Связан с рецепторной тирозинкиназой

БОГАТЫЙ
Идентификаторы
Псевдонимы	RYK , D3S3195, JTK5, JTK5A, RYK1, рецептор-подобная тирозинкиназа, рецептор-подобная тирозинкиназа
Внешние идентификаторы	Опустить : 600524 ; МГИ : 101766 ; Гомологен : 68287 ; GeneCards : RYK ; ОМА : РЫК - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	134,250,859 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	102,785,504 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; Achilles tendon; ; left ovary; ; saphenous vein; ; gastric mucosa; ; urethra; ; ventricular zone; ; germinal epithelium; ; right ovary; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; secondary oocyte; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; zygote; ; lip; ; muscle of thigh; ; epiblast; ; calvaria; ; molar;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; protein tyrosine kinase activity; transferase activity; transmembrane signaling receptor activity; kinase activity; Wnt-activated receptor activity; ATP binding; protein binding; frizzled binding; Wnt-protein binding; coreceptor activity involved in Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; receptor tyrosine kinase; transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; protein kinase activity;
Cellular component	cytoplasm; integral component of membrane; integral component of plasma membrane; membrane; plasma membrane; nucleus; receptor complex;
Biological process	positive regulation of MAPK cascade; corpus callosum development; signal transduction; canonical Wnt signaling pathway; non-canonical Wnt signaling pathway; neurogenesis; commissural neuron axon guidance; neuron projection development; protein phosphorylation; synapse assembly; chemorepulsion of dopaminergic neuron axon; neuron differentiation; cell proliferation in midbrain; phosphorylation; axonogenesis; axon guidance; Wnt signaling pathway involved in midbrain dopaminergic neuron differentiation; midbrain dopaminergic neuron differentiation; planar cell polarity pathway involved in axon guidance; Wnt signaling pathway; peptidyl-tyrosine phosphorylation; skeletal system morphogenesis; negative regulation of axon extension involved in axon guidance; negative chemotaxis; negative regulation of signal transduction; cell differentiation; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; nervous system development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	6259
	20187
	ENSG00000163785
	ENSMUSG00000032547
	P34925
	Q01887
	НМ_001005861 ; НМ_002958
	НМ_001042607 ; НМ_013649 ; НМ_001284258
	НП_001005861 ; НП_002949
	НП_001036072 ; НП_001271187 ; НП_038677
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Родственный рецептору тирозинкиназы ( RYK ) ген кодирует белок Ryk.

Белок, кодируемый этим геном, является атипичным членом семейства протеинтирозинкиназ рецепторов факторов роста, отличаясь от других членов рядом консервативных остатков в активационном и нуклеотидсвязывающем доменах. Этот генный продукт принадлежит к подсемейству, члены которого, по-видимому, не регулируются фосфорилированием в сегменте активации. Было высказано предположение, что опосредование биологической активности путем рекрутирования компетентного в передаче сигналов вспомогательного белка может происходить посредством еще не охарактеризованного механизма. Были идентифицированы два альтернативных варианта сплайсинга, кодирующие разные изоформы. ^{[ 5 ]}

История

Ген, кодирующий мышиный RYK, был впервые идентифицирован в 1992 году. ^{[ 6 ]} Впоследствии кДНК, кодирующая белок RYK, была выделена из следующих видов. ^{[ 7 ]}

Структура

Как и другие члены семейства рецепторных тирозинкиназ , RYK состоит из трех доменов: N-концевого внеклеточного лиганд - связывающего домена, трансмембранного охватывающего домена и C-концевого внутриклеточного домена. Однако, в отличие от других рецепторных тирозинкиназ, С-концевой домен RYK лишен обнаруживаемой киназной активности. ^{[ 7 ]}

Функция

RYK участвует в регуляции роста аксонов во время развития нервной системы . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163785 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032547 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Рецептор RYK, подобный тирозинкиназе [ Homo sapiens (человек)]» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США. 13 марта 2020 г. Проверено 2 апреля 2020 г.
^ Ховенс СМ, Stacker SA (1992). «RYK, молекула, родственная рецепторной тирозинкиназе, с необычными мотивами киназного домена» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (24): 11818–11822. Бибкод : 1992PNAS...8911818H . дои : 10.1073/pnas.89.24.11818 . ПМК 50648 . ПМИД 1334548 .
^ Jump up to: ^а ^б Хэлфорд М.М., Stacker SA (2001). «Откровения рецептора RYK». Биоэссе . 23 (1): 34–45. doi : 10.1002/1521-1878(200101)23:1<34::AID-BIES1005>3.0.CO;2-D . ПМИД 11135307 . S2CID 18535933 .
^ Холлис ЭР, Ишико Н, Ю Т, Лу CC, Хаймович А, Толентино К, Ричман А, Тьюри А, Ван Ш, Пессиан М, Джо Э, Колодкин А, Цзоу Ю (2016). «Рык контролирует переназначение моторной коры во время функционального восстановления после травмы спинного мозга» . Природная неврология . 19 (5): 697–705. дои : 10.1038/nn.4282 . ПМЦ 4847956 . ПМИД 27065364 .

Дальнейшее чтение

Партанен Дж., Мякеля Т.П., Алитало Р. и др. (1991). «Предположительные тирозинкиназы, экспрессируемые в клетках лейкемии человека K-562» . Натл. акад. наук. США . 87 (22): 8913–8917. дои : 10.1073/pnas.87.22.8913 . ПМК 55070 . ПМИД 2247464 .
Гоф Н.М., Ракар С., Ховенс С.М., Уилкс А. (1995). «Локализация двух мышиных генов, кодирующих белок RYK, родственный рецептору протеинтирозинкиназы». Мамм. Геном . 6 (4): 255–6. дои : 10.1007/BF00352411 . ПМИД 7613029 . S2CID 2577241 .
Ли С.Т., Странк К.М., Спритц Р.А. (1993). «Обзор мРНК протеинтирозинкиназы, экспрессируемых в нормальных меланоцитах человека». Онкоген . 8 (12): 3403–3410. ПМИД 8247543 .
Стакер С.А., Ховенс С.М., Виталий А. и др. (1993). «Молекулярное клонирование и хромосомная локализация человеческого гомолога рецептора, родственного тирозинкиназам (RYK)». Онкоген . 8 (5): 1347–1356. PMID 8386829 .
Таманьоне Л., Партанен Дж., Армстронг Э. и др. (1993). «Последовательность кДНК ryk человека предсказывает белок, содержащий два предполагаемых трансмембранных сегмента и каталитический домен тирозинкиназы». Онкоген . 8 (7): 2009–2014. ПМИД 8390040 .
Ван XC, Катсо Р., Батлер Р. и др. (1996). «H-RYK, необычная рецепторная киназа: выделение и анализ экспрессии при раке яичников» . Мол. Добавлять . 2 (2): 189–203. дои : 10.1007/BF03401616 . ПМК 2230112 . ПМИД 8726462 .
Кацо Р.М., Рассел Р.Б., Ганесан Т.С. (1999). «Функциональный анализ H-Ryk, атипичного члена семейства рецепторных тирозинкиназ» . Мол. Клетка. Биол . 19 (9): 6427–6440. дои : 10.1128/mcb.19.9.6427 . ПМЦ 84612 . ПМИД 10454588 .
Тривье Э., Ганесан Т.С. (2002). «RYK, каталитически неактивная рецепторная тирозинкиназа, связывается с EphB2 и EphB3, но не взаимодействует с AF-6» . Ж. Биол. Хим . 277 (25): 23037–43. дои : 10.1074/jbc.M202486200 . ПМИД 11956217 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Лу В., Ямамото В., Ортега Б., Балтимор Д. (2004). «Ryk у млекопитающих является корецептором Wnt, необходимым для стимуляции роста нейритов» . Клетка . 119 (1): 97–108. дои : 10.1016/j.cell.2004.09.019 . ПМИД 15454084 . S2CID 18567677 .
Ватанабэ А., Акита С., Тин НТ и др. (2006). «Мутация в RYK является генетическим фактором несиндромальной расщелины губы и неба». Краниофакальная волчья пасть. Дж . 43 (3): 310–6. дои : 10.1597/04-145.1 . ПМИД 16681403 . S2CID 23152169 .
Шафрански К., Шиндлер С., Таудиен С. и др. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: динуклеотиды TG функционируют как альтернативные 3'-сайты сплайсинга в U2-зависимых интронах» . Геномная биология . 8 (8): 154 р. дои : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . ПМК 2374985 . ПМИД 17672918 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163785 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032547 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Рецептор RYK, подобный тирозинкиназе [ Homo sapiens (человек)]» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США. 13 марта 2020 г. Проверено 2 апреля 2020 г.

[hovens-6] Ховенс СМ, Stacker SA (1992). «RYK, молекула, родственная рецепторной тирозинкиназе, с необычными мотивами киназного домена» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (24): 11818–11822. Бибкод : 1992PNAS...8911818H . дои : 10.1073/pnas.89.24.11818 . ПМК 50648 . ПМИД 1334548 .

[halford-7] Jump up to: ^а ^б Хэлфорд М.М., Stacker SA (2001). «Откровения рецептора RYK». Биоэссе . 23 (1): 34–45. doi : 10.1002/1521-1878(200101)23:1<34::AID-BIES1005>3.0.CO;2-D . ПМИД 11135307 . S2CID 18535933 .

[8] Холлис ЭР, Ишико Н, Ю Т, Лу CC, Хаймович А, Толентино К, Ричман А, Тьюри А, Ван Ш, Пессиан М, Джо Э, Колодкин А, Цзоу Ю (2016). «Рык контролирует переназначение моторной коры во время функционального восстановления после травмы спинного мозга» . Природная неврология . 19 (5): 697–705. дои : 10.1038/nn.4282 . ПМЦ 4847956 . ПМИД 27065364 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)