DDR1

Чтобы узнать о типе компьютерной памяти, см. DDR SDRAM .

DDR1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3ZOS, 4AG4, 4BKJ, 4CKR, 5BVK, 5BVN, 5BVO, 5BVW, 5FDP
Идентификаторы
Псевдонимы	DDR1 , CAK, CD167, DDR, EHGK2, MCK10, NEP, NTRK4, PTK3, PTK3A, RTK6, TRKE, тирозинкиназа 1 рецептора дискоидинового домена
Внешние идентификаторы	Опустить : 600408 ; МГИ : 99216 ; Гомологен : 68212 ; Генные карты : DDR1 ; OMA : DDR1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p21.33 Start 30,876,421 bp End 30,900,156 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 17 (mouse) Band 17 B1|17 18.7 cM Start 35,992,459 bp End 36,015,513 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in ventricular zone right uterine tube ganglionic eminence olfactory zone of nasal mucosa C1 segment minor salivary glands islet of Langerhans skin of abdomen mucosa of esophagus substantia nigra Top expressed in ciliary body iris Epithelium of choroid plexus retinal pigment epithelium conjunctival fornix Rostral migratory stream medial ganglionic eminence epithelium of stomach motor neuron parotid gland More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function transferase activity nucleotide binding protein kinase activity collagen binding metal ion binding kinase activity protein binding transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity protein tyrosine kinase collagen receptor activity protein tyrosine kinase activity ATP binding receptor tyrosine kinase Cellular component integral component of membrane membrane receptor complex plasma membrane integral component of plasma membrane extracellular region extracellular exosome extracellular space Biological process collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway branching involved in mammary gland duct morphogenesis phosphorylation transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway female pregnancy extracellular matrix organization ear development mammary gland alveolus development regulation of extracellular matrix disassembly smooth muscle cell migration smooth muscle cell-matrix adhesion regulation of cell-matrix adhesion protein phosphorylation cell adhesion regulation of cell growth peptidyl-tyrosine phosphorylation lactation wound healing, spreading of cells embryo implantation negative regulation of cell population proliferation peptidyl-tyrosine autophosphorylation protein autophosphorylation axon development neuron projection extension cell-matrix adhesion positive regulation of cell population proliferation cell differentiation regulation of extracellular matrix organization Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 780 12305 Вместе showENSG00000215522 ENSG00000137332 ENSG00000229767 ENSG00000230456 ENSG00000234078 ENSG00000204580 ENSG00000223680 ENSMUSG00000003534 ЮниПрот Q08345 Q03146 RefSeq (мРНК) showНМ_001202521 НМ_001202522 НМ_001202523 НМ_001297652 НМ_001297653 NM_001297654 NM_001954 NM_013993 NM_013994 НМ_001198831 НМ_001198833 НМ_007584 НМ_172962 RefSeq (белок) showНП_001189450 НП_001189451 НП_001189452 НП_001284581 НП_001284582 NP_001284583 NP_001945 NP_054699 NP_054700 NP_001284583.1 NP_054699.2 НП_001185760 НП_001185762 НП_031610 НП_766550 Местоположение (UCSC) Чр 6: 30,88 – 30,9 Мб Чр 17: 35,99 – 36,02 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Семейство рецепторов домена дискоидина, член 1 , также известное как DDR1 или CD167a ( кластер дифференцировки человека 167a), представляет собой ген .

Функция

Рецепторные тирозинкиназы (РТК) играют ключевую роль в коммуникации клеток с их микроокружением. Эти молекулы участвуют в регуляции роста, дифференцировки и метаболизма клеток. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой RTK, который широко экспрессируется в нормальных и трансформированных эпителиальных клетках и активируется различными типами коллагена . Этот белок принадлежит к подсемейству тирозинкиназных рецепторов с областью гомологии с I Dictyostelium discoideum белком дискоидином во внеклеточном домене. Его аутофосфорилирование достигается всеми протестированными на данный момент коллагенами (от типа I до типа VI). Близкородственным членом семейства является белок DDR2 . Исследования in situ и нозерн-блот-анализ показали, что экспрессия этого кодируемого белка ограничена эпителиальными клетками, особенно в почках, легких, желудочно-кишечном тракте и мозге. Кроме того, этот белок значительно сверхэкспрессируется в некоторых опухолях человека молочной железы, яичников, пищевода и головного мозга у детей. Этот ген расположен на хромосоме 6p21.3 рядом с несколькими HLA класса I. генами Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к образованию множества вариантов транскрипта.

Дальнейшее чтение

• Эдельхофф С., Свитсер Д.А., Дистече К.М. (январь 1995 г.). «Картирование гена тирозинкиназы рецептора NEP с хромосомой 6p21.3 человека и хромосомой 17C мыши». Геномика . 25 (1): 309–11. дои : 10.1016/0888-7543(95)80144-B . ПМИД   7774938 .
• Шеллинг А.Н., Батлер Р., Джонс Т., Лаваль С., Бойл Дж.М., Ганесан Т.С. (январь 1995 г.). «Локализация киназы эпителиально-специфического рецептора (EDDR1) на хромосоме 6q16». Геномика . 25 (2): 584–7. дои : 10.1016/0888-7543(95)80065-T . ПМИД   7789998 .
• Вайнер Т.М., Лю Э.Т., Крейвен Р.Дж., Кэнс В.Г. (январь 1994 г.). «Экспрессия рецепторов фактора роста, киназы фокальной адгезии и других тирозинкиназ в опухолях мягких тканей человека». Анналы хирургической онкологии . 1 (1): 18–27. дои : 10.1007/BF02303537 . ПМИД   7834423 . S2CID   2737602 .
• Лаваль С., Батлер Р., Шеллинг А.Н., Хэнби А.М., Поулсом Р., Ганесан Т.С. (ноябрь 1994 г.). «Выделение и характеристика эпителиально-специфической рецепторной тирозинкиназы из линии клеток рака яичников». Рост и дифференцировка клеток . 5 (11): 1173–83. ПМИД   7848919 .
• Като Дж.Ю., Мацуока М., Стром Д.К., Шерр С.Дж. (апрель 1994 г.). «Регуляция циклин D-зависимой киназы 4 (cdk4) с помощью киназы, активирующей cdk4» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (4): 2713–21. дои : 10.1128/MCB.14.4.2713 . ПМЦ   358637 . ПМИД   8139570 .
• Ди Марко Э., Кутули Н., Герра Л., Канседда Р., Де Лука М. (ноябрь 1993 г.). «Молекулярное клонирование trkE, нового предполагаемого рецептора тирозинкиназы, связанного с trk, выделенного из нормальных кератиноцитов человека и широко экспрессируемого нормальными тканями человека» . Журнал биологической химии . 268 (32): 24290–5. дои : 10.1016/S0021-9258(20)80524-9 . hdl : 11380/607761 . ПМИД   8226977 .
• Перес Дж.Л., Шен X, Финкернагель С., Шиорра Л., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Д., Коупленд Н.Г., Вонг Т.В. (январь 1994 г.). «Идентификация и хромосомное картирование рецепторной тирозинкиназы с предполагаемой последовательностью связывания фосфолипидов в ее эктодомене». Онкоген . 9 (1): 211–9. ПМИД   8302582 .
• Джонсон Дж.Д., Эдман Дж.К., Раттер У.Дж. (июнь 1993 г.). «Рецептор тирозинкиназы, обнаруженный в клетках карциномы молочной железы, имеет внеклеточный дискоидин I-подобный домен» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (12): 5677–81. Бибкод : 1993PNAS...90.5677J . дои : 10.1073/pnas.90.12.5677 . ПМК   46784 . ПМИД   8390675 .
• Перес Дж.Л., Цзин С.К., Вонг Т.В. (апрель 1996 г.). «Идентификация двух изоформ киназы рецептора Cak, которые коэкспрессируются в клеточных линиях опухоли молочной железы». Онкоген . 12 (7): 1469–77. ПМИД   8622863 .
• Валент А., Меддеб М., Данглот Г., Дювергер А., Нгуен В.К., Бернхейм А. (июль 1996 г.). «Присвоение гена NTRK4 (trkE) хромосоме 6p21». Генетика человека . 98 (1): 12–5. дои : 10.1007/s004390050152 . ПМИД   8682498 . S2CID   9450185 .
• Член парламента от Плейфорда, Батлер Р.Дж., Ван XC, Катсо Р.М., Кук И.Е., Ганесан Т.С. (июль 1996 г.). «Геномная структура тирозинкиназы дискоидинового рецептора» . Геномные исследования . 6 (7): 620–7. дои : 10.1101/гр.6.7.620 . ПМИД   8796349 .
• Сакума С., Сая Х., Тада М., Накао М., Фудзивара Т., Рот Дж.А., Савамура Ю., Шинохе Ю., Абэ Х. (декабрь 1996 г.). «Рецепторная протеинтирозинкиназа DDR активируется белком p53» . Письма ФЭБС . 398 (2–3): 165–9. дои : 10.1016/S0014-5793(96)01234-3 . ПМИД   8977099 . S2CID   7573214 .
• Немото Т., Охаси К., Акаши Т., Джонсон Дж.Д., Хирокава К. (1998). «Сверхэкспрессия протеинтирозинкиназ при раке пищевода человека». Патобиология . 65 (4): 195–203. дои : 10.1159/000164123 . ПМИД   9396043 .
• Танака К., Нагаяма Ю., Накано Т., Такамура Н., Намба Х., Фукада С., Кума К., Ямасита С., Нива М. (март 1998 г.). «Профиль экспрессии генов протеинтирозинкиназы рецепторного типа в щитовидной железе человека» . Эндокринология . 139 (3): 852–8. дои : 10.1210/endo.139.3.5791 . ПМИД   9492013 .
• Фогель В., Гиш Г.Д., Алвес Ф., Поусон Т. (декабрь 1997 г.). «Тирозинкиназы рецептора дискоидинового домена активируются коллагеном» . Молекулярная клетка . 1 (1): 13–23. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80003-9 . ПМИД   9659899 .
• Шривастава А., Радзеевский С., Кэмпбелл Е., Ковач Л., МакГлинн М., Райан Т.Е., Дэвис С., Гольдфарб MP, Glass DJ, Лемке Г., Янкопулос Г.Д. (декабрь 1997 г.). «Семейство тирозинкиназных рецепторов-сирот, члены которых служат неинтегриновыми рецепторами коллагена» . Молекулярная клетка . 1 (1): 25–34. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80004-0 . ПМИД   9659900 .
• Фогель В., Брейкбуш К., Фесслер Р., Алвес Ф., Руджеро Ф., Поусон Т. (февраль 2000 г.). «Рецептор 1 дискоидинового домена активируется независимо от бета (1) интегрина» . Журнал биологической химии . 275 (8): 5779–84. дои : 10.1074/jbc.275.8.5779 . ПМИД   10681566 .
• Фер Э.Д., Татавос А., Танабе Э., Раффиони С., Гетц С., Димарко Э., Де Лука М., Брэдшоу Р.А. (май 2000 г.). «Передача сигналов рецептора 1 домена дискоидина (DDR1) в клетках PC12: активация околомембранных доменов в химерных рецепторах PDGFR/DDR/TrkA» . Журнал ФАСЭБ . 14 (7): 973–81. дои : 10.1096/fasebj.14.7.973 . ПМИД   10783152 . S2CID   43317719 .
• Вайнер Х.Л., Хуанг Х., Загзаг Д., Бойс Х., Лихтенбаум Р., Зифф Э.Б. (декабрь 2000 г.). «Последовательная и селективная экспрессия тирозинкиназы рецептора-1 дискоидинового домена в опухолях головного мозга человека». Нейрохирургия . 47 (6): 1400–9. дои : 10.1097/00006123-200012000-00028 . ПМИД   11126911 . S2CID   2299503 .
• Мохан Р.Р., Мохан Р.Р., Уилсон С.Е. (январь 2001 г.). «Рецептор дискоидинового домена (DDR) 1 и 2: коллаген-активируемые тирозинкиназные рецепторы в роговице». Экспериментальное исследование глаз . 72 (1): 87–92. дои : 10.1006/exer.2000.0932 . ПМИД   11133186 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .