DecisionX-A

DecisionDX-UM -это прогностический тест, который точно определяет метастатический риск, связанный с опухолями глаз глаз глаз. Гласть меланома является термином, обычно используемым для описания опухолей увеального тракта , таких как увеальная меланома , хориоидальная меланома , меланома ресничного тела и меланома радужной оболочки. Тест Deciesdx-UM был клинически подтвержден на этих опухолях Uveal Tract. DecisionDX-UM оценивает профиль экспрессии генов (GEP) подмножества генов, которые дифференциально экспрессируются в первичных опухолевых клетках по сравнению с клетками, которые подвергались трансформации в метастатический фенотип.

Тест классифицирует опухоли как:

Класс 1а (низкий метастатический риск),
Класс 1B (долгосрочный метастатический риск),
Класс 2 (немедленный, высокий метастатический риск). ^{[ 1 ]}

Также называется профилем экспрессии генов, тест был непосредственно сравнивать со всеми другими клиническими и патологическими факторами, такими как хромосомы статус 3 ( моносомия 3), цитопатология и размер опухоли и тест DecisionDx-UM, как было показано эти другие факторы. ^{[ 2 ]} Тест Deciesdx-UM стал стандартом медицинской помощи в большинстве онкологических центров глазной онкологии в США и рекомендуется Американским совместным комитетом по раку (AJCC). AJCC рекомендует это тестирование для всех пациентов с диагнозом увеальной меланомы, поскольку результаты «клинически значимы». Точные результаты достигаются с использованием как биопсии, связанной с тонкой иглой, (FNAB), так и фиксированной формалином , парафином опухолевой тканью встроенной (FFPE). Прогностическая информация, предоставленная DecisionDX-UM, помогает врачам и их пациентам принимать индивидуальные решения о наблюдении и терапевтических вариантах, которые являются наиболее подходящими. Тест Deciesdx-UM был исключительно лицензирован в Вашингтонском университете в Сент-Луисе и доступен только через Castle Biosciences , Incorporated.

Увеальная меланома

В то время как редко увеальная меланома (глазная меланома) является наиболее распространенной формой рака глаз и второй наиболее распространенной формы меланомы . Уцеальные опухоли меланомы возникают в увеальном тракте глаза, который включает радужную оболочку , ресничное тело и сосудистую оболочку . Лечение первичной опухоли глаз состоит из терапии, снявшей глаз ( лучевая терапия бляшки или облучение протонного луча ) или удаление глаз ( энуклеация ). Оба очень эффективны с показателями «лечения» выше 90%. Однако, как было хорошо задокументировано в многочисленных публикациях, включая исследование совместной глазной меланомы (COMS), почти у 50% пациентов меланома, вероятно, уже метастазировала к моменту диагноза и лечения первичной опухоли глаз. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Большинство из этих метастазов являются микроскопическими и клинически не обнаруженными во время первичной диагностики опухоли. ^{[ 5 ]} К сожалению, многие из современных методов диагностики (включая тестирование визуализации и функции печени) не способны точно обнаруживать микрометастазы, пока опухолевые узелки не вырастут значительно, и, вероятно, становятся устойчивыми к терапии. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Отсутствие точных прогностических тестов для выявления того, какие пациенты подвергаются риску развития клинически открытого метастатического заболевания, стало важной проблемой в лечении отдельных пациентов с увеальной меланомой. Без точных измерений индивидуального метастатического риска невозможно определить, какие пациенты подвергаются высокому риску клинического метастазирования, что затем может привести к либо обратному или недостаточному лечению любого данного пациента. Был разработан тест DecisionDX-UM для обеспечения улучшенной индивидуальной оценки метастатического риска, которая позволяет обеспечить более подходящее наблюдение и планирование лечения.

DecisionDX-UM GEP Assay

Открытие

Профиль экспрессии генов, измеренный с помощью Decisdx-UM, был обнаружен в лаборатории Дж. Уильям Харбор в Вашингтонском университете в Сент-Луисе . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Применение анализа микрочипов к первичным необработанным увеальным меланомам показало, что опухоли сгруппировались в две незаметные группы на основе их профилей экспрессии. ^{[ 8 ]} Фильтрация дифференциально экспрессируемого набора генов привела к идентификации набора генов, способных различать опухоли класса 1 и класса 2.

В последующих экспериментах группа доктора Харбора собирала информацию о микрочипах из более крупного подмножества образцов опухоли увеальной меланомы и смогла идентифицировать дискриминационные гены кандидатов для дальнейшего анализа. ^{[ 9 ]} Генетические профили экспрессии этих дискриминационных генов были проверены в опухолях увеальной меланомы с использованием методов количественной полимеразной цепной реакции (КПЦР), и было выполнено прогнозное моделирование для определения оптимального набора генов, способных точно прогнозировать метастатический риск и отчетность класса. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} В последнем анализе оценивались 12 дискриминационных генов и 3 контрольных гена для определения опухолей класса 1 (низкий риск) и класса 2 (высокий риск), и был подтвержден в исследовании Multicenter пациента 609, которое включало образцы FNAB и FFPE. ^{[ 9 ]}

Прогностическая точность

Нынешняя платформа DecisionDX-UM была клинически подтверждена в исследовании COOG, в котором было включено 514 пациентов с UM, получавшим лечение в 12 онкологических центрах в Соединенных Штатах в период с 1998 по 2010 год. ^{[ 1 ]} В отчете представлены данные, показывающие, что DecisionDX-UM имеет высокий технический успех (> 95%).

Клинический технический успех

С момента первоначального предложения DecisionDX-UM в декабре 2009 года было получено более 800 клинических заказов для анализа Castle Biosciences из более чем 55 глазных онкологических центров по всему техническому успеху США, и определение класса было достигнуто для 96,2% образцов. ^{[ 11 ]} Большинство сбоев были связаны с неправильной сбором биопсией и/или обработкой. Сбор биопсии опухоли имеет решающее значение для успешной отчетности о назначении класса метастатического риска после тестирования DecestDX-UM.

DecisionDX-UM Заказ и отчетность

Castle Biosciences, включаемый только принимает заказы на обслуживание для DecisionDX-UM от лицензированных врачей (чаще всего окулярных онкологов, офтальмологов или специалистов по сетчатке ), которые заботятся о пациентах с диагнозом увеальной меланомы. Врачи, которые впервые являются клиентами, должны связаться с информацией за Касл и создать учетную запись. Примерное представление требует подачи формы заявки DecisionDX-UM, которая должна быть заполнена и по факсу в замке. Образцы FNAB требуют использования набора для сбора образцов, предоставленного Castle, для стабилизации образца и уменьшения вероятности технического отказа. Этот комплект должен быть получен врачом -заказом до сбора образцов. Сотрудники замка доступны, чтобы помочь с логистикой, касающимися сбора образцов и доставки.

Castle предоставляет отчет врачу, который будет классифицировать опухоль как класс 1A, класс 1B или класс. Информация, представленная в отчете из Castle, показывает, насколько вероятно, что опухоль метастазирует (разбросан) с этим риском, классифицируемым как низкий (класс 1A), промежуточный (класс 1B) или высокий (класс 2).

Другие прогностические факторы UM Metastasis

Гистопатологические факторы и методы визуализации

Исторически есть несколько клинических и патологических особенностей, которые были статически связаны с метастазированием. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} размер опухоли, местоположение опухоли, возраст пациента и сосудистая структура коррелируют с метастатическим началом и выживаемостью пациента. Сообщалось, что ^{[ 2 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} В то время как общие, касающиеся популяции пациентов с УМ, могут быть сделаны на основе этих факторов, ни один, отдельный или коллективно, не продемонстрировал прогнозирующую точность в отношении метастатической активности.

Методы визуализации, используемые для обнаружения метастатической активности, также имеют ограничения. Системные метастазы обнаруживаются с помощью позитронной эмиссионной томографии (ПЭТ) визуализации во время первоначального диагноза менее чем у 4% пациентов с УМК ^{[ 6 ]} Магнитно -резонансная визуализация (МРТ) недавно сообщила о более чувствительном, чем ПЭТ для выявления метастазирования из хориоидальной меланомы , но МРТ требует массы опухоли размером более 5 мм. ^{[ 15 ]} Таким образом, текущей технологии визуализации не хватает чувствительности к обнаружению микрометастаз , которые могут присутствовать во время первичной диагностики увеальной меланомы.

Генетические факторы

Методы генетического анализа привели к идентификации хромосомных аномалий, связанных с прогрессированием метастатической опухоли при увеальной меланоме. Потеря гетерозиготности , потеря целых аллелей из хромосом, частичное добавление хромосом , а также хромосомная делеция и отдельные нуклеотидные полиморфизмы (SNP) были связаны с метастатическими поражениями увеальной меланомы. ^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]} В частности, хромосомы 1, 3, 6 и 8 были тщательно изучены для их связи с более коротким временем выживания и развитием метастатического заболевания. ^{[ 17 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}

В то время как генетические аберрации в хромосомах 1, 6 и 8 не способны предсказывать прогрессирование заболевания, цитогенетическое профилирование хромосомы 3 обнаружило важную генетическую область, очень связанную с метастатическим началом у пациентов с увеальной меланомой. ^{[ 16 ]}^{[ 23 ]} Аномалии хромосомы 3 были проанализированы с использованием множественных методов, включая гибридизацию флуоресценции in situ (FISH), хромосомную гибридизация in situ (CISH), сравнительную гибридизация геномного генома (ACGH), SNP, мультиплексная лигирующая амплификация (MLPA) и микрозателлитный анализ, а также микрозателлитный анализ и микрозателлитный Полем ^{[ 16 ]}^{[ 21 ]}^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}^{[ 27 ]}^{[ 28 ]}

Несмотря на множество данных, которые выявили ассоциацию мутации хромосомы 3 с метастазированием UM, клиническое применение этих данных еще не реализовано. ^{[ 29 ]} Причины неопределенности клинического использования хромосомы 3 включают:

высокие ложноположительные показатели (от 5 до 22%)
высокие ложноотрицательные показатели (от 4 до 50%)
Высокие технические показатели отказов (до 50%) из -за крупной потребности в тканях для текущих методов анализа
Побочные эффекты клеточной гетерогенности на хромосомы 3 . цитогенетический анализ ^{[ 2 ]}^{[ 26 ]}^{[ 29 ]}^{[ 30 ]}^{[ 31 ]}^{[ 32 ]}^{[ 33 ]}^{[ 34 ]}

Кроме того, в отличие от теста DecisionDX-UM, нет опубликованных, рецензируемых исследований, которые демонстрируют клиническую валидацию у независимого набора пациентов.

Castle Biosciences, Incorporated

Castle Biosciences, Incorporated - это молекулярная диагностика компания, которая разрабатывает диагностические и прогностические анализы для редких видов рака. Миссия замка состоит в том, чтобы служить людям, страдающим от редких видов рака, предлагая точные прогностические тесты, которые предоставляют информацию для принятия критических решений, касающихся наблюдения за индивидуумом и режимов лечения. В дополнение к DecisionDX-UM, Castle предлагает прогностические тесты на меланому (DecisionDX-Melanoma) и плоскоклеточную карциному (Decisdx-SCC). Касл базируется в Friendswood, штат Техас , и имеет операции в Фениксе, Аризона .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Harbour, JW, Retina Times 2011; 29: 36-7.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Worley, LA, et al., Clinical Cancer Research, 2007. 13 (5): с. 1466-71.
^ Архив офтальмологии, 2006. 124 (12): с. 1684-93.
^ Diener-West, M., et al., Архивы офтальмологии, 2001. 119 (7): с. 969-82.
^ Harbour, JW, Клинический обзор увеальной меланомы: введение в опухоли глаза., Изд. DM Albert, Polans, A.2003: Марсель Деккер. 1-18.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Finger, Pt, et al., Британский журнал офтальмологии, 2005. 89 (10): с. 1270-4.
^ Kurli, M., et al., Американский журнал офтальмологии, 2005. 140 (2): с. 193-9.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Onken, MD, et al., Rance Research, 2004. 64 (20): с. 7205-9.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Onken, MD, et al., Журнал молекулярной диагностики: JMD, 2010. 12 (4): с. 461-8.
^ Onken, MD, et al., Журнал молекулярной диагностики: JMD, 2006. 8 (5): с. 567-73.
^ Bergstrom, CS, Hovland, PG, Stone, JF, Oelschlager, K. и Cook, RW, 2011.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Augsburger, JJ и JW Gamel, Cancer, 1990. 66 (7): с. 1596-600.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} McLean, IW, KS Keefe и Mn Burnier, Ophthalmology, 1997. 104 (5): с. 777-80.
^ Foss, AJ, et al., Rance Research, 1996. 56 (13): с. 2900-3.
^ Servois, V. и др., Европейский журнал хирургической онкологии: журнал Европейского общества хирургической онкологии и Британской ассоциации хирургической онкологии, 2010. 36 (2): с. 189-94.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Harbour, JW, et al., Science, 2010. 330 (6009): с. 1410-3.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Килич Э. и др., Исследование офтальмологии и визуальной науки, 2006. 47 (9): с. 3703-7.
^ Онкен, MD, La Worley и JW Harbour, Clinical Cancer Research, 2008. 14 (12): с. 3737-45.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Пресчер, Г., Н. Борнфельд и Р. Бехер, журнал Национального института рака, 1990. 82 (22): с. 1765-9.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Сисли К. и др., Гены, хромосомы и рак, 1990. 2 (3): с. 205-9.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Damato, B., Ja Dopierala и Se Coupland, Clinical Cancer Research, 2010. 16 (24): с. 6083-92.
^ Sisley, K., et al., Genes, Chromosomes & Cancer, 1997. 19 (1): p. 22-8.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Prussia, G., It Old., Например, 1996. 347 (9010): P. 1222-5.
^ Singh, AD и др., Архивы патологии и лабораторной медицины, 2009 г. 133 (8): с. 1223-7.
^ NAUS, NC и AL., Исследование клиники, клиника, 534-9
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Onken, MD, et al., Clinical Cancer Research, 2007. 13 (10): с. 2923-7.
^ Sandinha, MT, Ma Farquharson и F. Roberts, Британский журнал офтальмологии, 2004. 88 (12): с. 1527-32.
^ Tnsentings, F., It Al., Genetics and Cytognettics, 2000. 122 (1): P. 13-7.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Damato, B. и SE Coupland, Archives of Ophthalmology, 2009. 127 (4): p. 423-9.
^ Maat, W. и др., Архивы патологии и лабораторной медицины, 2007. 131 (1): с. 91-6.
^ Mensink, HW, et al., Исследование офтальмология и визуальная наука, 2009. 50 (2): с. 500-4.
^ Midene, E. и др., Европейский журнал офтальмологии, 2006. 16 (3): с. 422-5.
^ Shields, CL, et al., Труды Американского офтальмологического общества, 2007. 105: с. 43-52; Обсуждение 52-3.
^ Young, Ta, et al., Ophthalmology, 2007. 114 (1): p. 142-6.

Внешние ссылки

[Reference_1-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Harbour, JW, Retina Times 2011; 29: 36-7.

[Reference_2-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Worley, LA, et al., Clinical Cancer Research, 2007. 13 (5): с. 1466-71.

[Reference_3-3] Архив офтальмологии, 2006. 124 (12): с. 1684-93.

[Reference_4-4] Diener-West, M., et al., Архивы офтальмологии, 2001. 119 (7): с. 969-82.

[Reference_5-5] Harbour, JW, Клинический обзор увеальной меланомы: введение в опухоли глаза., Изд. DM Albert, Polans, A.2003: Марсель Деккер. 1-18.

[Reference_6-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Finger, Pt, et al., Британский журнал офтальмологии, 2005. 89 (10): с. 1270-4.

[Reference_7-7] Kurli, M., et al., Американский журнал офтальмологии, 2005. 140 (2): с. 193-9.

[Reference_8-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Onken, MD, et al., Rance Research, 2004. 64 (20): с. 7205-9.

[Reference_9-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Onken, MD, et al., Журнал молекулярной диагностики: JMD, 2010. 12 (4): с. 461-8.

[Reference_10-10] Onken, MD, et al., Журнал молекулярной диагностики: JMD, 2006. 8 (5): с. 567-73.

[Reference_11-11] Bergstrom, CS, Hovland, PG, Stone, JF, Oelschlager, K. и Cook, RW, 2011.

[Reference_12-12] Jump up to: ^а ^{беременный} Augsburger, JJ и JW Gamel, Cancer, 1990. 66 (7): с. 1596-600.

[Reference_13-13] Jump up to: ^а ^{беременный} McLean, IW, KS Keefe и Mn Burnier, Ophthalmology, 1997. 104 (5): с. 777-80.

[Reference_14-14] Foss, AJ, et al., Rance Research, 1996. 56 (13): с. 2900-3.

[Reference_15-15] Servois, V. и др., Европейский журнал хирургической онкологии: журнал Европейского общества хирургической онкологии и Британской ассоциации хирургической онкологии, 2010. 36 (2): с. 189-94.

[Reference_16-16] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Harbour, JW, et al., Science, 2010. 330 (6009): с. 1410-3.

[Reference_17-17] Jump up to: ^а ^{беременный} Килич Э. и др., Исследование офтальмологии и визуальной науки, 2006. 47 (9): с. 3703-7.

[Reference_18-18] Онкен, MD, La Worley и JW Harbour, Clinical Cancer Research, 2008. 14 (12): с. 3737-45.

[Reference_19-19] Jump up to: ^а ^{беременный} Пресчер, Г., Н. Борнфельд и Р. Бехер, журнал Национального института рака, 1990. 82 (22): с. 1765-9.

[Reference_20-20] Jump up to: ^а ^{беременный} Сисли К. и др., Гены, хромосомы и рак, 1990. 2 (3): с. 205-9.

[Reference_21-21] Jump up to: ^а ^{беременный} Damato, B., Ja Dopierala и Se Coupland, Clinical Cancer Research, 2010. 16 (24): с. 6083-92.

[Reference_22-22] Sisley, K., et al., Genes, Chromosomes & Cancer, 1997. 19 (1): p. 22-8.

[Reference_23-23] Jump up to: ^а ^{беременный} Prussia, G., It Old., Например, 1996. 347 (9010): P. 1222-5.

[Reference_24-24] Singh, AD и др., Архивы патологии и лабораторной медицины, 2009 г. 133 (8): с. 1223-7.

[Reference_25-25] NAUS, NC и AL., Исследование клиники, клиника, 534-9

[Reference_26-26] Jump up to: ^а ^{беременный} Onken, MD, et al., Clinical Cancer Research, 2007. 13 (10): с. 2923-7.

[Reference_27-27] Sandinha, MT, Ma Farquharson и F. Roberts, Британский журнал офтальмологии, 2004. 88 (12): с. 1527-32.

[Reference_28-28] Tnsentings, F., It Al., Genetics and Cytognettics, 2000. 122 (1): P. 13-7.

[Reference_29-29] Jump up to: ^а ^{беременный} Damato, B. и SE Coupland, Archives of Ophthalmology, 2009. 127 (4): p. 423-9.

[Reference_30-30] Maat, W. и др., Архивы патологии и лабораторной медицины, 2007. 131 (1): с. 91-6.

[Reference_31-31] Mensink, HW, et al., Исследование офтальмология и визуальная наука, 2009. 50 (2): с. 500-4.

[Reference_32-32] Midene, E. и др., Европейский журнал офтальмологии, 2006. 16 (3): с. 422-5.

[Reference_33-33] Shields, CL, et al., Труды Американского офтальмологического общества, 2007. 105: с. 43-52; Обсуждение 52-3.

[Reference_34-34] Young, Ta, et al., Ophthalmology, 2007. 114 (1): p. 142-6.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]