Рецептор 2, содержащий дискоидиновый домен

DDR2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2WUH, 2Z4F
Идентификаторы
Псевдонимы	DDR2 , MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, тирозинкиназа 2 рецептора дискоидинового домена, WRCN
Внешние идентификаторы	Опустить : 191311 ; МГИ : 1345277 ; Гомологен : 68505 ; Генные карты : DDR2 ; OMA : DDR2 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	162,787,405 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	169,938,331 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tail of epididymis; ; tendon of biceps brachii; ; vena cava; ; synovial joint; ; Achilles tendon; ; caput epididymis; ; cartilage tissue; ; tibia; ; buccal mucosa cell; ; pericardium;
	Top expressed in
	calvaria; ; ascending aorta; ; dermis; ; lumbar spinal ganglion; ; aortic valve; ; body of femur; ; fossa; ; ankle; ; iris; ; stroma of bone marrow;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein kinase activity; kinase activity; protein binding; transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; protein tyrosine kinase collagen receptor activity; protein tyrosine kinase activity; ATP binding; collagen binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; focal adhesion; integral component of plasma membrane; extracellular exosome; apical plasma membrane; plasma membrane; actin cytoskeleton; receptor complex;
Biological process	collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway; ossification; phosphorylation; collagen fibril organization; transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; regulation of bone mineralization; positive regulation of fibroblast proliferation; biomineral tissue development; positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; extracellular matrix organization; regulation of extracellular matrix disassembly; positive regulation of extracellular matrix disassembly; protein phosphorylation; cell adhesion; positive regulation of osteoblast differentiation; chondrocyte proliferation; positive regulation of cell population proliferation; peptidyl-tyrosine phosphorylation; endochondral bone growth; positive regulation of fibroblast migration; signal transduction; positive regulation of protein kinase activity; protein autophosphorylation; regulation of cell-matrix adhesion; cell-matrix adhesion; cell differentiation; regulation of extracellular matrix organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	4921
	18214
	ENSG00000162733
	ENSMUSG00000026674
	Q16832
	Q62371
	НМ_001014796 ; НМ_006182 ; НМ_001354982 ; НМ_001354983
	НМ_022563
	НП_001014796 ; НП_006173 ; НП_001341911 ; НП_001341912
	НП_072075
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рецептор 2, содержащий домен дискоидина , также известный как CD167b ( кластер дифференцировки 167b), представляет собой белок, который у человека кодируется геном DDR2 . ^{[ 5 ]} Рецептор 2, содержащий домен дискоидина, представляет собой рецептор тирозинкиназу (RTK).

Функция

РТК играют ключевую роль в коммуникации клеток с их микроокружением. Эти молекулы участвуют в регуляции роста, дифференцировки и метаболизма клеток. В нескольких случаях было показано, что биохимический механизм, с помощью которого RTK передают сигналы через мембрану, представляет собой индуцированную лигандом олигомеризацию рецептора и последующее внутриклеточное фосфорилирование . В случае DDR2 лигандом является коллаген , который связывается со своим внеклеточным дискоидиновым доменом. ^{[ 6 ]} Это аутофосфорилирование приводит к фосфорилированию цитозольных мишеней, а также к ассоциации с другими молекулами, которые участвуют в плейотропных эффектах передачи сигнала. DDR2 связана с рядом заболеваний, включая фиброз и рак . ^{[ 7 ]}

Структура

RTK имеют трехчастную структуру с внеклеточной, трансмембранной и цитоплазматической областями. Этот ген кодирует члена нового подкласса RTK и содержит отдельную внеклеточную область, включающую домен, подобный фактору VIII . ^{[ 5 ]}

Ген

Альтернативный сплайсинг 5'-UTR гена DDR2 приводит к образованию множества вариантов транскрипта, кодирующих один и тот же белок. ^{[ 5 ]}

Взаимодействия

Было показано, что DDR2 (ген) взаимодействует с SHC1. ^{[ 8 ]} и фосфорилировать Shp2 . ^{[ 9 ]} DDR2 также взаимодействует с интегрином α ₁ β ₁ и α ₂ β _1, способствуя их адгезии к коллагену. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162733 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026674 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: семейство рецепторов домена дискоидина DDR2, член 2» .
^ Фу Х.Л., Валиатан Р.Р., Аркрайт Р., Сохаил А., Михай С., Кумарасири М., Махасенан К.В., Мобашери С., Хуанг П., Агарвал Г., Фридман Р. (март 2013 г.). «Рецепторы дискоидинового домена: уникальные рецепторные тирозинкиназы в передаче сигналов, опосредованных коллагеном» . Ж. Биол. Хим . 288 (11): 7430–7. дои : 10.1074/jbc.R112.444158 . ПМЦ 3597784 . ПМИД 23335507 .
^ Лейтингер Б (май 2011 г.). «Трансмембранные коллагеновые рецепторы». Анну. Преподобный Cell Dev. Биол . 27 : 265–90. doi : 10.1146/annurev-cellbio-092910-154013 . ПМИД 21568710 .
^ Икеда К., Ван Л.Х., Торрес Р., Чжао Х., Оласо Э., Энг Ф.Дж., Лабрадор П., Кляйн Р., Ловетт Д., Янкопулос Г.Д., Фридман С.Л., Лин ХК (май 2002 г.). «Рецептор 2 дискоидинового домена взаимодействует с Src и Shc после его активации коллагеном I типа» . Ж. Биол. Хим . 277 (21): 19206–12. дои : 10.1074/jbc.M201078200 . ПМИД 11884411 .
^ Иваи Л.К., Пейн Л.С., Лучински М.Т., Чанг Ф., Сюй Х., Клинтон Р.В., Пол А., Эспозито Э.А., Гридли С., Лейтингер Б., Нэгл К.М., Хуан П.Х. (июль 2013 г.). «Фосфопротеомика сетей рецепторов коллагена обнаруживает фосфорилирование SHP-2 ниже DDR2 дикого типа и его мутантов рака легких» . Биохим. Дж . 454 (3): 501–13. дои : 10.1042/BJ20121750 . ПМЦ 3893797 . ПМИД 23822953 .
^ Сюй Х., Бихан Д., Чанг Ф., Хуан П.Х., Фарндейл Р.В., Лейтингер Б. (декабрь 2012 г.). «Рецепторы дискоидинового домена способствуют адгезии клеток к коллагену, опосредованной α1β1- и α2β1-интегринами, путем усиления активации интегрина» . ПЛОС ОДИН . 7 (12): е52209. Бибкод : 2012PLoSO...752209X . дои : 10.1371/journal.pone.0052209 . ПМЦ 3527415 . ПМИД 23284937 .

Дальнейшее чтение

Лапсис Н.М., Лэйфилд Р., Бейкер Э., Каллен Д.Ф., Сазерленд Г.Р. , Абединиа М., Никсон П.Ф., Мэттик Дж.С. (1992). «Хромосомное расположение гена транскетолазы человека». Цитогенет. Клеточная генетика . 61 (4): 274–5. дои : 10.1159/000133421 . ПМИД 1486804 .
Абединиа М., Лэйфилд Р., Джонс С.М., Никсон П.Ф., Мэттик Дж.С. (1992). «Нуклеотид и предсказанная аминокислотная последовательность клона кДНК, кодирующего часть транскетолазы человека». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 183 (3): 1159–66. дои : 10.1016/S0006-291X(05)80312-2 . ПМИД 1567394 .
Эдельхофф С., Свитсер Д.А., Дистече С.М. (1995). «Картирование гена тирозинкиназы рецептора NEP с хромосомой 6p21.3 человека и хромосомой 17C мыши». Геномика . 25 (1): 309–11. дои : 10.1016/0888-7543(95)80144-B . ПМИД 7774938 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Карн Т., Холтрих У., Браунингер А., Бёме Б., Вольф Г., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (1993). «Структура, экспрессия и хромосомное картирование ТКТ человека и мыши: новый подкласс рецепторных тирозинкиназ с доменом, подобным фактору VIII». Онкоген . 8 (12): 3433–40. ПМИД 8247548 .
Хиллиер Л.Д., Леннон Дж., Беккер М., Бональдо М.Ф., Кьяпелли Б., Чиссо С., Дитрих Н., Дюбук Т., Фавелло А., Гиш В., Хокинс М., Хультман М., Кукаба Т., Лейси М., Ле М., Ле Н., Мардис Э. , Мур Б, Моррис М, Парсонс Дж, Прейндж С, Рифкин Л, Ролфинг Т, Шелленберг К, Бенто Соареш М, Тан Ф, Тьерри-Мэг Дж., Треваскис Э., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра М. (1996). «Создание и анализ 280 000 меток экспрессируемых последовательностей человека» . ГеномРес . 6 (9): 807–28. дои : 10.1101/гр.6.9.807 . ПМИД 8889549 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Фогель В., Гиш Г.Д., Алвес Ф., Поусон Т. (1997). «Тирозинкиназы рецептора дискоидинового домена активируются коллагеном» . Мол. Клетка . 1 (1): 13–23. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80003-9 . ПМИД 9659899 .
Мохан Р.Р., Мохан Р.Р., Уилсон С.Е. (2001). «Рецептор дискоидинового домена (DDR) 1 и 2: коллаген-активируемые тирозинкиназные рецепторы в роговице». Эксп. Глазное разрешение . 72 (1): 87–92. дои : 10.1006/exer.2000.0932 . ПМИД 11133186 .
Икеда К., Ван Л.Х., Торрес Р., Чжао Х., Оласо Э., Энг Ф.Дж., Лабрадор П., Кляйн Р., Ловетт Д., Янкопулос Г.Д., Фридман С.Л., Лин ХК (2002). «Рецептор 2 дискоидинового домена взаимодействует с Src и Shc после его активации коллагеном I типа» . Ж. Биол. Хим . 277 (21): 19206–12. дои : 10.1074/jbc.M201078200 . ПМИД 11884411 .
Фарачи Э., Эк М., Герстмайер Б., Босио А., Фогель В.Ф. (2003). «Микроматрица, специфичная для внеклеточного матрикса, позволила идентифицировать гены-мишени, расположенные ниже рецепторов домена дискоидина». Матрица Биол . 22 (4): 373–81. дои : 10.1016/S0945-053X(03)00053-2 . ПМИД 12935821 .
Ферри Н., Каррагер Н.О., Рейнс Э.В. (2004). «Роль рецепторов дискоидинового домена 1 и 2 в ремоделировании коллагена, опосредованном гладкомышечными клетками человека: потенциальные последствия при атеросклерозе и лимфангиолейомиоматозе» . Являюсь. Дж. Патол . 164 (5): 1575–85. дои : 10.1016/S0002-9440(10)63716-9 . ПМЦ 1615659 . ПМИД 15111304 .
Лейтингер Б, Степлевски А, Фертала А (2004). «Период D2 коллагена II содержит специфический сайт связывания для рецептора домена дискоидина человека, DDR2». Дж. Мол. Биол . 344 (4): 993–1003. дои : 10.1016/j.jmb.2004.09.089 . ПМИД 15544808 .
Уолл С.Дж., Вернер Э., Верб З., ДеКлерк Я.А. (2005). «Рецептор 2 домена дискоидина опосредует остановку цикла опухолевых клеток, индуцированную фибриллярным коллагеном» . Ж. Биол. Хим . 280 (48): 40187–94. дои : 10.1074/jbc.M508226200 . ПМЦ 2768768 . ПМИД 16186104 .
Ян К., Ким Дж.Х., Ким Х.Дж., Пак И.С., Ким И.Ю., Ян Б.С. (2005). «Фосфорилирование тирозина 740 рецептора 2 домена дискоидина с помощью Src стимулирует внутримолекулярное аутофосфорилирование и образование сигнального комплекса Shc» . Ж. Биол. Хим . 280 (47): 39058–66. дои : 10.1074/jbc.M506921200 . ПМИД 16186108 .
Лейтингер Б., Кван А.П. (2006). «Рецептор домена дискоидина DDR2 является рецептором коллагена типа X». Матрица Биол . 25 (6): 355–64. дои : 10.1016/j.matbio.2006.05.006 . ПМИД 16806867 .
Чжан В., Дин Т., Чжан Дж., Су Дж., Ли Ф, Лю Икс, Ма В., Яо Л. (2006). «Экспрессия внеклеточного домена рецептора 2 домена дискоидина (DDR2) в пасторской ягодице и функциональный анализ в синовиальных фибробластах и клетках NIT3T3». Мол. Клетка. Биохим . 290 (1–2): 43–53. дои : 10.1007/s11010-006-9136-4 . ПМИД 16967187 . S2CID 19400659 .
Форд CE, Лау СК, Чжу CQ, Андерссон Т, Цао М.С., Фогель В.Ф. (2007). «Анализ экспрессии и мутаций рецепторов дискоидинового домена 1 и 2 при немелкоклеточной карциноме легкого» . Бр. Дж. Рак . 96 (5): 808–14. дои : 10.1038/sj.bjc.6603614 . ПМК 2360060 . ПМИД 17299390 .
Сюй Л., Серве Дж., Полур И., Ким Д., Ли П.Л., Чунг К., Ли Ю (2010). «Ослабление прогрессирования остеоартрита за счет уменьшения рецептора 2 домена дискоидина у мышей» . Ревмирующий артрит . 62 (9): 2736–44. дои : 10.1002/арт.27582 . ПМЦ 2946478 . ПМИД 20518074 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162733 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026674 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: семейство рецепторов домена дискоидина DDR2, член 2» .

[pmid23335507-6] Фу Х.Л., Валиатан Р.Р., Аркрайт Р., Сохаил А., Михай С., Кумарасири М., Махасенан К.В., Мобашери С., Хуанг П., Агарвал Г., Фридман Р. (март 2013 г.). «Рецепторы дискоидинового домена: уникальные рецепторные тирозинкиназы в передаче сигналов, опосредованных коллагеном» . Ж. Биол. Хим . 288 (11): 7430–7. дои : 10.1074/jbc.R112.444158 . ПМЦ 3597784 . ПМИД 23335507 .

[pmid21568710-7] Лейтингер Б (май 2011 г.). «Трансмембранные коллагеновые рецепторы». Анну. Преподобный Cell Dev. Биол . 27 : 265–90. doi : 10.1146/annurev-cellbio-092910-154013 . ПМИД 21568710 .

[pmid11884411-8] Икеда К., Ван Л.Х., Торрес Р., Чжао Х., Оласо Э., Энг Ф.Дж., Лабрадор П., Кляйн Р., Ловетт Д., Янкопулос Г.Д., Фридман С.Л., Лин ХК (май 2002 г.). «Рецептор 2 дискоидинового домена взаимодействует с Src и Shc после его активации коллагеном I типа» . Ж. Биол. Хим . 277 (21): 19206–12. дои : 10.1074/jbc.M201078200 . ПМИД 11884411 .

[pmid23822953-9] Иваи Л.К., Пейн Л.С., Лучински М.Т., Чанг Ф., Сюй Х., Клинтон Р.В., Пол А., Эспозито Э.А., Гридли С., Лейтингер Б., Нэгл К.М., Хуан П.Х. (июль 2013 г.). «Фосфопротеомика сетей рецепторов коллагена обнаруживает фосфорилирование SHP-2 ниже DDR2 дикого типа и его мутантов рака легких» . Биохим. Дж . 454 (3): 501–13. дои : 10.1042/BJ20121750 . ПМЦ 3893797 . ПМИД 23822953 .

[pmid23284937-10] Сюй Х., Бихан Д., Чанг Ф., Хуан П.Х., Фарндейл Р.В., Лейтингер Б. (декабрь 2012 г.). «Рецепторы дискоидинового домена способствуют адгезии клеток к коллагену, опосредованной α1β1- и α2β1-интегринами, путем усиления активации интегрина» . ПЛОС ОДИН . 7 (12): е52209. Бибкод : 2012PLoSO...752209X . дои : 10.1371/journal.pone.0052209 . ПМЦ 3527415 . ПМИД 23284937 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Белки : кластеры дифференциации (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)