ZC3HC1
ZC3HC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ZC3HC1 , NIPA, HSPC216, цинковый палец типа C3HC, содержащий 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | МГИ : 1916023 ; Гомологен : 32315 ; Генные карты : ZC3HC1 ; OMA : ZC3HC1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Ядерно-взаимодействующий партнер ALK (NIPA) , также известный как белок 1 типа C3HC с цинковым пальцем (ZC3HC1), представляет собой белок , который у людей кодируется ZC3HC1 геном на хромосоме 7 . [ 5 ] [ 6 ] Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток, хотя экспрессируется исключительно в ядерных субклеточных местах . [ 7 ] [ 8 ] (SCFNIPA) типа skp1 куллина F-box (SCF), NIPA представляет собой комплексный белок убиквитин E3-лигазы E3 участвующий в регуляции вступления в митоз . [ 9 ] Ген ZC3HC1 также содержит один из 27 SNP , связанных с повышенным риском развития ишемической болезни сердца . [ 10 ]
Структура
[ редактировать ]Ген
[ редактировать ]Ген ZC3HC1 расположен на хромосоме 7 в участке 7q32.2 и включает 14 экзонов . [ 6 ]
Белок
[ редактировать ]NIPA представляет собой лигазу E3 массой 60 кДа, которая содержит один цинковый палец типа C3HC и одну область, подобную F-боксу. [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] Более того, участок из 50 остатков (аминокислоты 352–402) на его С-конце служит сигналом ядерной транслокации (последовательность NLS), тогда как участок из 96 остатков (аминокислоты 306–402), как предполагается, служит фосфотирозин-последовательностью. связывающий домен . [ 9 ] [ 11 ] NIPA является одним из компонентов ядерного комплекса SCFNIPA, и было продемонстрировано, что фосфорилирование NIPA по трем остаткам серина, Ser-354, Ser-359 и Ser-395, инактивирует комплекс в целом. [ 9 ]
Функция
[ редактировать ]NIPA широко экспрессируется в тканях человека, с наибольшей экспрессией в сердце, скелетных мышцах и яичках. [ 11 ] Это человеческий белок F-box, который определяет SCF -типа лигазу убиквитина E3 , образование которой регулируется зависимым от клеточного цикла фосфорилированием NIPA. Циклин B1 , необходимый для вступления в митоз , подвергается воздействию SCFNIPA в интерфазе. Фосфорилирование NIPA происходит в фазе G2 , приводит к диссоциации NIPA от ядра SCF и, как было доказано, имеет решающее значение для правильного перехода G2/M. [ 8 ] Осциллирующее убиквитинирование ядерного циклина B1, управляемое комплексом SCFNIPA, способствует выбору времени вступления в митоз. [ 9 ] [ 14 ] Сообщается также, что NIPA задерживает апоптоз , и для этой антиапоптотической функции необходима локализация NIPA. [ 11 ]
Клиническая значимость
[ редактировать ]Исследования полногеномной ассоциации (GWAS) показали, что у людей NIPA участвует в сердечно-сосудистых заболеваниях. В частности, было показано , что однонуклеотидный полиморфизм (SNP), расположенный в ZC3HC1, предсказывает ишемическую болезнь сердца. [ 15 ] [ 16 ] Этот прогноз, по-видимому, не зависит от традиционных факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний, таких как высокий уровень холестерина, высокое кровяное давление, ожирение, курение и сахарный диабет, которые являются основными целями современных методов лечения ишемической болезни сердца. Таким образом, изучение функции этого гена может выявить новые пути, способствующие развитию ишемической болезни сердца, что приведет к разработке новых методов лечения.
Клинический маркер
[ редактировать ]В локусе 7q32.2, ассоциированном с ишемической болезнью сердца, только один SNP (rs11556924) связан с риском развития ишемической болезни сердца, без других вариантов с сильным неравновесием по сцеплению. SNP rs11556924 в гене ZC3HC1 приводит к аргинин-гистидиновому полиморфизму по аминокислотному остатку 363 в NIPA. [ 17 ] Кроме того, rs11556924 также связан с изменением толщины интимы-медиа сонных артерий у пациентов с ревматоидным артритом. [ 18 ] и с измененным риском фибрилляции предсердий. [ 19 ]
Кроме того, мультилокусное исследование оценки генетического риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген ZC3HC1, выявило лиц с повышенным риском как возникновения, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также увеличило клиническую пользу от терапии статинами. Исследование было основано на групповом исследовании на уровне сообщества (исследование «Диета Мальмё и рак») и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22). [ 10 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000091732 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039130 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Чжан QH, Е М, Ву XY, Рен SX, Чжао М, Чжао CJ, Фу Г, Шен Ю, Фань ХИ, Лу Г, Чжун М, Сюй XR, Хань ZG, Чжан JW, Тао Дж, Хуан QH, Чжоу Дж , Ху GX, Гу J, Чен SJ, Чен Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–60. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтреза: цинковый палец ZC3HC1, тип C3HC, содержащий 1» .
- ^ «BioGPS – ваша генная портальная система» . biogps.org . Проверено 11 октября 2016 г.
- ^ Перейти обратно: а б Бассерманн Ф., фон Клитцинг К., Мюнх С., Бай Р.Ю., Кавагути Х., Моррис С.В., Пешель К., Дайстер Дж. (июль 2005 г.). «NIPA определяет лигазу E3 млекопитающих SCF-типа, которая регулирует вход в митоз» . Клетка . 122 (1): 45–57. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.034 . ПМИД 16009132 . S2CID 16122567 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Бассерманн Ф., фон Клитцинг С., Иллерт А.Л., Мюнх С., Моррис С.В., Пагано М., Пешель К., Дайстер Дж. (июнь 2007 г.). «Мультисайтовое фосфорилирование партнера ядерного взаимодействия ALK (NIPA) по G2/M с участием циклина B1/Cdk1» . Журнал биологической химии . 282 (22): 15965–72. дои : 10.1074/jbc.M610819200 . ПМИД 17389604 .
- ^ Перейти обратно: а б Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж., Нордио Ф., Хайд КЛ., Кэннон КП, Сакс Ф.М., Поултер Н.Р., Север П.С., Ридкер П.М., Браунвальд Э., Меландер О., Катиресан С., Сабатин М.С. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Оуян Т., Бай Р.Ю., Бассерманн Ф., фон Клитцинг С., Клюмпен С., Митинг С., Моррис С.В., Пешель С., Дайстер Дж. (август 2003 г.). «Идентификация и характеристика ядерного взаимодействующего партнера киназы анапластической лимфомы (NIPA)» . Журнал биологической химии . 278 (32): 30028–36. дои : 10.1074/jbc.M300883200 . ПМИД 12748172 .
- ^ Куннас Т., Никкари С.Т. (август 2015 г.). «Ассоциация генетического варианта цинкового пальца, типа C3HC, содержащего 1 (ZC3HC1) rs11556924, с гипертонией в финской популяции, исследование TAMRISK» . Лекарство . 94 (32): e1221. дои : 10.1097/MD.0000000000001221 . ПМЦ 4616712 . ПМИД 26266351 .
- ^ «ZC3HC1 - Ядерно-взаимодействующий партнер ALK - Homo sapiens (Человек) - ген и белок ZC3HC1» . www.uniprot.org . Проверено 11 октября 2016 г.
- ^ Бассерманн Ф., Пешель К., Дайстер Дж. (ноябрь 2005 г.). «Митотический вход: вопрос колеблющегося разрушения» . Клеточный цикл . 4 (11): 1515–7. дои : 10.4161/cc.4.11.2192 . ПМИД 16258267 .
- ^ Джонс П.Д., Кайзер М.А., Гадери Наджафабади М., Маквей Д.Г., Беверидж А.Дж., Шофилд К.Л., Самани, Нью-Джерси, Уэбб Т.Р. (июль 2016 г.). «Вариант кодирования, связанный с ишемической болезнью сердца, в цинковом пальце типа C3HC, содержащий 1 (ZC3HC1), влияет на регуляцию клеточного цикла» . Журнал биологической химии . 291 (31): 16318–27. дои : 10.1074/jbc.M116.734020 . ПМЦ 4965579 . ПМИД 27226629 .
- ^ Джонс П.Д., Кайзер М.А., Гадери Наджафабади М., Маквей Д.Г., Беверидж А.Дж., Шофилд К.Л., Самани, Нью-Джерси, Уэбб Т.Р. (июль 2016 г.). «Вариант кодирования, связанный с ишемической болезнью сердца, в цинковом пальце типа C3HC, содержащий 1 (ZC3HC1), влияет на регуляцию клеточного цикла» . Журнал биологической химии . 291 (31): 16318–27. дои : 10.1074/jbc.M116.734020 . ПМЦ 4965579 . ПМИД 27226629 .
- ^ Бассерманн Ф., фон Клитцинг С., Мюнх С. и др. (июль 2005 г.). «NIPA определяет лигазу E3 млекопитающих SCF-типа, которая регулирует вход в митоз» . Клетка . 122 (1): 45–57. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.034 . ПМИД 16009132 . S2CID 16122567 .
- ^ Лопес-Мехиас Р., Жанр Ф, Гарсия-Бермудес М., Корралес А., Гонсалес-Хуанатей С., Льорка Дж., Миранда-Филлой Х.А., Уил-Готор Дж., Уайт Р., Честнат С., Мартин Дж., Гонсалес-Гей М.А. (2013- 01-01). «Полиморфизм rs11556924 ZC3HC1 связан с увеличением толщины интимы-медиа сонных артерий у пациентов с ревматоидным артритом» . Исследования и терапия артрита . 15 (5):R1 дои : 10.1186/ar4335 . ПМЦ 3978706 . ПМИД 24286297 .
- ^ Ямасе Ю, Като К, Хорибе Х, Уэяма С, Фудзимаки Т, Огури М, Араи М, Ватанабэ С, Мурохара Т, Ямада Ю (февраль 2016 г.). «Ассоциация генетических вариантов с фибрилляцией предсердий» . Биомедицинские отчеты . 4 (2): 178–182. дои : 10.3892/br.2015.551 . ПМЦ 4734142 . ПМИД 26893834 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Диас Нето Э, Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста ФФ, Гольдман Г.Х., Карвальо А.Ф., Мацукума А., Бая Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонджинил К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Секвенирование транскрипции человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
- Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
- Оуян Т., Бай Р.Ю., Бассерманн Ф., фон Клитцинг С., Клюмпен С., Митинг С., Моррис С.В., Пешель С., Дайстер Дж. (август 2003 г.). «Идентификация и характеристика ядерного взаимодействующего партнера киназы анапластической лимфомы (NIPA)» . Журнал биологической химии . 278 (32): 30028–36. дои : 10.1074/jbc.M300883200 . ПМИД 12748172 .
- Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
- Бассерманн Ф., фон Клитцинг К., Мюнх С., Бай Р.Ю., Кавагути Х., Моррис С.В., Пешель К., Дайстер Дж. (июль 2005 г.). «NIPA определяет лигазу E3 млекопитающих SCF-типа, которая регулирует вход в митоз» . Клетка . 122 (1): 45–57. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.034 . ПМИД 16009132 . S2CID 16122567 .
- Амброджо К, Воэна С, Манацца АД, Пива Р, Риера Л, Барберис Л, Коста С, Тароне Г, Дефилиппи П, Хирш Е, Боэри Эрба Е, Мохаммед С, Йенсен ОН, Палестро Г, Ингирами Г, Чиарле Р (декабрь) 2005). «p130Cas опосредует трансформирующие свойства киназы анапластической лимфомы» . Кровь . 106 (12): 3907–16. дои : 10.1182/кровь-2005-03-1204 . ПМК 1895100 . ПМИД 16105984 .
- Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
- Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природная биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
- Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .