SEMA домен
 SEMA Domain, иммуноглобулиновый домен (IG), короткий базовый домен | |||
| Идентификаторы | |||
|---|---|---|---|
| Символ | Семя | ||
| Pfam | PF01403 | ||
| InterPro | IPR001627 | ||
| PROSITE | PDOC51004 | ||
| Краткое содержание | 1olz / scope / supfam | ||
| Мембраном | 71 | ||
| |||
Домен SEMA представляет собой структурный домен семафоринов секретируемых и трансмембранных белков, некоторые из , которые представляют собой большое семейство которых функционируют как репеллентные сигналы во время наведения аксонов . Домены SEMA также встречаются в рецепторе фактора роста гепатоцитов (Uniprot: P08581 ), Plexin-A3 [ 1 ] (Uniprot: P51805 ) и в вирусных белках.
CD100 (также называемый SEMA4D ) связан с активностью PTPase и серинкиназы . CD100 увеличивает PMA, CD3 и CD2, индуцированную пролиферацией Т-клеток, увеличивает индуцированную CD45 адгезию Т-клеток, индуцирует гомотипическую адгезию B-клеток и подавляет B-клеток экспрессию CD23 .
Домен SEMA характеризуется консервативным набором остатков цистеина, которые образуют четыре дисульфидные связи для стабилизации структуры. Складка домена SEMA - это вариация топологии бета -пропеллера, с семью лезвиями радиально расположены вокруг центральной оси. Каждое лезвие содержит четырехпользованный (пряди от А-г) антипараллельный бета-лист. Внутренняя прядь каждого лезвия (а) выстраивает канал в центре винта, с нитями B и C того же повторного излучения, излучающейся наружу, и пряди D следующего повторения, образуя внешний край лезвия. Большой размер домена SEMA связан не с одним вставленным доменом, но является результатом наличия дополнительных элементов вторичной структуры, вставленных в большинство лопастей. Домен SEMA использует систему «петля и крюк», чтобы закрыть круг между первым и последним лезвием. Лезвия строятся последовательно с N-концевым бета-пряди, закрывающим круг, предоставляя самую внешнюю цепь (D) седьмого (C-концевого) лезвия. Бета-пропеллер дополнительно стабилизируется расширением N-конца, обеспечивая дополнительную пятую бета-цепь на внешнем краю лезвия 6. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]
Человеческие белки, содержащие этот домен
[ редактировать ]Встретиться ; MST1R ; Plxna1 ; Plxna2 ; Plxna3 ; Plxna4 ; Plxnb1 ; Plxnb2 ; Plxnb3 ; Plxnd1 ; Sema3a ; Sema3b ; Sema3c ; Sema3d ; Sema3e ; Sema3f ; Sema3g ; Sema4a ; Sema4b ; Sema4c ; Sema4d ; Sema4f ; Sema4g ; Sema5a ; Sema5b ; Sema6a ; Sema6b ; Sema6c ; Sema6d ; Sema7a ;
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Винберг М.Л., Нодермир Дж. Н., Тамагноне Л., Комоглио П.М., Сприггс М.К., Тессиер-Лавинь М., Гудман С.С. (декабрь 1998 г.). «Плексин А - это нейрональный рецептор семафорина, который контролирует руководство аксонов» . Клетка . 95 (7): 903–16. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81715-8 . PMID 9875845 . S2CID 14703056 .
- ^ Antentco A, Himmanen JP, Van Leyen K, Nordi-Dei V, Lesniac J, Barton WA, Rajashankark KR, Lu M, Homem C, Püschel AW, Nikolov DB (август 2003 г.). «Структура модуля связывания Semphorein-3A Esptors» . Нейрон . 39 (4): 589–98. doi : 10.1016/s0896-6273 (03) 00502-6 . PMID 12925274 . S2CID 9782923 .
- ^ Love CA, Harlos K, Mavaddat N, Davis SJ, Stuart Di, Jones EY, Esnouf RM (октябрь 2003 г.). «Лиганд-связывающая поверхность семафоринов, выявленных кристаллической структурой высокого разрешения SEMA4D». Природа структурная биология . 10 (10): 843–8. doi : 10.1038/nsb977 . PMID 12958590 . S2CID 24468463 .
- ^ Stamos J, Lazarus RA, Yao X, Kirchhofer D, Wiesmann C (июнь 2004 г.). «Кристаллическая структура бета-цепь HGF в комплексе с доменом SEMA рецептора Met» . Embo Journal . 23 (12): 2325–35. doi : 10.1038/sj.emboj.7600243 . PMC 423285 . PMID 15167892 .