ДХТКД1

ДХТКД1
Идентификаторы
Псевдонимы	DHTKD1 , AMOXAD, CMT2Q, дегидрогеназа E1 и домен транскетолазы, содержащий 1, AAKAD
Внешние идентификаторы	Опустить : 614984 ; МГИ : 2445096 ; Гомологен : 10278 ; Генные карты : DHTKD1 ; OMA : DHTKD1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	12,123,221 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	5,942,792 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	liver; ; right lobe of liver; ; secondary oocyte; ; parotid gland; ; ventricular zone; ; renal medulla; ; ganglionic eminence; ; kidney tubule; ; human kidney; ; gonad;
	Top expressed in
	zygote; ; liver; ; secondary oocyte; ; left lobe of liver; ; human kidney; ; spermatocyte; ; primary oocyte; ; proximal tubule; ; parotid gland; ; morula;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	thiamine pyrophosphate binding; oxidoreductase activity; oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor; oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity;
Cellular component	oxoglutarate dehydrogenase complex; cytosol; mitochondrial matrix; mitochondrion;
Biological process	metabolism; tricarboxylic acid cycle; glycolytic process; generation of precursor metabolites and energy; hematopoietic progenitor cell differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55526
	209692
	ENSG00000181192
	ENSMUSG00000025815
	Q96HY7
	А2АТУ0
	НМ_018706
	НМ_001081131
	НП_061176
	НП_001074600
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Домен дегидрогеназы E1 и транскетолазы, содержащий 1, представляет собой белок , который у человека кодируется геном DHTKD1 . Этот ген кодирует компонент митохондриального белка, подобного комплексу 2-оксоглутаратдегидрогеназы, участвующего в путях деградации нескольких аминокислот , включая лизин . Мутации в этом гене связаны с 2-аминоадипиновой 2-оксоадипиновой ацидурией и болезнью Шарко-Мари-Тута типа 2Q. ^{[ 5 ]}

Структура

Ген DHTKD1 кодирует белок, содержащий 919 аминокислот и являющийся одной из двух изоформ комплекса 2-оксоглутарат-дегидрогеназы. ^{[ 5 ]}

Функция

DHTKD1 является частью OGDHc-подобного суперкомплекса, который отвечает за решающий этап пути деградации L-лизина, L-гидроксилизина и L-триптофана. В частности, этот фермент катализирует декарбоксилирование до 2-оксоадипата глутарил -КоА . ^{[ 6 ]} Существует сильная корреляция между уровнями экспрессии DHTKD1 и производством АТФ , что означает, что DHTKD1 играет решающую роль в производстве энергии в митохондриях. Более того, подавление DHTKD1 приводит к снижению уровня биогенеза и повышению уровня активных форм кислорода (АФК) в митохондриях. В глобальном масштабе это ухудшает рост клеток и усиливает апоптоз клеток . ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Мутации в гене DHTKD1 связаны с альфа-аминоадипиновой и альфа-кетоадипиновой ацидурией, аутосомно-рецессивной врожденной ошибкой деградации лизина, гидроксилизина и триптофана . У пациентов наблюдалось лишь несколько мутаций, включая три миссенс-мутации, две нонсенс-мутации, две донорские мутации сплайсинга, одну дупликацию и одну делецию и вставку. Две миссенс-мутации являются наиболее распространенной причиной дефицита. Клиническая картина этого заболевания противоречива. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}

Мутации в этом гене также могут вызывать неврологические нарушения. ^{[ 7 ]} Действительно, одна форма болезни Шарко-Мари-Тута (ШМТ) связана с DHTKD1, хотя это заболевание охватывает широкий спектр клинических нейропатий. В частности, гетерогенная нонсенс-мутация внутри гена приводит к снижению уровня мРНК и белков DHTKD1 и нарушению выработки АТФ. Это предполагает, что эта мутация является возбудителем болезни ШМТ-2. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000181192 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025815 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: дегидрогеназа Е1 и домен транскетолазы, содержащий 1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Данхаузер К., Зауэр С.В., Хаак Т.Б., Виланд Т., Штауфнер С., Граф Е., Зшоке Дж., Стром Т.М., Трауб Т., Окун Ю.Г., Мейтингер Т., Хоффманн Г.Ф., Прокиш Х., Кёлькер С. (декабрь 2012 г.). «Мутации DHTKD1 вызывают 2-аминоадипиновую и 2-оксоадипиновую ацидурию» . Американский журнал генетики человека . 91 (6): 1082–7. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.10.006 . ПМЦ 3516599 . ПМИД 23141293 .
^ Jump up to: ^а ^б Сюй В, Чжу Х, Гу М, Луо Ц, Дин Дж, Яо Ю, Чен Ф, Ван Цзи (ноябрь 2013 г.). «DHTKD1 необходим для биогенеза и поддержания функций митохондрий». Письма ФЭБС . 587 (21): 3587–92. дои : 10.1016/j.febslet.2013.08.047 . ПМИД 24076469 . S2CID 27665973 .
^ Хаген Дж., Те Бринке Х., Вандерс Р.Дж., Кнегт А.С., Уссорен Э., Хугебум А.Дж., Руйтер Г.Дж., Беккер Д., Шваб КО, Франке И., Дюран М., Уотерхэм Х.Р., Сасс Дж.О., Хаутен С.М. (апрель 2015 г.). «Генетическая основа альфа-аминоадипиновой и альфа-кетоадипиновой ацидурии» . Журнал наследственных метаболических заболеваний . 38 (5): 873–9. дои : 10.1007/s10545-015-9841-9 . ПМИД 25860818 . S2CID 20379124 .

Дальнейшее чтение

Сюй В, Чжу Х, Гу М, Луо Ц, Дин Дж, Яо Ю, Чен Ф, Ван Цзи (ноябрь 2013 г.). «DHTKD1 необходим для биогенеза и поддержания функций митохондрий». Письма ФЭБС . 587 (21): 3587–92. дои : 10.1016/j.febslet.2013.08.047 . ПМИД 24076469 . S2CID 27665973 .
Сюй WY, Гу ММ, Сунь ЛХ, Го ВТ, Чжу ХБ, Ма Дж.Ф., Юань В.Т., Куан Ю, Цзи БиДжей, Ву XL, Чэнь Ю, Чжан ХХ, Сунь FT, Хуан В, Хуан Л, Чен С.Д., Ван ЗГ (декабрь 2012 г.). «Нонсенс-мутация в DHTKD1 вызывает болезнь Шарко-Мари-Тута 2-го типа у крупной китайской родословной» . Американский журнал генетики человека . 91 (6): 1088–94. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.09.018 . ПМК 3516600 . ПМИД 23141294 .
Буник В.И., Дегтярев Д. (май 2008 г.). «Структурно-функциональные взаимоотношения в семействе дегидрогеназ 2-оксокислот: специфичные для субстрата признаки и функциональные предсказания для белков, подобных 2-оксоглутаратдегидрогеназе». Белки . 71 (2): 874–90. дои : 10.1002/прот.21766 . ПМИД 18004749 . S2CID 23882203 .
Данхаузер К., Зауэр С.В., Хаак Т.Б., Виланд Т., Штауфнер С., Граф Е., Зшоке Дж., Стром Т.М., Трауб Т., Окун Ю.Г., Мейтингер Т., Хоффманн Г.Ф., Прокиш Х., Кёлькер С. (декабрь 2012 г.). «Мутации DHTKD1 вызывают 2-аминоадипиновую и 2-оксоадипиновую ацидурию» . Американский журнал генетики человека . 91 (6): 1082–7. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.10.006 . ПМЦ 3516599 . ПМИД 23141293 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 10 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000181192 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025815 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: дегидрогеназа Е1 и домен транскетолазы, содержащий 1» .

[pmid231-6] Jump up to: ^а ^б ^с Данхаузер К., Зауэр С.В., Хаак Т.Б., Виланд Т., Штауфнер С., Граф Е., Зшоке Дж., Стром Т.М., Трауб Т., Окун Ю.Г., Мейтингер Т., Хоффманн Г.Ф., Прокиш Х., Кёлькер С. (декабрь 2012 г.). «Мутации DHTKD1 вызывают 2-аминоадипиновую и 2-оксоадипиновую ацидурию» . Американский журнал генетики человека . 91 (6): 1082–7. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.10.006 . ПМЦ 3516599 . ПМИД 23141293 .

[pmid240-7] Jump up to: ^а ^б Сюй В, Чжу Х, Гу М, Луо Ц, Дин Дж, Яо Ю, Чен Ф, Ван Цзи (ноябрь 2013 г.). «DHTKD1 необходим для биогенеза и поддержания функций митохондрий». Письма ФЭБС . 587 (21): 3587–92. дои : 10.1016/j.febslet.2013.08.047 . ПМИД 24076469 . S2CID 27665973 .

[8] Хаген Дж., Те Бринке Х., Вандерс Р.Дж., Кнегт А.С., Уссорен Э., Хугебум А.Дж., Руйтер Г.Дж., Беккер Д., Шваб КО, Франке И., Дюран М., Уотерхэм Х.Р., Сасс Дж.О., Хаутен С.М. (апрель 2015 г.). «Генетическая основа альфа-аминоадипиновой и альфа-кетоадипиновой ацидурии» . Журнал наследственных метаболических заболеваний . 38 (5): 873–9. дои : 10.1007/s10545-015-9841-9 . ПМИД 25860818 . S2CID 20379124 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]