Коллаген типа XIX, альфа 1

COL19A1
Идентификаторы
Псевдонимы	COL19A1 , COL9A1L, D6S228E, коллаген типа XIX альфа 1, цепь коллагена типа XIX альфа 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 120165 ; МГИ : 1095415 ; Гомологен : 55608 ; Генные карты : COL19A1 ; OMA : COL19A1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	70,212,468 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	24,626,553 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; gonad; ; gastric mucosa; ; endothelial cell; ; epithelium of nasopharynx; ; cerebellar vermis; ; right hemisphere of cerebellum; ; cartilage tissue; ; tibialis anterior muscle; ; lymph node;
	Top expressed in
	facial skeleton; ; primary motor cortex; ; rib; ; tunica media of zone of aorta; ; Dermatocranium; ; mammillary body; ; lateral part of occipital bone; ; CA3 field; ; perirhinal cortex; ; membranous bone;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein-macromolecule adaptor activity; extracellular matrix structural constituent; extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Cellular component	endoplasmic reticulum lumen; collagen; extracellular region; extracellular matrix; extracellular space; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	collagen catabolic process; multicellular organism development; skeletal system development; cell differentiation; muscle organ development; skeletal muscle tissue development; extracellular matrix organization; cell adhesion; cell-cell adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1310
	12823
	ENSG00000082293
	ENSMUSG00000026141
	Q14993
	Q0VF58
	НМ_001858
	НМ_007733
	НП_001849
	НП_031759
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-1(XIX) представляет собой белок , который у человека кодируется COL19A1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует альфа-цепь коллагена типа XIX, члена семейства коллагенов FACIT (коллагены, связанные с фибриллами, с прерывистыми спиралями). Хотя функция этого коллагена неизвестна, другие члены этого семейства коллагенов обнаруживаются в сочетании с коллагенами, образующими фибриллы, такими как тип I и II, и служат для поддержания целостности внеклеточного матрикса. Транскрипт, полученный из этого гена, имеет необычно большую 3'-UTR, которая еще не полностью секвенирована. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000082293 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026141 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Майерс Дж.К., Сан М.Дж., Д'Ипполито Дж.А., Джабс Э.В., Нилсон Э.Г., Дион А.С. (март 1993 г.). «Клоны кДНК человека, транскрибированные с РНК с необычно высокой молекулярной массой, кодируют новую цепь коллагена». Джин . 123 (2): 211–7. дои : 10.1016/0378-1119(93)90126-Н . ПМИД 7916703 .
^ Гереке Д.Р., Олсон П.Ф., Кох М., Нолл Дж.Х., Тейлор Р., Хадсон Д.Л., Шамплио М.Ф., Олсен Б.Р., Бергесон Р.Э. (июль 1997 г.). «Полная первичная структура двух сплайсинговых вариантов коллагена XII и отнесение коллагена альфа 1(XII) (COL12A1), коллагена альфа 1(IX) (COL9A1) и коллагена альфа 1(XIX) (COL19A1) к хромосоме человека 6q12- q13". Геномика . 41 (2): 236–42. дои : 10.1006/geno.1997.4638 . ПМИД 9143499 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL19A1, тип XIX, альфа 1» .

Дальнейшее чтение

Йошиока Х., Чжан Х., Рамирес Ф. и др. (1992). «Синтения между локусами нового локуса FACIT-подобного коллагена (D6S228E) и коллагена альфа 1 (IX) (COL9A1) на участках 6q12-q14 у людей». Геномика . 13 (3): 884–6. дои : 10.1016/0888-7543(92)90176-S . ПМИД 1639419 .
Иногути К., Ёсиока Х., Халедузаман М., Ниномия Ю. (1995). «МРНК цепи коллагена альфа 1 (XIX), нового члена FACIT, содержит длинную необычную 3'-нетранслируемую область и демонстрирует множество уникальных вариантов сплайсинга». Дж. Биохим . 117 (1): 137–46. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124700 . ПМИД 7775380 .
Майерс Дж.С., Ян Х., Д'Ипполито Дж.А. и др. (1994). «Тройная спираль человеческого коллагена типа XIX состоит из множества коллагеновых субдоменов и демонстрирует ограниченную гомологию последовательности с альфа 1(XVI)» . Ж. Биол. Хим . 269 (28): 18549–57. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32344-X . ПМИД 8034603 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Сумиёси Х., Иногути К., Халедуззаман М. и др. (1997). «Повсеместная экспрессия гена коллагена альфа1(XIX) (Col19a1) во время эмбриогенеза мышей ограничивается несколькими тканями взрослого организма» . Ж. Биол. Хим . 272 (27): 17104–11. дои : 10.1074/jbc.272.27.17104 . ПМИД 9202028 .
Халедуззаман М., Сумиёси Х., Уэки Ю. и др. (1998). «Структура гена человеческого коллагена XIX типа (COL19A1), что позволяет предположить, что он произошел от предкового гена семейства FACIT». Геномика . 45 (2): 304–12. дои : 10.1006/geno.1997.4921 . ПМИД 9344653 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Майерс Дж.К., Ли Д., Амента П.С. и др. (2003). «Коллаген типа XIX, очищенный из пуповины человека, характеризуется множественными резкими изломами, очерчивающими коллагеновые субдомены, и межмолекулярными агрегатами через глобулярные, дисульфидные и гепаринсвязывающие аминоконцы» . Ж. Биол. Хим . 278 (34): 32047–57. дои : 10.1074/jbc.M304629200 . ПМИД 12788917 .
Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека» . Природа . 425 (6960): 805–11. Бибкод : 2003Natur.425..805M . дои : 10.1038/nature02055 . ПМИД 14574404 .
Капюля Дж., Яалиноя Дж., Тулла М. и др. (2005). «Связанный с фибриллами коллаген IX обеспечивает новый механизм адгезии клеток к хрящевому матриксу» . Ж. Биол. Хим . 279 (49): 51677–87. дои : 10.1074/jbc.M409412200 . ПМИД 15383545 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000082293 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026141 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7916703-5] Майерс Дж.К., Сан М.Дж., Д'Ипполито Дж.А., Джабс Э.В., Нилсон Э.Г., Дион А.С. (март 1993 г.). «Клоны кДНК человека, транскрибированные с РНК с необычно высокой молекулярной массой, кодируют новую цепь коллагена». Джин . 123 (2): 211–7. дои : 10.1016/0378-1119(93)90126-Н . ПМИД 7916703 .

[pmid9143499-6] Гереке Д.Р., Олсон П.Ф., Кох М., Нолл Дж.Х., Тейлор Р., Хадсон Д.Л., Шамплио М.Ф., Олсен Б.Р., Бергесон Р.Э. (июль 1997 г.). «Полная первичная структура двух сплайсинговых вариантов коллагена XII и отнесение коллагена альфа 1(XII) (COL12A1), коллагена альфа 1(IX) (COL9A1) и коллагена альфа 1(XIX) (COL19A1) к хромосоме человека 6q12- q13". Геномика . 41 (2): 236–42. дои : 10.1006/geno.1997.4638 . ПМИД 9143499 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL19A1, тип XIX, альфа 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]