CHD2
| CHD2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | CHD2 , EEOC, ДНК-связывающий белок 2 хромодоменной хеликазы, DEE94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | ОМИМ : 602119 ; МГИ : 2448567 ; Гомологен : 37462 ; Генные карты : CHD2 ; ОМА : CHD2 – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок 2, связывающий хромодомен-геликазу-ДНК, представляет собой фермент , который у человека кодируется CHD2 геном . [5] [6]
Функция
[ редактировать ]Семейство белков CHD характеризуется наличием хромодоменов (модификаторов организации хроматина) и SNF2 -родственных доменов геликазы/ АТФазы . Гены CHD изменяют экспрессию генов, возможно, за счет модификации структуры хроматина , тем самым изменяя доступ транскрипционного аппарата к его матрице хромосомной ДНК. CHD2 катализирует сборку хроматина в периодические массивы; а N-концевая область CHD2, которая содержит тандемные хромодомены, выполняет аутоингибирующую роль как в ДНК-связывающей, так и в АТФазной активности CHD2. [7] альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы . Для этого гена были обнаружены [6]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации и делеции de novo в этом гене связаны со случаями эпилептических энцефалопатий. [8] [9] [10] [11] [12]
Эпилепсия CHD2 все чаще идентифицируется как субпопуляция синдрома Леннокса-Гасто . [13] [14]
Миоклоническая энцефалопатия CHD2 — это состояние, характеризующееся повторяющимися припадками (эпилепсией), нарушением функции мозга (энцефалопатией) и умственной отсталостью. Эпилепсия начинается в детстве, обычно в возрасте от 6 месяцев до 4 лет. Каждый человек может испытывать различные типы судорог, чаще всего миоклонические судороги. [15]
Недавно мутации или делеции de novo при CHD2 были связаны с умственной отсталостью. [16] и к аутизму. [17] [18] [19] Исследователи обнаружили 27 генов, которые нарушают функцию соответствующего белка — как минимум у двух людей с аутизмом, а 6 генов мутированы у трёх и более людей с аутизмом. Эти шесть генов — CHD8 , DYRK1A , ANK2 , GRIN2B , DSCAM и CHD2 — являются наиболее сильными кандидатами на аутизм, выявленными на данный момент.
Поддержка семьи
[ редактировать ]Синдромы, связанные с мутациями или делециями CHD2, могут иметь разрушительные последствия. Семьи людей с мутациями или делециями CHD2 могут присоединиться к группе поддержки и исследования CHD2 на Facebook. [20] или найдите информацию и поддержку через некоммерческую организацию Coalition to Cure CHD2. [21]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000173575 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078671 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Вудэдж Т., Басрай М.А., Баксеванис А.Д., Хитер П., Коллинз Ф.С. (октябрь 1997 г.). «Характеристика белков семейства CHD» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (21): 11472–7. Бибкод : 1997PNAS...9411472W . дои : 10.1073/pnas.94.21.11472 . ПМК 23509 . ПМИД 9326634 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: ДНК-связывающий белок 2 хромодомен-хеликазы CHD2» .
- ^ Лю Дж.К., Феррейра К.Г., Юсуфзай Т. (январь 2015 г.). «Человеческий CHD2 представляет собой АТФазу сборки хроматина, регулируемую ее хромо- и ДНК-связывающими доменами» . Журнал биологической химии . 290 (1): 25–34. дои : 10.1074/jbc.M114.609156 . ПМЦ 4281729 . ПМИД 25384982 .
- ^ Карвилл Г.Л., Хивин С.Б., Йендл С.С., МакМэхон Дж.М., О'Рок Б.Дж., Кук Дж., Хан А., Доршнер М.О., Уивер М., Калверт С., Мэлоун С., Уоллес Дж., Стэнли Т., Пока А.М., Близел А., Хауэлл К.Б., Кивив С, Маккей МТ, Родригес-Касеро В, Вебстер Р, Корчин А, Афави З, Зельник Н, Лерман-Сэги Т, Лев Д, Мёллер Р.С., Гилл Д., Андраде Д.М., Фриман Дж.Л., Садлер Л.Г., Шендюр Дж., Беркович СФ, Шеффер И.Е., Меффорд ХК (июль 2013 г.). «Целевое секвенирование при эпилептических энцефалопатиях выявляет мутации de novo в CHD2 и SYNGAP1» . Природная генетика . 45 (7): 825–30. дои : 10.1038/ng.2646 . ПМК 3704157 . ПМИД 23708187 .
- ^ Шенье С., Юн Дж., Аргиропулос Б., Лозон Дж., Лафрамбуаз Р., Ан Дж.В., Огилви СМ, Лайонел А.С., Маршалл К.Р., Ваагс А.К., Хашеми Б., Буасверт К., Матонне Дж., Тихи Ф, Со Дж., Шерер С.В., Лемир Е. , Ставропулос DJ (2014). «Гаплонедостаточность CHD2 связана с задержкой развития, умственной отсталостью, эпилепсией и нейроповеденческими проблемами» . Журнал расстройств нервного развития . 6 (1): 9. дои : 10.1186/1866-1955-6-9 . ПМК 4022362 . ПМИД 24834135 .
- ^ Сулс А, Джаэн Х.А., Кечкес А., Вебер Ю., Векхейсен С., Крайу Д.С., Секиерска А., Джемье Т., Африканова Т., Гормли П., фон Спичак С., Клюгер Г., Илиеску С.М., Тальвик Т., Тальвик И., Мерал С., Чаглаян ХС, Хиральдез Б.Г., Серратоса Дж., Лемке Дж.Р., Хоффман-Захарска Д., Щепаник Е., Баришич Н., Комарек В., Хьялгрим Х., Мёллер Р.С., Линнанкиви Т., Димова П., Стриано П., Зара Ф., Марини С., Геррини Р., Депьенн. С, Баулак С., Куленбоймер Г., Кроуфорд А.Д., Лехесйоки А.Е., де Витте П.А., Палоти А., Лерш Х., Эсгерра К.В., Де Йонге П., Хельбиг И. (ноябрь 2013 г.). «Мутации с потерей функции de novo при CHD2 вызывают чувствительную к лихорадке миоклоническую эпилептическую энцефалопатию, имеющую общие черты с синдромом Драве» . Американский журнал генетики человека . 93 (5): 967–75. дои : 10.1016/j.ajhg.2013.09.017 . ПМЦ 3824114 . ПМИД 24207121 .
- ^ Консорциум EuroEPINOMICS-RES (октябрь 2014 г.). «Мутации de novo в генах синаптической передачи, включая DNM1, вызывают эпилептические энцефалопатии» . Американский журнал генетики человека . 95 (4): 360–70. дои : 10.1016/j.ajhg.2014.08.013 . ПМК 4185114 . ПМИД 25262651 .
- ^ Кураж К., Хоуг Дж., Галлати С., Шьельдеруп Дж., Риубланд К. (сентябрь 2014 г.). «Микроделеция 15q26.1, охватывающая только CHD2 и RGMA, у двух взрослых с умеренной умственной отсталостью, эпилепсией и ожирением туловища». Европейский журнал медицинской генетики . 57 (9): 520–3. дои : 10.1016/j.ejmg.2014.06.003 . ПМИД 24932903 .
- ^ Лунд К., Бродткорб Э., Ойе А.М., Рёсби О., Селмер К.К. (апрель 2014 г.). «Мутации CHD2 при синдроме Леннокса-Гасто». Эпилепсия и поведение . 33 : 18–21. дои : 10.1016/j.yebeh.2014.02.005 . ПМИД 24614520 . S2CID 140207920 .
- ^ Капелли Л.П., Креписки А.С., Гургель-Джаннетти Дж., Мендес М.Ф., Родригес Т., Варела М.К., Койффманн К.П., Розенберг К. (февраль 2012 г.). «Делекция генов RMGA и CHD2 у ребенка с эпилепсией и умственной отсталостью». Европейский журнал медицинской генетики . 55 (2): 132–4. дои : 10.1016/j.ejmg.2011.10.004 . ПМИД 22178256 .
- ^ Миоклоническая энцефалопатия CHD2 в MedlinePlus
- ^ Хамдан Ф.Ф., Срур М., Капо-Чичи Дж.М., Дауд Х., Нассиф С., Патри Л., Массикотт С., Амбалаванан А., Шпигельман Д., Диалло О., Генрион Е., Дионн-Лапорт А., Фужера А., Пшежецкий А.В., Венкатешваран С., Руло. Дж.А., Мишо Дж.Л. (октябрь 2014 г.). «Мутации de novo при умеренной или тяжелой умственной отсталости» . ПЛОС Генетика . 10 (10): e1004772. дои : 10.1371/journal.pgen.1004772 . ПМЦ 4214635 . ПМИД 25356899 .
- ^ Иосифов И, О'Рок Б.Дж., Сандерс С.Дж., Ронемус М., Крамм Н., Леви Д., Стессман Х.А., Уизерспун К.Т., Вивес Л., Паттерсон К.Е., Смит Дж.Д., Папер Б., Никерсон Д.А., Деа Дж., Донг С., Гонсалес Л.Е., Манделл Дж.Д., Мане С.М., Мурта М.Т., Салливан К.А., Уокер М.Ф., Вакар З., Вей Л., Уиллси А.Дж., Ямром Б., Ли Ю.Х., Грабовска Е., Далкич Е., Ван З., Маркс С., Эндрюс П., Леотта А., Кендалл Дж. , Хаккер И, Розенбаум Дж, Ма Б, Роджерс Л, Троге Дж, Нарцизи Г, Юн С, Шац MC, Йе К, Маккомби ВР, Шендюр Дж, Эйхлер Э., Стэйт М.В., Виглер М (ноябрь 2014 г.). «Вклад кодирующих мутаций de novo в расстройства аутистического спектра» . Природа . 515 (7526): 216–21. Бибкод : 2014Natur.515..216I . дои : 10.1038/nature13908 . ПМЦ 4313871 . ПМИД 25363768 .
- ^ Де Рубейс С., Хе Х, Голдберг А.П., Поултни К.С., Самоча К., Чичек А.Е., Коу Ю, Лю Л, Фромер М., Уокер С., Сингх Т., Клей Л., Космицки Дж., Ши-Чен Ф., Алексич Б., Бискальди М. , Болтон П.Ф., Браунфельд Дж.М., Кай Дж., Кэмпбелл Н.Г., Карраседо А., Чахрур М.Х., Чиоккетти А.Г., Кун Х., Кроуфорд Э.Л., Карран С.Р., Доусон Г., Дукетис Э., Фернандес Б.А., Галлахер Л., Геллер Э., Гутер С.Дж., Хилл РС, Ионита-Лаза Дж., Хименц Гонсалес П., Килпинен Х., Клаук С.М., Колевзон А., Ли И., Лей И., Лей Дж., Лехтимяки Т., Лин К.Ф., Мааян А., Маршалл Ч.Р., Макиннес А.Л., Нил Б., Оуэн. MJ, Одзаки Н, Пареллада М, Парр Дж.Р., Перселл С., Пуура К., Раджагопалан Д., Ренстрём К., Райхенберг А., Сабо А., Саксе М., Сандерс С.Дж., Шафер Дж., Шульте-Рютер М., Скузе Д., Стивенс С., Сатмари П., Таммимис К., Валладарес О., Воран А., Ли-Сан В., Вайс Л.А., Уиллси А.Дж., Ю Т.В., Юэнь Р.К., Кук Э.Х., Фрайтаг К.М., Гилл М., Хультман К.М., Ленер Т., Палоти А., Шелленберг Г.Д., Склар П., Стэйт М.В., Сатклифф Дж.С., Уолш К.А., Шерер С.В., Цвик М.Е., Баретт Дж.К., Катлер Д.Д., Родер К., Девлин Б., Дейли М.Дж., Буксбаум Дж.Д. (ноябрь 2014 г.). «Синаптические, транскрипционные и хроматиновые гены нарушаются при аутизме» . Природа . 515 (7526): 209–15. Бибкод : 2014Natur.515..209. . дои : 10.1038/nature13772 . ПМК 4402723 . ПМИД 25363760 .
- ^ О'Рок Б.Дж., Стессман Х.А., Бойл Э.А., Уизерспун К.Т., Мартин Б., Ли С., Вивес Л., Бейкер С., Хайатт Дж.Б., Никерсон Д.А., Бернье Р., Шендюр Дж., Эйхлер Э.Э. (2014). «Рекуррентные мутации de novo задействуют новые гены, лежащие в основе риска простого аутизма» . Природные коммуникации . 5 : 5595. Бибкод : 2014NatCo...5.5595O . дои : 10.1038/ncomms6595 . ПМЦ 4249945 . ПМИД 25418537 .
- ^ https://www.facebook.com/groups/1462485137354985/ [ источник, созданный пользователем ]
- ^ "Дом" . curechd2.org .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Фейс Т., Поппе Б., Де Претер К., Ван Рой Н., Верхасселт Б., Де Паепе П., Де Паепе А., Спелеман Ф (июль 2007 г.). «Подробный перечень изменений количества копий ДНК в четырех широко используемых клеточных линиях лимфомы Ходжкина» . Гематологическая . 92 (7): 913–20. дои : 10.3324/гематол.11073 . hdl : 1854/LU-376639 . ПМИД 17606441 .
- Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (январь 2006 г.) : Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» ( ) 16 1 : 55–65 « 10.1101 /gr.4039406 . PMID . . . 16344560 doi
- Хиллер М., Хус К., Платцер М., Бакофен Р. (2005). «Прогнозирование событий пропуска экзонов и удержания интронов, не основанное на EST, с использованием информации Pfam» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (17): 5611–21. дои : 10.1093/nar/gki870 . ПМЦ 1243800 . ПМИД 16204458 .
- Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мураж Дж., Фиск Г.Дж., Ли Ю, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М.С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л.В. (июнь 2004 г.). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природная биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
- Джонсон Дж.М., Касл Дж., Гарретт-Энгеле П., Кан З., Лёрч П.М., Armor CD, Сантос Р., Шадт Э.Э., Стоутон Р., Шумейкер Д.Д. (декабрь 2003 г.). «Полногеномное исследование альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с помощью микрочипов экзонных соединений». Наука . 302 (5653): 2141–4. Бибкод : 2003Sci...302.2141J . дои : 10.1126/science.1090100 . ПМИД 14684825 . S2CID 10007258 .