USP9X
USP9X | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | USP9X , DFFRX, FAF, FAM, MRX99, MRXS99F, убиквитинспецифическая пептидаза 9, Х-связанная, убиквитинспецифическая пептидаза 9, Хсвязанная, XLID99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 300072 ; МГИ : 894681 ; Гомологен : 3418 ; Генные карты : USP9X ; OMA : USP9X — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Вероятная убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза FAF-X представляет собой фермент , который у человека кодируется USP9X геном . [ 5 ] [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]Этот ген является членом семейства пептидаз C19 и кодирует белок, аналогичный убиквитин -специфичным протеазам. Хотя этот ген расположен на Х-хромосоме, он избегает Х-инактивации .
Истощение USP9X в двухклеточных эмбрионах мышей останавливает развитие бластоцист и приводит к замедлению скорости расщепления бластомеров, нарушению клеточной адгезии и потере полярности клеток. Также предполагается, что USP9X, вероятно, влияет на процессы развития через сигнальные пути Notch , Wnt , EGF и mTOR . USP9X был признан в исследованиях стволовых клеток мыши и человека, включая эмбриональные, нервные и гемопоэтические стволовые клетки . [ 7 ] Высокая экспрессия сохраняется в недифференцированных клетках-предшественниках и стволовых клетках и снижается по мере продолжения дифференцировки. USP9X — это ген, кодирующий белок, который либо прямо посредством мутаций, либо косвенно участвует в ряде нарушений развития нервной системы и нейродегенеративных расстройств. Три мутации связаны с Х-сцепленной умственной отсталостью из-за нарушения роста нейронов и миграции клеток. Нейродегенеративные расстройства , такие как болезнь Альцгеймера, Паркинсона и Хантингтона, также связаны с USP9X. В частности, USP9X участвует в регуляции фосфорилирования и экспрессии ассоциированного с микротуле белка тау , который образует патологические агрегаты при болезни Альцгеймера и других таупатиях . [ 8 ] Ученые создали нокаутную модель, в которой они изолировали нейроны гиппокампа от мышей-самцов с нокаутом USP9X, что показало уменьшение длины аксонов и их разветвленности на 43% по сравнению с диким типом . [ 9 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что USP9X взаимодействует с:
Синдром USP9X
[ редактировать ]варианты гена USP9X Было обнаружено, что вызывают синдром USP9X, связанный с развитием нервной системы , как у мужчин, так и у женщин. USP9X сильно эволюционно консервативен у людей и нетерпим к вариациям. Это связано с важной ролью фермента USP9X, который обращает вспять убиквитилирование белков, тем самым уменьшая ферментативную деградацию и увеличивая долговечность этих белков. [ 15 ] Находясь на Х-хромосоме, синдром USP9X проявляется у женщин по-разному, чем у мужчин. У женщин потеря функциональных вариаций в одной копии гена приводит к гаплонедостаточности . Это связано с тем, что USP9X избегает обычно защитного процесса X-инактивации . В результате носителей синдром проявляется даже у женщин- .
Варианты, обнаруженные у женщин с синдромом USP9X, включают полную или частичную делецию одной копии гена USP9X , а также ошибочные мутации или небольшие делеционные мутации в рамке считывания. [ 15 ] Симптомы у женщин включают умственную отсталость , дисморфию лица и нарушение речи . Менее распространенные симптомы включают низкий рост , сколиоз , полидактилию и изменения зубного ряда . [ 16 ] Женщины имеют более широкий спектр симптомов, чем мужчины, вероятно, из-за более широкого разнообразия вариантов гена USP9X по сравнению с мужчинами. Другие симптомы, иногда встречающиеся у женщин, но редко или никогда не встречающиеся у мужчин, включают дисплазию тазобедренного сустава , дисморфию сердца, проблемы со слухом и аномальную пигментацию кожи. [ 15 ]
Варианты USP9X , наблюдаемые у выживших самцов, вызывают потерю функции только процессов, специфичных для мозга, поскольку полная потеря функции этого гена фатальна на эмбриональной стадии. Мужчины являются гемизиготными по этому гену, поскольку обладают только одной Х-хромосомой. Симптомы, наблюдаемые у пораженных мужчин, включают умственную отсталость, проблемы с языком, речью, поведением и зрением, а также дисморфию лица. Специфические аномалии головного мозга включают нарушения белого вещества , тонкое мозолистое тело и расширение желудочков . [ 17 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000124486 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031010 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Джонс М.Х., Ферлонг Р.А., Буркин Х., Чалмерс И.Дж., Браун Г.М., Ходжа О., Аффара Н.А. (1996). «Жировые фасетки гена развития дрозофилы имеют человеческий гомолог в Xp11.4, который избегает X-инактивации и имеет родственные последовательности на Yq11.2» . Хм. Мол. Жене . 5 (11): 1695–701. дои : 10.1093/hmg/5.11.1695 . ПМИД 8922996 .
- ^ «Ген Энтреза: USP9X убиквитинспецифическая пептидаза 9, Х-связанная» .
- ^ Муртаза М., Джолли Л.А., Геч Дж., Вуд С.А. (01 января 2015 г.). «Роковая FAM: USP9X в развитии и болезни» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 72 (11): 2075–2089. дои : 10.1007/s00018-015-1851-0 . ISSN 1420-682X . ПМЦ 4427618 . ПМИД 25672900 .
- ^ Кёглсбергер С., Кордеро-Мальдонадо МЛ, Энтони П., Форстер Дж.И., Гарсия П., Буттини М., Кроуфорд А., Глааб Е (01 декабря 2016 г.). «Пол-специфическая экспрессия убиквитин-специфической пептидазы 9 модулирует экспрессию тау и фосфорилирование: возможные последствия тауопатий» . Молекулярная нейробиология . 54 (10): 7979–7993. дои : 10.1007/s12035-016-0299-z . ПМЦ 5684262 . ПМИД 27878758 .
- ^ «Запись OMIM - * 300072 - УБИКВИТИН-СПЕЦИФИЧЕСКАЯ ПРОТЕАЗА 9, СВЯЗАННАЯ с Х; USP9X» . www.omim.org . Проверено 12 апреля 2016 г.
- ^ Перейти обратно: а б Тая С., Ямамото Т., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Кайбути К. (декабрь 1999 г.). «Дубиквитинирующий фермент Fam взаимодействует с бета-катенином и стабилизирует его» . Генные клетки . 4 (12): 757–67. дои : 10.1046/j.1365-2443.1999.00297.x . ПМИД 10620020 . S2CID 85747886 .
- ^ Перейти обратно: а б Аль-Хаким А.К., Загорска А., Чепмен Л., Дик М., Пегги М., Алесси Д.Р. (апрель 2008 г.). «Контроль киназ, связанных с AMPK, с помощью USP9X и атипичных полиубиквитиновых цепей, связанных с Lys (29) / Lys (33)» (PDF) . Биохим. Дж . 411 (2): 249–60. дои : 10.1042/BJ20080067 . ПМИД 18254724 . S2CID 13038944 .
- ^ Тая С., Ямамото Т., Кано К., Кавано Ю., Ивамацу А., Цучия Т., Танака К., Канаи-Адзума М., Вуд С.А., Мэттик Дж.С., Кайбути К. (август 1998 г.). «Цель Ras AF-6 является субстратом известного деубиквитинирующего фермента» . Дж. Клеточная Биол . 142 (4): 1053–62. дои : 10.1083/jcb.142.4.1053 . ПМК 2132865 . ПМИД 9722616 .
- ^ Ван С., Коллипара Р.К., Шривастава Н., Ли Р., Равиндранатан П., Эрнандес Э., Фриман Э., Хамфрис К.Г., Капур П., Лотан Ю., Фазли Л., Глив М.Э., Плимат С.Р., Радж Г.В., Се Дж.Т., Киттлер Р. (2014) . «Аблация онкогенного фактора транскрипции ERG путем ингибирования деубиквитиназы при раке простаты» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 111 (11): 4251–6. Бибкод : 2014PNAS..111.4251W . дои : 10.1073/pnas.1322198111 . ПМЦ 3964108 . ПМИД 24591637 .
- ^ Ли Х, Сун Н, Лю Л, Лю Х, Дин Х, Сун Х, Ян С, Шань Л, Чжоу Икс (31 марта 2017 г.). «USP9X регулирует дупликацию центросом и способствует канцерогенезу молочной железы» . Природные коммуникации . 8 : 14866. Бибкод : 2017NatCo...814866L . дои : 10.1038/ncomms14866 . ISSN 2041-1723 . ПМК 5380967 . ПМИД 28361952 .
- ^ Перейти обратно: а б с Джолли Л.А., Парнелл Э., Гарднер А.Э., Корбетт М.А., Перес-Хурадо Л.А., Шоу М., Леска Дж., Киган С., Шнайдер М.С., Гриффин Э., Майер Ф., Кисс С., Герен А., Кросби К., Розенбаум К. (2020–12 гг.) -09). «Вклад варианта Миссенс в женский синдром USP9X» . npj Геномная медицина . 5 (1): 53. дои : 10.1038/s41525-020-00162-9 . ISSN 2056-7944 . ПМЦ 7725775 . ПМИД 33298948 .
- ^ «USP9X» . Прожектор Саймонса . Проверено 22 февраля 2023 г.
- ^ Джонсон Б.В., Кумар Р., Оиси С., Александр С., Кашерман М., Вега М.С., Иванцевич А., Гарднер А., Доминго Д., Корбетт М., Парнелл Э., Юн С., О Т, Лайнс М., Лефрой Х (15 января 2020 г.) ). «Частичная потеря функции USP9X приводит к нарушениям психического развития и поведения у мужчин, связанным с передачей сигналов TGFβ» . Биологическая психиатрия . 87 (2): 100–112. doi : 10.1016/j.biopsych.2019.05.028 . ISSN 0006-3223 . ПМЦ 6925349 . ПМИД 31443933 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Д'Андреа А., Пеллман Д. (1998). «Дебиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Крит. Преподобный Биохим. Мол. Биол . 33 (5): 337–52. дои : 10.1080/10409239891204251 . ПМИД 9827704 .
- Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
- Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
- Диас Нето Э, Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста ФФ, Гольдман Г.Х., Карвалью А.Ф., Мацукума А., Бая Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонджинил К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (2000). «Секвенирование транскрипции человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. Академический. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
- Мюррей Р.З., Джолли Л.А., Вуд С.А. (2004). «Фермент, деубиквитилирующий FAM, локализуется во многих точках транспортировки белков в эпителии, где он связывается с E-кадгерином и бета-катенином» . Мол. Биол. Клетка . 15 (4): 1591–9. doi : 10.1091/mbc.E03-08-0630 . ПМК 379258 . ПМИД 14742711 .
- Баумистер Т , Баух А , Раффнер Х , Ангранд ПО , Бергамини Г , Кротон К , Круциат С , Эберхард Д , Гагнер Дж , Гиделли С , Хопф С , Хузе Б , Мангано Р , Мишон А.М. , Ширле М , Шлегль Дж , Шваб М , Стейн М.А. , Бауэр А. , Казари Дж. , Древес Дж. , Гэвин А.С. , Джексон Д.Б. , Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кастер Б., Суперти-Фурга Дж. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Нат. Клеточная Биол . 6 (2): 97–105. дои : 10.1038/ncb1086 . ПМИД 14743216 . S2CID 11683986 .
- Фу Г.К., Ван Дж.Т., Ян Дж., Ау-Янг Дж., Стув Л.Л. (2004). «Циркулярная быстрая амплификация концов кДНК для высокопроизводительного расширенного клонирования частичных генов». Геномика . 84 (1): 205–10. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . ПМИД 15203218 .
- Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа К.М., Полакевич Р.Д., Комб М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
- Аль-Хаким А.К., Йоранссон О., Дик М., Тот Р., Кэмпбелл Д.Г., Моррис Н.А., Прескотт А.Р., Алесси Д.Р. (2005). «14-3-3 сотрудничает с ЛКБ1 для регулирования деятельности и локализации QSK и SIK». Дж. Клеточная наука . 118 (Часть 23): 5661–73. дои : 10.1242/jcs.02670 . ПМИД 16306228 . S2CID 17404931 .
- Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р, Канда К, Ёкой Т, Кондо Х, Вагацума М, Муракава К, Исида С, Исибаши Т, Такахаси-Фудзи А, Танасе Т, Нагай К, Кикучи Х, Накаи К, Исогай Т, Сугано С (2006) / Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» Genome Res . 16 (1): 55–65. : 10.1101 gr.4039406 . PMID . . « 16344560 doi
- Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .
- Мушантаф Р., Азакир Б.А., Макферсон П.С., Миллард С.М., Вуд С.А., Анжер А (2006). «Убиквитинлигаза зуд аутоубиквитилируется in vivo и in vitro, но защищена от деградации за счет взаимодействия с деубиквитилирующим ферментом FAM/USP9X» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 281 (50): 38738–47. дои : 10.1074/jbc.M605959200 . ПМИД 17038327 .
- Олсен Й.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 .