ЕПХБ3

ЕПХБ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3P1I, 3ZFY
Идентификаторы
Псевдонимы	EPHB3 , ETK2, HEK2, TYRO6, рецептор EPH B3, EK2
Внешние идентификаторы	Опустить : 601839 ; МГИ : 104770 ; Гомологен : 20938 ; GeneCards : EPHB3 ; OMA : EPHB3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	184,582,408 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	21,042,055 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; skin of leg; ; skin of abdomen; ; gingival epithelium; ; parotid gland; ; mucosa of transverse colon; ; periodontal fiber; ; skin of arm; ; hair follicle; ; rectum;
	Top expressed in
	saccule; ; otic placode; ; otic vesicle; ; lip; ; tongue; ; corneal stroma; ; molar; ; skin of abdomen; ; esophagus; ; calvaria;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; protein kinase activity; kinase activity; ATP binding; transferase activity; ephrin receptor activity; axon guidance receptor activity; protein tyrosine kinase activity; receptor tyrosine kinase; transmembrane signaling receptor activity; transmembrane-ephrin receptor activity;
Cellular component	extracellular region; dendrite; integral component of membrane; cell projection; membrane; cytosol; plasma membrane; integral component of plasma membrane; cytoplasm; neuron projection; receptor complex;
Biological process	phosphorylation; peptidyl-tyrosine phosphorylation; nervous system development; multicellular organism development; regulation of cell-cell adhesion; protein phosphorylation; substrate adhesion-dependent cell spreading; transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; regulation of GTPase activity; protein autophosphorylation; angiogenesis; ephrin receptor signaling pathway; urogenital system development; axon guidance; axonal fasciculation; cell migration; central nervous system projection neuron axonogenesis; corpus callosum development; retinal ganglion cell axon guidance; thymus development; digestive tract morphogenesis; regulation of axonogenesis; positive regulation of synapse assembly; roof of mouth development; dendritic spine development; dendritic spine morphogenesis; negative regulation of signal transduction; cell differentiation; negative regulation of apoptotic process; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2049
	13845
	ENSG00000182580
	ENSMUSG00000005958
	P54753
	P54754
	НМ_004443
	НМ_010143
	НП_004434
	НП_034273
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Рецептор 3 эфрина типа B представляет собой белок , который у человека кодируется EPHB3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рецепторы эфрина и их лиганды, эфрины, опосредуют многочисленные процессы развития, особенно в нервной системе. В зависимости от структуры и взаимоотношений последовательностей эфрины делятся на класс эфрина-А (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые представляют собой трансмембранные белки. Семейство рецепторов Eph разделено на 2 группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-А и эфрина-В. Рецепторы эфрина составляют самую большую подгруппу семейства рецепторов тирозинкиназ (RTK). Белок, кодируемый этим геном, является рецептором членов семейства эфрина-В. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EPHB3 взаимодействует с MLLT4. ^{[ 7 ]} и активатор белка p21 RAS 1 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182580 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005958 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бёме Б., Холтрих У., Вольф Г., Люциус Х., Гжещик К.Х., Стребхардт К., Рубсамен-Вайгманн Х. (октябрь 1993 г.). «ПЦР-опосредованное обнаружение нового человеческого рецептора тирозинкиназы HEK 2». Онкоген . 8 (10): 2857–62. ПМИД 8397371 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: EPHB3 EPH-рецептор B3» .
^ Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбучи К., Холтрих У., Холланд С., Поусон Т., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие тирозинкиназы EphB3-родственного рецептора и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора» . Учеб. Натл. акад. наук. США 95 (17): 9779–84. Бибкод : 1998PNAS...95.9779H . дои : 10.1073/pnas.95.17.9779 . ПМК 21413 . ПМИД 9707552 .
^ Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Феллер С., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (июль 1998 г.). «Тирозин-614, основной сайт аутофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как сайт мультистыковки для взаимодействий, опосредованных SH2-доменом» . Онкоген . 17 (2): 255–60. дои : 10.1038/sj.onc.1201907 . ПМИД 9674711 .

Дальнейшее чтение

Фланаган Дж. Г., Вандерхаген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в развитии нервной системы» (PDF) . Анну. Преподобный Нейроски . 21 : 309–45. дои : 10.1146/annurev.neuro.21.1.309 . ПМИД 9530499 . S2CID 1278600 . Архивировано из оригинала (PDF) 21 февраля 2019 г.
Чжоу Р (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакол. Там . 77 (3): 151–81. дои : 10.1016/S0163-7258(97)00112-5 . ПМИД 9576626 .
Холдер Н., Кляйн Р. (1999). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Разработка . 126 (10): 2033–44. дои : 10.1242/dev.126.10.2033 . ПМИД 10207129 .
Уилкинсон Д.Г. (2000). «Эф-рецепторы и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Межд. Преподобный Цитол . Международный обзор цитологии. 196 : 177–244. дои : 10.1016/S0074-7696(00)96005-4 . ISBN 9780123646002 . ПМИД 10730216 .
Сюй Ц, Меллитцер Г, Уилкинсон Д.Г. (2001). «Роль рецепторов Eph и эфринов в формировании сегментного паттерна» . Филос. Пер. Р. Сок. Лонд. Б Биол. Наука . 355 (1399): 993–1002. дои : 10.1098/rstb.2000.0635 . ПМЦ 1692797 . ПМИД 11128993 .
Уилкинсон Д.Г. (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Нат. Преподобный Нейроски . 2 (3): 155–64. дои : 10.1038/35058515 . ПМИД 11256076 . S2CID 205014301 .
Бёме Б, ВанденБос Т, Серретти Д.П., Парк Л.С., Холтрих У., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (1996). «Адгезия клеток, опосредованная связыванием мембраносвязанного лиганда LERK-2 с EPH-связанным рецептором эмбриональной киназы 2 человека, способствует активности тирозинкиназы» . Ж. Биол. Хим . 271 (40): 24747–52. дои : 10.1074/jbc.271.40.24747 . ПМИД 8798744 .
Эфноменклатурный комитет (1997). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph» . Клетка . 90 (3): 403–4. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . ПМИД 9267020 . S2CID 26773768 .
Бергеманн А.Д., Чжан Л., Чан М.К., Брамбилла Р., Кляйн Р., Фланаган Дж.Г. (1998). «Эфрин-B3, лиганд рецептора EphB3, экспрессируемый на средней линии развивающейся нервной трубки» . Онкоген . 16 (4): 471–80. дои : 10.1038/sj.onc.1201557 . ПМИД 9484836 .
Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Феллер С., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (1998). «Тирозин-614, основной сайт аутофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как сайт мультистыковки для взаимодействий, опосредованных SH2-доменом» . Онкоген . 17 (2): 255–60. дои : 10.1038/sj.onc.1201907 . ПМИД 9674711 .
Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбучи К., Холтрих У., Холланд С., Поусон Т., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (1998). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие тирозинкиназы EphB3-родственного рецептора и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (17): 9779–84. Бибкод : 1998PNAS...95.9779H . дои : 10.1073/pnas.95.17.9779 . ПМК 21413 . ПМИД 9707552 .
Чоссек Т., Моншау Б., Кремозер С., Лёшингер Дж., Ланг С., Мюллер Б.К., Бонхёффер Ф., Дрешер У. (1998). «Взаимодействие рецептора Eph с лигандом необходимо для управления аксонами ганглиозных клеток сетчатки in vitro». Евро. Дж. Нейроски . 10 (5): 1574–80. дои : 10.1046/j.1460-9568.1998.00180.x . ПМИД 9751130 . S2CID 20470923 .
Адамс Р.Х., Уилкинсон Г.А., Вайс С., Диелла Ф., Гейл Н.В., Дойч Ю., Рисау В., Кляйн Р. (1999). «Роль лигандов ephrinB и рецепторов EphB в развитии сердечно-сосудистой системы: разграничение артериальных / венозных доменов, сосудистый морфогенез и прорастающий ангиогенез» . Генс Дев . 13 (3): 295–306. дои : 10.1101/gad.13.3.295 . ПМК 316426 . ПМИД 9990854 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P54753 (рецептор эфрина типа B 3) на PDBe-KB .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182580 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005958 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8397371-5] Бёме Б., Холтрих У., Вольф Г., Люциус Х., Гжещик К.Х., Стребхардт К., Рубсамен-Вайгманн Х. (октябрь 1993 г.). «ПЦР-опосредованное обнаружение нового человеческого рецептора тирозинкиназы HEK 2». Онкоген . 8 (10): 2857–62. ПМИД 8397371 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: EPHB3 EPH-рецептор B3» .

[pmid9707552-7] Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбучи К., Холтрих У., Холланд С., Поусон Т., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие тирозинкиназы EphB3-родственного рецептора и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора» . Учеб. Натл. акад. наук. США 95 (17): 9779–84. Бибкод : 1998PNAS...95.9779H . дои : 10.1073/pnas.95.17.9779 . ПМК 21413 . ПМИД 9707552 .

[pmid9674711-8] Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Феллер С., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (июль 1998 г.). «Тирозин-614, основной сайт аутофосфорилирования рецепторной тирозинкиназы HEK2, функционирует как сайт мультистыковки для взаимодействий, опосредованных SH2-доменом» . Онкоген . 17 (2): 255–60. дои : 10.1038/sj.onc.1201907 . ПМИД 9674711 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )