Коллаген типа V, альфа 3

COL5A3
Идентификаторы
Псевдонимы	COL5A3 , альфа-3-цепь коллагена типа V
Внешние идентификаторы	Опустить : 120216 ; МГИ : 1858212 ; Гомологен : 9253 ; Генные карты : COL5A3 ; OMA : COL5A3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	10,010,504 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	20,726,363 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; apex of heart; ; canal of the cervix; ; subcutaneous adipose tissue; ; left uterine tube; ; putamen; ; ectocervix; ; amygdala; ; right frontal lobe; ; dorsal motor nucleus of vagus nerve;
	Top expressed in
	sciatic nerve; ; white adipose tissue; ; ankle; ; subcutaneous adipose tissue; ; belly cord; ; lumbar spinal ganglion; ; trachea; ; soleus muscle; ; vastus lateralis muscle; ; brown adipose tissue;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	heparin binding; extracellular matrix structural constituent; collagen binding; extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength; proteoglycan binding;
Cellular component	collagen type V trimer; extracellular region; collagen; endoplasmic reticulum lumen; extracellular matrix; extracellular space; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	collagen catabolic process; cell-matrix adhesion; extracellular matrix organization; skin development; collagen fibril organization; cell adhesion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	50509
	53867
	ENSG00000080573
	ENSMUSG00000004098
	P25940
	Q9JLI2
	НМ_015719
	НМ_016919 ; НМ_001317388
	НП_056534
	НП_001304317 ; НП_058615
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-3(V) представляет собой белок , который у человека кодируется COL5A3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует альфа-цепь одного из фибриллярных коллагенов с низким содержанием. Молекулы фибриллярного коллагена представляют собой тримеры, которые могут состоять из одного или нескольких типов альфа-цепей. Коллаген типа V обнаруживается в тканях, содержащих коллаген типа I, и, по-видимому, регулирует сборку гетеротипических волокон, состоящих как из коллагена типа I, так и из коллагена типа V. Этот генный продукт тесно связан с коллагеном типа XI, и возможно, что цепи коллагена типов V и XI составляют один тип коллагена с тканеспецифичными комбинациями цепей. Считается, что мутации в этом гене ответственны за симптомы у части пациентов с синдромом Элерса-Данлоса III типа. Сообщения нескольких размеров могут быть обнаружены в нозерн-блоттинге, но информация о последовательности не может подтвердить идентичность более коротких сообщений. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000080573 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004098 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Имамура Ю., Скотт И.С., Гринспен Д.С. (апрель 2000 г.). «Цепь коллагена про-альфа3 (V). Полная первичная структура, домены экспрессии во взрослых и развивающихся тканях, а также сравнение со структурами и доменами экспрессии других цепей проколлагена V и XI типов» . J Биол Хим . 275 (12): 8749–59. дои : 10.1074/jbc.275.12.8749 . ПМИД 10722718 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: коллаген COL5A3, тип V, альфа 3» .

Дальнейшее чтение

ван дер Рест М., Гарроне Р. (1991). «Коллагеновое семейство белков» . ФАСЕБ Дж . 5 (13): 2814–23. дои : 10.1096/fasebj.5.13.1916105 . ПМИД 1916105 . S2CID 11261357 .
Фичард А., Клеман Дж.П., Руджеро Ф. (1996). «Другой взгляд на молекулы коллагена V и XI». Матрица Биол . 14 (7): 515–31. дои : 10.1016/S0945-053X(05)80001-0 . ПМИД 8535602 .
Манн К. (1992). «Выделение альфа-3-цепи человеческого коллагена типа V и характеристика путем частичного секвенирования». Биол. хим. Хоппе-Сейлер . 373 (2): 69–75. дои : 10.1515/bchm3.1992.373.1.69 . ПМИД 1571108 .
Нийибизи С., Фитцек П.П., ван дер Рест М. (1984). «Коллагены плаценты человека типа V. Доказательства существования молекулы альфа 1 (V) альфа 2 (V) альфа 3 (V) коллагена» . Ж. Биол. Хим . 259 (22): 14170–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)89872-6 . ПМИД 6501291 .
Абедин М.З., Аяд С., Вайс Дж.Б. (1982). «Выделение и нативная характеристика богатых цистеином коллагенов из бычьих плацентарных тканей и матки и их связь с коллагенами типов IV и V». Биология. Представитель . 2 (7): 493–502. дои : 10.1007/BF01115247 . ПМИД 7115902 . S2CID 22620593 .
Роудс Р.К., Миллер Э.Дж. (1982). «Доказательства существования молекулы коллагена альфа 1 (V) альфа 2 (V) альфа 3 (V) в плацентарной ткани человека». Колл. Отн. Рез . 1 (4): 337–43. дои : 10.1016/S0174-173X(81)80010-6 . ПМИД 7346227 .
Кипреос К.Е., Соненшейн Г.Е. (1998). «Основной фактор роста фибробластов снижает экспрессию коллагена типа V/XI в культивируемых гладкомышечных клетках аорты крупного рогатого скота» . Дж. Селл. Биохим . 68 (2): 247–58. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19980201)68:2<247::AID-JCB11>3.0.CO;2-C . ПМИД 9443080 . S2CID 19211563 .
Чанут-Делаланд Х., Фишар А., Бернокко С. и др. (2001). «Контроль образования гетеротипических фибрилл с помощью коллагена V определяется цепной стехиометрией» . Ж. Биол. Хим . 276 (26): 24352–9. дои : 10.1074/jbc.M101182200 . ПМИД 11423559 .
Гопалакришнан Б., Ван В.М., Гринспен Д.С. (2004). «Биосинтетическая обработка гетеротримера проколлагена Pro-alpha1(V)Pro-alpha2(V)Pro-alpha3(V)» . Ж. Биол. Хим . 279 (29): 30904–12. дои : 10.1074/jbc.M402252200 . ПМИД 15136578 .
Нагато Х., Мацуо Н., Сумиёси Х. и др. (2004). «Фактор транскрипции CCAAT-связывающий фактор CBF/NF-Y и два репрессора регулируют основной промотор человеческого гена коллагена про-альфа3(V) (COL5A3)» . Ж. Биол. Хим . 279 (45): 46373–83. дои : 10.1074/jbc.M406069200 . ПМИД 15316020 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000080573 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004098 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10722718-5] Имамура Ю., Скотт И.С., Гринспен Д.С. (апрель 2000 г.). «Цепь коллагена про-альфа3 (V). Полная первичная структура, домены экспрессии во взрослых и развивающихся тканях, а также сравнение со структурами и доменами экспрессии других цепей проколлагена V и XI типов» . J Биол Хим . 275 (12): 8749–59. дои : 10.1074/jbc.275.12.8749 . ПМИД 10722718 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: коллаген COL5A3, тип V, альфа 3» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]