Эфрин B3

ЭФНБ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4BKF
Идентификаторы
Псевдонимы	EFNB3 , EFL6, EPLG8, LERK8, эфрин B3
Внешние идентификаторы	Опустить : 602297 ; МГИ : 109196 ; Гомологен : 1076 ; Генные карты : EFNB3 ; OMA : EFNB3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	7,711,372 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	69,451,031 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; nucleus accumbens; ; endothelial cell; ; prefrontal cortex; ; Brodmann area 46; ; ganglionic eminence; ; dorsolateral prefrontal cortex; ; caudate nucleus; ; entorhinal cortex; ; ventricular zone;
	Top expressed in
	entorhinal cortex; ; CA3 field; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; perirhinal cortex; ; superior frontal gyrus; ; nucleus of stria terminalis; ; primary visual cortex; ; subiculum; ; suprachiasmatic nucleus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	ephrin receptor binding; transmembrane-ephrin receptor activity; virus receptor activity; protein tyrosine kinase activity;
Cellular component	integral component of membrane; integral component of plasma membrane; membrane; plasma membrane; hippocampal mossy fiber to CA3 synapse; glutamatergic synapse; integral component of presynaptic membrane; integral component of postsynaptic density membrane;
Biological process	ephrin receptor signaling pathway; multicellular organism development; cell-cell signaling; viral entry into host cell; T cell costimulation; cell differentiation; viral process; axon choice point recognition; nervous system development; adult walking behavior; axon guidance; peptidyl-tyrosine phosphorylation; negative regulation of axonogenesis; trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex, modulating synaptic transmission;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1949
	13643
	ENSG00000108947
	ENSMUSG00000003934
	Q15768
	О35393
	НМ_001406
	НМ_007911
	НП_001397
	НП_031937
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Эфрин-В3 — это белок , который у человека кодируется EFNB3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

EFNB3, член семейства генов эфрина , важен как для развития мозга, так и для его поддержания. EPH и EPH-родственные рецепторы составляют самое большое подсемейство рецепторных протеинтирозинкиназ . Рецепторы EPH обычно имеют один киназный домен и внеклеточную область, содержащую богатый цистеином домен и 2 повтора фибронектина типа III. Лиганды и рецепторы эфрина были названы Комитетом по номенклатуре Eph (1997) на основании их структуры и взаимоотношений последовательностей. Эфрины делятся на класс эфрина-А (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые представляют собой трансмембранные белки. Лиганды эфрина-B также содержат внутриклеточный хвост с высококонсервативными остатками тирозина и PDZ-связывающим мотивом на С-конце . ^{[ 7 ]} Этот хвост функционирует как механизм обратной передачи сигналов, при котором передача сигнала происходит в клетку, содержащую лиганд, а не в клетку с рецептором. При взаимодействии рецептор-лиганд остатки тирозина фосфорилируются и происходит рекрутирование белков, содержащих домен PDZ . ^{[ 7 ]} Семейство рецепторов Eph аналогичным образом разделено на две группы на основании сходства их последовательностей внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-А и эфрина-В. ^{[ 6 ]} EphrinB3 участвует в обеспечении различных событий развития, особенно в нервной системе . Обратная передача сигналов EphrinB3 важна для обрезки аксонов, формирования синапсов и шипов во время постнатального развития нервной системы. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Предыдущая работа также показала, что передача сигналов через этот лиганд важна для радиальной миграции во время развития коры. ^{[ 8 ]} Более того, уровни экспрессии EFNB3 особенно высоки в некоторых субрегионах переднего мозга по сравнению с другими субрегионами мозга и могут играть ключевую роль в функции переднего мозга. Было высказано предположение, что передача сигналов ephrinB3 необходима для синаптической пластичности возникновения в гиппокампе ; это указывает на то, что ephrinB3 играет важную роль в обучении и памяти. ^{[ 9 ]} Совсем недавно было показано, что ephrinB3 регулирует пролиферацию нейральных стволовых клеток в субвентрикулярной зоне взрослых (СВЗ). ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000108947 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003934 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Тан XX, Pleasure DE, Икегаки Н (май 1997 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и характер экспрессии EPLG8, нового члена семейства генов EPLG, кодирующего лиганды рецепторов протеинтирозинкиназ, связанных с EPH» . Геномика . 41 (1): 17–24. дои : 10.1006/geno.1997.4615 . ПМИД 9126477 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: EFNB3 эфрин-В3» .
^ Jump up to: ^а ^б Кляйн, Рюдигер (15 ноября 2012 г.). «Передача сигналов эф/эфрина во время развития» . Разработка . 139 (22): 4105–9. дои : 10.1242/dev.074997 . ПМИД 23093422 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Роджер, Дженнифер; Лорена Сальваторе; Паоло Мигани (2012). «Должен ли я остаться или уйти? Эфс и эфринс в миграции нейронов» . Нейросигналы . 20 (3): 190–201. дои : 10.1159/000333784 . ПМИД 22456188 .
^ Jump up to: ^а ^б Грушка, Мартин; Мэтью Б. Далва (2012). «Эфриновая регуляция образования, функции и пластичности синапсов» . Молекулярная и клеточная нейронаука . 50 (1): 35–44. дои : 10.1016/j.mcn.2012.03.004 . ПМЦ 3631567 . ПМИД 22449939 .
^ Рикар, Джером; Джессика Салинас; Лиссетт Гарсия; Дэниел Дж. Либл (2006). «ЭфринB3 регулирует пролиферацию и выживаемость клеток в нейрогенезе у взрослых». Молекулярная и клеточная нейронаука . 31 (4): 713–22. дои : 10.1016/j.mcn.2006.01.002 . ПМИД 16483793 . S2CID 206830930 .

Дальнейшее чтение

Фланаган Дж. Г., Вандерхаген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в развитии нервной системы». Анну. Преподобный Нейроски . 21 : 309–45. дои : 10.1146/annurev.neuro.21.1.309 . ПМИД 9530499 .
Чжоу Р (1998). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакол. Там . 77 (3): 151–81. дои : 10.1016/S0163-7258(97)00112-5 . ПМИД 9576626 .
Холдер Н., Кляйн Р. (1999). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Разработка . 126 (10): 2033–44. дои : 10.1242/dev.126.10.2033 . ПМИД 10207129 .
Уилкинсон Д.Г. (2000). «Эф-рецепторы и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Межд. Преподобный Цитол . Международный обзор цитологии. 196 : 177–244. дои : 10.1016/S0074-7696(00)96005-4 . ISBN 978-0-12-364600-2 . ПМИД 10730216 .
Сюй Ц, Меллитцер Г, Уилкинсон Д.Г. (2001). «Роль рецепторов Eph и эфринов в формировании сегментного паттерна» . Филос. Пер. Р. Сок. Лонд. Б Биол. Наука . 355 (1399): 993–1002. дои : 10.1098/rstb.2000.0635 . ПМЦ 1692797 . ПМИД 11128993 .
Уилкинсон Д.Г. (2001). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Нат. Преподобный Нейроски . 2 (3): 155–64. дои : 10.1038/35058515 . ПМИД 11256076 . S2CID 205014301 .
Гейл Н.В., Фленникен А., Комптон, округ Колумбия, и др. (1996). «Elk-L3, новый трансмембранный лиганд для семейства рецепторных тирозинкиназ Eph, экспрессируемый в эмбриональной пластинке дна, верхней пластинке и сегментах заднего мозга». Онкоген . 13 (6): 1343–52. ПМИД 8808709 .
Эфноменклатурный комитет (1997). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph» . Клетка . 90 (3): 403–4. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . ПМИД 9267020 . S2CID 26773768 .
Бергеманн А.Д., Чжан Л., Чан М.К. и др. (1998). «Эфрин-B3, лиганд рецептора EphB3, экспрессируемый на средней линии развивающейся нервной трубки» . Онкоген . 16 (4): 471–80. дои : 10.1038/sj.onc.1201557 . ПМИД 9484836 .
Брюкнер К., Пабло Лабрадор Дж., Шайффеле П. и др. (1999). «Лиганды EphrinB рекрутируют адаптерные белки PDZ семейства GRIP в микродомены мембраны плота» . Нейрон . 22 (3): 511–24. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80706-0 . ПМИД 10197531 .
Лю В., Ахмад С.А., Юнг Ю.Д. и др. (2002). «Коэкспрессия эфрина-B и их рецепторов при раке толстой кишки» . Рак . 94 (4): 934–9. дои : 10.1002/cncr.10122 . ПМИД 11920461 . S2CID 25734266 .
Такемото М., Фукуда Т., Сонода Р. и др. (2002). «Взаимодействия эфрин-B3-EphA4 регулируют рост специфических популяций таламокортикальных аксонов in vitro». Евро. Дж. Нейроски . 16 (6): 1168–72. дои : 10.1046/j.1460-9568.2002.02166.x . ПМИД 12383247 . S2CID 7540058 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000108947 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003934 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9126477-5] Тан XX, Pleasure DE, Икегаки Н (май 1997 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и характер экспрессии EPLG8, нового члена семейства генов EPLG, кодирующего лиганды рецепторов протеинтирозинкиназ, связанных с EPH» . Геномика . 41 (1): 17–24. дои : 10.1006/geno.1997.4615 . ПМИД 9126477 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: EFNB3 эфрин-В3» .

[Klein-7] Jump up to: ^а ^б Кляйн, Рюдигер (15 ноября 2012 г.). «Передача сигналов эф/эфрина во время развития» . Разработка . 139 (22): 4105–9. дои : 10.1242/dev.074997 . ПМИД 23093422 .

[Rodger_2012-8] Jump up to: ^а ^б ^с Роджер, Дженнифер; Лорена Сальваторе; Паоло Мигани (2012). «Должен ли я остаться или уйти? Эфс и эфринс в миграции нейронов» . Нейросигналы . 20 (3): 190–201. дои : 10.1159/000333784 . ПМИД 22456188 .

[Hruska_2012-9] Jump up to: ^а ^б Грушка, Мартин; Мэтью Б. Далва (2012). «Эфриновая регуляция образования, функции и пластичности синапсов» . Молекулярная и клеточная нейронаука . 50 (1): 35–44. дои : 10.1016/j.mcn.2012.03.004 . ПМЦ 3631567 . ПМИД 22449939 .

[10] Рикар, Джером; Джессика Салинас; Лиссетт Гарсия; Дэниел Дж. Либл (2006). «ЭфринB3 регулирует пролиферацию и выживаемость клеток в нейрогенезе у взрослых». Молекулярная и клеточная нейронаука . 31 (4): 713–22. дои : 10.1016/j.mcn.2006.01.002 . ПМИД 16483793 . S2CID 206830930 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Межклеточные сигнальные пептиды и белки/ лиганды
Growth factors	Epidermal growth factor Fibroblast growth factor Nerve growth factor Platelet-derived growth factor Transforming growth factor beta superfamily Vascular endothelial growth factor
Ephrin	EFNA1 EFNA2 EFNA3 EFNA4 EFNA5 EFNB1 EFNB2 EFNB3
Other	Adipokine Agouti signaling protein Agouti-related protein Angiogenic protein CCN intercellular signaling protein Cysteine-rich protein 61 Connective tissue growth factor Nephroblastoma overexpressed protein Cytokine Endothelin EDN1 EDN2 EDN3 Hedgehog protein Interferon Kinin Parathyroid hormone-related protein Semaphorin Somatomedin Tolloid-like metalloproteinase Tumor necrosis factor Wnt protein
see also extracellular ligand disorders