CD6

CD6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	5A2E
Идентификаторы
Псевдонимы	CD6 , TP120, молекула CD6
Внешние идентификаторы	Опустить : 186720 ; МГИ : 103566 ; Гомологен : 4893 ; Генные карты : CD6 ; ОМА : CD6 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	61,020,377 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	10,807,422 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; lymph node; ; blood; ; thymus; ; appendix; ; spleen; ; cervix epithelium; ; superficial temporal artery; ; bone marrow; ; endothelial cell;
	Top expressed in
	thymus; ; mesenteric lymph nodes; ; blood; ; granulocyte; ; embryo; ; axillary lymph node; ; subcutaneous adipose tissue; ; embryo; ; spleen; ; morula;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	lipopolysaccharide binding; lipoteichoic acid binding; scavenger receptor activity; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; intrinsic component of plasma membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; T cell receptor complex; extracellular region; immunological synapse; external side of plasma membrane;
Biological process	positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; adaptive immune response; immune system process; acute inflammatory response to antigenic stimulus; receptor-mediated endocytosis; response to lipopolysaccharide; cell adhesion; positive regulation of T cell proliferation; innate immune response; immunological synapse formation; lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; vesicle-mediated transport; endocytosis;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	923
	12511
	ENSG00000013725
	ENSMUSG00000024670
	P30203
	Q61003
	НМ_001254750 ; НМ_001254751 ; НМ_006725
	НМ_001037801 ; НМ_009852
	НП_001241679 ; НП_001241680 ; НП_006716
	НП_001032890 ; НП_033982
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

CD6 ( кластер дифференциации D- 6) — человеческий белок, кодируемый CD6 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок, обнаруженный на внешней мембране Т-лимфоцитов, а также некоторых других иммунных клеток. Кодируемый белок содержит три богатых цистеином (SRCR) домена рецептора-поглотителя и сайт связывания для активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток . Генный продукт важен для продолжения активации Т-клеток . ^{[ 5 ]}

Клиническое значение

Определенные аллели этого гена могут быть связаны с предрасположенностью к рассеянному склерозу . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

См. также

Кластер дифференциации

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000013725 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024670 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: Молекула CD6 CD6» .
^ Боуэн М.А., Патель Д.Д., Ли Х, Модрелл Б., Малако А.Р., Ван В.К., Марквардт Х., Нойбауэр М., Песандо Дж.М., Франк У (1995). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов (ALCAM), лиганда CD6» . Дж. Эксп. Мед . 181 (6): 2213–20. дои : 10.1084/jem.181.6.2213 . ПМК 2192054 . ПМИД 7760007 .
^ Де Джагер П.Л., Цзя Икс, Ван Дж., де Баккер П.И., Оттобони Л., Аггарвал Н.Т., Пиччио Л., Райчаудхури С., Тран Д., Обин С., Брискин Р., Романо С., Баранзини С.Е., Макколи Дж.Л., Перикак-Вэнс М.А., Хейнс Дж.Л., Гибсон Р.А., Наэглин Ю., Уитдехааг Б., Мэтьюз П.М., Каппос Л., Полман С., Макардл В.Л., Страхан Д.П., Эванс Д., Кросс А.Х., Дейли М.Дж., Компстон А., Сосер С.Дж., Вайнер Х.Л., Хаузер С.Л., Хафлер Д.А., Оксенберг-младший (2009). «Метаанализ сканирования генома и репликации идентифицирует CD6, IRF8 и TNFRSF1A как новые локусы предрасположенности к рассеянному склерозу» . Нат. Жене . 41 (7): 776–82. дои : 10.1038/ng.401 . ПМЦ 2757648 . ПМИД 19525953 .
^ Кофлер Д.М., Северсон К.А., Мусиссян Н., Де Ягер П.Л., Хафлер Д.А. (2011). «Аллель предрасположенности к рассеянному склерозу CD6 связан с изменениями в пролиферации CD4+ Т-клеток» . Дж. Иммунол . 187 (6): 3286–91. doi : 10.4049/jimmunol.1100626 . ПМИД 21849685 .

Дальнейшее чтение

Аруффо А., Мельник М.Б., Линсли П.С., Сид Б (1991). «Лимфоцитарный гликопротеин CD6 содержит повторяющуюся доменную структуру, характерную для нового семейства клеточных поверхностных и секретируемых белков» . Дж. Эксп. Мед . 174 (4): 949–52. дои : 10.1084/jem.174.4.949 . ПМК 2118957 . ПМИД 1919444 .
Свак Дж.А., Миер Дж.В., Ромен П.Л., Халл С.Р., Радд CE (1991). «Биосинтез и посттрансляционная модификация CD6, молекулы, передающей сигнал Т-клеток» . Ж. Биол. Хим . 266 (11): 7137–43. дои : 10.1016/S0021-9258(20)89621-5 . ПМИД 2016320 .
Цугэ И., Уцуми К.Р., Уэда Р., Такамото С., Такахаси Т. (1985). «Присвоение гена, кодирующего антиген дифференцировки Т-клеток человека, Tp120, на хромосому 11». Сомат. Клетка Мол. Жене . 11 (3): 217–22. дои : 10.1007/BF01534678 . ПМИД 3923629 . S2CID 39343360 .
Уитни Г.С., Старлинг Г.К., Боуэн М.А., Модрелл Б., Сиадак А.В., Аруффо А. (1995). «Богатый цистеином домен CD6 мембранно-проксимального рецептора-поглотителя содержит сайт связывания активированной молекулы адгезии лейкоцитов» . Ж. Биол. Хим . 270 (31): 18187–90. дои : 10.1074/jbc.270.31.18187 . ПМИД 7543097 .
Робинсон WH, Нойман де Вегвар HE, Прохаска SS, Ри JW, Парнес JR (1995). «Человеческий CD6 обладает большим цитоплазматическим доменом, альтернативно сращенным». Евро. Дж. Иммунол . 25 (10): 2765–9. дои : 10.1002/eji.1830251008 . ПМИД 7589069 . S2CID 8996113 .
Ви С., Шивен Г.Л., Кирихара Дж.М., Цу Т.Т., Ледбеттер Дж.А., Аруффо А. (1993). «Тирозиновое фосфорилирование CD6 путем стимуляции CD3: увеличение корецепторов CD4 и CD2» . Дж. Эксп. Мед . 177 (1): 219–23. дои : 10.1084/jem.177.1.219 . ПМК 2190871 . ПМИД 7678115 .
Боуэн М.А., Уитни Г.С., Нойбауэр М., Старлинг Г.К., Палмер Д., Чжан Дж., Новак Н.Дж., Шоу ТБ, Аруффо А. (1997). «Структура и хромосомное расположение гена CD6 человека: обнаружение пяти изоформ CD6 человека» . Дж. Иммунол . 158 (3): 1149–56. дои : 10.4049/jimmunol.158.3.1149 . ПМИД 9013954 . S2CID 24196035 .
Кобарг Дж., Уитни Г.С., Палмер Д., Аруффо А., Боуэн М.А. (1998). «Анализ фосфорилирования тирозина и потока кальция изоформ CD6 человека с различными цитоплазматическими доменами». Евро. Дж. Иммунол . 27 (11): 2971–80. дои : 10.1002/eji.1830271133 . ПМИД 9394826 . S2CID 20897222 .
Певица Н.Г., Митра Р., Лиалиос Ф., Ричардсон Б.К., Маркс Р.М., Песандо Дж.М., Фокс Д.А., Николофф Б.Дж. (1998). «CD6-зависимые взаимодействия Т-клеток и кератиноцитов: функциональные доказательства наличия второго лиганда CD6 на кератиноцитах, активированных гамма-интерфероном». Иммунол. Летт . 58 (1): 9–14. дои : 10.1016/S0165-2478(97)02707-7 . ПМИД 9436462 .
Гимферрер И, Фарнос М, Кальво М, Миттельбрунн М, Энрих К, Санчес-Мадрид Ф, Вивес Х, Лосано Ф (2003). «Аксессуарные молекулы CD5 и CD6 связываются на мембране лимфоидных Т-клеток» . Ж. Биол. Хим . 278 (10): 8564–71. дои : 10.1074/jbc.M209591200 . ПМИД 12473675 .
Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М., Ле Наур Ф., Бричори Ф., Чжан Дж.Х., Чжао Р., Пуравс Э., Тра Дж., Майкл К.В., Мисек Д.Е., Ханаш С.М. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток выявило множество белков с функцией шаперона» . Ж. Биол. Хим . 278 (9): 7607–16. дои : 10.1074/jbc.M210455200 . ПМИД 12493773 .
Гимферрер И., Ибаньес А., Фарнос М., Сарриас М.Р., Фенутриа Р., Роселло С., Циммерманн П., Давид Г., Вивес Х., Серра-Пажес С., Лосано Ф. (2005). «Рецептор CD6 лимфоцитов взаимодействует с синтенином-1, каркасным белком, содержащим домены PDZ» . Дж. Иммунол . 175 (3): 1406–14. дои : 10.4049/jimmunol.175.3.1406 . ПМИД 16034076 .
Като Ю, Танака Ю, Хаяси М, Окава К, Минато Н (2006). «Участие CD166 в активации гамма-дельта-Т-клеток человека опухолевыми клетками, сенсибилизированными непептидными антигенами» . Дж. Иммунол . 177 (2): 877–84. дои : 10.4049/jimmunol.177.2.877 . ПМИД 16818742 .
Ибаньес А., Сарриас М.Р., Фарнос М., Гимферрер И., Серра-Пажес С., Вивес Х., Лосано Ф. (2006). «Активация пути митоген-активируемой протеинкиназы поверхностным рецептором лимфоцитов CD6» . Дж. Иммунол . 177 (2): 1152–9. дои : 10.4049/jimmunol.177.2.1152 . ПМИД 16818773 .
Хасан Нью-Джерси, Симмондс С.Дж., Кларксон Н.Г., Ханрахан С., Пуклавец М.Дж., Бомб М., Барклай А.Н., Браун М.Х. (2006). «CD6 регулирует ответы Т-клеток посредством зависимого от активации рекрутирования положительного регулятора SLP-76» . Мол. Клетка. Биол . 26 (17): 6727–38. дои : 10.1128/MCB.00688-06 . ПМЦ 1592849 . ПМИД 16914752 .
Кастро М.А., Оливейра М.И., Нуньес Р.Дж., Фабр С., Барбоза Р., Пейшото А., Браун М.Х., Парнес Дж.Р., Висмут Г., Морейра А., Роча Б., Кармо А.М. (2007). «Внеклеточные изоформы CD6, генерируемые путем альтернативного сплайсинга, регулируют нацеливание CD6 на иммунологический синапс» . Дж. Иммунол . 178 (7): 4351–61. дои : 10.4049/jimmunol.178.7.4351 . ПМИД 17371992 .
Сарриас М.Р., Фарнос М., Мота Р., Санчес-Барберо Ф., Ибаньес А., Гимферрер И., Вера Х., Фенутриа Р., Казальс К., Йеламос Х., Лосано Ф. (2007). «CD6 связывается с молекулярными структурами, связанными с патогенами, и защищает от септического шока, вызванного ЛПС» . Учеб. Натл. Академический. наук. США . 104 (28): 11724–9. Бибкод : 2007PNAS..10411724S . дои : 10.1073/pnas.0702815104 . ЧВК 1913855 . ПМИД 17601777 .

Внешние ссылки

CD6+белок+человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека Расположение генома CD6 и страница сведений о гене CD6 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P30203 (антиген дифференцировки Т-клеток человека CD6) на PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000013725 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024670 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: Молекула CD6 CD6» .

[pmid7760007-6] Боуэн М.А., Патель Д.Д., Ли Х, Модрелл Б., Малако А.Р., Ван В.К., Марквардт Х., Нойбауэр М., Песандо Дж.М., Франк У (1995). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов (ALCAM), лиганда CD6» . Дж. Эксп. Мед . 181 (6): 2213–20. дои : 10.1084/jem.181.6.2213 . ПМК 2192054 . ПМИД 7760007 .

[pmid19525953-7] Де Джагер П.Л., Цзя Икс, Ван Дж., де Баккер П.И., Оттобони Л., Аггарвал Н.Т., Пиччио Л., Райчаудхури С., Тран Д., Обин С., Брискин Р., Романо С., Баранзини С.Е., Макколи Дж.Л., Перикак-Вэнс М.А., Хейнс Дж.Л., Гибсон Р.А., Наэглин Ю., Уитдехааг Б., Мэтьюз П.М., Каппос Л., Полман С., Макардл В.Л., Страхан Д.П., Эванс Д., Кросс А.Х., Дейли М.Дж., Компстон А., Сосер С.Дж., Вайнер Х.Л., Хаузер С.Л., Хафлер Д.А., Оксенберг-младший (2009). «Метаанализ сканирования генома и репликации идентифицирует CD6, IRF8 и TNFRSF1A как новые локусы предрасположенности к рассеянному склерозу» . Нат. Жене . 41 (7): 776–82. дои : 10.1038/ng.401 . ПМЦ 2757648 . ПМИД 19525953 .

[pmid21849685-8] Кофлер Д.М., Северсон К.А., Мусиссян Н., Де Ягер П.Л., Хафлер Д.А. (2011). «Аллель предрасположенности к рассеянному склерозу CD6 связан с изменениями в пролиферации CD4+ Т-клеток» . Дж. Иммунол . 187 (6): 3286–91. doi : 10.4049/jimmunol.1100626 . ПМИД 21849685 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Белки : кластеры дифференциации (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350