APBA2

APBA2
Идентификаторы
Псевдонимы	APBA2 , D15S1518E, HsT16821, LIN-10, MGC:14091, MINT2, X11-BETA, X11L, член 2 семейства A, связывающего белок-предшественник бета-амилоида
Внешние идентификаторы	Опустить : 602712 ; МГИ : 1261791 ; Гомологен : 4021 ; Генные карты : APBA2 ; ОМА : APBA2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	29,118,315 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	64,753,878 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	superior frontal gyrus; ; right hemisphere of cerebellum; ; primary visual cortex; ; prefrontal cortex; ; right frontal lobe; ; Brodmann area 9; ; anterior cingulate cortex; ; hippocampus proper; ; ganglionic eminence; ; C1 segment;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; perirhinal cortex; ; CA3 field; ; entorhinal cortex; ; cerebellar cortex; ; hippocampus proper; ; primary motor cortex; ; cingulate gyrus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	amyloid-beta binding; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	plasma membrane; synaptic vesicle; Schaffer collateral - CA1 synapse; cytoplasm; dendritic spine; synapse;
Biological process	regulation of gene expression; protein transport; in utero embryonic development; locomotory behavior; nervous system development; multicellular organism growth; chemical synaptic transmission; regulation of synaptic vesicle exocytosis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	321
	11784
	ENSG00000034053 ; ENSG00000276495
	ENSMUSG00000030519
	Q99767
	P98084
showНМ_001130414 ; НМ_005503 ; НМ_001353788 ; НМ_001353789 ; НМ_001353790 ;
	NM_001353791; NM_001353792; NM_001353793; NM_001353794; NM_001353795; NM_001353796; NM_001353797; NM_001379685
	НМ_001291166 ; НМ_001291167 ; НМ_007461
showНП_001123886 ; НП_005494 ; НП_001340717 ; НП_001340718 ; НП_001340719 ;
	NP_001340720; NP_001340721; NP_001340722; NP_001340723; NP_001340724; NP_001340725; NP_001340726; NP_001366614
	НП_001278095 ; НП_001278096 ; НП_031487
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Семейство A, связывающее белок-предшественник бета-А4, представляет собой белок , который у человека кодируется APBA2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Структура

Этот белок имеет фосфотирозин-связывающий домен (домен PTB или PID) в середине и два домена PDZ на С-конце .

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков X11. Это нейрональный адаптерный белок, который взаимодействует с болезни Альцгеймера белком-предшественником амилоида (APP). Он стабилизирует АРР и ингибирует выработку протеолитических фрагментов АРР, включая пептид А-бета , который откладывается в мозге пациентов с болезнью Альцгеймера. Считается, что этот генный продукт участвует в процессах передачи сигнала. Он также считается предполагаемым белком, транспортирующим везикулы в головном мозге, который может образовывать комплекс, способный связывать синаптических везикул экзоцитоз с адгезией нейрональных клеток. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что APBA2 взаимодействует с CLSTN1 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} РЕЛА ^{[ 9 ]} и белок-предшественник амилоида. ^{[ 7 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000276495 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000034053, ENSG00000276495 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030519 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Маклафлин Д.М., Миллер CC (январь 1997 г.). «Внутриклеточный цитоплазматический домен белка-предшественника амилоида болезни Альцгеймера взаимодействует с белками фосфотирозинсвязывающего домена в двугибридной системе дрожжей» . ФЭБС Летт . 397 (2–3): 197–200. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01128-3 . ПМИД 8955346 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: связывание белка-предшественника бета-амилоида APBA2 (A4), семейство A, член 2 (X11-подобный)» .
^ Jump up to: ^а ^б Араки Ю, Томита С, Ямагути Х, Мияги Н, Сумиока А, Кирино Ю, Сузуки Т (декабрь 2003 г.). «Новые мембранные белки, связанные с кадгерином, алкадины, усиливают опосредованную X11-подобным белком стабилизацию метаболизма предшественников бета-амилоидных белков» . Ж. Биол. Хим . 278 (49): 49448–58. дои : 10.1074/jbc.M306024200 . ПМИД 12972431 .
^ Араки Ю, Мияги Н, Като Н, Ёсида Т, Вада С, Нишимура М, Комано Х, Ямамото Т, Де Струпер Б, Ямамото К, Сузуки Т (июнь 2004 г.). «Скоординированный метаболизм алкадеина и предшественника бета-амилоидного белка регулирует FE65-зависимую трансактивацию генов» . Ж. Биол. Хим . 279 (23): 24343–54. дои : 10.1074/jbc.M401925200 . ПМИД 15037614 .
^ Томита С., Фудзита Т., Кирино Ю., Сузуки Т. (апрель 2000 г.). «PDZ-домен-зависимое подавление NF-kappaB/p65-индуцированной продукции Abeta42 с помощью нейрон-специфического X11-подобного белка» . Ж. Биол. Хим . 275 (17): 13056–60. дои : 10.1074/jbc.C000019200 . ПМИД 10777610 .
^ Бидерер Т., Цао X, Зюдхоф TC, Лю X (сентябрь 2002 г.). «Регуляция APP-зависимых транскрипционных комплексов с помощью Mint/X11s: дифференциальные функции изоформ Mint» . Дж. Нейроски . 22 (17): 7340–51. doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-17-07340.2002 . ПМК 6757996 . ПМИД 12196555 .
^ Томита С., Одзаки Т., Тару Х., Огучи С., Такеда С., Яги Ю., Сакияма С., Кирино Ю., Судзуки Т. (январь 1999 г.). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего домены PDZ, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера» . Ж. Биол. Хим . 274 (4): 2243–54. дои : 10.1074/jbc.274.4.2243 . ПМИД 9890987 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома APBA2 и страница сведений о гене APBA2 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

ван дер Гир П., Поусон Т. (1995). «Домен PTB: новый белковый модуль, участвующий в передаче сигнала». Тенденции биохимии. Наука . 20 (7): 277–80. doi : 10.1016/S0968-0004(00)89043-X . ПМИД 7545337 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Окамото М, Зюдхоф ТЦ (1998). «Мяты, белки, взаимодействующие с Munc18, при экзоцитозе синаптических пузырьков» . Ж. Биол. Хим . 272 (50): 31459–64. дои : 10.1074/jbc.272.50.31459 . ПМИД 9395480 .
Бланко Дж., Ирвинг Н.Г., Браун С.Д., Миллер CC, Маклафлин Д.М. (1998). «Картирование человеческих и мышиных X11-подобных генов (APBA2 и apba2), мышиного гена Fe65 (Apbb1) и человеческого Fe65-подобного гена (APBB2): гены, кодирующие белки фосфотирозин-связывающего домена, которые взаимодействуют с амилоидом болезни Альцгеймера. белок-предшественник». Мамм. Геном . 9 (6): 473–5. дои : 10.1007/s003359900800 . ПМИД 9585438 . S2CID 31066473 .
Борг Дж.П., Ян Й., Де Таддео-Борг М., Марголис Б., Тернер Р.С. (1998). «Белок X11альфа замедляет процессинг клеточного белка-предшественника амилоида и снижает секрецию Abeta40 и Abeta42» . Ж. Биол. Хим . 273 (24): 14761–6. дои : 10.1074/jbc.273.24.14761 . ПМИД 9614075 .
Борг Дж.П., Стрейт С.В., Каеч С.М., де Таддео-Борг М., Крун Д.Е., Карнак Д., Тернер Р.С., Ким С.К., Марголис Б (1998). «Идентификация эволюционно консервативного гетеротримерного белкового комплекса, участвующего в нацеливании на белки» . Ж. Биол. Хим . 273 (48): 31633–6. дои : 10.1074/jbc.273.48.31633 . ПМИД 9822620 .
Окамото М, Зюдхоф ТЦ (1999). «Mint 3: вездесущая изоформа мяты, которая не связывается с munc18-1 или -2». Евро. Дж. Клеточная Биол . 77 (3): 161–5. дои : 10.1016/s0171-9335(98)80103-9 . ПМИД 9860131 .
Томита С., Одзаки Т., Тару Х., Огучи С., Такеда С., Яги Ю., Сакияма С., Кирино Ю., Судзуки Т. (1999). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего домены PDZ, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера» . Ж. Биол. Хим . 274 (4): 2243–54. дои : 10.1074/jbc.274.4.2243 . ПМИД 9890987 .
Маклафлин Д.М., Ирвинг Н.Г., Браунлис Дж., Брайон Дж.П., Лерой К., Миллер CC (1999). «Mint2/X11-подобный колокализуется с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера и связан с нейритическими бляшками при болезни Альцгеймера». Евро. Дж. Нейроски . 11 (6): 1988–94. дои : 10.1046/j.1460-9568.1999.00610.x . ПМИД 10336668 . S2CID 42411043 .
Томита С., Фудзита Т., Кирино Ю., Сузуки Т. (2000). «PDZ-домен-зависимое подавление NF-kappaB/p65-индуцированной продукции Abeta42 с помощью нейрон-специфического X11-подобного белка» . Ж. Биол. Хим . 275 (17): 13056–60. дои : 10.1074/jbc.C000019200 . ПМИД 10777610 .
Готхардт М., Троммсдорф М., Невитт М.Ф., Шелтон Дж., Ричардсон Дж.А., Стокингер В., Нимпф Дж., Герц Дж. (2000). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольными адаптерными и каркасными белками предполагает разнообразные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов» . Ж. Биол. Хим . 275 (33): 25616–24. дои : 10.1074/jbc.M000955200 . ПМИД 10827173 .
Ли Д.С., Томита С., Кирино Ю., Сузуки Т. (2000). «Регуляция X11L-зависимого метаболизма белка-предшественника амилоида с помощью XB51, нового X11L-связывающего белка» . Ж. Биол. Хим . 275 (30): 23134–8. дои : 10.1074/jbc.C000302200 . ПМИД 10833507 .
Бидерер Т, Зюдхоф ТЦ (2001). «Мяты как адаптеры. Прямое связывание с нейрексинами и привлечение munc18» . Ж. Биол. Хим . 275 (51): 39803–6. дои : 10.1074/jbc.C000656200 . ПМИД 11036064 .
Лау К.Ф., Маклафлин Д.М., Стэнден С., Миллер CC (2001). «X11 альфа и x11 бета взаимодействуют с пресенилином-1 через свои домены PDZ». Мол. Клетка. Нейроски . 16 (5): 557–65. дои : 10.1006/mcne.2000.0898 . ПМИД 11083918 . S2CID 54389955 .
Сатклифф Дж.С., Хан МК, Амин Т., Кестерсон Р.А., Нурми Э.Л. (2003). «Частичная дупликация гена APBA2 в хромосоме 15q13 соответствует дупликонным структурам» . БМК Геномика . 4 (1): 15. дои : 10.1186/1471-2164-4-15 . ПМК 156605 . ПМИД 12720574 .
Сумиока А., Имото С., Мартинс Р.Н., Кирино Ю., Сузуки Т. (2003). «Изоформы XB51 опосредуют выработку бета-амилоидного пептида при болезни Альцгеймера с помощью X11L (X11-подобного белка)-зависимых и независимых механизмов» . Биохим. Дж . 374 (Часть 1): 261–8. дои : 10.1042/BJ20030489 . ПМЦ 1223589 . ПМИД 12780348 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 15 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000276495 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000034053, ENSG00000276495 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030519 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8955346-5] Маклафлин Д.М., Миллер CC (январь 1997 г.). «Внутриклеточный цитоплазматический домен белка-предшественника амилоида болезни Альцгеймера взаимодействует с белками фосфотирозинсвязывающего домена в двугибридной системе дрожжей» . ФЭБС Летт . 397 (2–3): 197–200. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01128-3 . ПМИД 8955346 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: связывание белка-предшественника бета-амилоида APBA2 (A4), семейство A, член 2 (X11-подобный)» .

[pmid12972431-7] Jump up to: ^а ^б Араки Ю, Томита С, Ямагути Х, Мияги Н, Сумиока А, Кирино Ю, Сузуки Т (декабрь 2003 г.). «Новые мембранные белки, связанные с кадгерином, алкадины, усиливают опосредованную X11-подобным белком стабилизацию метаболизма предшественников бета-амилоидных белков» . Ж. Биол. Хим . 278 (49): 49448–58. дои : 10.1074/jbc.M306024200 . ПМИД 12972431 .

[pmid15037614-8] Араки Ю, Мияги Н, Като Н, Ёсида Т, Вада С, Нишимура М, Комано Х, Ямамото Т, Де Струпер Б, Ямамото К, Сузуки Т (июнь 2004 г.). «Скоординированный метаболизм алкадеина и предшественника бета-амилоидного белка регулирует FE65-зависимую трансактивацию генов» . Ж. Биол. Хим . 279 (23): 24343–54. дои : 10.1074/jbc.M401925200 . ПМИД 15037614 .

[pmid10777610-9] Томита С., Фудзита Т., Кирино Ю., Сузуки Т. (апрель 2000 г.). «PDZ-домен-зависимое подавление NF-kappaB/p65-индуцированной продукции Abeta42 с помощью нейрон-специфического X11-подобного белка» . Ж. Биол. Хим . 275 (17): 13056–60. дои : 10.1074/jbc.C000019200 . ПМИД 10777610 .

[pmid12196555-10] Бидерер Т., Цао X, Зюдхоф TC, Лю X (сентябрь 2002 г.). «Регуляция APP-зависимых транскрипционных комплексов с помощью Mint/X11s: дифференциальные функции изоформ Mint» . Дж. Нейроски . 22 (17): 7340–51. doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-17-07340.2002 . ПМК 6757996 . ПМИД 12196555 .

[pmid9890987-11] Томита С., Одзаки Т., Тару Х., Огучи С., Такеда С., Яги Ю., Сакияма С., Кирино Ю., Судзуки Т. (январь 1999 г.). «Взаимодействие нейрон-специфического белка, содержащего домены PDZ, с белком-предшественником амилоида болезни Альцгеймера» . Ж. Биол. Хим . 274 (4): 2243–54. дои : 10.1074/jbc.274.4.2243 . ПМИД 9890987 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]