ИФИТМ1
| ИФИТМ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | IFITM1 , 9-27, CD225, DSPA2a, IFI17, LEU13, интерферон-индуцированный трансмембранный белок 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 604456 ; Гомологен : 74501 ; GeneCards : IFITM1 ; OMA : IFITM1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Индуцируемый интерфероном трансмембранный белок 1 представляет собой белок , который у человека кодируется IFITM1 геном . [ 3 ] [ 4 ] IFITM1 также недавно получил обозначение CD225 ( кластер дифференцировки 225). Этот белок имеет несколько дополнительных названий: fragilis (человеческий гомолог мышиного белка), IFI17 [интерферон-индуцируемый белок 17], 9-27 [интерферон-индуцируемый белок 9-27] и Leu13.
IFITM1 является членом семейства IFITM (интерферон-индуцированный трансмембранный белок), который кодируется генами IFITM. Гены IFITM человека расположены на хромосоме 11 и состоят из четырех членов: IFITM1, IFITM2, IFITM3 и IFITM5. [ 5 ] В то время как мышиные гены Ifitm располагаются на хромосомах 7 и 16 и имеют шесть членов: Ifitm1, Ifitm2 , Ifitm3 , Ifitm5 , Ifitm6 и Ifitm7 .
Молекулярная биология
[ редактировать ]Ген IFITM1 расположен на Ватсоновской (плюсовой) цепи короткого плеча хромосомы 11 (11p15.5) и имеет длину 3956 оснований. Кодируемый белок содержит 125 аминокислот (молекулярная масса 13,964 кДа ).
Это внутренний мембранный белок, который, по прогнозам, пересекает мембрану несколько раз.
Структура и функции
[ редактировать ]Белки IFITM имеют короткие N-концевой и C-концевой домен, два трансмембранных домена (TM1 и TM2) и короткий цитоплазматический домен. Первый трансмембранный домен (TM1) и цитоплазматический домен консервативны среди различных белков IFITM у человека и мышей. [ 6 ] В отсутствие стимуляции интерфероном белки IFITM могут широко экспрессироваться в тканях и клеточных линиях. У людей IFITM1, IFITM2 и IFITM3 способны экспрессироваться в различных тканях и клетках, тогда как экспрессия IFITM5 ограничивается остеобластами. [ 7 ] Интерфероны типов I и II значительно индуцируют экспрессию белков IFITM. Белки IFITM участвуют в физиологическом процессе передачи сигналов иммунного ответа, созревания и развития зародышевых клеток. [ 8 ]
Биохимия
[ редактировать ]Ген индуцируется интерфероном , и белок является частью сигнального пути.
Противовирусная функция белков IFITM
[ редактировать ]Белки IFITM были идентифицированы как клеточно-автономные белки, которые подавляют ранние стадии репликации вируса . [ 9 ] Нокаут IFITM3 увеличивает репликацию вируса гриппа А , а сверхэкспрессия IFITM3 ингибирует репликацию вируса гриппа А. [ 10 ] В дополнение к компетентному к репликации вирусу гриппа А, белки IFITM были способны ингибировать псевдотипированный вирус гриппа А на основе ретровирусов, что указывает на то, что белок IFITM ингибирует вирус гриппа А на ранней стадии жизненного цикла, что может происходить на стадиях входа и слияния.
Белки IFITM также способны ингибировать некоторые инфекции другими вирусами с оболочкой , принадлежащими к различным семействам вирусов. К этим вирусам относятся флавивирусы ( вирус денге и вирус Западного Нила ), филовирусы ( вирус Марбурга и вирус Эбола ), коронавирусы ( коронавирус атипичной пневмонии ) и лентивирусы ( вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)). [ 11 ] Однако белки IFITM не влияли на инфекцию альфавируса , аренавируса или вируса мышиного лейкоза .
Белки IFITM ингибируют слияние мембран вирусов и мембран клеточных эндосомальных или лизосомальных везикул путем изменения их липидных компонентов или текучести. Белки IFITM блокируют стадию гемифузии, [ 9 ] промежуточная стадия, на которой части внешних мембран клетки-мишени и вирусной оболочки смешиваются до завершения слияния. [ 12 ] Кроме того, белки IFITM снижали текучесть мембран и влияли на кривизну мембраны, ограничивая слияние вирусной мембраны с клеточной мембраной. [ 9 ] Кроме того, IFITM3 взаимодействовал с клеточными белками, регулирующими уровень холестерина, мембранным белком А, связанным с везикулой (VAPA), и оксистеролсвязывающим белком (OSBP), вызывая внутриклеточное накопление холестерина, что, в свою очередь, блокирует слияние вирусной мембраны и мембраны везикул. [ 13 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185885 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Дебландр Г.А., Маринкс О.П., Эванс С.С., Маджадж С., Лео О., Капут Д., Юэз Г.А., Уотелет М.Г. (ноябрь 1995 г.). «Экспрессионное клонирование интерферон-индуцируемого мембранного белка массой 17 кДа, участвующего в контроле роста клеток» . J Биол Хим . 270 (40): 23860–6. дои : 10.1074/jbc.270.40.23860 . ПМИД 7559564 .
- ^ «Ген Энтрез: трансмембранный белок 1 (9-27), индуцированный интерфероном IFITM1» .
- ^ Хикфорд Д., Франкенберг С., Шоу Дж., Ренфри М.Б. (2012). «Эволюция трансмембранных белков, индуцируемых интерфероном позвоночных» . БМК Геномика . 13 :155. дои : 10.1186/1471-2164-13-155 . ПМЦ 3424830 . ПМИД 22537233 .
- ^ Йонт Дж.С., Молтедо Б., Ян Ю.И., Чаррон Дж., Моран Т.М., Лопес С.Б., Ханг ХК (август 2010 г.). «Профилирование пальмитоилома выявило S-пальмитоилирование-зависимую противовирусную активность IFITM3» . Нат. хим. Биол . 6 (8): 610–4. дои : 10.1038/nchembio.405 . ПМЦ 2928251 . ПМИД 20601941 .
- ^ Танака С.С., Ямагути Ю.Л., Цой Б., Ликерт Х., Там П.П. (декабрь 2005 г.). «Белки семейства IFITM/Mil/fragilis IFITM1 и IFITM3 играют разные роли в возвращении и отталкивании первичных зародышевых клеток мыши» . Дев. Клетка . 9 (6): 745–56. дои : 10.1016/j.devcel.2005.10.010 . ПМИД 16326387 .
- ^ Левин А.Р., Рид Л.Е., МакМахон М., Старк Г.Р., Керр И.М. (июль 1991 г.). «Молекулярный анализ семейства генов, индуцируемых интерфероном человека» . Евро. Дж. Биохим . 199 (2): 417–23. дои : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb16139.x . ПМИД 1906403 .
- ^ Перейти обратно: а б с Ли К., Маркосян Р.М., Чжэн Ю.М., Гольфетто О., Бунгарт Б., Ли М., Дин С., Хэ Ю, Лян С., Ли Дж.К., Граттон Е., Коэн Ф.С., Лю С.Л. (январь 2013 г.). «Белки IFITM ограничивают гемислияние вирусных мембран» . ПЛОС Патог . 9 (1): e1003124. дои : 10.1371/journal.ppat.1003124 . ПМЦ 3554583 . ПМИД 23358889 .
- ^ Фили Э.М., Симс Дж.С., Джон С.П., Чин Ч.Р., Пертель Т., Чен Л.М., Гайха Г.Д., Райан Б.Дж., Донис Р.О., Элледж С.Дж., Брасс А.Л. (октябрь 2011 г.). «IFITM3 ингибирует инфекцию вируса гриппа А, предотвращая проникновение в цитозоль» . ПЛОС Патог . 7 (10): e1002337. дои : 10.1371/journal.ppat.1002337 . ПМК 3203188 . ПМИД 22046135 .
- ^ Брасс А.Л., Хуанг И.С., Бенита Й., Джон С.П., Кришнан М.Н., Фили Э.М., Райан Б.Дж., Вейер Дж.Л., ван дер Вейден Л., Фикриг Э., Адамс Дж., Ксавьер Р.Дж., Фарзан М., Элледж С.Дж. (декабрь 2009 г.). «Белки IFITM опосредуют клеточную устойчивость к вирусу гриппа A H1N1, вирусу Западного Нила и вирусу денге» . Ячейка 139 (7): 1243–54. дои : 10.1016/j.cell.2009.12.017 . ПМК 2824905 . ПМИД 20064371 .
- ^ Харрисон, Стивен С. (июль 2008 г.). «Слияние вирусных мембран» . Nat Struct Мол Биол . 15 (7): 690–8. дои : 10.1038/nsmb.1456 . ПМК 2517140 . ПМИД 18596815 .
- ^ Амини-Бавил-Оляи С., Чхве Ю.Дж., Ли Дж.Х., Ши М., Хуанг И.С., Фарзан М., Юнг Ю. (апрель 2013 г.). «Противовирусный эффектор IFITM3 нарушает внутриклеточный гомеостаз холестерина, блокируя проникновение вируса» . Микроб-хозяин клетки . 13 (4): 452–64. дои : 10.1016/j.chom.2013.03.006 . ПМЦ 3646482 . ПМИД 23601107 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Брэдбери Л.Е., Канзас Г.С., Леви С. и др. (1992). «Комплекс, передающий сигнал CD19/CD21 В-лимфоцитов человека, включает в себя мишень антипролиферативных антител-1 и молекул Leu-13» . Дж. Иммунол . 149 (9): 2841–50. дои : 10.4049/jimmunol.149.9.2841 . ПМИД 1383329 . S2CID 23655762 .
- Такахаши С., Досс С., Леви С., Леви Р. (1990). «TAPA-1, мишень антипролиферативного антитела, связана на поверхности клетки с антигеном Leu-13» . Дж. Иммунол . 145 (7): 2207–13. doi : 10.4049/jimmunol.145.7.2207 . ПМИД 2398277 . S2CID 30999229 .
- Рид Л.Е., Браснетт А.Х., Гилберт К.С. и др. (1989). «Один элемент ответа ДНК может обеспечивать индуцируемость как альфа-, так и гамма-интерферонами» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (3): 840–4. Бибкод : 1989ПНАС...86..840Р . дои : 10.1073/pnas.86.3.840 . ПМК 286573 . ПМИД 2492664 .
- Келли Дж. М., Гилберт К. С., Старк Г. Р., Керр И. М. (1986). «Дифференциальная регуляция интерферон-индуцированных мРНК и мРНК c-myc альфа- и гамма-интерферонами» . Евро. Дж. Биохим . 153 (2): 367–71. дои : 10.1111/j.1432-1033.1985.tb09312.x . ПМИД 3935435 .
- Фридман Р.Л., Мэнли С.П., МакМахон М. и др. (1984). «Транкрипционная и посттранскрипционная регуляция интерферон-индуцированной экспрессии генов в клетках человека». Клетка . 38 (3): 745–55. дои : 10.1016/0092-8674(84)90270-8 . ПМИД 6548414 . S2CID 37810920 .
- Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
- Кита К., Сугая С., Чжай Л. и др. (2003). «Участие LEU13 в индуцированной интерфероном рефрактерности клеток RSa человека к уничтожению клеток рентгеновскими лучами». Радиат. Рез . 160 (3): 302–8. Бибкод : 2003РадР..160..302К . дои : 10.1667/RR3039 . ПМИД 12926988 . S2CID 34613110 .
- Ленер Б., Семпл Дж.И., Браун С.Е. и др. (2004). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика . 83 (1): 153–67. дои : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . ПМИД 14667819 .
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
- Акьерли CB, Бексак М, Холко М и др. (2005). «Экспрессия IFITM1 у пациентов с хроническим миелолейкозом». Лейк. Рез . 29 (3): 283–6. doi : 10.1016/j.leukres.2004.07.007 . hdl : 11693/24093 . ПМИД 15661263 . S2CID 43389978 .
- Ян Ю, Ли Дж. Х., Ким К. Ю. и др. (2005). «Интерферон-индуцируемый ген 9-27 модулирует восприимчивость к естественным клеткам-киллерам и инвазивность клеток рака желудка». Рак Летт . 221 (2): 191–200. дои : 10.1016/j.canlet.2004.08.022 . ПМИД 15808405 .
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- IFITM1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .