Эфрин А5

ВЕЩЕСТВО 5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2X11, 3MX0, 4BK5, 4BKA, 4L0P, 4M4R
Идентификаторы
Псевдонимы	EFNA5 , AF1, EFL5, EPLG7, GLC1M, LERK7, RAGS, эфрин А5
Внешние идентификаторы	Опустить : 601535 ; МГИ : 107444 ; Гомологен : 1482 ; Генные карты : EFNA5 ; ОМА : EFNA5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	107,670,937 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	63,188,312 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	hair follicle; ; Brodmann area 23; ; middle temporal gyrus; ; primary visual cortex; ; germinal epithelium; ; synovial joint; ; parietal pleura; ; nipple; ; endothelial cell; ; pancreatic ductal cell;
	Top expressed in
	superior cervical ganglion; ; utricle; ; external carotid artery; ; ciliary body; ; internal carotid artery; ; iris; ; arcuate nucleus; ; hand; ; epithelium of lens; ; epithelium of stomach;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	neurotrophin TRKC receptor binding; transmembrane receptor protein tyrosine kinase activator activity; neurotrophin TRKA receptor binding; ephrin receptor binding; chemorepellent activity; neurotrophin TRKB receptor binding; protein binding;
Cellular component	membrane; plasma membrane; anchored component of external side of plasma membrane; caveola; anchored component of membrane; basement membrane; adherens junction; cell periphery; GABA-ergic synapse;
Biological process	positive regulation of synapse assembly; apoptotic process; cell differentiation; regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; positive regulation of protein phosphorylation; negative chemotaxis; regulation of actin cytoskeleton organization; regulation of GTPase activity; ephrin receptor signaling pathway; regulation of microtubule cytoskeleton organization; positive regulation of collateral sprouting; nervous system development; multicellular organism development; regulation of cell-cell adhesion; positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; regulation of focal adhesion assembly; regulation of cell morphogenesis; collateral sprouting; negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading; retinal ganglion cell axon guidance; cellular response to follicle-stimulating hormone stimulus; cellular response to forskolin; activation of transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; axon guidance; synaptic membrane adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1946
	13640
	ENSG00000184349
	ENSMUSG00000048915
	P52803
	О08543
	НМ_001962
	НМ_010109 ; НМ_207654
	НП_001953
	НП_034239 ; НП_997537
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Эфрин А5 — белок , который у человека кодируется EFNA5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Эфрин А5 представляет собой гликозилфосфатидилинозитол (ГФИ)-заякоренный белок подкласса эфрина-А лигандов эфрина , который связывается с подклассом EphA рецепторов Eph . Также было показано, что эфрин А5 связывается с рецептором EphB2 . ^{[ 8 ]}

Обратная передача сигналов при выживании конуса роста

«Обратная» передача сигналов является уникальным свойством лигандов эфрина, которое позволяет передавать внутриклеточный сигнал в клетках, экспрессирующих эфрин, который отличается от сигнала, передаваемого в клетках, экспрессирующих рецептор Eph. Хотя механизм «обратной» передачи сигналов эфрином-А не совсем понятен, это относительно удивительно, учитывая, что лиганды эфрина-А прикрепляются к клеточной мембране исключительно посредством связи GPI и, в отличие от эфрина-B, не имеют потенциального внутриклеточного сигнального домена. . Тем не менее, известно, что некоторые лиганды эфрина-А инициируют обратные сигнальные каскады, такие как эфрин А5, который, как было показано, стимулирует распространение конусов роста в культурах спинальных мотонейронов мыши . ^{[ 9 ]} Было продемонстрировано, что обратная передача сигналов эфрином А5 является GPI-зависимой, поскольку устранение всех связей GPI с помощью фосфатидлиинозитол-специфической фосфолипазы C устраняет положительные эффекты эфрина A5 на распространение конуса роста. Кроме того, было показано, что рецепторы EphA оказывают противоположное воздействие на конусы роста двигательных нейронов за счет уменьшения размера конусов роста.

Формирование ретинотопической карты

Это открытие о том, что эфрин А5 способствует выживанию конуса роста, что противоположно передаче сигналов EphA и опосредовано непосредственно обратной передачей сигналов эфрина A5, имеет важное значение для управления аксонами , поскольку обеспечивает механизм, с помощью которого мигрирующие аксоны, экспрессирующие EphA, будут преимущественно избегать клеток, экспрессирующих эфрин A5, и, возможно, мигрировать. в сторону клеток с более низкой экспрессией эфрина А5. ^{[ 9 ]} Фактически этот механизм тот же самый, который обеспечивает направление ганглиозных клеток сетчатки в отдельные области верхних холмиков во время формирования ретинотопической карты. Высокая экспрессия эфрина А5 на клетках задней области СК связывается с EphAs, экспрессируемыми в РГК, мигрирующих из височной сетчатки, вызывая коллапс конуса роста и отталкивая эти РГК от задней части СК к области низкой экспрессии эфрина А5 в передней СК. . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000184349 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048915 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Черретти Д.П., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Куэфер М.Ю., Валентайн В., Шапиро Д.Н., Куи Икс, Моррис С.В. (сентябрь 1996 г.). «Ген, кодирующий LERK-7 (EPLG7, Epl7), лиганд тирозинкиназных рецепторов, связанных с Eph, картируется на хромосоме 5 человека в полосе q21 и на хромосоме 17 мыши». Геномика . 35 (2): 376–9. дои : 10.1006/geno.1996.0371 . ПМИД 8661153 .
^ Козлоски С.Дж., ВанденБос Т., Парк Л., Серретти Д.П., Карпентер М.К. (октябрь 1997 г.). «LERK-7: лиганд киназ, связанных с Eph, регулируется в мозге на этапе развития». Цитокин . 9 (8): 540–9. дои : 10.1006/cyto.1997.0199 . ПМИД 9245480 .
^ «Ген Энтреза: EFNA5 эфрин-А5» .
^ Химанен Дж.П., Чамли М.Дж., Лакманн М., Ли С., Бартон В.А., Джеффри П.Д., Веринг С., Гелейк Д., Фельдхайм Д.А., Бойд А.В., Хенкемейер М., Николов Д.Б. (май 2004 г.). «Отталкивающая классовая дискриминация: эфрин-А5 связывается с рецептором EphB2 и активирует передачу сигналов». Нат. Нейроски . 7 (5): 501–9. дои : 10.1038/nn1237 . ПМИД 15107857 . S2CID 15643420 .
^ Jump up to: ^а ^б Марквардт Т., Ширасаки Р., Гош С., Эндрюс С.Е., Картер Н., Хантер Т., Пфафф С.Л. (апрель 2005 г.). «Коэкспрессированные рецепторы EphA и лиганды эфрина-A опосредуют противоположные действия на навигацию конуса роста из разных мембранных доменов» . Клетка . 121 (1): 127–39. дои : 10.1016/j.cell.2005.01.020 . ПМИД 15820684 . S2CID 16818608 .
^ Дрешер У, Кремозер С, Хандверкер С, Лёшингер Дж, Нода М, Бонхёффер Ф (август 1995 г.). «Наведение in vitro аксонов ганглиозных клеток сетчатки с помощью RAGS, тектального белка массой 25 кДа, родственного лигандам тирозинкиназ рецептора Eph» . Клетка . 82 (3): 359–70. дои : 10.1016/0092-8674(95)90425-5 . ПМИД 7634326 . S2CID 2537692 .

Дальнейшее чтение

Фланаган Дж. Г., Вандерхаген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в развитии нервной системы». Анну. Преподобный Нейроски . 21 : 309–45. дои : 10.1146/annurev.neuro.21.1.309 . ПМИД 9530499 . S2CID 1278600 .
Чжоу Р (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакол. Там . 77 (3): 151–81. дои : 10.1016/S0163-7258(97)00112-5 . ПМИД 9576626 .
Холдер Н., Кляйн Р. (1999). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Разработка . 126 (10): 2033–44. дои : 10.1242/dev.126.10.2033 . ПМИД 10207129 .
Уилкинсон Д.Г. (2000). «Эф-рецепторы и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Межд. Преподобный Цитол . Международный обзор цитологии. 196 : 177–244. дои : 10.1016/S0074-7696(00)96005-4 . ISBN 978-0-12-364600-2 . ПМИД 10730216 .
Сюй Ц, Меллитцер Г, Уилкинсон Д.Г. (2001). «Роль рецепторов Eph и эфринов в формировании сегментного паттерна» . Филос. Пер. Р. Сок. Лонд. Б Биол. Наука . 355 (1399): 993–1002. дои : 10.1098/rstb.2000.0635 . ПМЦ 1692797 . ПМИД 11128993 .
Уилкинсон Д.Г. (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Нат. Преподобный Нейроски . 2 (3): 155–64. дои : 10.1038/35058515 . ПМИД 11256076 . S2CID 205014301 .
Уинслоу Дж.В., Моран П., Вальверде Дж. и др. (1995). «Клонирование AL-1, лиганда рецептора тирозинкиназы, связанного с Eph, участвующего в формировании пучка аксонов» . Нейрон . 14 (5): 973–81. дои : 10.1016/0896-6273(95)90335-6 . ПМИД 7748564 . S2CID 18373575 .
Гейл Н.В., Холланд С.Дж., Валенсуэла Д.М. и др. (1996). «Рецепторы и лиганды Eph включают два основных подкласса специфичности и взаимно компартментализируются во время эмбриогенеза» . Нейрон . 17 (1): 9–19. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80276-7 . ПМИД 8755474 . S2CID 1075856 .
Лакманн М., Манн Р.Дж., Кравец Л. и др. (1997). «Лиганд киназы, связанной с EPH (LERK) 7, является предпочтительным лигандом с высоким сродством к рецептору HEK» . Ж. Биол. Хим . 272 (26): 16521–30. дои : 10.1074/jbc.272.26.16521 . ПМИД 9195962 .
Эфноменклатурный комитет (1997). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph» . Клетка . 90 (3): 403–4. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . ПМИД 9267020 . S2CID 26773768 .
Чоссек Т., Моншау Б., Кремозер С. и др. (1998). «Взаимодействие рецептора Eph с лигандом необходимо для управления аксонами ганглиозных клеток сетчатки in vitro». Евро. Дж. Нейроски . 10 (5): 1574–80. дои : 10.1046/j.1460-9568.1998.00180.x . ПМИД 9751130 . S2CID 20470923 .
Дженис Л.С., Кэссиди Р.М., Кромер Л.Ф. (1999). «Связывание эфрина-А и экспрессия рецептора EphA определяют матриксный отсек полосатого тела» . Дж. Нейроски . 19 (12): 4962–71. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-12-04962.1999 . ПМК 6782661 . ПМИД 10366629 .
Герлай Р., Шински Н., Ши А. и др. (1999). «Регуляция обучения с помощью рецепторов EphA: исследование нацеливания на белок» . Дж. Нейроски . 19 (21): 9538–49. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-21-09538.1999 . ПМЦ 6782889 . ПМИД 10531456 .
Дэви А., Гейл Н.В., Мюррей Э.В. и др. (2000). «Компартментализированная передача сигналов с помощью GPI-заякоренного эфрина-А5 требует, чтобы тирозинкиназа Fyn регулирула клеточную адгезию» . Генс Дев . 13 (23): 3125–35. дои : 10.1101/gad.13.23.3125 . ПМК 317175 . ПМИД 10601038 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P52803 (Human Ephrin-A5) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O08543 (Mouse Ephrin-A5) в PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000184349 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048915 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8661153-5] Черретти Д.П., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Куэфер М.Ю., Валентайн В., Шапиро Д.Н., Куи Икс, Моррис С.В. (сентябрь 1996 г.). «Ген, кодирующий LERK-7 (EPLG7, Epl7), лиганд тирозинкиназных рецепторов, связанных с Eph, картируется на хромосоме 5 человека в полосе q21 и на хромосоме 17 мыши». Геномика . 35 (2): 376–9. дои : 10.1006/geno.1996.0371 . ПМИД 8661153 .

[pmid9245480-6] Козлоски С.Дж., ВанденБос Т., Парк Л., Серретти Д.П., Карпентер М.К. (октябрь 1997 г.). «LERK-7: лиганд киназ, связанных с Eph, регулируется в мозге на этапе развития». Цитокин . 9 (8): 540–9. дои : 10.1006/cyto.1997.0199 . ПМИД 9245480 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: EFNA5 эфрин-А5» .

[pmid15107857-8] Химанен Дж.П., Чамли М.Дж., Лакманн М., Ли С., Бартон В.А., Джеффри П.Д., Веринг С., Гелейк Д., Фельдхайм Д.А., Бойд А.В., Хенкемейер М., Николов Д.Б. (май 2004 г.). «Отталкивающая классовая дискриминация: эфрин-А5 связывается с рецептором EphB2 и активирует передачу сигналов». Нат. Нейроски . 7 (5): 501–9. дои : 10.1038/nn1237 . ПМИД 15107857 . S2CID 15643420 .

[pmid15820684-9] Jump up to: ^а ^б Марквардт Т., Ширасаки Р., Гош С., Эндрюс С.Е., Картер Н., Хантер Т., Пфафф С.Л. (апрель 2005 г.). «Коэкспрессированные рецепторы EphA и лиганды эфрина-A опосредуют противоположные действия на навигацию конуса роста из разных мембранных доменов» . Клетка . 121 (1): 127–39. дои : 10.1016/j.cell.2005.01.020 . ПМИД 15820684 . S2CID 16818608 .

[pmid7634326-10] Дрешер У, Кремозер С, Хандверкер С, Лёшингер Дж, Нода М, Бонхёффер Ф (август 1995 г.). «Наведение in vitro аксонов ганглиозных клеток сетчатки с помощью RAGS, тектального белка массой 25 кДа, родственного лигандам тирозинкиназ рецептора Eph» . Клетка . 82 (3): 359–70. дои : 10.1016/0092-8674(95)90425-5 . ПМИД 7634326 . S2CID 2537692 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Межклеточные сигнальные пептиды и белки/ лиганды
Growth factors	Epidermal growth factor Fibroblast growth factor Nerve growth factor Platelet-derived growth factor Transforming growth factor beta superfamily Vascular endothelial growth factor
Ephrin	EFNA1 EFNA2 EFNA3 EFNA4 EFNA5 EFNB1 EFNB2 EFNB3
Other	Adipokine Agouti signaling protein Agouti-related protein Angiogenic protein CCN intercellular signaling protein Cysteine-rich protein 61 Connective tissue growth factor Nephroblastoma overexpressed protein Cytokine Endothelin EDN1 EDN2 EDN3 Hedgehog protein Interferon Kinin Parathyroid hormone-related protein Semaphorin Somatomedin Tolloid-like metalloproteinase Tumor necrosis factor Wnt protein
see also extracellular ligand disorders