SEMA4D

SEMA4D
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1OLZ, 3OL2
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA4D , C9orf164, CD100, M-sema-G, SEMAJ, кол-4, семафорин 4D, COLL4, A8, GR3, BB18
Внешние идентификаторы	Опустить : 601866 ; МГИ : 109244 ; Гомологен : 21282 ; GeneCards : SEMA4D ; OMA : SEMA4D — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	89,498,130 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	51,793,747 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	C1 segment; ; granulocyte; ; corpus callosum; ; blood; ; monocyte; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; lymph node; ; muscle of thigh; ; internal globus pallidus; ; substantia nigra;
	Top expressed in
	granulocyte; ; muscle of thigh; ; mesenteric lymph nodes; ; thymus; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; cumulus cell; ; tibiofemoral joint; ; blood; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; spleen;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	signaling receptor binding; transmembrane signaling receptor activity; protein binding; semaphorin receptor binding; neuropilin binding; identical protein binding; signaling receptor activity; chemorepellent activity;
Cellular component	integral component of membrane; integral component of plasma membrane; membrane; plasma membrane; extracellular space;
Biological process	regulation of dendrite morphogenesis; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; multicellular organism development; leukocyte aggregation; nervous system development; negative regulation of cell adhesion; positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; positive regulation of axonogenesis; semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis; regulation of cell projection organization; negative regulation of osteoblast differentiation; positive regulation of collateral sprouting; regulation of cell shape; negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; cell differentiation; positive regulation of protein phosphorylation; semaphorin-plexin signaling pathway; cell adhesion; immune response; ossification involved in bone maturation; positive regulation of cell migration; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of GTPase activity; negative regulation of alkaline phosphatase activity; negative chemotaxis; neural crest cell migration; negative regulation of axon extension involved in axon guidance; positive regulation of inhibitory synapse assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	10507
	20354
	ENSG00000187764
	ENSMUSG00000021451
	Q92854
	О09126
показывать НМ_001142287 ; НМ_006378 ; НМ_182635 ; НМ_001371194 ; НМ_001371195 ;
	NM_001371196; NM_001371197; NM_001371198; NM_001371199; NM_001371200; NM_001371201; NM_001371202
	НМ_001281880 ; НМ_013660
показывать НП_001135759 ; НП_006369 ; НП_001358123 ; НП_001358124 ; НП_001358125 ;
	NP_001358126; NP_001358127; NP_001358128; NP_001358129; NP_001358130; NP_001358131
показывать НП_001268809 ; НП_038688 ; НП_001365242 ; НП_001365243 ; НП_001365246 ;
	NP_001365247; NP_001365248; NP_001365249; NP_001365251; NP_001365252; NP_001365253; NP_001365244; NP_001365245; NP_001365250; NP_001365254
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Семафорин-4D ( SEMA4D ), также известный как кластер дифференциации D- 100 ( CD100 ) , представляет собой белок семейства семафоринов , который у человека кодируется SEMA4D геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Семафорин 4D (Sema 4D) представляет собой молекулу , направляющую аксоны , которая секретируется олигодендроцитами и вызывает коллапс конуса роста в центральной нервной системе . Связывая рецептор плексина B1, он действует как белок, активирующий R-Ras GTPase (GAP), и отталкивает конусы роста аксонов как в зрелой центральной нервной системе. ^{[ 6 ]}

В иммунной системе CD100 связывается с CD72 , активируя В-клетки и дендритные клетки , хотя многое в этом взаимодействии все еще изучается. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Во время кожи восстановления повреждений SEMA4D взаимодействует с плексином B2 на гамма-дельта-Т-клетках, играя роль в процессе заживления. ^{[ 9 ]}

См. также

Кластер дифференциации

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000187764 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021451 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: сема-домен SEMA4D, домен иммуноглобулина (Ig), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен (семафорин) 4D» .
^ Ито Ю, Ойнума И, Като Х, Кайбути К, Негиши М (июль 2006 г.). «Sema4D/плексин-B1 активирует GSK-3β посредством активности R-Ras GAP, вызывая коллапс конуса роста» . Отчеты ЭМБО . 7 (7): 704–9. дои : 10.1038/sj.embor.7400737 . ПМК 1500830 . ПМИД 16799460 .
^ Куманогох А., Ватанабэ С., Ли И., Ван Х., Ши В., Араки Х., Хирата Х., Ивахори К., Учида Дж., Ясуи Т., Мацумото М., Ёсида К., Якура Х., Пан С., Парнес-младший, Кикутани Х. (ноябрь 2000 г.) ). «Идентификация CD72 как лимфоцитного рецептора семафорина CD100 класса IV: новый механизм регуляции передачи сигналов В-клеток» . Иммунитет . 13 (5): 621–31. дои : 10.1016/S1074-7613(00) 00062-5 ПМИД 11114375 .
^ Исида И, Куманогох А, Сузуки К, Акахани С, Нода К, Кикутани Х (август 2003 г.). «Участие CD100, семафорина лимфоцитов, в активации иммунной системы человека посредством CD72: значение для регуляции иммунных и воспалительных реакций» . Межд. Иммунол . 15 (8): 1027–34. дои : 10.1093/intimm/dxg098 . ПМИД 12882840 .
^ Дебора А. Уизерден, Мегуми Ватанабэ, Оливия Гариджо, Стефани Э. Ридер, Гор Саркисян, Шейн Дж. Ф. Кронин, Петра Вердино, Ян А. Уилсон, Ацуши Куманого, Хитоши Кикутани, Люк Тейтон, Вольфганг Х. Фишер, Венди Л. Хавран ( август 2012 г.). «Рецептор CD100 взаимодействует со своим лигандом плексина B2, регулируя функцию эпидермальных γδ Т-клеток» . Иммунитет . 37 (2): 314–25. doi : 10.1016/j.immuni.2012.05.026 . ПМК 3430606 . ПМИД 22902232 .

Дальнейшее чтение

Бужере С., Мансур И.Г., Дастот Х. и др. (1992). «Увеличенная поверхностная экспрессия недавно идентифицированного димера массой 150 кДа вскоре после активации Т-лимфоцитов человека» . Дж. Иммунол . 148 (2): 318–23. дои : 10.4049/jimmunol.148.2.318 . ПМИД 1530858 . S2CID 29224711 .
Холл К.Т., Бумселл Л., Шульце Дж.Л. и др. (1996). «Человеческий CD100, новый семафорин лейкоцитов, который способствует агрегации и дифференцировке B-клеток» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (21): 11780–5. Бибкод : 1996PNAS...9311780H . дои : 10.1073/pnas.93.21.11780 . ПМК 38135 . ПМИД 8876214 .
Герольд С., Эльхабази А., Висмут Г. и др. (1997). «CD100 связан с CD45 на поверхности Т-лимфоцитов человека. Роль в гомотипической адгезии Т-клеток» . Дж. Иммунол . 157 (12): 5262–8. дои : 10.4049/jimmunol.157.12.5262 . ПМИД 8955171 . S2CID 36341775 .
Фуруяма Т., Инагаки С., Косуги А. и др. (1997). «Идентификация нового трансмембранного семафорина, экспрессируемого на лимфоцитах» . Ж. Биол. Химия 271 (52): 33376–81. дои : 10.1074/jbc.271.52.33376 . ПМИД 8969198 .
Таманьоне Л., Артиджиани С., Чен Х. и др. (1999). «Плексины представляют собой большое семейство рецепторов трансмембранных, секретируемых и GPI-заякоренных семафоринов у позвоночных» . Клетка . 99 (1): 71–80. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80063-X . ПМИД 10520995 . S2CID 17386412 .
Эльхабази А., Делэр С., Бенсуссан А. и др. (2001). «Биологическая активность растворимого CD100. I. Внеклеточная область CD100 высвобождается с поверхности Т-лимфоцитов путем регулируемого протеолиза» . Дж. Иммунол . 166 (7): 4341–7. дои : 10.4049/jimmunol.166.7.4341 . ПМИД 11254687 .
Делэр С., Биллард С., Торджман Р. и др. (2001). «Биологическая активность растворимого CD100. II. Растворимый CD100, подобно H-SemaIII, ингибирует миграцию иммунных клеток» . Дж. Иммунол . 166 (7): 4348–54. дои : 10.4049/jimmunol.166.7.4348 . ПМИД 11254688 .
Викис Х.Г., Ли В., Гуань К.Л. (2002). «Взаимодействие Plexin-B1/Rac ингибирует активацию PAK и усиливает связывание лиганда Sema4D» . Генс Дев . 16 (7): 836–45. дои : 10.1101/gad.966402 . ЧВК 186329 . ПМИД 11937491 .
Гранциеро Л., Циркоста П., Сьельцо С. и др. (2003). «Взаимодействие CD100/плексин-B1 поддерживает пролиферацию и выживание нормальных и лейкемических CD5+ B-лимфоцитов» . Кровь . 101 (5): 1962–9. дои : 10.1182/кровь-2002-05-1339 . ПМИД 12406905 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Измайлова Е., Бертли Ф.М., Хуан К. и др. (2003). «Тат ВИЧ-1 перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Нат. Мед . 9 (2): 191–7. дои : 10.1038/nm822 . ПМИД 12539042 . S2CID 26145639 .
Лав К.А., Харлос К., Маваддат Н. и др. (2003). «Лигандсвязывающая сторона семафоринов, выявленная с помощью кристаллической структуры SEMA4D с высоким разрешением». Нат. Структура. Биол . 10 (10): 843–8. дои : 10.1038/nsb977 . ПМИД 12958590 . S2CID 24468463 .
Жиродон П., Винсент П., Вуайя С. и др. (2004). «Семафорин CD100 из активированных Т-лимфоцитов вызывает коллапс расширения отростков в олигодендроцитах и гибель незрелых нервных клеток» . Дж. Иммунол . 172 (2): 1246–55. дои : 10.4049/jimmunol.172.2.1246 . ПМИД 14707103 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Деаглио С., Ваиситти Т., Берги Л. и др. (2005). «CD38 и CD100 возглавляют сеть поверхностных рецепторов, передающих положительные сигналы для роста и выживания B-CLL» . Кровь . 105 (8): 3042–50. дои : 10.1182/кровь-2004-10-3873 . ПМИД 15613544 .
Конротто П., Вальдембри Д., Корсо С. и др. (2005). «Sema4D индуцирует ангиогенез посредством рекрутирования Met с помощью плексина B1» . Кровь . 105 (11): 4321–9. дои : 10.1182/blood-2004-07-2885 . ПМИД 15632204 .
Базиль-младший, Афхами Т., Гуткинд Дж.С. (2005). «Семафорин 4D/Плексин-B1 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток посредством активации PYK2, Src и пути фосфатидилинозитол-3-киназы-Akt» . Мол. Клетка. Биол . 25 (16): 6889–98. дои : 10.1128/MCB.25.16.6889-6898.2005 . ПМК 1190270 . ПМИД 16055703 .
Левандровски Ю, Мебиус Дж, Уолтер Ю, Зикманн А (2006). «Выявление сайтов N-гликозилирования белков тромбоцитов человека: гликопротеомный подход» . Мол. Клетка. Протеомика . 5 (2): 226–33. дои : 10.1074/mcp.M500324-MCP200 . ПМИД 16263699 .
[ Бесплатная статья ЧВК ] [ PubMed ] Чаповал С.П. (2011). «Биология и функция нейроиммунных семафоринов 4А и 4D» . Иммунол. Рез 50 (1): 10–21. дои : 10.1007/s12026-010-8201-y . ПМК 3366695 . ПМИД 21203905 .
Смит Е.П., Шанкс К., Липски М.М., ДеТолла Л.Дж., Киган А.Д., Чаповал С.П. (2011). «Экспрессия нейроиммунных семафоринов 4A и 4D и их рецепторов в легких усиливается аллергеном и фактором роста эндотелия сосудов» . БМК Иммунол . 12:30 . дои : 10.1186/1471-2172-12-30 . ПМК 3118960 . ПМИД 21595947 .
Шанкс К., Нкиимбенг-Такви Э.Х., Смит Э.П., Липски М.М., ДеТолла Л.Дж., Киган А.Д., Чаповал С.П. (2013). «Нейроиммунный семафорин 4D необходим для оптимального аллергического воспаления легких» . Мол. Иммунол . 56 (4): 480–7. дои : 10.1016/j.molimm.2013.05.228 . ПМЦ 3783523 . ПМИД 23911404 .

Внешние ссылки

SEMA4D + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000187764 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021451 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: сема-домен SEMA4D, домен иммуноглобулина (Ig), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен (семафорин) 4D» .

[pmid16799460-6] Ито Ю, Ойнума И, Като Х, Кайбути К, Негиши М (июль 2006 г.). «Sema4D/плексин-B1 активирует GSK-3β посредством активности R-Ras GAP, вызывая коллапс конуса роста» . Отчеты ЭМБО . 7 (7): 704–9. дои : 10.1038/sj.embor.7400737 . ПМК 1500830 . ПМИД 16799460 .

[pmid11114375-7] Куманогох А., Ватанабэ С., Ли И., Ван Х., Ши В., Араки Х., Хирата Х., Ивахори К., Учида Дж., Ясуи Т., Мацумото М., Ёсида К., Якура Х., Пан С., Парнес-младший, Кикутани Х. (ноябрь 2000 г.) ). «Идентификация CD72 как лимфоцитного рецептора семафорина CD100 класса IV: новый механизм регуляции передачи сигналов В-клеток» . Иммунитет . 13 (5): 621–31. дои : 10.1016/S1074-7613(00) 00062-5 ПМИД 11114375 .

[pmid12882840-8] Исида И, Куманогох А, Сузуки К, Акахани С, Нода К, Кикутани Х (август 2003 г.). «Участие CD100, семафорина лимфоцитов, в активации иммунной системы человека посредством CD72: значение для регуляции иммунных и воспалительных реакций» . Межд. Иммунол . 15 (8): 1027–34. дои : 10.1093/intimm/dxg098 . ПМИД 12882840 .

[Witherden-9] Дебора А. Уизерден, Мегуми Ватанабэ, Оливия Гариджо, Стефани Э. Ридер, Гор Саркисян, Шейн Дж. Ф. Кронин, Петра Вердино, Ян А. Уилсон, Ацуши Куманого, Хитоши Кикутани, Люк Тейтон, Вольфганг Х. Фишер, Венди Л. Хавран ( август 2012 г.). «Рецептор CD100 взаимодействует со своим лигандом плексина B2, регулируя функцию эпидермальных γδ Т-клеток» . Иммунитет . 37 (2): 314–25. doi : 10.1016/j.immuni.2012.05.026 . ПМК 3430606 . ПМИД 22902232 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и Белки : кластеры дифференциации (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350