WTAP (ген)

ВТАП
Идентификаторы
Псевдонимы	WTAP , Mum2, белок, ассоциированный с опухолью Вильмса 1, белок, ассоциированный с WT1
Внешние идентификаторы	Опустить : 605442 ; МГИ : 1926395 ; Гомологен : 68422 ; GeneCards : WTAP ; OMA : WTAP — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	159,756,319 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	13,213,056 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; epithelium of nasopharynx; ; vena cava; ; buccal mucosa cell; ; cartilage tissue; ; amniotic fluid; ; germinal epithelium; ; pericardium; ; parietal pleura; ; caput epididymis;
	Top expressed in
	morula; ; ciliary body; ; medullary collecting duct; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; retinal pigment epithelium; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; condyle; ; primary oocyte; ; fossa; ; genital tubercle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	nuclear membrane; nucleus; RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex; nuclear speck; nucleoplasm; cytoplasm;
Biological process	RNA splicing; cell cycle; mRNA processing; mRNA methylation; regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; multicellular organism development; RNA metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9589
	60532
	ENSG00000146457
	ENSMUSG00000060475
	Q15007
	Q9ER69
showНМ_001270531 ; НМ_001270532 ; НМ_001270533 ; НМ_004906 ; НМ_152857 ;
	NM_152858
	НМ_001113532 ; НМ_001113533 ; НМ_175394 ; НМ_001379058
showНП_001257460 ; НП_001257461 ; НП_001257462 ; НП_004897 ; НП_690596 ;
	NP_690597
	НП_001107004 ; НП_001107005 ; НП_780603 ; НП_001365987
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Регулятор сплайсинга пре-мРНК WTAP представляет собой белок , который у человека кодируется WTAP геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Ген-супрессор опухоли Вильмса WT1, по-видимому, играет роль как в транскрипционной , так и в посттранскрипционной регуляции определенных клеточных генов. Этот ген кодирует белок, ассоциированный с WT1, который представляет собой повсеместно экспрессируемый ядерный белок. Подобно белку WT1, этот белок локализован по всей нуклеоплазме , а также в спеклах и частично колокализуется с факторами сплайсинга. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию трех вариантов транскрипта, два из которых кодируют одну и ту же изоформу. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что WTAP взаимодействует с WT1 . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000146457 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060475 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси Ю., Котани Х. и др. (июль 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Рез . 2 (1): 37–43. дои : 10.1093/dnares/2.1.37 . ПМИД 7788527 .
^ Jump up to: ^а ^б Литтл Н.А., Хасти Н.Д., Дэвис Р.К. (октябрь 2000 г.). «Идентификация WTAP, нового белка, ассоциированного с опухолью Вильмса 1» . Хум Мол Жене . 9 (15): 2231–9. doi : 10.1093/oxfordjournals.hmg.a018914 . ПМИД 11001926 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок, ассоциированный с опухолью 1 WTAP Вильмса» .

Дальнейшее чтение

Смолл Т.В., Болендер З., Буэно С. и др. (2007). «Белок, ассоциированный с опухолью Вильмса 1, регулирует пролиферацию гладкомышечных клеток сосудов» . Цирк. Рез . 99 (12): 1338–46. дои : 10.1161/01.RES.0000252289.79841.d3 . ПМИД 17095724 .
Хориучи К., Уметани М., Минами Т. и др. (2007). «Белок, ассоциированный с опухолью Вильмса 1, регулирует переход G2/M посредством стабилизации мРНК циклина А2» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (46): 17278–83. дои : 10.1073/pnas.0608357103 . ПМЦ 1634838 . ПМИД 17088532 .
Ронг Ю, Ченг Л, Нин Х и др. (2007). «Опухоль Вильмса 1, преобразователи сигналов и активаторы транскрипции 3 синергически способствуют пролиферации клеток: возможный механизм спорадической опухоли Вильмса» . Рак Рез . 66 (16): 8049–57. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-1172 . ПМИД 16912181 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Обусе С., Ян Х., Нозаки Н. и др. (2004). «Протеомный анализ центромерного комплекса интерфазных клеток HeLa: поврежденный УФ-излучением ДНК-связывающий белок 1 (DDB-1) является компонентом CEN-комплекса, тогда как ИМТ-1 временно колокализуется с центромерной областью в интерфазе» . Генные клетки . 9 (2): 105–20. дои : 10.1111/j.1365-2443.2004.00705.x . ПМИД 15009096 . S2CID 21813024 .
Утч Б., Кая А., Озбурун А. и др. (2004). «Исключение WTAP и HOXA13 как генов-кандидатов изолированной гипоспадии». Скан. Дж. Урол. Нефрол . 37 (6): 498–501. дои : 10.1080/00365590310014517 . ПМИД 14675924 . S2CID 34145137 .
Томсиг Дж.Л., Снайдер С.Л., Крейц К.Э. (2003). «Идентификация мишеней для передачи сигналов кальция через семейство белков копина. Характеристика спирально-спирального мотива, связывающего копин» . Ж. Биол. Хим . 278 (12): 10048–54. дои : 10.1074/jbc.M212632200 . ПМИД 12522145 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ортега А., Никшич М., Бачи А. и др. (2003). «Биохимическая функция женских летальных белков (2)D/Wilms', связанных с опухолевым супрессором-1, в альтернативном сплайсинге пре-мРНК» . Ж. Биол. Хим . 278 (5): 3040–7. дои : 10.1074/jbc.M210737200 . hdl : 10261/162976 . ПМИД 12444081 .
Ходжа М.Р., Валестедт С., Хёг С. (2000). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации неохарактеризованных белков человека». Эксп. Сотовый Res . 259 (1): 239–46. дои : 10.1006/excr.2000.4948 . ПМИД 10942595 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000146457 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060475 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7788527-5] Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А., Сазука Т., Секи Н., Сато С., Табата С., Исикава К., Каварабаяси Ю., Котани Х. и др. (июль 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . ДНК Рез . 2 (1): 37–43. дои : 10.1093/dnares/2.1.37 . ПМИД 7788527 .

[pmid11001926-6] Jump up to: ^а ^б Литтл Н.А., Хасти Н.Д., Дэвис Р.К. (октябрь 2000 г.). «Идентификация WTAP, нового белка, ассоциированного с опухолью Вильмса 1» . Хум Мол Жене . 9 (15): 2231–9. doi : 10.1093/oxfordjournals.hmg.a018914 . ПМИД 11001926 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок, ассоциированный с опухолью 1 WTAP Вильмса» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]