Витронектин

ВТН
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1OC0, 1S4G, 1SSU, 2JQ8, 3BT1, 3BT2, 4K24
Идентификаторы
Псевдонимы	ВТН , В75, ВН, ВНТ, витронектин
Внешние идентификаторы	Опустить : 193190 ; МГИ : 98940 ; Гомологен : 532 ; GeneCards : ВТН ; ОМА : ВТН - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	28,373,091 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	78,393,150 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; gallbladder; ; left ventricle; ; apex of heart; ; placenta; ; right hemisphere of cerebellum;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; left lobe of liver; ; gallbladder; ; optic nerve; ; retinal pigment epithelium; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; epithelium of lens; ; sexually immature organism; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; pia mater;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; scavenger receptor activity; heparin binding; extracellular matrix binding; polysaccharide binding; integrin binding; identical protein binding; collagen binding; extracellular matrix structural constituent;
Cellular component	alphav-beta3 integrin-vitronectin complex; extracellular exosome; blood microparticle; Golgi lumen; basement membrane; rough endoplasmic reticulum lumen; cytoplasm; extracellular matrix; extracellular space; endoplasmic reticulum; intracellular membrane-bounded organelle; extracellular region; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	receptor-mediated endocytosis; positive regulation of protein binding; cell adhesion; positive regulation of cell-substrate adhesion; extracellular matrix organization; smooth muscle cell-matrix adhesion; regulation of complement activation; positive regulation of smooth muscle cell migration; negative regulation of endopeptidase activity; positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; immune response; endodermal cell differentiation; positive regulation of wound healing; positive regulation of receptor-mediated endocytosis; negative regulation of blood coagulation; oligodendrocyte differentiation; cell adhesion mediated by integrin; cell-matrix adhesion; protein polymerization; liver regeneration; cell population proliferation; cell migration; vesicle-mediated transport; endocytosis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7448
	22370
	ENSG00000109072
	ENSMUSG00000017344
	P04004
	P29788
	НМ_000638
	НМ_011707
	НП_000629
	НП_035837
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Витронектин ( VTN или VN ) представляет собой гликопротеин семейства гемопексинов , который синтезируется и выводится печенью и в большом количестве обнаруживается в сыворотке, внеклеточном матриксе и костях . ^{[ 5 ]} У человека он кодируется VTN геном . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Витронектин связывается с интегрином альфа-V бета-3 и, таким образом, способствует клеток адгезии и распространению . Он также ингибирует повреждающее мембрану действие терминального цитолитического пути комплемента и связывается с несколькими серпинами (ингибиторами сериновых протеаз). Это секретируемый белок, который существует либо в одноцепочечной форме, либо в обрезанной двухцепочечной форме, удерживаемой вместе дисульфидной связью. ^{[ 6 ]} Предполагается, что витронектин участвует в гемостазе. ^{[ 8 ]} и опухолей злокачественность . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Структура

Витронектин представляет собой гликопротеин массой 54 кДа, состоящий из 478 аминокислотных остатков . белка Около одной трети молекулярной массы составляют углеводы . Иногда белок расщепляется после аргинина 379 с образованием двухцепочечного витронектина, где две части связаны дисульфидной связью . Ни одна структура высокого разрешения пока не определена экспериментально. за исключением N-концевого домена.

Белок состоит из трёх доменов :

N -концевой домен соматомедина B (1-39)
Центральные домены с гомологией гемопексина (131-342)
С -концевой домен (остатки 347-459) также гомологичен гемопексину.

Сообщалось о нескольких структурах домена соматомедина B. Первоначально белок был кристаллизован в комплексе с одним из его физиологических партнеров по связыванию: ингибитором активатора плазминогена-1 (PAI-1), и была решена структура этого комплекса. ^{[ 11 ]} Впоследствии две группы сообщили о ЯМР-структурах домена. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Домен соматомедина В представляет собой плотный дисульфидный узел с 4 дисульфидными связями в пределах 35 остатков. Для этого домена сообщалось о различных конфигурациях дисульфида. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} но эта двусмысленность разрешилась кристаллической структурой. ^{[ 16 ]}

Модели гомологии построены для центрального и С-концевого доменов. ^{[ 16 ]}

Функция

Соматомедин B-домен витронектина связывается с ингибитором активатора плазминогена-1 (PAI-1) и стабилизирует его. ^{[ 11 ]} Таким образом, витронектин регулирует протеолиз, инициируемый активацией плазминогена . Кроме того, витронектин входит в состав тромбоцитов и, таким образом, участвует в гемостазе. Витронектин содержит последовательность RGD (45-47), которая является сайтом связывания мембраносвязанных интегринов , например, рецептора витронектина , которые служат для закрепления клеток во внеклеточном матриксе. Домен соматомедина B взаимодействует с рецептором урокиназы , и это взаимодействие участвует в миграции клеток и передаче сигнала. Было показано, что высокие уровни PAI-1 и рецептора урокиназы в плазме коррелируют с негативным прогнозом для больных раком. Адгезия и миграция клеток напрямую участвуют в метастазировании рака , что дает вероятное механистическое объяснение этому наблюдению.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000109072 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017344 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Борон, Уолтер Ф. и Булпап, Эмиль Л. «Медицинская физиология». Сондерс, 2012, стр.1097.
^ Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: М Витронектин» .
^ Дженн Д., Стэнли К.К. (октябрь 1987 г.). «Нуклеотидная последовательность и организация гена S-белка человека: повторяющиеся пептидные мотивы в семействе пексинов и модель их эволюции». Биохимия . 26 (21): 6735–42. дои : 10.1021/bi00395a024 . ПМИД 2447940 .
^ Прейсснер К.Т., Зайфферт Д. (январь 1998 г.). «Роль витронектина и его рецепторов в гемостазе и ремоделировании сосудов». Исследование тромбоза . 89 (1): 1–21. дои : 10.1016/S0049-3848(97)00298-3 . ПМИД 9610756 .
^ Фелдинг-Хаберманн Б., Череш Д.А. (октябрь 1993 г.). «Витронектин и его рецепторы». Современное мнение в области клеточной биологии . 5 (5): 864–8. дои : 10.1016/0955-0674(93)90036-П . ПМИД 7694604 .
^ Херт, Элейн М.; Чан, король; Серрат, Мария Ана Духагон; Томас, Сунита Б.; Винстра, Тимоти Д.; Фаррар, Уильям Л. (2009). «Идентификация витронектина как внешнего индуктора дифференцировки раковых стволовых клеток и образования опухолей» . Стволовые клетки . 28 (3): 390–8. дои : 10.1002/stem.271 . ПМЦ 3448441 . ПМИД 19998373 .
^ Jump up to: ^а ^б Чжоу А., Хантингтон Дж.А., Панну Н.С., Каррелл Р.В., Рид Р.Дж. (июль 2003 г.). «Как витронектин связывает PAI-1, модулируя фибринолиз и миграцию клеток». Структурная биология природы . 10 (7): 541–4. дои : 10.1038/nsb943 . ПМИД 12808446 . S2CID 26086796 .
^ Камикубо Ю., Де Гузман Р., Кроон Г., Карриден С., Нилс Дж.Г., Черчилль М.Дж., Доусон П., Олдзей С., Ягельска А., Шерага Х.А., Лоскутофф DJ, Дайсон Х.Дж. (июнь 2004 г.). «Механизмы дисульфидных связей в активных формах домена соматомедина B витронектина человека». Биохимия . 43 (21): 6519–34. дои : 10.1021/bi049647c . ПМИД 15157085 .
^ Маясундари А., Уиттемор Н.А., Серперсу Э.Х., Петерсон CB (июль 2004 г.). «Структура раствора N-концевого домена витронектина человека: проксимальные участки, регулирующие фибринолиз и миграцию клеток» . Журнал биологической химии . 279 (28): 29359–66. дои : 10.1074/jbc.M401279200 . ПМИД 15123712 .
^ Камикубо Ю., Окумура Ю., Лоскутофф DJ (июль 2002 г.). «Идентификация дисульфидных связей в рекомбинантном домене соматомедина В человеческого витронектина» . Журнал биологической химии . 277 (30): 27109–19. дои : 10.1074/jbc.M200354200 . ПМИД 12019263 .
^ Хорн Н.А., Херст ГБ, Маясундари А., Уиттемор Н.А., Серперсу Э.Х., Петерсон CB (август 2004 г.). «Назначение четырех дисульфидов в N-концевом домене соматомедина B нативного витронектина, выделенного из плазмы человека» . Журнал биологической химии . 279 (34): 35867–78. дои : 10.1074/jbc.M405716200 . ПМИД 15173163 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Сюй Д., Бабурадж К., Петерсон CB, Сюй Ю (август 2001 г.). «Модель трехмерной структуры витронектина: предсказания многодоменного белка на основе резьбы и стыковки». Белки . 44 (3): 312–20. дои : 10.1002/прот.1096 . ПМИД 11455604 . S2CID 24765480 .

Дальнейшее чтение

Сингх Б., Су Ю.К., Рисбек К. (2010). «Витронектин в бактериальном патогенезе: белок-хозяин, используемый для ускользания комплемента и клеточной инвазии» . Мол. Микробиол . 78 (3): 545–60. дои : 10.1111/j.1365-2958.2010.07373.x . ПМИД 20807208 . S2CID 24516528 .
Сингх Б., Джалалванд Ф., Мергелин М., Зипфель П., Блом А.М., Рисбек К. (2011). «Белок E Haemophilus influenzae распознает С-концевой домен витронектина и модулирует мембраноатакующий комплекс» . Мол. Микробиол . 81 (1): 80–98. дои : 10.1111/j.1365-2958.2011.07678.x . ПМИД 21542857 . S2CID 26484037 .
Су Ю.К., Джалалванд Ф., Мергелин М., Блом А.М., Сингх Б., Рисбек К. (2013). «Haemophilus influenzae приобретает витронектин через вездесущий белок F, чтобы подорвать врожденный иммунитет хозяина» . Мол. Микробиол . 87 (6): 1245–66. дои : 10.1111/mmi.12164 . ПМИД 23387957 . S2CID 26923730 .

Внешние ссылки

Витронектин Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000109072 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017344 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Борон, Уолтер Ф. и Булпап, Эмиль Л. «Медицинская физиология». Сондерс, 2012, стр.1097.

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Энтрез Ген: М Витронектин» .

[pmid2447940-7] Дженн Д., Стэнли К.К. (октябрь 1987 г.). «Нуклеотидная последовательность и организация гена S-белка человека: повторяющиеся пептидные мотивы в семействе пексинов и модель их эволюции». Биохимия . 26 (21): 6735–42. дои : 10.1021/bi00395a024 . ПМИД 2447940 .

[pmid9610756-8] Прейсснер К.Т., Зайфферт Д. (январь 1998 г.). «Роль витронектина и его рецепторов в гемостазе и ремоделировании сосудов». Исследование тромбоза . 89 (1): 1–21. дои : 10.1016/S0049-3848(97)00298-3 . ПМИД 9610756 .

[pmid7694604-9] Фелдинг-Хаберманн Б., Череш Д.А. (октябрь 1993 г.). «Витронектин и его рецепторы». Современное мнение в области клеточной биологии . 5 (5): 864–8. дои : 10.1016/0955-0674(93)90036-П . ПМИД 7694604 .

[10] Херт, Элейн М.; Чан, король; Серрат, Мария Ана Духагон; Томас, Сунита Б.; Винстра, Тимоти Д.; Фаррар, Уильям Л. (2009). «Идентификация витронектина как внешнего индуктора дифференцировки раковых стволовых клеток и образования опухолей» . Стволовые клетки . 28 (3): 390–8. дои : 10.1002/stem.271 . ПМЦ 3448441 . ПМИД 19998373 .

[zhou-11] Jump up to: ^а ^б Чжоу А., Хантингтон Дж.А., Панну Н.С., Каррелл Р.В., Рид Р.Дж. (июль 2003 г.). «Как витронектин связывает PAI-1, модулируя фибринолиз и миграцию клеток». Структурная биология природы . 10 (7): 541–4. дои : 10.1038/nsb943 . ПМИД 12808446 . S2CID 26086796 .

[kamikubo04-12] Камикубо Ю., Де Гузман Р., Кроон Г., Карриден С., Нилс Дж.Г., Черчилль М.Дж., Доусон П., Олдзей С., Ягельска А., Шерага Х.А., Лоскутофф DJ, Дайсон Х.Дж. (июнь 2004 г.). «Механизмы дисульфидных связей в активных формах домена соматомедина B витронектина человека». Биохимия . 43 (21): 6519–34. дои : 10.1021/bi049647c . ПМИД 15157085 .

[mayasundari-13] Маясундари А., Уиттемор Н.А., Серперсу Э.Х., Петерсон CB (июль 2004 г.). «Структура раствора N-концевого домена витронектина человека: проксимальные участки, регулирующие фибринолиз и миграцию клеток» . Журнал биологической химии . 279 (28): 29359–66. дои : 10.1074/jbc.M401279200 . ПМИД 15123712 .

[kamikubo02-14] Камикубо Ю., Окумура Ю., Лоскутофф DJ (июль 2002 г.). «Идентификация дисульфидных связей в рекомбинантном домене соматомедина В человеческого витронектина» . Журнал биологической химии . 277 (30): 27109–19. дои : 10.1074/jbc.M200354200 . ПМИД 12019263 .

[horn-15] Хорн Н.А., Херст ГБ, Маясундари А., Уиттемор Н.А., Серперсу Э.Х., Петерсон CB (август 2004 г.). «Назначение четырех дисульфидов в N-концевом домене соматомедина B нативного витронектина, выделенного из плазмы человека» . Журнал биологической химии . 279 (34): 35867–78. дои : 10.1074/jbc.M405716200 . ПМИД 15173163 .

[xu-16] Jump up to: ^а ^б ^с Сюй Д., Бабурадж К., Петерсон CB, Сюй Ю (август 2001 г.). «Модель трехмерной структуры витронектина: предсказания многодоменного белка на основе резьбы и стыковки». Белки . 44 (3): 312–20. дои : 10.1002/прот.1096 . ПМИД 11455604 . S2CID 24765480 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]