CD1b

CD1B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1GZP, 1GZQ, 1UQS, 2H26, 3OV6, 3T8X, 4ONO
Идентификаторы
Псевдонимы	CD1B , CD1, CD1A, R1, молекула CD1b
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 188360 ; Гомологен : 129921 ; Генные карты : CD1B ; ОМА : CD1B — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	158,331,531 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	thymus; ; testicle; ; skin of thigh; ; white blood cell; ; monocyte; ; lymph node; ; granulocyte; ; cecum; ; appendix; ; vulva;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	beta-2-microglobulin binding; endogenous lipid antigen binding; lipopeptide binding; protein binding; exogenous lipid antigen binding;
Cellular component	integral component of membrane; cell surface; lysosomal membrane; endosome; lysosome; endosome membrane; membrane; plasma membrane; extracellular space; external side of plasma membrane;
Biological process	antigen processing and presentation, exogenous lipid antigen via MHC class Ib; adaptive immune response; immune system process; regulation of immune response; positive regulation of T cell mediated cytotoxicity; immune response; antigen processing and presentation, endogenous lipid antigen via MHC class Ib;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	910
	н/д
	ENSG00000158485
	н/д
	P29016
	н/д
	НМ_001764
	н/д
	НП_001755
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Гликопротеин поверхности Т-клеток CD1b представляет собой белок , который у человека кодируется CD1B геном .

CD1b принадлежит к группе 1 CD1 семейства трансмембранных гликопротеинов . Молекулы CD1 экспрессируются на поверхности множества различных антигенпрезентирующих клеток человека ( ДК , моноцитов и некоторых тимоцитов ). Эта специализированная группа гликопротеинов представляет собственные и чужие липидные антигены специфическим αβ Т-клеткам. ^{[ 3 ]} Молекулы CD1 структурно связаны с главным комплексом гистосовместимости (MHC), принадлежащим генам, подобным MHC класса I. CD1 человека Локус находится на хромосоме 1 и содержит пять неполиморфных генов (CD1a, CD1b, CD1c, CD1d и CD1e). ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Структура и функции

Молекулы CD1b (как и другие молекулы CD1 и классические молекулы MHC I ) образованы мембраносвязанным гликопротеином, состоящим из трех внеклеточных доменов (α1, α2, α3). Эти внеклеточные домены нековалентно связаны с микроглобулином β2 (который выполняет функцию стабилизации белка). Эта организация образует узкую гидрофобную связывающую бороздку, в которой размещаются липидные антигены. Связывающая бороздка состоит из четырех широко соединенных друг с другом карманов, которые заняты алкильными цепями гликолипида и двумя молекулами детергента. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} По сравнению с другими молекулами CD1 это уникальное расположение CD1b обеспечивает возможность связывания широкого спектра антигенов с различной длиной алкильной цепи. Алкильные компоненты антигенов прикрепляются к гидрофобной бороздке, а гидрофильная часть выделяется из молекулы CD1b и, таким образом, обеспечивает TCR место для связывания. ^{[ 8 ]}

Молекула CD1b имеет самую большую антигенсвязывающую щель среди семейства CD1. В то время как микробные липиды имеют тенденцию иметь более длинные алкильные цепи, чем собственные эндогенные липиды, кажется, что CD1b специально адаптирован для представления микробных липидов (а не эндогенных) Т-клеткам. ^{[ 7 ]} В отсутствие более длинных микробных липидов CD1b представляет собой как эндогенный липид, так и каркасный/спейсерный липид(ы). ^{[ 9 ]}

Клиническое значение

Когда иммунная система не различает собственные и чужие антигены, это приводит к аутореактивному Т-клеточному ответу. Аутореактивный CD1b может распознавать, например, фосфатидилглицерин, который характерен для бактерий, а также для митохондрий млекопитающих. Этот аутоантиген высвобождается во время бактериальной инфекции или митохондриального стресса. CD1b также представляет эндогенные ганглиозиды специфическим Т-клеткам, поэтому они могут вызвать аутоиммунные заболевания, такие как рассеянный склероз .

В отличие от главных комплексов гистосовместимости, молекулы CD1 имеют ограниченное разнообразие, они могут быть интересным маркером для иммунотерапии и мишенью для разработки новых лекарств. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000158485 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Грас С., Ван Рейн И., Шахин А., Ченг Т.Ю., Бхати М., Тан Л.Л. и др. (октябрь 2016 г.). «Распознавание Т-клеточным рецептором CD1b, представляющего микобактериальный гликолипид» . Природные коммуникации . 7 : 13257. Бибкод : 2016NatCo...713257G . дои : 10.1038/ncomms13257 . ПМЦ 5095289 . ПМИД 27807341 .
^ «Молекула CD1B CD1b [Homo sapiens (человек)]» . NCBI Ген . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . Проверено 06 февраля 2019 г.
^ Джекман Р.М., Стенгер С., Ли А., Муди Д.Б., Роджерс Р.А., Ниязи К.Р. и др. (март 1998 г.). «Тирозинсодержащий цитоплазматический хвост CD1b необходим для эффективной презентации бактериальных липидных антигенов» . Иммунитет . 8 (3): 341–51. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80539-7 . ПМИД 9529151 .
^ «CD1B - предшественник поверхностного гликопротеина CD1b Т-клеток - Homo sapiens (человек) - ген и белок CD1B» . Универсальный ресурс белка (UniProt) . Проверено 06 февраля 2019 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Гадола С.Д., Заккаи Н.Р., Харлос К., Шепард Д., Кастро-Паломино Дж.К., Риттер Г. и др. (август 2002 г.). «Структура человеческого CD1b со связанными лигандами при 2,3 А, лабиринт алкильных цепей». Природная иммунология . 3 (8): 721–6. дои : 10.1038/ni821 . ПМИД 12118248 . S2CID 86980 .
^ Батувангала Т., Шепард Д., Гадола С.Д., Гибсон К.Дж., Заккаи Н.Р., Фершт А.Р. и др. (февраль 2004 г.). «Кристаллическая структура CD1b человека со связанным бактериальным гликолипидом» . Журнал иммунологии . 172 (4): 2382–8. дои : 10.4049/jimmunol.172.4.2382 . ПМИД 14764708 .
^ Шахин, Адам (2018). «Тонкости самопрезентации липидного антигена CD1b» . Молекулярная иммунология . 104 : 27–36. дои : 10.1016/j.molimm.2018.09.022 . ПМИД 30399491 . S2CID 53243699 .
^ Ван Рейн И., ван Берло Т., Хильменюк Т., Ченг Т.Ю., Вольф Б.Дж., Татитури Р.В. и др. (январь 2016 г.). «Аутореактивные Т-клетки человека распознают CD1b и фосфолипиды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (2): 380–5. Бибкод : 2016PNAS..113..380В . дои : 10.1073/pnas.1520947112 . ПМК 4720340 . ПМИД 26621732 .

Дальнейшее чтение

Мерфи К., Уивер С. (2016). Иммунобиология Джейнвей (9-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Garland Science/Taylor & Francisco Group. ISBN 978-0-8153-4551-0 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P29016 (поверхностный гликопротеин Т-клеток CD1b) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000158485 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] Грас С., Ван Рейн И., Шахин А., Ченг Т.Ю., Бхати М., Тан Л.Л. и др. (октябрь 2016 г.). «Распознавание Т-клеточным рецептором CD1b, представляющего микобактериальный гликолипид» . Природные коммуникации . 7 : 13257. Бибкод : 2016NatCo...713257G . дои : 10.1038/ncomms13257 . ПМЦ 5095289 . ПМИД 27807341 .

[4] «Молекула CD1B CD1b [Homo sapiens (человек)]» . NCBI Ген . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . Проверено 06 февраля 2019 г.

[5] Джекман Р.М., Стенгер С., Ли А., Муди Д.Б., Роджерс Р.А., Ниязи К.Р. и др. (март 1998 г.). «Тирозинсодержащий цитоплазматический хвост CD1b необходим для эффективной презентации бактериальных липидных антигенов» . Иммунитет . 8 (3): 341–51. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80539-7 . ПМИД 9529151 .

[6] «CD1B - предшественник поверхностного гликопротеина CD1b Т-клеток - Homo sapiens (человек) - ген и белок CD1B» . Универсальный ресурс белка (UniProt) . Проверено 06 февраля 2019 г.

[:0-7] Перейти обратно: ^а ^б Гадола С.Д., Заккаи Н.Р., Харлос К., Шепард Д., Кастро-Паломино Дж.К., Риттер Г. и др. (август 2002 г.). «Структура человеческого CD1b со связанными лигандами при 2,3 А, лабиринт алкильных цепей». Природная иммунология . 3 (8): 721–6. дои : 10.1038/ni821 . ПМИД 12118248 . S2CID 86980 .

[8] Батувангала Т., Шепард Д., Гадола С.Д., Гибсон К.Дж., Заккаи Н.Р., Фершт А.Р. и др. (февраль 2004 г.). «Кристаллическая структура CD1b человека со связанным бактериальным гликолипидом» . Журнал иммунологии . 172 (4): 2382–8. дои : 10.4049/jimmunol.172.4.2382 . ПМИД 14764708 .

[9] Шахин, Адам (2018). «Тонкости самопрезентации липидного антигена CD1b» . Молекулярная иммунология . 104 : 27–36. дои : 10.1016/j.molimm.2018.09.022 . ПМИД 30399491 . S2CID 53243699 .

[10] Ван Рейн И., ван Берло Т., Хильменюк Т., Ченг Т.Ю., Вольф Б.Дж., Татитури Р.В. и др. (январь 2016 г.). «Аутореактивные Т-клетки человека распознают CD1b и фосфолипиды» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (2): 380–5. Бибкод : 2016PNAS..113..380В . дои : 10.1073/pnas.1520947112 . ПМК 4720340 . ПМИД 26621732 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Белки : кластеры дифференцировки (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Генный локус	1q23.1
Молекулярная масса ( Да )	36939
Размер Ag -связывающей щели ( Å )	2,3
Длина антигенов (углеродов)	25-80