Protein-coding gene in the species Homo sapiens
Афадин — это белок , который у человека кодируется AFDN геном . [ 5 ]
Афадин представляет собой мишень Ras (см. HRAS; MIM 190020), которая регулирует межклеточные адгезии после активации Ras. Он слит с MLL (MIM 159555) при лейкозах, вызванных транслокациями t(6;11) (Taya et al., 1998). [предоставлено OMIM] [ 6 ]
Было показано, что афадин взаимодействует с:
ген BCR , [ 7 ] ЭПХБ3 , [ 8 ] рецептор F11 , [ 9 ] HRAS [ 10 ] [ 11 ] ЛМО2 , [ 12 ] ПВРЛ1 , [ 13 ] ПВРЛ3 , [ 14 ] [ 15 ] Профиль 1 , [ 10 ] РАП1А , [ 10 ] РАП1ГАП , [ 16 ] СОРБЫ1 , [ 17 ] ССХ2ИП , [ 18 ] Белок плотного соединения 1 , [ 11 ] USP9X . [ 19 ] [ 20 ]
^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130396 – Ensembl , май 2017 г. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068036 – Ensembl , май 2017 г. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . ^ Прасад Р., Гу Й., Алдер Х., Накамура Т., Канаани О., Сайто Х., Хюбнер К., Гейл Р.П., Ноуэлл П.С., Курияма К. (декабрь 1993 г.). «Клонирование партнера по слиянию ALL-1, гена AF-6, участвующего в острых миелоидных лейкозах, с транслокацией хромосомы t (6;11)». Исследования рака . 53 (23): 5624–8. ПМИД 8242616 . ^ «Ген Энтреза: MLLT4 миелоидный/лимфоидный лейкоз или лейкоз смешанного происхождения (гомолог триторакса, Drosophila); транслоцирован в, 4» . ^ Радзивилл Г., Эрдманн Р.А., Маргелиш У., Мёллинг К. (июль 2003 г.). «Киназа Bcr подавляет передачу сигналов Ras путем фосфорилирования AF-6 и связывания с его доменом PDZ» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (13): 4663–72. дои : 10.1128/mcb.23.13.4663-4672.2003 . ПМК 164848 ПМИД 12808105 . ^ Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбучи К., Холтрих У., Холланд С., Поусон Т., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие тирозинкиназы EphB3 рецептора, связанного с Eph, и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 9779–84. Бибкод : 1998PNAS...95.9779H . дои : 10.1073/pnas.95.17.9779 ПМК 21413 ПМИД 9707552 . ^ Эбнет К., Шульц К.У., Мейер Цу Брикведде М.К., Пендл Г.Г., Вествебер Д. (сентябрь 2000 г.). «Молекула соединительной адгезии взаимодействует с белками AF-6 и ZO-1, содержащими домен PDZ» . Журнал биологической химии . 275 (36): 27979–88. дои : 10.1074/jbc.M002363200 ПМИД 10856295 . ^ Перейти обратно: а б с Беттнер Б., Говек Э.Э., Кросс Дж., Ван Алст Л. (август 2000 г.). «Соединительный мультидоменный белок AF-6 является партнером по связыванию Rap1A GTPase и связывается с актиновым регулятором цитоскелета профилином» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (16): 9064–9. Бибкод : 2000PNAS...97.9064B . дои : 10.1073/pnas.97.16.9064 ПМК 16822 ПМИД 10922060 . ^ Перейти обратно: а б Ямамото Т., Харада Н., Кавано Ю., Тая С., Кайбути К. (май 1999 г.). «Взаимодействие AF-6 in vivo с активированным Ras и ZO-1» Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 259 (1): 103–7. дои : 10.1006/bbrc.1999.0731 . ПМИД 10334923 . ^ Беге-Мюллер В., Ансьо С., Лойц А. (июнь 2002 г.). «Белок Lmo2 домена LIM связывается с AF6, партнером по транслокации онкогена MLL». Письма ФЭБС . 521 (1–3): 36–8. дои : 10.1016/s0014-5793(02)02814-4 . ПМИД 12067721 . S2CID 29461336 . ^ Такахаси К., Наканиси Х., Мияхара М., Мандай К., Сато К., Сато А., Нисиока Х., Аоки Дж., Номото А., Мидзогучи А., Такаи Ю. (май 1999 г.). «Нектин / PRR: иммуноглобулинподобная молекула клеточной адгезии, рекрутируемая в адгезионные соединения на основе кадгерина посредством взаимодействия с афадином, белком, содержащим домен PDZ» . Журнал клеточной биологии . 145 (3): 539–49. дои : 10.1083/jcb.145.3.539 . ПМК 2185068 ПМИД 10225955 . ^ Сато-Хорикава К., Наканиси Х., Такахаши К., Мияхара М., Нисимура М., Татибана К., Мидзогучи А., Такаи Ю. (апрель 2000 г.). «Нектин-3, новый член иммуноглобулиноподобных молекул клеточной адгезии, который проявляет гомофильную и гетерофильную активность межклеточной адгезии» . Журнал биологической химии . 275 (14): 10291–9. дои : 10.1074/jbc.275.14.10291 ПМИД 10744716 . ^ Реймонд Н., Борг Дж.П., Лекок Э., Аделаида Дж., Кампаделли-Фьюме Дж., Дюбрей П., Лопес М. (сентябрь 2000 г.). «Человеческий нектин3/PRR3: новый член семейства PVR/PRR/нектина, который взаимодействует с афадином». Джин . 255 (2): 347–55. дои : 10.1016/s0378-1119(00)00316-4 . ПМИД 11024295 . ^ Су Л, Хаттори М, Морияма М, Мурата Н, Харазаки М, Кайбути К, Минато Н (апрель 2003 г.). «AF-6 контролирует опосредованную интегрином клеточную адгезию, регулируя активацию Rap1 посредством специфического привлечения Rap1GTP и SPA-1» . Журнал биологической химии . 278 (17): 15232–8. дои : 10.1074/jbc.M211888200 hdl : 2433/148462 ПМИД 12590145 . ^ Мандай К., Наканиси Х., Сато А., Такахаши К., Сато К., Нисиока Х., Мидзогучи А., Такаи Ю. (март 1999 г.). «Понсин / SH3P12: l-афадин- и винкулин-связывающий белок, локализованный в адгезионных соединениях клетка-клетка и клетка-матрикс» . Журнал клеточной биологии . 144 (5): 1001–17. дои : 10.1083/jcb.144.5.1001 . ПМК 2148189 ПМИД 10085297 . ^ Асада М., Ирие К., Моримото К., Ямада А., Икеда В., Такеучи М., Такаи Ю. (февраль 2003 г.). «ADIP, новый белок, связывающий афадин и альфа-актинин, локализованный в межклеточных соединениях» . Журнал биологической химии . 278 (6): 4103–11. дои : 10.1074/jbc.M209832200 ПМИД 12446711 . ^ Тая С., Ямамото Т., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Кайбути К. (декабрь 1999 г.). «Дубиквитинирующий фермент Fam взаимодействует с бета-катенином и стабилизирует его» . Гены в клетки . 4 (12): 757–67. дои : 10.1046/j.1365-2443.1999.00297.x ПМИД 10620020 . S2CID 85747886 . ^ Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано Ю., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Мэттик Дж.С., Кайбути К. (август 1998 г.). «Цель Ras AF-6 является субстратом известного деубиквитинирующего фермента» . Журнал клеточной биологии . 142 (4): 1053–62. дои : 10.1083/jcb.142.4.1053 . ПМК 2132865 ПМИД 9722616 .
Такай Ю., Наканиси Х. (январь 2003 г.). «Нектин и афадин: новые организаторы межклеточных соединений». Журнал клеточной науки . 116 (Часть 1): 17–27. CiteSeerX 10.1.1.321.6596 дои : 10.1242/jcs.00167 . ПМИД 12456712 . S2CID 6465469 . Саха В., Лиллингтон Д.М., Шеллинг А.Н., Чаплин Т., Яспо М.Л., Ганесан Т.С., Янг Б.Д. (ноябрь 1995 г.). «Ген AF6 на участке хромосомы 6q27 картируется дистальнее минимальной области делеции при эпителиальном раке яичников». Гены, хромосомы и рак . 14 (3): 220–2. дои : 10.1002/gcc.2870140311 . ПМИД 8589040 . S2CID 23752846 . Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 ПМИД 8889548 . Мандай К., Наканиси Х., Сато А., Обаиси Х., Вада М., Нисиока Х., Ито М., Мидзогучи А., Аоки Т., Фудзимото Т., Мацуда Ю., Цукита С., Такай Ю. (октябрь 1997 г.). «Афадин: новый белок, связывающий актиновые филаменты, с одним доменом PDZ, локализованным в месте соединения адгезивов клеток на основе кадгерина» . Журнал клеточной биологии . 139 (2): 517–28. дои : 10.1083/jcb.139.2.517 . ПМК 2139800 ПМИД 9334353 . Джо Т., Ямамото К., Кагами Ю., Какуда Х., Сато Т., Ямамото Т., Такахаши Т., Уэда Р., Кайбути К., Сето М. (октябрь 1997 г.). «Химерные продукты MLL с Ras-связывающим цитоплазматическим белком AF6, участвующим в лейкозе t(6;11) (q27;q23), локализуются в ядре» . Онкоген . 15 (14): 1681–7. дои : 10.1038/sj.onc.1201332 ПМИД 9349501 . Сайто С., Мацусима М., Сирахама С., Минагучи Т., Канамори Ю., Минами М., Накамура Ю. (апрель 1998 г.). «Полиморфизмы ДНК полной геномной структуры и альтернативный сплайсинг гена AF-6 человека» . Исследование ДНК . 5 (2): 115–20. дои : 10.1093/dnares/5.2.115 ПМИД 9679199 . Хок Б., Бёме Б., Карн Т., Ямамото Т., Кайбучи К., Холтрих У., Холланд С., Поусон Т., Рубсамен-Вайгманн Х., Стребхардт К. (август 1998 г.). «Опосредованное PDZ-доменом взаимодействие тирозинкиназы EphB3 рецептора, связанного с Eph, и ras-связывающего белка AF6 зависит от киназной активности рецептора» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 9779–84. Бибкод : 1998PNAS...95.9779H . дои : 10.1073/pnas.95.17.9779 ПМК 21413 ПМИД 9707552 . Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано Ю., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Мэттик Дж.С., Кайбути К. (август 1998 г.). «Цель Ras AF-6 является субстратом известного деубиквитинирующего фермента» . Журнал клеточной биологии . 142 (4): 1053–62. дои : 10.1083/jcb.142.4.1053 . ПМК 2132865 ПМИД 9722616 . Мандай К., Наканиси Х., Сато А., Такахаши К., Сато К., Нисиока Х., Мидзогучи А., Такаи Ю. (март 1999 г.). «Понсин / SH3P12: l-афадин- и винкулин-связывающий белок, локализованный в адгезионных соединениях клетка-клетка и клетка-матрикс» . Журнал клеточной биологии . 144 (5): 1001–17. дои : 10.1083/jcb.144.5.1001 . ПМК 2148189 ПМИД 10085297 . Линнеманн Т., Гейер М., Джайтнер Б.К., Блок C, Кальбитцер Х.Р., Виттингхофер А., Херрманн С. (май 1999 г.). «Термодинамическая и кинетическая характеристика взаимодействия между Ras-связывающим доменом AF6 и членами подсемейства Ras» . Журнал биологической химии . 274 (19): 13556–62. дои : 10.1074/jbc.274.19.13556 ПМИД 10224125 . Такахаси К., Наканиси Х., Мияхара М., Мандай К., Сато К., Сато А., Нисиока Х., Аоки Дж., Номото А., Мидзогучи А., Такаи Ю. (май 1999 г.). «Нектин / PRR: иммуноглобулинподобная молекула клеточной адгезии, рекрутируемая в адгезионные соединения на основе кадгерина посредством взаимодействия с афадином, белком, содержащим домен PDZ» . Журнал клеточной биологии . 145 (3): 539–49. дои : 10.1083/jcb.145.3.539 . ПМК 2185068 ПМИД 10225955 . Ямамото Т., Харада Н., Кавано Ю., Тая С., Кайбути К. (май 1999 г.). «Взаимодействие AF-6 in vivo с активированным Ras и ZO-1» Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 259 (1): 103–7. дои : 10.1006/bbrc.1999.0731 . ПМИД 10334923 . Минагути Т., Мацусима М., Сайто С., Канамори Ю., Сирахама С., Окамото С., Минами М., Такетани Ю., Накамура Ю. (апрель 1999 г.). «Полная последовательность ДНК и характеристика области размером 330 т.п.н., богатой VNTR, на хромосоме 6q27, которая обычно удаляется при раке яичников» . Исследование ДНК . 6 (2): 131–6. дои : 10.1093/dnares/6.2.131 ПМИД 10382971 . Куиллиам Л.А., Кастро А.Ф., Роджерс-Грэм К.С., Мартин CB, Дер CJ, Би С (август 1999 г.). «M-Ras/R-Ras3, трансформирующий белок ras, регулируемый Sos1, GRF1 и белком, активирующим Ras GTPase p120, взаимодействует с предполагаемым эффектором Ras AF6» . Журнал биологической химии . 274 (34): 23850–7. дои : 10.1074/jbc.274.34.23850 ПМИД 10446149 . Кавабе Х., Хата Ю., Такеучи М., Иде Н., Мидзогучи А., Такаи Ю. (октябрь 1999 г.). «nArgBP2, новый нейронный член семейства понсин/ArgBP2/винексин, который взаимодействует с ассоциированным с синапсом белком 90/белком, ассоциированным с постсинаптической плотностью-95 (SAPAP)» . Журнал биологической химии . 274 (43): 30914–8. дои : 10.1074/jbc.274.43.30914 ПМИД 10521485 . Шао Х, Кадоно-Окуда К, Финлин Б.С., Андрес Д.А. (ноябрь 1999 г.). «Биохимическая характеристика Ras-связанных GTPases Rit и Rin». Архив биохимии и биофизики . 371 (2): 207–19. дои : 10.1006/abbi.1999.1448 . ПМИД 10545207 . Асакура Т., Наканиси Х., Сакисака Т., Такахаши К., Мандай К., Нишимура М., Сасаки Т., Такаи Ю. (октябрь 1999 г.). «Сходное и дифференциальное поведение между системами нектин-афадин-понсин и кадгерин-катенин во время формирования и нарушения выравнивания поляризованных соединений в эпителиальных клетках» . Гены в клетки . 4 (10): 573–81. дои : 10.1046/j.1365-2443.1999.00283.x ПМИД 10583506 . S2CID 24023429 . Мияхара М., Наканиси Х., Такахаши К., Сато-Хорикава К., Татибана К., Такаи Ю. (январь 2000 г.). «Взаимодействие нектина с афадином необходимо для его кластеризации в местах межклеточного контакта, но не для его цис-димеризации или транс-взаимодействия» . Журнал биологической химии . 275 (1): 613–8. дои : 10.1074/jbc.275.1.613 ПМИД 10617658 . Бушар М.Дж., Донг И., Макдермотт Б.М., Лам Д.Х., Браун К.Р., Шелански М., Бельве А.Р., Раканьелло В.Р. (апрель 2000 г.). «Дефекты морфологии ядра и цитоскелета, а также локализации митохондрий в сперматозоидах мышей, лишенных нектина-2, компонента межклеточных адгезионных соединений» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (8): 2865–73. дои : 10.1128/MCB.20.8.2865-2873.2000 . ПМЦ 85510 ПМИД 10733589 .
показывать галерея PDB
1t2m : Solution Structure Of The Pdz Domain Of AF-6
1wln : Solution structure of the FHA domain of mouse Afadin 6
1wxa : Solution Structure of Ras-binding Domain in Mouse AF-6 Protein
1xz9 : Structure of AF-6 PDZ domain
2ain : Solution structure of the AF-6 PDZ domain complexed with the C-terminal peptide from the Bcr protein
2exg : Making Protein-Protein Interactions Drugable: Discovery of Low-Molecular-Weight Ligands for the AF6 PDZ Domain
