ЖМО2

ЖМО2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2XJY, 2XJZ, 2YPA, 4KFZ
Идентификаторы
Псевдонимы	LMO2 , RBTN2, RBTNL1, RHOM2, TTG2, только домен LIM 2, LMO-2
Внешние идентификаторы	Опустить : 180385 ; МГИ : 102811 ; Гомологен : 4072 ; Генные карты : LMO2 ; ОМА : LMO2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	33,892,076 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	103,812,223 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	monocyte; ; tendon of biceps brachii; ; trabecular bone; ; urethra; ; endothelial cell; ; vena cava; ; inferior ganglion of vagus nerve; ; glutes; ; internal globus pallidus; ; synovial membrane;
	Top expressed in
	fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; blood; ; spleen; ; tibiofemoral joint; ; human fetus; ; external carotid artery; ; parotid gland; ; tail of embryo; ; granulocyte; ; bone marrow;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; bHLH transcription factor binding; E-box binding; protein binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; metal ion binding;
Cellular component	nucleus; transcription regulator complex; nucleoplasm;
Biological process	multicellular organism development; mRNA transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; cellular response to thyroid hormone stimulus; regulation of hematopoietic stem cell differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4005
	16909
	ENSG00000135363
	ENSMUSG00000032698
	P25791
	P25801
	НМ_001142315 ; НМ_001142316 ; НМ_005574
	НМ_001142335 ; НМ_001142336 ; НМ_001142337 ; НМ_008505
	НП_001135787 ; НП_001135788 ; НП_005565
	НП_001135807 ; НП_001135808 ; НП_001135809 ; НП_032531
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

LIM-домен 2 ( ромботин-подобный 1 ), также известный как LMO2 , RBTNL1 , RBTN2 , RHOM2 , LIM Domain Only Protein 2 , TTG2 и Т-клеточный транслокационный белок 2 , представляет собой белок , который у людей кодируется LMO2. геном . ^[5]

Функция

LMO2 кодирует богатый цистеином белок с двумя доменами LIM , который необходим для эритропоэза желточного мешка . ^[6] Белок LMO2 играет центральную и решающую роль в развитии кроветворения и является высококонсервативным.

Клиническое значение

Аберрантная экспрессия LMO2 является важной особенностью острого Т-клеточного лимфобластного лейкоза с множественными описанными механизмами активации. ^[5]^[7] Сайт начала транскрипции LMO2 расположен примерно на 25 т.п.н. ниже кластера транслокаций Т-клеток 11p13 (11p13 ttc), где происходит ряд транслокаций, специфичных для острого лимфобластного лейкоза Т-клеток . ^[8] Вышестоящий некодирующий элемент ДНК также является местом рецидивирующих мутаций при остром лимфобластном лейкозе Т-клеток , что приводит к привлечению транскрипционного фактора MYB и значительному обогащению H3K27ac и, таким образом, к образованию аберрантного энхансера, который усиливает экспрессию LMO2. ^[9] Более того, рецидивирующие и соматически приобретенные мутации 1 LMO2 интрона приводят к его сверхэкспрессии как при остром Т-клеточном лейкозе у взрослых, так и у детей . ^[10] Эти мутации создают новые сайты связывания транскрипционных факторов для MYB, ETS1 и RUNX1, что позволяет сформировать аберрантный промотор, который управляет экспрессией LMO2 .

Взаимодействия

Было показано, что LMO2 взаимодействует с:

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135363 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032698 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Бём Т., Форони Л., Канеко Ю., Перуц М.Ф., Rabbitts TH (май 1991 г.). «Ромботиновое семейство онкогенов LIM-домена, богатых цистеином: отдельные члены участвуют в транслокациях Т-клеток в хромосомы человека 11p15 и 11p13» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (10): 4367–4371. Бибкод : 1991PNAS...88.4367B . дои : 10.1073/pnas.88.10.4367 . ПМК 51660 . ПМИД 2034676 .
^ Уоррен А.Дж., Колледж WH, Карлтон М.Б., Эванс М.Дж., Смит А.Дж., Rabbitts TH (июль 1994 г.). «Онкогенный, богатый цистеином белок домена LIM rbtn2 необходим для развития эритроидов». Клетка . 78 (1): 45–57. дои : 10.1016/0092-8674(94)90571-1 . ПМИД 8033210 . S2CID 7156927 .
^ Фиш П., Бём Т., Лавенир И., Ларсон Т., Арно Дж., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (декабрь 1992 г.). «Острая Т-клеточная лимфобластная лимфома, индуцированная у трансгенных мышей генами LIM-доменов RBTN1 и RBTN2». Онкоген . 7 (12): 2389–2397. ПМИД 1461647 .
^ EnterGene 4005
^ Авраам Б.Дж., Хниш Д., Вайнтрауб А.С., Квятковски Н., Ли Ч., Ли З. и др. (февраль 2017 г.). «Небольшие геномные вставки образуют усилители, которые неправильно регулируют онкогены» . Природные коммуникации . 8 : 14385. Бибкод : 2017NatCo...814385A . дои : 10.1038/ncomms14385 . ПМК 5309821 . ПМИД 28181482 .
^ Рахман С., Магнуссен М., Леон Т.Э., Фара Н., Ли З., Авраам Б.Дж. и др. (июнь 2017 г.). «Активация онкогена LMO2 посредством соматически приобретенного неоморфного промотора при остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе» . Кровь . 129 (24): 3221–3226. дои : 10.1182/blood-2016-09-742148 . ПМЦ 5472898 . ПМИД 28270453 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Осада Х., Грутц Г., Аксельсон Х., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (октябрь 1995 г.). «Ассоциация эритроидных факторов транскрипции: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9585–9589. Бибкод : 1995PNAS...92.9585O . дои : 10.1073/pnas.92.21.9585 . ПМК 40846 . ПМИД 7568177 .
^ Мао С., Нил Г.А., Гура Р.М. (апрель 1997 г.). «Т-клеточный онкоген ромботин-2 взаимодействует с ретинобластомосвязывающим белком 2». Онкоген . 14 (13): 1531–1539. дои : 10.1038/sj.onc.1200988 . ПМИД 9129143 . S2CID 25877540 .
^ Беге-Мюллер В., Ансьо С., Лойц А. (июнь 2002 г.). «Белок Lmo2 домена LIM связывается с AF6, партнером по транслокации онкогена MLL». Письма ФЭБС . 521 (1–3): 36–38. дои : 10.1016/s0014-5793(02)02814-4 . ПМИД 12067721 . S2CID 29461336 .
^ Вадман И., Ли Дж., Баш Р.О., Форстер А., Осада Х., Рэббиттс Т.Х., Баер Р. (октябрь 1994 г.). «Специфическая связь in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в Т-клеточном лейкозе человека» . Журнал ЭМБО . 13 (20): 4831–4839. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x . ПМЦ 395422 . ПМИД 7957052 .
^ Валге-Арчер В.Е., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Рэббиттс Т.Х. (август 1994 г.). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (18): 8617–8621. Бибкод : 1994PNAS...91.8617V . дои : 10.1073/pnas.91.18.8617 . ПМК 44657 . ПМИД 8078932 .
^ Гоардон Н., Ламберт Дж.А., Родригес П., Ниссер П., Херблот С., Тибо П. и др. (январь 2006 г.). «ETO2 координирует клеточную пролиферацию и дифференцировку во время эритропоэза» . Журнал ЭМБО . 25 (2): 357–366. дои : 10.1038/sj.emboj.7600934 . ПМЦ 1383517 . ПМИД 16407974 .

Дальнейшее чтение

Ройер-Покора Б., Лоос У., Людвиг В.Д. (октябрь 1991 г.). «TTG-2, новый ген, кодирующий богатый цистеином белок с мотивом LIM, сверхэкспрессируется при остром Т-клеточном лейкозе с помощью t(11;14)(p13;q11)». Онкоген . 6 (10): 1887–1893. ПМИД 1923511 .
Бём Т., Форони Л., Канеко Ю., Перуц М.Ф., Rabbitts TH (май 1991 г.). «Ромботиновое семейство онкогенов LIM-домена, богатых цистеином: отдельные члены участвуют в транслокациях Т-клеток в хромосомы человека 11p15 и 11p13» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (10): 4367–4371. Бибкод : 1991PNAS...88.4367B . дои : 10.1073/pnas.88.10.4367 . ПМК 51660 . ПМИД 2034676 .
Бём Т., Спиллантини М.Г., Софрониев М.В., Сурани М.А., Rabbitts TH (май 1991 г.). «Регулируемая развитием и тканеспецифичная экспрессия мРНК, кодирующих две альтернативные формы онкогена домена LIM, ромботина: доказательства экспрессии в тимусе». Онкоген . 6 (5): 695–703. ПМИД 2052354 .
Донг В.Ф., Сюй Ю., Ху К.Л., Манро Д., Миновада Дж., Хаусман Д.Э., Минден, доктор медицинских наук (ноябрь 1995 г.). «Молекулярная характеристика точки разрыва хромосомной транслокации t (11; 14) (p13; q11) из клеточной линии KOPT-K1». Лейкемия . 9 (11): 1812–1817. ПМИД 7475267 .
Осада Х., Грутц Г., Аксельсон Х., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (октябрь 1995 г.). «Ассоциация эритроидных факторов транскрипции: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9585–9589. Бибкод : 1995PNAS...92.9585O . дои : 10.1073/pnas.92.21.9585 . ПМК 40846 . ПМИД 7568177 .
Санчес-Гарсия I, Аксельсон Х, Rabbitts TH (апрель 1995 г.). «Функциональное разнообразие белков LIM: аминоконцевые домены активации в онкогенных белках RBTN1 и RBTN2». Онкоген . 10 (7): 1301–1306. ПМИД 7731680 .
Вадман И., Ли Дж., Баш Р.О., Форстер А., Осада Х., Рэббиттс Т.Х., Баер Р. (октябрь 1994 г.). «Специфическая связь in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в Т-клеточном лейкозе человека» . Журнал ЭМБО . 13 (20): 4831–4839. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x . ПМЦ 395422 . ПМИД 7957052 .
Валге-Арчер В.Е., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Рэббиттс Т.Х. (август 1994 г.). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (18): 8617–8621. Бибкод : 1994PNAS...91.8617V . дои : 10.1073/pnas.91.18.8617 . ПМК 44657 . ПМИД 8078932 .
Уилкинсон Д.А., Нил Г.А., Мао С., Наив К.В., Гурха Р.М. (январь 1997 г.). «Эльф-2, фактор транскрипции, связывающий ромботин-2: открытие и потенциальная роль в Т-клеточном лейкозе» . Лейкемия . 11 (1): 86–96. дои : 10.1038/sj.leu.2400516 . ПМИД 9001422 .
Мао С., Нил Г.А., Гура Р.М. (апрель 1997 г.). «Т-клеточный онкоген ромботин-2 взаимодействует с ретинобластомосвязывающим белком 2». Онкоген . 14 (13): 1531–1539. дои : 10.1038/sj.onc.1200988 . ПМИД 9129143 . S2CID 25877540 .
Осада Х., Грутц Г.Г., Аксельсон Х., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (апрель 1997 г.). «Белок Lmo2, содержащий только LIM, образует белковый комплекс с эритроидным транскрипционным фактором GATA-1». Лейкемия . 11 (Приложение 3): 307–312. ПМИД 9209374 .
Вадман И.А., Осада Х., Грютц Г.Г., Агульник А.Д., Вестфаль Х., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (июнь 1997 г.). «Белок Lmo2, содержащий только LIM, представляет собой мостиковую молекулу, собирающую эритроидный ДНК-связывающий комплекс, который включает белки TAL1, E47, GATA-1 и Ldb1/NLI» . Журнал ЭМБО . 16 (11): 3145–3157. дои : 10.1093/emboj/16.11.3145 . ПМК 1169933 . ПМИД 9214632 .
Висвадер Дж.Э., Мао Х, Фудзивара Ю., Хам К., Оркин С.Х. (декабрь 1997 г.). «Белок, связывающий LIM-домен Ldb1, и его партнер LMO2 действуют как негативные регуляторы дифференцировки эритроидов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (25): 13707–13712. Бибкод : 1997PNAS...9413707V . дои : 10.1073/pnas.94.25.13707 . ПМК 28370 . ПМИД 9391090 .
Юрата Л.В., Пфафф С.Л., Гилл Г.Н. (февраль 1998 г.). «Ядерный интерактор домена LIM NLI опосредует гомо- и гетеродимеризацию факторов транскрипции домена LIM» . Журнал биологической химии . 273 (6): 3152–3157. дои : 10.1074/jbc.273.6.3152 . ПМИД 9452425 .
Кенни Д.А., Джурата Л.В., Сага Ю., Гилл Г.Н. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация и характеристика LMO4, гена LMO с новым характером экспрессии во время эмбриогенеза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (19): 11257–11262. Бибкод : 1998PNAS...9511257K . дои : 10.1073/pnas.95.19.11257 . ПМК 21629 . ПМИД 9736723 .
Оно Ю, Фукухара Н, Ёси О (декабрь 1998 г.). «Белки, содержащие только TAL1 и LIM, синергически индуцируют экспрессию ретинальдегиддегидрогеназы 2 при остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе, действуя в качестве кофакторов для GATA3» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (12): 6939–6950. дои : 10.1128/MCB.18.12.6939 . ПМЦ 109277 . ПМИД 9819382 .
Бах I, Родригес-Эстебан С, Карьер С, Бхушан А, Кронес А, Роуз Д.В. и др. (август 1999 г.). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Природная генетика . 22 (4): 394–399. дои : 10.1038/11970 . ПМИД 10431247 . S2CID 22326394 .
Вителли Л., Кондорелли Г., Лулли В., Хоанг Т., Лукетти Л., Кроче С.М., Пешле С. (июль 2000 г.). «Пентамерный транскрипционный комплекс, включающий tal-1 и белок ретинобластомы, снижает экспрессию c-kit в нормальных эритробластах» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (14): 5330–5342. дои : 10.1128/MCB.20.14.5330-5342.2000 . ПМК 85982 . ПМИД 10866689 .
Давенпорт Дж., Нил Г.А., Гурха Р. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация генов, потенциально участвующих в лейкемогенезе, индуцированном LMO2». Лейкемия . 14 (11): 1986–1996. дои : 10.1038/sj.leu.2401913 . ПМИД 11069036 . S2CID 5827053 .
Сум Э.Ю., Пэн Б., Юй X, Чен Дж., Бирн Дж., Линдеман Г.Дж., Висвадер Дж.Э. (март 2002 г.). «Белок домена LIM LMO4 взаимодействует с кофактором CtIP и супрессором опухоли BRCA1 и ингибирует активность BRCA1» . Журнал биологической химии . 277 (10): 7849–7856. дои : 10.1074/jbc.M110603200 . ПМИД 11751867 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P25791 (Human Rhombotin-2) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P25801 (Mouse Rhombotin-2) в PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135363 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032698 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2034676-5] Jump up to: ^а ^б Бём Т., Форони Л., Канеко Ю., Перуц М.Ф., Rabbitts TH (май 1991 г.). «Ромботиновое семейство онкогенов LIM-домена, богатых цистеином: отдельные члены участвуют в транслокациях Т-клеток в хромосомы человека 11p15 и 11p13» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (10): 4367–4371. Бибкод : 1991PNAS...88.4367B . дои : 10.1073/pnas.88.10.4367 . ПМК 51660 . ПМИД 2034676 .

[pmid8033210-6] Уоррен А.Дж., Колледж WH, Карлтон М.Б., Эванс М.Дж., Смит А.Дж., Rabbitts TH (июль 1994 г.). «Онкогенный, богатый цистеином белок домена LIM rbtn2 необходим для развития эритроидов». Клетка . 78 (1): 45–57. дои : 10.1016/0092-8674(94)90571-1 . ПМИД 8033210 . S2CID 7156927 .

[7] Фиш П., Бём Т., Лавенир И., Ларсон Т., Арно Дж., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (декабрь 1992 г.). «Острая Т-клеточная лимфобластная лимфома, индуцированная у трансгенных мышей генами LIM-доменов RBTN1 и RBTN2». Онкоген . 7 (12): 2389–2397. ПМИД 1461647 .

[entrez-8] EnterGene 4005

[9] Авраам Б.Дж., Хниш Д., Вайнтрауб А.С., Квятковски Н., Ли Ч., Ли З. и др. (февраль 2017 г.). «Небольшие геномные вставки образуют усилители, которые неправильно регулируют онкогены» . Природные коммуникации . 8 : 14385. Бибкод : 2017NatCo...814385A . дои : 10.1038/ncomms14385 . ПМК 5309821 . ПМИД 28181482 .

[10] Рахман С., Магнуссен М., Леон Т.Э., Фара Н., Ли З., Авраам Б.Дж. и др. (июнь 2017 г.). «Активация онкогена LMO2 посредством соматически приобретенного неоморфного промотора при остром Т-клеточном лимфобластном лейкозе» . Кровь . 129 (24): 3221–3226. дои : 10.1182/blood-2016-09-742148 . ПМЦ 5472898 . ПМИД 28270453 .

[pmid7568177-11] Jump up to: ^а ^б ^с Осада Х., Грутц Г., Аксельсон Х., Форстер А., Рэббиттс Т.Х. (октябрь 1995 г.). «Ассоциация эритроидных факторов транскрипции: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (21): 9585–9589. Бибкод : 1995PNAS...92.9585O . дои : 10.1073/pnas.92.21.9585 . ПМК 40846 . ПМИД 7568177 .

[pmid9129143-12] Мао С., Нил Г.А., Гура Р.М. (апрель 1997 г.). «Т-клеточный онкоген ромботин-2 взаимодействует с ретинобластомосвязывающим белком 2». Онкоген . 14 (13): 1531–1539. дои : 10.1038/sj.onc.1200988 . ПМИД 9129143 . S2CID 25877540 .

[pmid12067721-13] Беге-Мюллер В., Ансьо С., Лойц А. (июнь 2002 г.). «Белок Lmo2 домена LIM связывается с AF6, партнером по транслокации онкогена MLL». Письма ФЭБС . 521 (1–3): 36–38. дои : 10.1016/s0014-5793(02)02814-4 . ПМИД 12067721 . S2CID 29461336 .

[pmid7957052-14] Вадман И., Ли Дж., Баш Р.О., Форстер А., Осада Х., Рэббиттс Т.Х., Баер Р. (октябрь 1994 г.). «Специфическая связь in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в Т-клеточном лейкозе человека» . Журнал ЭМБО . 13 (20): 4831–4839. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x . ПМЦ 395422 . ПМИД 7957052 .

[pmid8078932-15] Валге-Арчер В.Е., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Рэббиттс Т.Х. (август 1994 г.). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (18): 8617–8621. Бибкод : 1994PNAS...91.8617V . дои : 10.1073/pnas.91.18.8617 . ПМК 44657 . ПМИД 8078932 .

[pmid16407974-16] Гоардон Н., Ламберт Дж.А., Родригес П., Ниссер П., Херблот С., Тибо П. и др. (январь 2006 г.). «ETO2 координирует клеточную пролиферацию и дифференцировку во время эритропоэза» . Журнал ЭМБО . 25 (2): 357–366. дои : 10.1038/sj.emboj.7600934 . ПМЦ 1383517 . ПМИД 16407974 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]