УИМК1

УИМК1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2MKF, 2MKG, 2RR9, 2N9E
Идентификаторы
Псевдонимы	UIMC1 , RAP80, X2HRIP110, мотив взаимодействия убиквитина, содержащий 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 609433 ; МГИ : 103185 ; Гомологен : 9455 ; GeneCards : UIMC1 ; OMA : UIMC1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	177,022,633 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	55,248,113 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; sural nerve; ; Achilles tendon; ; monocyte; ; left ovary; ; granulocyte; ; right ovary; ; epithelium of colon; ; body of uterus;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; epiblast; ; tunica media of zone of aorta; ; Paneth cell; ; gastrula; ; mesenteric lymph nodes; ; body of femur; ; spleen; ; hair follicle; ; bone marrow;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	histone binding; K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding; protein binding;
Cellular component	BRCA1-A complex; nucleus; nucleoplasm; nuclear body;
Biological process	response to ionizing radiation; positive regulation of DNA repair; histone H2A K63-linked deubiquitination; negative regulation of transcription, DNA-templated; double-strand break repair via nonhomologous end joining; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; cellular response to DNA damage stimulus; double-strand break repair; DNA repair; protein deubiquitination; mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51720
	20184
	ENSG00000087206
	ENSMUSG00000025878
	Q96RL1
	Q5U5Q9
	НМ_001199297 ; НМ_001199298 ; НМ_016290 ; НМ_001317961
	НМ_001293660 ; НМ_011307 ; НМ_001359757 ; НМ_001359758
	НП_001186226 ; НП_001186227 ; НП_001304890 ; НП_057374
	НП_001280589 ; НП_035437 ; НП_001346686 ; НП_001346687
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица комплекса BRCA1-A RAP80 представляет собой белок , который у человека кодируется UIMC1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Восстановление повреждений ДНК

RAP80, белковый продукт гена UIMC1, является основным компонентом деубиквитинового комплекса BRCA1-A. ^{[ 7 ]} Другими основными компонентами комплекса BRCA1-A являются белок BRCC36 ( ген BRCC3 ), белок BRE ( ген BRE (ген) ) и белок MERIT40 ( ген BABAM1 ). ^{[ 7 ]}

BRCA1 , в отличие от BRCA1-A, используется для восстановления хромосомных повреждений, играя важную роль в безошибочном гомологичном рекомбинационном (HR) восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК . Секвестрация BRCA1 вдали от места повреждения ДНК подавляет гомологичную рекомбинацию и перенаправляет клетку в направлении восстановления посредством процесса негомологичного соединения концов (NHEJ). ^{[ 7 ]} Роль комплекса BRCA1-A, по-видимому, заключается в том, чтобы связывать BRCA1 с высоким сродством и отводить его от места повреждения ДНК на периферию, где он остается секвестрированным, тем самым способствуя NHEJ в пользу HR.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000087206 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025878 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ян З., Ким Ю.С., Джеттен А.М. (август 2002 г.). «RAP80, новый ядерный белок, который взаимодействует с ретиноидным рецептором, связанным с семенниками» . J Биол Хим . 277 (35): 32379–88. дои : 10.1074/jbc.M203475200 . ПМИД 12080054 .
^ «Ген Энтрез: мотив взаимодействия убиквитина UIMC1, содержащий 1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Рабл Дж. (октябрь 2020 г.). «BRCA1-A и BRISC: многофункциональные молекулярные машины для передачи сигналов убиквитина» . Биомолекулы . 10 (11). дои : 10.3390/biom10111503 . ПМЦ 7692841 . ПМИД 33142801 .

Дальнейшее чтение

Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ким Ю.С., Наканиши Г., Оудес А.Дж. и др. (2004). «Tsp57: новый ген, индуцируемый на определенной стадии сперматогенеза» . Биол. Репродукция . 70 (1): 106–13. дои : 10.1095/biolreprod.103.018465 . ПМИД 12954732 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Ван Б., Мацуока С., Баллиф Б.А. и др. (2007). «Абраксас и RAP80 образуют белковый комплекс BRCA1, необходимый для реакции на повреждение ДНК» . Наука . 316 (5828): 1194–8. Бибкод : 2007Sci...316.1194W . дои : 10.1126/science.1139476 . ПМЦ 3573690 . ПМИД 17525340 .
Собхиан Б., Шао Г., Лилли Д.Р. и др. (2007). «RAP80 нацеливает BRCA1 на определенные структуры убиквитина в местах повреждения ДНК» . Наука . 316 (5828): 1198–202. Бибкод : 2007Sci...316.1198S . дои : 10.1126/science.1139516 . ПМК 2706583 . ПМИД 17525341 .
Ким Х, Чен Дж, Юй Х (2007). «Убиквитин-связывающий белок RAP80 опосредует BRCA1-зависимую реакцию на повреждение ДНК». Наука . 316 (5828): 1202–5. Бибкод : 2007Sci...316.1202K . дои : 10.1126/science.1139621 . ПМИД 17525342 . S2CID 31636419 .
Шебзухов Ю.В., Королева Е.П., Хлгатян С.В. и др. (2007). «RAP80/UIMC1 как рак-ассоциированный антиген: альтернативные варианты сплайсинга и их иммуногенность». Рак Летт . 255 (2): 255–62. дои : 10.1016/j.canlet.2007.04.013 . ПМИД 17562356 .
Ян Дж., Ким Ю.С., Ян Х.П. и др. (2007). «Взаимодействующий с убиквитином мотив, содержащий белок RAP80, взаимодействует с BRCA1 и участвует в реакции восстановления повреждений ДНК» . Рак Рез . 67 (14): 6647–56. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-0924 . ПМК 2391092 . ПМИД 17621610 .
Ян Дж., Ян Х.П., Ким Ю.С. и др. (2007). «RAP80 взаимодействует с SUMO-конъюгирующим ферментом UBC9 и является новой мишенью для сумойлирования» . Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 362 (1): 132–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.07.158 . ПМК 2049087 . ПМИД 17698038 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000087206 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025878 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12080054-5] Ян З., Ким Ю.С., Джеттен А.М. (август 2002 г.). «RAP80, новый ядерный белок, который взаимодействует с ретиноидным рецептором, связанным с семенниками» . J Биол Хим . 277 (35): 32379–88. дои : 10.1074/jbc.M203475200 . ПМИД 12080054 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: мотив взаимодействия убиквитина UIMC1, содержащий 1» .

[Rabl2020-7] Jump up to: ^а ^б ^с Рабл Дж. (октябрь 2020 г.). «BRCA1-A и BRISC: многофункциональные молекулярные машины для передачи сигналов убиквитина» . Биомолекулы . 10 (11). дои : 10.3390/biom10111503 . ПМЦ 7692841 . ПМИД 33142801 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]