АЛКАМ

АЛКАМ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5A2F
Идентификаторы
Псевдонимы	ALCAM , CD166, MEMD, активированная молекула адгезии лейкоцитарных клеток.
Внешние идентификаторы	Опустить : 601662 ; МГИ : 1313266 ; Гомологен : 1229 ; Генные карты : ALCAM ; ОМА : ALCAM – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	105,576,900 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	52,274,437 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	bronchial epithelial cell; ; mucosa of paranasal sinus; ; endothelial cell; ; palpebral conjunctiva; ; pars reticulata; ; corpus callosum; ; visceral pleura; ; external globus pallidus; ; Pars compacta; ; trigeminal ganglion;
	Top expressed in
	olfactory tubercle; ; vas deferens; ; right lung lobe; ; left lung lobe; ; stria vascularis; ; nucleus accumbens; ; anterior amygdaloid area; ; globus pallidus; ; ventromedial nucleus; ; lateral septal nucleus;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; signaling receptor binding; identical protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; cell projection; membrane; focal adhesion; intrinsic component of plasma membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; T cell receptor complex; extracellular region; axon; neuronal cell body; dendrite; immunological synapse; extracellular exosome; external side of plasma membrane;
Biological process	heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; adaptive immune response; immune system process; neuron projection extension; cell adhesion; motor neuron axon guidance; axon extension involved in axon guidance; signal transduction; retinal ganglion cell axon guidance; axon guidance;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	214
	11658
	ENSG00000170017
	ENSMUSG00000022636
	Q13740
	Q61490
	НМ_001627 ; НМ_001243280 ; НМ_001243281 ; НМ_001243283
	НМ_009655 ; НМ_001331110
	НП_001230209 ; НП_001230210 ; НП_001230212 ; НП_001618
	НП_001318039 ; НП_033785
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Антиген CD166 представляет собой трансмембранный гликопротеин типа I массой 100–105 кДа , который является членом суперсемейства иммуноглобулинов белков . У человека он кодируется ALCAM геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Его еще называют CD166 ( кластер дифференцировки 166), MEMD, ^{[ 7 ]} SC-1/DM-GRASP/BEN у курицы и KG-CAM у крысы.

В некоторых литературных источниках его также называют лигандом CD6 (CD6L). Он экспрессируется на активированных Т-клетках , активированных моноцитах , эпителиальных клетках, фибробластах , нейронах , клетках меланомы , а также в потовых и сальных железах. ^{[ нужна ссылка ]} Сообщается, что экспрессия белка CD166 усиливается в клеточной линии, происходящей из метастазирующей меланомы - а. ^{[ 7 ]} CD166 играет важную роль в обеспечении адгезионных взаимодействий между эпителиальными клетками тимуса и CD6+ клетками во время развития внутритимических Т-клеток. ^{[ нужна ссылка ]}

Недавно CD166 также использовался в качестве потенциального маркера раковых стволовых клеток. ^{[ нужна ссылка ]}

См. также

Список генов-маркеров стволовых клеток кишечника

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170017 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022636 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Боуэн М.А., Патель Д.Д., Ли X, Модрелл Б., Малако А.Р., Ван В.К., Марквардт Х., Нойбауэр М., Песандо Дж.М., Франке У. и др. (июнь 1995 г.). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов (ALCAM), лиганда CD6» . Джей Эксп Мед . 181 (6): 2213–20. дои : 10.1084/jem.181.6.2213 . ПМК 2192054 . ПМИД 7760007 .
^ «Ген Энтрез: ALCAM-активированная молекула адгезии лейкоцитарных клеток» .
^ Jump up to: ^а ^б Деген В.Г., ван Кемпен Л.С., Гийзен Э.Г. и др. (1998). «MEMD, новая молекула клеточной адгезии в метастазирующих клеточных линиях меланомы человека, идентична ALCAM (активированной молекуле клеточной адгезии лейкоцитов)» . Являюсь. Дж. Патол . 152 (3): 805–13. ПМК 1858405 . ПМИД 9502422 .

Дальнейшее чтение

Уитни Г.С., Старлинг Г.К., Боуэн М.А. и др. (1995). «Богатый цистеином домен CD6 мембранно-проксимального рецептора-поглотителя содержит сайт связывания активированной молекулы адгезии лейкоцитов» . Ж. Биол. Хим . 270 (31): 18187–90. дои : 10.1074/jbc.270.31.18187 . ПМИД 7543097 .
Баджорат Дж., Боуэн М.А., Аруффо А. (1996). «Молекулярная модель N-концевого рецептор-связывающего домена человеческого CD6-лиганда ALCAM» . Белковая наука . 4 (8): 1644–7. дои : 10.1002/pro.5560040822 . ПМК 2143187 . ПМИД 8520490 .
Сконьер Дж.Э., Боуэн М.А., Эмсвилер Дж. и др. (1996). «Распознавание разнообразных белков членами суперсемейства иммуноглобулинов: определение места связывания рецептора в лиганде CD6 человека ALCAM». Биохимия . 35 (38): 12287–91. дои : 10.1021/bi961038k . ПМИД 8823162 .
Сингер Н.Г., Митра Р., Лиалиос Ф. и др. (1998). «CD6-зависимые взаимодействия Т-клеток и кератиноцитов: функциональные доказательства наличия второго лиганда CD6 на кератиноцитах, активированных гамма-интерфероном». Иммунол. Летт . 58 (1): 9–14. дои : 10.1016/S0165-2478(97)02707-7 . ПМИД 9436462 .
Деген В.Г., ван Кемпен Л.С., Гийзен Э.Г. и др. (1998). «MEMD, новая молекула клеточной адгезии в метастазирующих клеточных линиях меланомы человека, идентична ALCAM (активированной молекуле клеточной адгезии лейкоцитов)» . Являюсь. Дж. Патол . 152 (3): 805–13. ПМК 1858405 . ПМИД 9502422 .
Кортес Ф., Дешазо Ф., Учида Н. и др. (1999). «HCA, иммуноглобулинподобная молекула адгезии, присутствующая на самых ранних гемопоэтических клетках-предшественниках человека, также экспрессируется стромальными клетками в кроветворных тканях». Кровь . 93 (3): 826–37. дои : 10.1182/blood.V93.3.826 . ПМИД 9920831 .
Томита К., ван Боховен А., Янсен К.Ф. и др. (2000). «Координировать привлечение E-кадгерина и ALCAM к межклеточным контактам с помощью альфа-катенина». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 267 (3): 870–4. дои : 10.1006/bbrc.1999.2040 . ПМИД 10673383 .
ван Кемпен Л.С., Нелиссен Дж.М., Деген В.Г. и др. (2001). «Молекулярная основа взаимодействия гомофильной активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток (ALCAM)-ALCAM» . Ж. Биол. Хим . 276 (28): 25783–90. дои : 10.1074/jbc.M011272200 . hdl : 2066/143807 . ПМИД 11306570 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Кристиансен Г., Пиларски С., Виссман С. и др. (2003). «Регуляция ALCAM/CD166 повышается при раке предстательной железы низкой степени злокачественности и постепенно теряется при поражениях высокой степени». Простата . 54 (1): 34–43. дои : 10.1002/pros.10161 . ПМИД 12481253 . S2CID 22749852 .
Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (2003). «Идентификация и количественная оценка N-связанных гликопротеинов с использованием химии гидразидов, мечения стабильными изотопами и масс-спектрометрии». Нат. Биотехнология . 21 (6): 660–6. дои : 10.1038/nbt827 . ПМИД 12754519 . S2CID 581283 .
Фудзивара Х., Тацуми К., Косака К. и др. (2003). «Человеческие бластоцисты и эпителиальные клетки эндометрия экспрессируют активированную молекулу адгезии лейкоцитарных клеток (ALCAM/CD166)» . Дж. Клин. Эндокринол. Метаб . 88 (7): 3437–43. дои : 10.1210/jc.2002-021888 . ПМИД 12843199 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
ван Кемпен Л.С., Мейер Ф., Эгеблад М. и др. (2004). «Усечение активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток: путь к метастазированию меланомы» . Дж. Инвест. Дерматол . 122 (5): 1293–301. дои : 10.1111/j.0022-202X.2004.22531.x . ПМИД 15140234 .
Циммерман А.В., Нелиссен Дж.М., ван Эмст-де Врис С.Е. и др. (2005). «Цитоскелетные ограничения регулируют гомотипическую ALCAM-опосредованную адгезию через PKCalpha независимо от Rho-подобных GTPases» . Дж. Клеточная наука . 117 (Часть 13): 2841–52. дои : 10.1242/jcs.01139 . hdl : 2066/57147 . ПМИД 15169840 .
Икеда К., Квертермус Т. (2005). «Молекулярное выделение и характеристика растворимой изоформы активированной молекулы адгезии лейкоцитарных клеток, которая модулирует функцию эндотелиальных клеток» . Ж. Биол. Хим . 279 (53): 55315–23. дои : 10.1074/jbc.M407776200 . ПМИД 15496415 .
Верма А., Шукла Н.К., Део С.В. и др. (2005). «MEMD/ALCAM: потенциальный маркер опухолевой инвазии и узловых метастазов при плоскоклеточном раке пищевода». Онкология . 68 (4–6): 462–70. дои : 10.1159/000086989 . ПМИД 16024937 . S2CID 25355369 .
Лантер П.С., ван Килсдонк Дж.В., ван Бик Х. и др. (2005). «Активированная молекула адгезии лейкоцитарных клеток (ALCAM/CD166/MEMD), новый участник инвазивного роста, контролирует активность матриксной металлопротеиназы» . Рак Рез . 65 (19): 8801–8. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-0378 . ПМИД 16204050 .
Лю Т, Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Протеом Рез . 4 (6): 2070–80. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК 1850943 . ПМИД 16335952 .

Внешние ссылки

ALCAM в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
человека Расположение генома ALCAM и страница сведений о гене ALCAM в браузере генома UCSC .

Эта мембранных белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000170017 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022636 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7760007-5] Боуэн М.А., Патель Д.Д., Ли X, Модрелл Б., Малако А.Р., Ван В.К., Марквардт Х., Нойбауэр М., Песандо Дж.М., Франке У. и др. (июнь 1995 г.). «Клонирование, картирование и характеристика активированной молекулы адгезии лейкоцитов (ALCAM), лиганда CD6» . Джей Эксп Мед . 181 (6): 2213–20. дои : 10.1084/jem.181.6.2213 . ПМК 2192054 . ПМИД 7760007 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: ALCAM-активированная молекула адгезии лейкоцитарных клеток» .

[Degan1998-7] Jump up to: ^а ^б Деген В.Г., ван Кемпен Л.С., Гийзен Э.Г. и др. (1998). «MEMD, новая молекула клеточной адгезии в метастазирующих клеточных линиях меланомы человека, идентична ALCAM (активированной молекуле клеточной адгезии лейкоцитов)» . Являюсь. Дж. Патол . 152 (3): 805–13. ПМК 1858405 . ПМИД 9502422 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Белки : кластеры дифференциации (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350