Ламинин, бета 1

ЛАМБ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4AQS
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMB1 , CLM, LIS5, ламинин, бета 1, субъединица ламинина бета 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 150240 ; МГИ : 96743 ; Гомологен : 1722 ; Генные карты : LAMB1 ; ОМА : LAMB1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	108,003,213 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	31,379,643 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibial nerve; ; right lung; ; epithelium of colon; ; muscle layer of sigmoid colon; ; stromal cell of endometrium; ; upper lobe of left lung; ; parietal pleura; ; sural nerve; ; left uterine tube; ; trigeminal ganglion;
	Top expressed in
	external carotid artery; ; internal carotid artery; ; primary oocyte; ; tail of embryo; ; iris; ; secondary oocyte; ; left lung lobe; ; Gonadal ridge; ; medullary collecting duct; ; Epithelium of choroid plexus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	extracellular matrix structural constituent; structural molecule activity; protein binding; integrin binding;
Cellular component	laminin-8 complex; extracellular matrix; laminin-2 complex; extracellular region; basement membrane; laminin-10 complex; perinuclear region of cytoplasm; laminin-1 complex; extracellular exosome; extracellular space; endoplasmic reticulum lumen; collagen-containing extracellular matrix; laminin complex;
Biological process	endodermal cell differentiation; positive regulation of epithelial cell proliferation; positive regulation of cell migration; neuronal-glial interaction involved in cerebral cortex radial glia guided migration; extracellular matrix organization; odontogenesis; cell adhesion; substrate adhesion-dependent cell spreading; neuron projection development; post-translational protein modification; animal organ morphogenesis; tissue development; cell migration; basement membrane assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3912
	16777
	ENSG00000091136
	ENSMUSG00000002900
	P07942
	P02469
	НМ_002291
	НМ_008482
	НП_002282
	НП_032508
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ламинина бета-1 представляет собой белок , который у человека кодируется LAMB1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Ламинины , семейство гликопротеинов внеклеточного матрикса, являются основным неколлагеновым компонентом базальных мембран. Они участвуют в широком спектре биологических процессов, включая клеточную адгезию, дифференцировку, миграцию, передачу сигналов, рост нейритов и метастазирование. Ламинины состоят из трех неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2 соответственно) и образуют крестообразную структуру, состоящую из трех коротких плеч, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинного плеча, состоящего из из всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой многодоменный белок, кодируемый отдельным геном. Описано несколько изоформ каждой цепи. Различные изомеры альфа-, бета- и гамма-цепей объединяются, образуя различные гетеротримерные изоформы ламинина, которые обозначаются арабскими цифрами в порядке их открытия, т.е. гетеротример альфа1бета1гамма1 представляет собой ламинин 1. Биологические функции различных цепей и молекул тримеров во многом различаются. неизвестно, но было показано, что некоторые цепи различаются по распределению в тканях, предположительно отражая разнообразные функции in vivo. Этот ген кодирует изоформу бета-цепи ламинина, бета-1. Цепь бета-1 имеет 7 структурно различных доменов, которые она разделяет с другими изомерами бета-цепи. С-концевая спиральная область, содержащая домены I и II, разделена доменом альфа, домены III и V содержат несколько EGF-подобных повторов, а домены IV и VI имеют глобулярную конформацию. Ламинин бета 1 экспрессируется в большинстве тканей, которые продуцируют базальные мембраны, и является одной из трех цепей, составляющих ламинин 1, первый ламинин, выделенный из опухоли Энгельбрета-Хольма-Роя (EHS). Была идентифицирована последовательность бета-1-цепи, которая участвует в прикреплении клеток, хемотаксисе и связывании с рецептором ламинина, и показано, что она обладает способностью ингибировать метастазирование. ^{[ 8 ]}

5'-UTR ламинина-B1 содержит IRES ( внутренний сайт входа в рибосому ) между -293 и -1 выше стартового кодона. IRES участвуют в злокачественных опухолях. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000091136 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002900 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Иконен Дж., Пиккарайнен Т., Саволайнен Э.Р., Трюггвасон К. (февраль 1989 г.). «Полиморфизм Hpa I в гене цепи ламинина B1 человека на 7q22» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (1): 473. doi : 10.1093/nar/17.1.473 . ПМК 331592 . ПМИД 2563160 .
^ Рош К.Б., Мур Дж.В., Сурана Р.Б., Уилсон Б.Е. (май 1989 г.). «Дилатация корня аорты, связанная с частичной трисомией 7 (q31.2----qter)» . Педиатр Кардиол . 10 (1): 53–5. дои : 10.1007/BF02328637 . ПМИД 2704655 . S2CID 22352528 .
^ Бонно Д., Юре Дж.Л., Годо Дж., Куэ Д., Путтерман М., Танзер Дж., Бабен П., Ларрег М. (сентябрь 1991 г.). «Рецидивирующий ctb (7) (q31.3) и возможное вовлечение ламинина в неонатальную кутис-лаксу с фенотипом Марфана». Хум Жене . 87 (3): 317–9. дои : 10.1007/bf00200911 . ПМИД 1864606 . S2CID 32445071 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ламинин LAMB1, бета 1» .
^ Петц М., Они Н., Хубер Х., Бег Х., Микулитс В. (январь 2012 г.). «La усиливает опосредованную IRES трансляцию ламинина B1 во время злокачественного эпителиально-мезенхимального перехода» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (1): 290–302. дои : 10.1093/nar/gkr717 . ПМЦ 3245933 . ПМИД 21896617 .

Дальнейшее чтение

Любимова Ю.Ю., Фудзита М., Хазензон Н.М. и др. (2006). «Изменения изоформ ламинина, связанные с инвазией опухоли головного мозга и ангиогенезом» . Передний. Биосци . 11 (1): 81–8. дои : 10.2741/1781 . ПМК 3506377 . ПМИД 16146715 .
Вуолтинахо Р., Чоу Л.Т., Трюггвасон К. (1990). «Структура гена цепи ламинина B1 человека» . Ж. Биол. Хим . 265 (26): 15611–6. дои : 10.1016/S0021-9258(18)55441-7 . ПМИД 1975589 .
Сасаки М., Като С., Коно К. и др. (1987). «Последовательность кДНК, кодирующей цепь ламинина B1, обнаруживает мультидоменный белок, содержащий богатые цистеином повторы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 84 (4): 935–9. Бибкод : 1987ПНАС...84..935С . дои : 10.1073/pnas.84.4.935 . ПМК 304334 . ПМИД 3493487 .
Пиккарайнен Т., Эдди Р., Фукусима Ю. и др. (1987). «Цепь ламинина B1 человека. Мультидоменный белок с локусом гена (LAMB1) в области q22 хромосомы 7» . Ж. Биол. Хим . 262 (22): 10454–62. дои : 10.1016/S0021-9258(18)60982-2 . ПМИД 3611077 .
Джей М., Моди В.С., Рикка Г.А. и др. (1987). «Выделение клона кДНК цепи ламинина-В1 человека и локализация его гена» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 41 (4): 605–15. ПМК 1684322 . ПМИД 3661559 .
Бергесон Р.Э., Шике М., Дойцманн Р. и др. (1994). «Новая номенклатура ламининов». Матрица Биол . 14 (3): 209–11. дои : 10.1016/0945-053X(94)90184-8 . ПМИД 7921537 .
Лохи Дж., Лейво И., Франсила К., Виртанен И. (1997). «Изменения в распределении интегринов и их лигандов базальной мембраны во время развития фолликулярного эпителия щитовидной железы человека». Гистохим. Дж . 29 (4): 337–45. дои : 10.1023/А:1026482700109 . ПМИД 9184849 . S2CID 25517944 .
Тейлор Дж., Мантони Ф., Робб С. и др. (1997). «Аутосомно-доминантная миопатия с ранним началом и ригидностью позвоночника: возможная роль ламинина бета 1?». Нервно-мышечная. Разлад . 7 (4): 211–6. дои : 10.1016/S0960-8966(97)00461-6 . ПМИД 9196901 . S2CID 11981067 .
Сьюри К.А., Д'Алессандро М., Уилсон Л.А. и др. (1997). «Экспрессия цепей ламинина в коже при врожденной мышечной дистрофии с дефицитом мерозина». Нейропедиатрия . 28 (4): 217–22. дои : 10.1055/s-2007-973703 . ПМИД 9309712 . S2CID 260243267 .
Махида Ю.Р., Белтингер Дж., Мах С. и др. (1998). «Субэпителиальные миофибробласты толстой кишки взрослого человека экспрессируют белки внеклеточного матрикса и циклооксигеназу-1 и -2». Являюсь. Дж. Физиол . 273 (6, часть 1): G1341–8. дои : 10.1152/ajpgi.1997.273.6.G1341 . ПМИД 9435560 .
О'Грейди П., Тай ТК, Сайто Х (1998). «Комплекс ламинин-нидоген является лигандом специфической сплайсинговой изоформы трансмембранной протеинтирозинфосфатазы LAR» . Дж. Клеточная Биол . 141 (7): 1675–84. дои : 10.1083/jcb.141.7.1675 . ПМК 2133008 . ПМИД 9647658 .
Кох М., Олсон П.Ф., Альбус А. и др. (1999). «Характеристика и экспрессия цепи ламинина гамма3: новая, не связанная с базальной мембраной цепь ламинина» . Дж. Клеточная Биол . 145 (3): 605–18. дои : 10.1083/jcb.145.3.605 . ПМК 2185082 . ПМИД 10225960 .
Мерлини Л., Вилланова М., Сабателли П. и др. (1999). «Снижение экспрессии ламинина бета 1 при миопатии Бетлема, сцепленной с 21 хромосомой». Нервно-мышечная. Разлад . 9 (5): 326–9. дои : 10.1016/S0960-8966(99)00022-X . ПМИД 10407855 . S2CID 53256492 .
Киккава Ю., Санзен Н., Фудзивара Х. и др. (2000). «Специфичность связывания ламинина-10/11 с интегрином: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа-3-бета-1, альфа-6-бета-1 и альфа-6-бета-4». Дж. Клеточная наука . 113. (Часть 5) (5): 869–76. дои : 10.1242/jcs.113.5.869 . ПМИД 10671376 .
Хиросаки Т., Мизушима Х., Цубота Ю. и др. (2000). «Структурные требования карбоксильных концевых глобулярных доменов альфа-3-цепи ламинина для стимулирования быстрой адгезии и миграции клеток с помощью ламинина-5» . Ж. Биол. Хим . 275 (29): 22495–502. дои : 10.1074/jbc.M001326200 . ПМИД 10801807 .
Шамплио М.Ф., Виртанен И., Тайгер К.Ф. и др. (2000). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета-/гамма-цепей цепей ламинина альфа1 и альфа5 человека: очистка ламинина-3 из плаценты». Эксп. Сотовый Res . 259 (2): 326–35. дои : 10.1006/excr.2000.4980 . ПМИД 10964500 .
Педраса С., Геберхивот Т., Ингерпуу С. и др. (2000). «Моноцитарные клетки синтезируют, прикрепляются и мигрируют на ламинине-8 (альфа 4 бета 1 гамма 1)» . Дж. Иммунол . 165 (10): 5831–8. дои : 10.4049/jimmunol.165.10.5831 . ПМИД 11067943 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000091136 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002900 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2563160-5] Иконен Дж., Пиккарайнен Т., Саволайнен Э.Р., Трюггвасон К. (февраль 1989 г.). «Полиморфизм Hpa I в гене цепи ламинина B1 человека на 7q22» . Нуклеиновые кислоты Рез . 17 (1): 473. doi : 10.1093/nar/17.1.473 . ПМК 331592 . ПМИД 2563160 .

[pmid2704655-6] Рош К.Б., Мур Дж.В., Сурана Р.Б., Уилсон Б.Е. (май 1989 г.). «Дилатация корня аорты, связанная с частичной трисомией 7 (q31.2----qter)» . Педиатр Кардиол . 10 (1): 53–5. дои : 10.1007/BF02328637 . ПМИД 2704655 . S2CID 22352528 .

[pmid1864606-7] Бонно Д., Юре Дж.Л., Годо Дж., Куэ Д., Путтерман М., Танзер Дж., Бабен П., Ларрег М. (сентябрь 1991 г.). «Рецидивирующий ctb (7) (q31.3) и возможное вовлечение ламинина в неонатальную кутис-лаксу с фенотипом Марфана». Хум Жене . 87 (3): 317–9. дои : 10.1007/bf00200911 . ПМИД 1864606 . S2CID 32445071 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: ламинин LAMB1, бета 1» .

[petz2012-9] Петц М., Они Н., Хубер Х., Бег Х., Микулитс В. (январь 2012 г.). «La усиливает опосредованную IRES трансляцию ламинина B1 во время злокачественного эпителиально-мезенхимального перехода» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (1): 290–302. дои : 10.1093/nar/gkr717 . ПМЦ 3245933 . ПМИД 21896617 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]