеческого фактора сплайсинга SF-1, выведенные из экзон-интронной структуры гена». Джин . 211 (1): 29–37. дои : 10.1016/S0378-1119(98)00058-4 . ПМИД 9573336 .
^ «Ген Энтрез: фактор сплайсинга SF1 1» .
^ Рино Дж., Дестерро Х.М., Пачеко Т.Р., Гаделла Т.В., Кармо-Фонсека М. (май 2008 г.). «Факторы сплайсинга SF1 и U2AF объединяются в экстрасплайсосомные комплексы» . Мол. Клетка. Биол . 28 (9): 3045–57. дои : 10.1128/MCB.02015-07 . ПМК 2293075 . ПМИД 18285458 .
^ Чжан Д., Пейли А.Дж., Чайлдс Дж. (июль 1998 г.). «Репрессор транскрипции ZFM1 взаимодействует и модулирует способность EWS активировать транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 273 (29): 18086–91. дои : 10.1074/jbc.273.29.18086 . ПМИД 9660765 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Берглунд Ю.А., Абович Н., Росбаш М. (март 1998 г.). «Совместное взаимодействие между U2AF65 и mBBP/SF1 облегчает распознавание области точки ветвления» . Генс Дев . 12 (6): 858–67. дои : 10.1101/gad.12.6.858 . ПМК 316625 . ПМИД 9512519 .
^ Абович Н., Росбаш М. (май 1997 г.). «Межинтронные мостиковые взаимодействия в коммитентном комплексе дрожжей законсервированы у млекопитающих» . Клетка . 89 (3): 403–12. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80221-4 . ПМИД 9150140 . S2CID 18466775 .
^ Кашимада К., Купман П. (декабрь 2010 г.). «Сорри: главный переключатель в определении пола млекопитающих» . Разработка . 137 (23): 3921–30. дои : 10.1242/dev.048983 . ПМИД 21062860 .
^ Гольдстрем AC, Альбрехт Т.Р., Сунье К., Бедфорд М.Т., Гарсиа-Бланко М.А. (ноябрь 2001 г.). «Фактор элонгации транскрипции CA150 взаимодействует с РНК-полимеразой II и фактором сплайсинга пре-мРНК SF1» . Мол. Клетка. Биол . 21 (22): 7617–28. дои : 10.1128/MCB.21.22.7617-7628.2001 . ПМК 99933 . ПМИД 11604498 .

Дальнейшее чтение

Кремер А (1992). «Очистка фактора сплайсинга SF1, термостабильного белка, который участвует в сборке пресплайсингового комплекса» . Мол. Клетка. Биол . 12 (10): 4545–52. дои : 10.1128/MCB.12.10.4545 . ПМК 360381 . ПМИД 1406644 .
Наумовски Л., Клири М.Л. (1996). «Р53-связывающий белок 53BP2 также взаимодействует с Bc12 и препятствует развитию клеточного цикла на уровне G2/M» . Мол. Клетка. Биол . 16 (7): 3884–92. дои : 10.1128/MCB.16.7.3884 . ПМК 231385 . ПМИД 8668206 .
Арнинг С., Грютер П., Бильбе Г., Кремер А. (1996). «Фактор сплайсинга млекопитающих SF1 кодируется вариантами кДНК и связывается с РНК» . РНК . 2 (8): 794–810. ПМЦ 1369416 . ПМИД 8752089 .
Абович Н, Росбаш М (1997). «Межинтронные мостиковые взаимодействия в коммитентном комплексе дрожжей законсервированы у млекопитающих» . Клетка . 89 (3): 403–12. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80221-4 . ПМИД 9150140 . S2CID 18466775 .
Каслини С., Спинелли О., Каззанига Г. и др. (1997). «Идентификация двух новых изоформ гена ZNF162: растущее семейство сигнальной трансдукции и активатора белков РНК». Геномика . 42 (2): 268–77. дои : 10.1006/geno.1997.4705 . ПМИД 9192847 .
Чжан Д., Чайлдс Дж. (1998). «Человеческий белок ZFM1 представляет собой репрессор транскрипции, который взаимодействует с доменом активации транскрипции стадийно-специфического белка-активатора» . Ж. Биол. Хим . 273 (12): 6868–77. дои : 10.1074/jbc.273.12.6868 . ПМИД 9506990 .
Берглунд Ю.А., Абович Н., Росбаш М. (1998). «Совместное взаимодействие между U2AF65 и mBBP/SF1 облегчает распознавание области точки ветвления» . Генс Дев . 12 (6): 858–67. дои : 10.1101/gad.12.6.858 . ПМК 316625 . ПМИД 9512519 .
Чжан Д., Пейли А.Дж., Чайлдс Дж. (1998). «Репрессор транскрипции ZFM1 взаимодействует и модулирует способность EWS активировать транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 273 (29): 18086–91. дои : 10.1074/jbc.273.29.18086 . ПМИД 9660765 .
Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж. и др. (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Нат. Жене . 20 (1): 46–50. дои : 10.1038/1700 . ПМИД 9731529 . S2CID 585778 .
Ван X, Брюдерер С., Рафи З. и др. (1999). «Фосфорилирование фактора сплайсинга SF1 на Ser20 с помощью цГМФ-зависимой протеинкиназы регулирует сборку сплайсосомы» . ЭМБО Дж . 18 (16): 4549–59. дои : 10.1093/emboj/18.16.4549 . ПМЦ 1171529 . ПМИД 10449420 .
Лаптева Н., Ниеда М., Андо Ю. и др. (2001). «Экспрессия генов ренин-ангиотензиновой системы в незрелых и зрелых дендритных клетках, выявленная с использованием микроматрицы кДНК человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 285 (4): 1059–65. дои : 10.1006/bbrc.2001.5215 . ПМИД 11467860 .
Гольдстрем А.С., Альбрехт Т.Р., Сунье С. и др. (2001). «Фактор элонгации транскрипции CA150 взаимодействует с РНК-полимеразой II и фактором сплайсинга пре-мРНК SF1» . Мол. Клетка. Биол . 21 (22): 7617–28. дои : 10.1128/MCB.21.22.7617-7628.2001 . ПМК 99933 . ПМИД 11604498 .
Лю З., Люйтен И., Боттомли М.Дж. и др. (2001). «Структурная основа распознавания РНК сайта ветвления интрона фактором сплайсинга 1» . Наука . 294 (5544): 1098–102. Бибкод : 2001Sci...294.1098L . дои : 10.1126/science.1064719 . ПМИД 11691992 . S2CID 21402023 .
Раппсилбер Дж., Райдер У., Ламонд А.И., Манн М. (2002). «Крупномасштабный протеомный анализ сплайсосомы человека» . Геном Рез . 12 (8): 1231–45. дои : 10.1101/гр.473902 . ЧВК 186633 . ПМИД 12176931 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Селенко П., Грегорович Г., Спрангерс Р. и др. (2003). «Структурная основа молекулярного распознавания между факторами сплайсинга человека U2AF65 и SF1/mBBP» . Мол. Клетка . 11 (4): 965–76. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00115-1 . ПМИД 12718882 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Лин КТ, Лу РМ, Тарн, Вайоминг (2004). «Белки, содержащие домен WW, взаимодействуют с ранней сплайсосомой и участвуют в сплайсинге пре-мРНК in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 24 (20): 9176–85. дои : 10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004 . ПМК 517884 . PMID 15456888 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000168066 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7912130-4] Тода Т., Иида А., Мива Т., Накамура Ю., Имаи Т. (июль 1994 г.). «Выделение и характеристика нового гена, кодирующего ядерный белок в локусе (D11S636), тесно связанном с множественной эндокринной неоплазией типа 1 (MEN1)». Хум Мол Жене . 3 (3): 465–70. дои : 10.1093/hmg/3.3.465 . ПМИД 7912130 .

[pmid9573336-5] Крамер А., Квентин М., Мулхаузер Ф. (июнь 1998 г.). «Различные способы альтернативного сплайсинга человеческого фактора сплайсинга SF-1, выведенные из экзон-интронной структуры гена». Джин . 211 (1): 29–37. дои : 10.1016/S0378-1119(98)00058-4 . ПМИД 9573336 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: фактор сплайсинга SF1 1» .

[pmid18285458-7] Рино Дж., Дестерро Х.М., Пачеко Т.Р., Гаделла Т.В., Кармо-Фонсека М. (май 2008 г.). «Факторы сплайсинга SF1 и U2AF объединяются в экстрасплайсосомные комплексы» . Мол. Клетка. Биол . 28 (9): 3045–57. дои : 10.1128/MCB.02015-07 . ПМК 2293075 . ПМИД 18285458 .

[pmid9660765-8] Чжан Д., Пейли А.Дж., Чайлдс Дж. (июль 1998 г.). «Репрессор транскрипции ZFM1 взаимодействует и модулирует способность EWS активировать транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 273 (29): 18086–91. дои : 10.1074/jbc.273.29.18086 . ПМИД 9660765 .

[pmid16189514-9] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid9512519-10] Берглунд Ю.А., Абович Н., Росбаш М. (март 1998 г.). «Совместное взаимодействие между U2AF65 и mBBP/SF1 облегчает распознавание области точки ветвления» . Генс Дев . 12 (6): 858–67. дои : 10.1101/gad.12.6.858 . ПМК 316625 . ПМИД 9512519 .

[pmid9150140-11] Абович Н., Росбаш М. (май 1997 г.). «Межинтронные мостиковые взаимодействия в коммитентном комплексе дрожжей законсервированы у млекопитающих» . Клетка . 89 (3): 403–12. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80221-4 . ПМИД 9150140 . S2CID 18466775 .

[Kashimada_Koopman_2010-12] Кашимада К., Купман П. (декабрь 2010 г.). «Сорри: главный переключатель в определении пола млекопитающих» . Разработка . 137 (23): 3921–30. дои : 10.1242/dev.048983 . ПМИД 21062860 .

[pmid11604498-13] Гольдстрем AC, Альбрехт Т.Р., Сунье К., Бедфорд М.Т., Гарсиа-Бланко М.А. (ноябрь 2001 г.). «Фактор элонгации транскрипции CA150 взаимодействует с РНК-полимеразой II и фактором сплайсинга пре-мРНК SF1» . Мол. Клетка. Биол . 21 (22): 7617–28. дои : 10.1128/MCB.21.22.7617-7628.2001 . ПМК 99933 . ПМИД 11604498 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]