Arfgef2

Arfgef2
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3L8N, 3SWV
Идентификаторы
Псевдонимы	ARFGEF2 , BIG2, PVNH2, DJ1164I10.1, Фактор рибозилирования ADP Гуанинового обмена.
Внешние идентификаторы	Омим : 605371 ; MGI : 2139354 ; Гомологен : 111880 ; GeneCards : Arfgef2 ; OMA : arfgef2 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	49,036,693 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	166,739,972 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	cartilage tissue; ; jejunal mucosa; ; parotid gland; ; Epithelium of choroid plexus; ; corpus epididymis; ; skin of thigh; ; cardia; ; mucosa of sigmoid colon; ; secondary oocyte; ; retinal pigment epithelium;
	Top expressed in
	retinal pigment epithelium; ; lacrimal gland; ; secondary oocyte; ; submandibular gland; ; Epithelium of choroid plexus; ; stroma of bone marrow; ; superior cervical ganglion; ; epithelium of stomach; ; interventricular septum; ; medial vestibular nucleus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	guanyl-nucleotide exchange factor activity; GABA receptor binding; myosin binding; protein binding; protein kinase A regulatory subunit binding;
Cellular component	cytoplasm; recycling endosome; cytosol; endosome; Golgi apparatus; cell projection; membrane; Golgi membrane; dendritic spine; synapse; microtubule organizing center; cell junction; trans-Golgi network; dendrite; symmetric synapse; asymmetric synapse; perinuclear region of cytoplasm; cytoskeleton; cytoplasmic vesicle; axonemal microtubule;
Biological process	endomembrane system organization; intracellular signal transduction; regulation of ARF protein signal transduction; endosome organization; receptor recycling; positive regulation of tumor necrosis factor production; protein transport; Golgi to plasma membrane transport; exocytosis; transport; regulation of molecular function; vesicle-mediated transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10564
	99371
	ENSG00000124198
	Ensmusg00000074582
	Q9y6d5
	A2A5R2
	NM_006420
	NM_001085495
	NP_006411
	NP_001078964
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Брефельдин А-ингибированный гуаниновый нуклеотидный белок 2 является белком , который у людей кодируется arfgef2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Факторы ADP-рибозилирования (ARF) играют важную роль во внутриклеточном пузикулярном транспорте. Белок, кодируемый этим геном, участвует в активации ARF, ускоряющей замену связанного ВВП GTP и участвует в Гольджи транспорте . Он содержит домен SEC7, который может быть ответственным за его гуанино-нуклеотидную активность, а также ингибирование Брефельдина А. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ARFGEF2 взаимодействует с ARFGEF1 , ^{[ 7 ]} Prkar1a ^{[ 8 ]} и prkar2a . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000124198 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000074582 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Тогава А., Моринага Н., Огасавара М., Мосс Дж., Воган М. (апрель 1999). «Очистка и клонирование брефельдина, ингибируемого гваниновым нуклеотидным белком для факторов ADP-рибозилирования» . Журнал биологической химии . 274 (18): 12308–15. doi : 10.1074/jbc.274.18.12308 . PMID 10212200 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: ADP-рибозилирующий фактор ARFGEF2 Гуанинового нуклеотидного обмена фактора 2 (ингибированный Brefeldin A)» .
^ Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (март 2000 г.). «Идентификация и локализация двух ингибируемых брефельдина A-ингибированных белков гваниновых нуклеотидов для факторов ADP-рибозилирования в макромолекулярном комплексе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (6): 2567–72. Bibcode : 2000pnas ... 97.2567y . doi : 10.1073/pnas.97.6.2567 . PMC 15969 . PMID 10716990 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ли Х, Адамик Р., Пачеко-Родригес Г., Мосс Дж., Воган М. (февраль 2003 г.). «Домены ANCHORE (AKAP) протеинкиназы A (AKAP) в ингибированном брефельдина A-ингибированном я нуклеотидном белке 2 (BIG2) (BIG2)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (4): 1627–32. Bibcode : 2003pnas..100.1627L . doi : 10.1073/pnas.0337678100 . PMC 149883 . PMID 12571360 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома ARFGEF2 и ARFGEF2 страница гена в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (март 2000 г.). «Идентификация и локализация двух ингибируемых брефельдина A-ингибированных белков гваниновых нуклеотидов для факторов ADP-рибозилирования в макромолекулярном комплексе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (6): 2567–72. Bibcode : 2000pnas ... 97.2567y . doi : 10.1073/pnas.97.6.2567 . PMC 15969 . PMID 10716990 .
Kamei Y, Takeda Y, Teramoto K, Tsutsumi O, Taketani Y, Watanabe K (октябрь 2000). «Человеческий NB-2 молекул подгруппы контактов: хромосомная локализация гена (CNTN5) и четкий паттерн экспрессии от других членов подгруппы». Геномика . 69 (1): 113–9. doi : 10.1006/geno.2000.6310 . PMID 11013081 .
Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (2002). «Big1 и Big2: Brefeldin A-ингибированные гуаниновые нуклеотидные белки для факторов ADP-рибозилирования». G белковые пути - часть C, эффекторные механизмы . Методы в фермере. Тол. 345. С. 397–404. doi : 10.1016/s0076-6879 (02) 45032-x . ISBN 9780121822460 Полем PMID 11665623 .
Shinotsuka C, Yoshida Y, Kawamoto K, Takatsu H, Nakayama K (март 2002 г.). «Чрезмерная экспрессия фактора обмена нуклеотид-обмена я нуклеотидный обмену нуклеотидного обмена, BIG2, рассеянный диссоциация адаптерного белка-1-индуцированного адаптерного белка-1 и мембранные трубки» . Журнал биологической химии . 277 (11): 9468–73. doi : 10.1074/jbc.m112427200 . PMID 11777925 .
Shinotsuka C, Waguri S, Wakasugi M, Uchiyama Y, Nakayama K (Jun 2002). «Доминантно-отрицательный мутант BIG2, фактора обмена нуклеотидов ARF-гуанина, в частности, влияет на перенос мембраны из сети транс-Гольджи посредством ингибирующей мембранной ассоциации белков AP-1 и GGA Poat». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 294 (2): 254–60. doi : 10.1016/s0006-291x (02) 00456-4 . PMID 12051703 .
Ли Х, Адамик Р., Пачеко-Родригес Г., Мосс Дж., Воган М. (февраль 2003 г.). «Домены ANCHORE (AKAP) протеинкиназы A (AKAP) в ингибированном брефельдина A-ингибированном я нуклеотидном белке 2 (BIG2) (BIG2)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (4): 1627–32. Bibcode : 2003pnas..100.1627L . doi : 10.1073/pnas.0337678100 . PMC 149883 . PMID 12571360 .
Шин В.Л., Ганеш В.С., Топку М., Себир Г., Боделл А., Хилл Р.С., Грант П.Е., Шугарт Ю.Ю., Имитола Дж., Хури С.Дж., Геррини Р., Уолш Калифорния (январь 2004 г.). «Мутации в ARFGEF2 включают в себя перенос пузырьков в пролиферации и миграции нервных предшественников в коре головного мозга человека» . Природа генетика . 36 (1): 69–76. doi : 10.1038/ng1276 . PMID 14647276 .
Colland F, Jacq X, Truplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (Jul 2004). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Исследование генома . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004pnas..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Сюй К.Ф., Шен Х, Ли Х, Пачеко-Родригес Г., Мосс Дж., Воган М. (февраль 2005 г.). «Взаимодействие BIG2, ингибируемого брефельдина A-ингибированным я нуклеотидным белком, с белком экзоцисты EXO70» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (8): 2784–9. Bibcode : 2005pnas..102.2784x . doi : 10.1073/pnas.0409871102 . PMC 549493 . PMID 15705715 .
Lu J, Tiao G, Folkerth R, Hecht J, Walsh C, Sheen V (январь 2006 г.). «Перекрывающаяся экспрессия ARFGEF2 и поля A в нейроэпендимальной слизистой оболочке боковых вентиляторов: понимание причины перивентриолаларарной гетеротопии» Журнал сравнительной неврологии 494 (3): 476–8 Doi : 10.1002/ cne.20806 16320251PMID 16527134S2CID
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Ислам А., Шен Х, Хирои Т., Мосс Дж., Воган М., Левин С.Дж. (март 2007 г.). «Брефельдин-а-ингибированный гуаниновый нуклеотидный белок обмена, BIG2, регулирует конститутивное высвобождение экзосомиподобных везикул TNFR1» . Журнал биологической химии . 282 (13): 9591–9. doi : 10.1074/jbc.m607122200 . PMID 17276987 .
Курода Ф., Мосс Дж., Воган М (февраль 2007 г.). «Регуляция брефельдина A-ингибированного гуанинового нуклеотидного белка 1 (BIG1) и активности BIG2 с помощью PKA и белковой фосфатазы 1гамма» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (9): 3201–6. Bibcode : 2007pnas..104.3201K . doi : 10.1073/pnas.0611696104 . PMC 1805514 . PMID 17360629 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000124198 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000074582 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10212200-5] Тогава А., Моринага Н., Огасавара М., Мосс Дж., Воган М. (апрель 1999). «Очистка и клонирование брефельдина, ингибируемого гваниновым нуклеотидным белком для факторов ADP-рибозилирования» . Журнал биологической химии . 274 (18): 12308–15. doi : 10.1074/jbc.274.18.12308 . PMID 10212200 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: ADP-рибозилирующий фактор ARFGEF2 Гуанинового нуклеотидного обмена фактора 2 (ингибированный Brefeldin A)» .

[pmid10716990-7] Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (март 2000 г.). «Идентификация и локализация двух ингибируемых брефельдина A-ингибированных белков гваниновых нуклеотидов для факторов ADP-рибозилирования в макромолекулярном комплексе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (6): 2567–72. Bibcode : 2000pnas ... 97.2567y . doi : 10.1073/pnas.97.6.2567 . PMC 15969 . PMID 10716990 .

[pmid12571360-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Ли Х, Адамик Р., Пачеко-Родригес Г., Мосс Дж., Воган М. (февраль 2003 г.). «Домены ANCHORE (AKAP) протеинкиназы A (AKAP) в ингибированном брефельдина A-ингибированном я нуклеотидном белке 2 (BIG2) (BIG2)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (4): 1627–32. Bibcode : 2003pnas..100.1627L . doi : 10.1073/pnas.0337678100 . PMC 149883 . PMID 12571360 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]