KLK4

KLK4
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2BDG, 2BDH, 2BDI, 4K1E, 4K8Y, 4KEL, 4KGA
Идентификаторы
Псевдонимы	KLK4 , AI2A1, ARM1, EMSP, EMSP1, KLK-L1, PRSS17, PSTS, Kallikrein, Kallikrein, связанные с пептидами 4
Внешние идентификаторы	Омим : 603767 ; MGI : 1861379 ; Гомологен : 55856 ; GeneCards : KLK4 ; OMA : KLK4 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	50,911,395 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	43,535,228 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	prostate; ; mucosa of transverse colon; ; testicle; ; skin of leg; ; skin of abdomen; ; gonad; ; salivary gland; ; minor salivary glands; ; left lobe of thyroid gland; ; canal of the cervix;
	Top expressed in
	molar; ; decidua; ; thymus; ; muscle; ; rhombencephalon; ; pituitary gland; ; adipose tissue; ; brown adipose tissue; ; muscle tissue; ; torso;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	peptidase activity; serine-type peptidase activity; protein binding; hydrolase activity; metal ion binding; serine-type endopeptidase activity;
Cellular component	extracellular region; secretory granule;
Biological process	proteolysis; amelogenesis; biomineral tissue development; extracellular matrix disassembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9622
	56640
	ENSG00000167749
	Emsmusmb00000006948
	Q9Y5K2
	Q9Z0M1
	NM_001302961 ; NM_004917
	NM_019928
	NP_001289890 ; NP_004908
	NP_064312
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Пептидаза 4, связанная с калликреином, является белком , который у людей кодируется KLK4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Калликреины являются подгруппой сериновых протеаз, имеющих разнообразные физиологические функции. ^{[ 8 ]} Растущие данные свидетельствуют о том, что многие калликреины участвуют в канцерогенезе , а некоторые имеют потенциал в качестве нового рака и других биомаркеров заболевания . В частности, они могут служить биомаркерами как для рака простаты, так и для рака молочной железы.

Этот ген является одним из пятнадцати членов подсемейства Kallikrein, расположенных в кластере на хромосоме 19. В некоторых тканях ее экспрессия регулируется гормонально. Паттерн экспрессии сходного белка мыши в мыши, развивающихся зубов, подтверждает роль белка в деградации эмалевых белков. ^{[ 9 ]} Альтернативные варианты сплайсинга для этого гена были описаны, но их биологическая достоверность не была определена. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000167749 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000006948 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Simmer JP, Fukae M, Tanabe T, Yamakoshi Y, Uchida T, Xue J, Margolis HC, Shimizu M, Dehart BC, Hu CC, Bartlett JD (февраль 1998 г.). «Очистка, характеристика и клонирование эмалевой матрицы сериновой протеиназы 1» . Журнал стоматологических исследований . 77 (2): 377–86. doi : 10.1177/00220345980770020601 . PMID 9465170 . S2CID 21816663 . Архивировано из оригинала 2008-08-21 . Получено 2008-10-20 .
^ Нельсон П.С., Ган Л., Фергюсон С., Мосс П., Гелинас Р., Худ Л., Ван К (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика простазы, андроген-регулируемой сериновой протеазы с ограниченной простатой экспрессией» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 3114–9. Bibcode : 1999pnas ... 96.3114n . doi : 10.1073/pnas.96.6.3114 . PMC 15904 . PMID 10077646 .
^ Стивенсон С.А., Верити К., Эшворт Л.К., Клементс Дж.А. (август 1999 г.). «Локализация нового специфического для простаты гена сериновой протеазы, связанного с антигеном, KLK4, является доказательством расширенного кластера семейства генов калликреина человека на хромосоме 19q13.13.4» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23210–4. doi : 10.1074/jbc.274.33.23210 . PMID 10438493 .
^ Lundwall A, Band V, Blaber M, Clements JA, Courty Y, Diamandis EP, Fritz H, Lilja H, Malm J, Maltais LJ, Olsson AY, Petraki C, Scorilas A, Sotiropoulou G, Stenman UH, Stephan C, Talieri M. , Yousef GM (июнь 2006 г.). «Комплексная номенклатура для сериновых протеаз с гомологией к тканям каллинеинов» . Биологическая химия . 387 (6): 637–41. doi : 10.1515/bc.2006.082 . PMID 16800724 . S2CID 436200 .
^ Simmer JP, Fukae M, Tanabe T, Yamakoshi Y, Uchida T, Xue J, Margolis HC, Shimizu M, Dehart BC, Hu CC, Bartlett JD (июнь 2000 г.). «Характеристика генов PRSS17 мыши и человека, их связь с другими сериновыми протеазами и экспрессия PRSS17 в развивающихся резцах мыши» . Ген . 251 (1): 1–8. doi : 10.1016/s0378-1119 (00) 00203-1 . PMID 10863090 . Архивировано из оригинала 2008-08-21 . Получено 2008-10-20 .
^ «Ген Entrez: Klk4 Kallikrein, связанная с пептидазой 4» .

Дальнейшее чтение

Клементс Дж., Хупер Дж., Донг Й., Харви Т. (2001). «Расширенное семейство генов Kallikrein (KLK) человека: геномная организация, тканевая экспрессия и потенциальные функции» (PDF) . Биол. Химический 382 (1): 5–14. doi : 10.1515/bc.2001.002 . PMID 11258672 . S2CID 5864448 .
Simmer JP, Fukae M, Tanabe T, et al. (1998). «Очистка, характеристика и клонирование эмалевой матрицы сериновой протеиназы 1». J. Dent. Резерв 77 (2): 377–86. doi : 10.1177/00220345980770020601 . PMID 9465170 . S2CID 21816663 .
Нельсон П.С., Ган Л., Фергюсон С. и др. (1999). «Молекулярное клонирование и характеристика простазы, андроген-регулируемой сериновой протеазы с ограниченной простатой экспрессией» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (6): 3114–9. Bibcode : 1999pnas ... 96.3114n . doi : 10.1073/pnas.96.6.3114 . PMC 15904 . PMID 10077646 .
Стивенсон С.А., Верити К., Эшворт Л.К., Клементс Дж.А. (1999). «Локализация нового простат-специфического гена серинового протеазы, связанного с антигеном, KLK4, является доказательством расширенного кластера семейства генов калликреина человека на хромосоме 19Q13.3-13,4» . Дж. Биол. Химический 274 (33): 23210–4. doi : 10.1074/jbc.274.33.23210 . PMID 10438493 .
Yousef GM, Obiezu CV, Luo Ly, et al. (1999). «Простаза/KLK-L1-новый член семейства генов калликреина человека, экспрессируется в тканях простаты и молочной железы и регулируется гормонально». Рак . 59 (17): 4252–6. PMID 10485467 .
Dupont BR, Hu CC, Reveles X, Simmer JP (2000). «Присвоение сериновой протеазы 17 (PRSS17) для хромосомных полос человека 19Q13.3 → Q13.4 с помощью гибридизации in situ». Цитогенет. Клеточная генера . 86 (3–4): 212–3. doi : 10.1159/000015340 . PMID 10575207 . S2CID 42446073 .
Hu JC, Zhang C, Sun X, et al. (2000). «Характеристика генов PRSS17 мыши и человека, их связь с другими сериновыми протеазами и экспрессия PRSS17 в развивающихся резцах мыши». Ген . 251 (1): 1–8. doi : 10.1016/s0378-1119 (00) 00203-1 . PMID 10863090 .
Gan L, Lee I, Smith R, et al. (2001). «Анализ секвенирования и экспрессии кластера генов сериновой протеазы, расположенного в области хромосомы 19Q13». Ген . 257 (1): 119–30. doi : 10.1016/s0378-1119 (00) 00382-6 . PMID 11054574 .
Obiezu CV, Diamandis EP (2001). «Альтернативно сплайсированный вариант KLK4, экспрессируемый в простатической ткани». Клин Биохимия . 33 (7): 599–600. doi : 10.1016/s0009-9120 (00) 00178-8 . PMID 11124349 .
Такаяма Т.К., Картер К.А., Дэн Т. (2001). «Активация простат-специфического предшественника антигена (Pro-PSA) простином, новой сериновой протеазой простатики человека, идентифицированной вырожденной ПЦР». Биохимия . 40 (6): 1679–87. doi : 10.1021/bi002129r . PMID 11327827 .
Korkmaz KS, Korkmaz CG, Pretlow TG, Saatcioglu F (2001). «Отчетливо различная генная структура KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1 по сравнению с другими членами семейства Kallikrein: внутриклеточная локализация, альтернативная форма кДНК и регуляция с помощью множественных гормонов». ДНК -клеточная биол . 20 (7): 435–45. doi : 10.1089/104454901750361497 . PMID 11506707 .
Takayama TK, McMullen BA, Nelson PS, et al. (2002). «Характеристика HK4 (простаза), специфической для простаты сериновой протеазы: активация предшественника специфического антигена простаты (Pro-PSA) и активатора плазминогена одноцепочечного типа и деградации фосфатазы простатической кислоты». Биохимия . 40 (50): 15341–8. doi : 10.1021/bi015775e . PMID 11735417 .
Hural JA, Friedman RS, McNabb A, et al. (2002). «Идентификация естественных эпитопов CD4 T-клеток из простат-специфического антигена Kallikrein 4 с использованием стимуляции in vitro на основе пептидов» . J. Immunol . 169 (1): 557–65. doi : 10.4049/jimmunol.169.1.557 . PMID 12077288 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Grimwood J, Gordon LA, Olsen A, et al. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы человека 19» . Природа . 428 (6982): 529–35. Bibcode : 2004natur.428..529G . doi : 10.1038/nature02399 . PMID 15057824 .
Xi Z, Klokk Ti, Korkmaz K, et al. (2004). «Kallikrein 4 является преимущественно ядерным белком и сверхэкспрессируется при раке простаты». Рак . 64 (7): 2365–70. doi : 10.1158/0008-5472.can-03-2025 . PMID 15059887 . S2CID 301169 .
Hart PS, Hart TC, Michalec MD, et al. (2004). «Мутация в калликреине 4 вызывает аутосомно -рецессивную гипоматурацию несовершенного амелогенеза» . J. Med. Генет . 41 (7): 545–9. doi : 10.1136/jmg.2003.017657 . PMC 1735847 . PMID 15235027 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Veveris-Lowe TL, Lawrence MG, Collard RL, et al. (2005). «Kallikrein 4 (HK4) и простат-специфический антиген (PSA) связаны с потерей E-кадгерина и эпителиально-мезенхимальным переходом (EMT), подобным эффекту в клетках рака простаты» . Эндок. Относительно Рак . 12 (3): 631–43. doi : 10.1677/erc.1.00958 . HDL : 2027,42/152955 . PMID 16172196 .

Внешние ссылки

Онлайн -база данных Merops : для пептидаз и их ингибиторов S01.251

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000167749 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000006948 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9465170-5] Simmer JP, Fukae M, Tanabe T, Yamakoshi Y, Uchida T, Xue J, Margolis HC, Shimizu M, Dehart BC, Hu CC, Bartlett JD (февраль 1998 г.). «Очистка, характеристика и клонирование эмалевой матрицы сериновой протеиназы 1» . Журнал стоматологических исследований . 77 (2): 377–86. doi : 10.1177/00220345980770020601 . PMID 9465170 . S2CID 21816663 . Архивировано из оригинала 2008-08-21 . Получено 2008-10-20 .

[pmid10077646-6] Нельсон П.С., Ган Л., Фергюсон С., Мосс П., Гелинас Р., Худ Л., Ван К (март 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика простазы, андроген-регулируемой сериновой протеазы с ограниченной простатой экспрессией» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 3114–9. Bibcode : 1999pnas ... 96.3114n . doi : 10.1073/pnas.96.6.3114 . PMC 15904 . PMID 10077646 .

[pmid10438493-7] Стивенсон С.А., Верити К., Эшворт Л.К., Клементс Дж.А. (август 1999 г.). «Локализация нового специфического для простаты гена сериновой протеазы, связанного с антигеном, KLK4, является доказательством расширенного кластера семейства генов калликреина человека на хромосоме 19q13.13.4» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23210–4. doi : 10.1074/jbc.274.33.23210 . PMID 10438493 .

[pmid16800724-8] Lundwall A, Band V, Blaber M, Clements JA, Courty Y, Diamandis EP, Fritz H, Lilja H, Malm J, Maltais LJ, Olsson AY, Petraki C, Scorilas A, Sotiropoulou G, Stenman UH, Stephan C, Talieri M. , Yousef GM (июнь 2006 г.). «Комплексная номенклатура для сериновых протеаз с гомологией к тканям каллинеинов» . Биологическая химия . 387 (6): 637–41. doi : 10.1515/bc.2006.082 . PMID 16800724 . S2CID 436200 .

[pmid10863090-9] Simmer JP, Fukae M, Tanabe T, Yamakoshi Y, Uchida T, Xue J, Margolis HC, Shimizu M, Dehart BC, Hu CC, Bartlett JD (июнь 2000 г.). «Характеристика генов PRSS17 мыши и человека, их связь с другими сериновыми протеазами и экспрессия PRSS17 в развивающихся резцах мыши» . Ген . 251 (1): 1–8. doi : 10.1016/s0378-1119 (00) 00203-1 . PMID 10863090 . Архивировано из оригинала 2008-08-21 . Получено 2008-10-20 .

[entrez-10] «Ген Entrez: Klk4 Kallikrein, связанная с пептидазой 4» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]