Коллаген IV типа, альфа 2

COL4A2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1LI1
Идентификаторы
Псевдонимы	COL4A2 , ICH, POREN2, коллаген типа IV альфа 2, цепь коллагена типа IV альфа 2, BSVD2
Внешние идентификаторы	Опустить : 120090 ; МГИ : 88455 ; Гомологен : 1390 ; GeneCards : COL4A2 ; OMA : COL4A2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	110,513,209 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	11,499,287 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	saphenous vein; ; decidua; ; pericardium; ; visceral pleura; ; stromal cell of endometrium; ; urethra; ; right coronary artery; ; ascending aorta; ; left coronary artery; ; Descending thoracic aorta;
	Top expressed in
	epithelium of lens; ; left lung lobe; ; external carotid artery; ; internal carotid artery; ; lactiferous gland; ; stroma of bone marrow; ; ascending aorta; ; belly cord; ; decidua; ; aortic valve;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	extracellular matrix structural constituent; protein binding; extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Cellular component	extracellular matrix; extracellular region; basement membrane; collagen; collagen type IV trimer; endoplasmic reticulum lumen; extracellular exosome; extracellular space; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	collagen catabolic process; negative regulation of angiogenesis; cellular response to transforming growth factor beta stimulus; extracellular matrix organization; endodermal cell differentiation; angiogenesis; transcription, DNA-templated; collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway; human ageing; response to activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1284
	12827
	ENSG00000134871
	ENSMUSG00000031503
	P08572
	P08122
	НМ_001846
	НМ_009932
	НП_001837
	НП_034062
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-2(IV) представляет собой белок , который у человека кодируется COL4A2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует одну из шести субъединиц коллагена IV типа , основного структурного компонента базальных мембран . С-концевая часть белка, известная как канстатин, является ингибитором ангиогенеза и роста опухоли . Как и другие члены семейства генов коллагена IV типа, этот ген организован в конформации «голова к голове» с другим геном коллагена IV типа, так что каждая пара генов имеет общий промотор. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134871 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031503 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Майерс Дж.С., Ховард П.С., Джелен А.М., Дион А.С., Макарак Э.Дж. (август 1987 г.). «Дупликация COOH-концевых повторов коллагена IV типа и видоспецифическая экспрессия генов коллагена альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV)» . J Биол Хим . 262 (19): 9231–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)48071-4 . ПМИД 2439508 .
^ Гриффин К.А., Эмануэль Б.С., Хансен-младший, Кавени В.К., Майерс Дж.К. (февраль 1987 г.). «Гены человеческого коллагена, кодирующие цепи альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV) базальной мембраны, расположены на дистальном длинном плече хромосомы 13» . Proc Natl Acad Sci США . 84 (2): 512–6. Бибкод : 1987PNAS...84..512G . дои : 10.1073/pnas.84.2.512 . ПМЦ 304239 . ПМИД 3025878 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL4A2, тип IV, альфа 2» .

Дальнейшее чтение

Хинек А (1995). «Природа и многочисленные функции белка, связывающего эластин / ламинин, массой 67 кДа». Клеточные клеи. Коммун . 2 (3): 185–93. дои : 10.3109/15419069409004436 . ПМИД 7827955 .
Стендер М., Науманн Ю., Вик В., Веллер М. (1999). «Трансформирующий фактор роста-бета и р-21: множественные молекулярные мишени опосредованного декорином подавления роста опухолей». Ресурсы клеточных тканей . 296 (2): 221–7. дои : 10.1007/s004410051283 . ПМИД 10382266 . S2CID 20282995 .
Курпакус Уитер М., Кернаки К.А., Хэзлетт Л.Д. (1999). «Белки клеток роговицы и патология поверхности глаза». Биотехника и гистохимия . 74 (3): 146–59. дои : 10.3109/10520299909047967 . ПМИД 10416788 .
Каллури Р., вице-президент Сукхатме (2000). «Фиброз и ангиогенез». Курс. Мнение. Нефрол. Гипертония . 9 (4): 413–8. дои : 10.1097/00041552-200007000-00013 . ПМИД 10926178 .
Гебрехивет Б., Першке Э.И., Хонг Ю. и др. (1992). «Короткие аминокислотные последовательности, полученные из рецептора C1q (C1q-R), демонстрируют гомологию с альфа-цепями рецепторов фибронектина и витронектина, а также коллагена типа IV». Дж. Леукок. Биол . 51 (6): 546–56. дои : 10.1002/jlb.51.6.546 . ПМИД 1377218 . S2CID 1214598 .
Гупта С., Батчу Р.Б., Датта К. (1992). «Очистка, частичная характеристика белка, связывающего гиалуроновую кислоту почек крысы, и его локализация на поверхности клеток». Евро. Дж. Клеточная Биол . 56 (1): 58–67. ПМИД 1724753 .
Паралкар В.М., Нандедкар А.К., Пойнтер Р.Х. и др. (1990). «Взаимодействие остеогенина, гепаринсвязывающего костного морфогенетического белка, с коллагеном IV типа» . Ж. Биол. Хим . 265 (28): 17281–4. дои : 10.1016/S0021-9258(17)44900-3 . ПМИД 2211625 .
Эрнандес М.Р., Иго Ф., Нойфельд А.Х. (1986). «Внеклеточный матрикс диска зрительного нерва человека». Являюсь. Дж. Офтальмол . 102 (2): 139–48. дои : 10.1016/0002-9394(86)90134-0 . ПМИД 2426947 .
Зибольд Б., Дойцманн Р., Кюн К. (1988). «Расположение внутри- и межмолекулярных дисульфидных связей в карбоксиконцевом, неколлагеновом домене агрегации и перекрестных связей коллагена типа IV базальной мембраны». Евро. Дж. Биохим . 176 (3): 617–24. дои : 10.1111/j.1432-1033.1988.tb14321.x . ПМИД 2844531 .
Пёшль Э, Полльнер Р, Кюн К (1988). «Гены цепей альфа-1(IV) и альфа-2(IV) коллагена базальной мембраны человека типа IV расположены лицом к лицу и разделены двунаправленным промотором уникальной структуры» . ЭМБО Дж . 7 (9): 2687–95. дои : 10.1002/j.1460-2075.1988.tb03122.x . ПМК 457057 . ПМИД 2846280 .
Мурата К., Мотаяма Т., Котаке С. (1986). «Типы коллагена в различных слоях аорты человека и их изменения при атеросклеротическом процессе». Атеросклероз . 60 (3): 251–62. дои : 10.1016/0021-9150(86)90172-3 . ПМИД 3089234 .
Сойнинен Р., Хуотари М., Хостикка С.Л. и др. (1988). «Структурные гены альфа-1 и альфа-2-цепей человеческого коллагена IV типа по-разному кодируются на противоположных нитях ДНК и имеют перекрывающуюся промоторную область» . Ж. Биол. Хим . 263 (33): 17217–20. дои : 10.1016/S0021-9258(19)77818-1 . ПМИД 3182844 .
Хостикка С.Л., Трюггвасон К. (1989). «Полная первичная структура альфа-2-цепи человеческого коллагена IV типа и сравнение с альфа-1 (IV)-цепью» . Ж. Биол. Хим . 263 (36): 19488–93. дои : 10.1016/S0021-9258(19)77660-1 . ПМИД 3198637 .
Бразель Д., Полльнер Р., Обербоймер И., Кюн К. (1988). «Коллаген базальной мембраны человека (тип IV). Аминокислотная последовательность цепи альфа 2 (IV) и ее сравнение с цепью альфа 1 (IV) выявляет делеции в цепи альфа 1 (IV)». Евро. Дж. Биохим . 172 (1): 35–42. дои : 10.1111/j.1432-1033.1988.tb13852.x . ПМИД 3345760 .
Хостикка С.Л., Куркинен М., Трюггвасон К. (1987). «Нуклеотидная последовательность, кодирующая кДНК альфа-2-цепи коллагена IV типа человека, обнаруживает значительную гомологию с доменом NC-1 альфа-1 (IV), но не с коллагеновым доменом или 3'-нетранслируемой областью» . ФЭБС Летт . 216 (2): 281–6. дои : 10.1016/0014-5793(87)80706-8 . ПМИД 3582677 .
Киллен П.Д., Франкомано К.А., Ямада И. и др. (1988). «Частичная структура цепи коллагена альфа 2 (IV) человека и хромосомная локализация гена (COL4A2)». Хм. Жене . 77 (4): 318–24. дои : 10.1007/BF00291418 . ПМИД 3692475 . S2CID 11387376 .
Глант Т.Т., Хадхази С., Микец К., Сипос А. (1985). «Появление и сохранение фибронектина в хряще. Специфическое взаимодействие фибронектина с коллагеном II типа». Гистохимия . 82 (2): 149–58. дои : 10.1007/bf00708199 . ПМИД 3997552 . S2CID 19401258 .
Усканга Л., Кеннеди Р.Х., Стокер С. и др. (1984). «Иммунолокализация типов коллагена, ламинина и фибронектина в нормальной поджелудочной железе человека». Пищеварение . 30 (3): 158–64. дои : 10.1159/000199100 . ПМИД 6389236 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 13 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134871 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031503 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2439508-5] Майерс Дж.С., Ховард П.С., Джелен А.М., Дион А.С., Макарак Э.Дж. (август 1987 г.). «Дупликация COOH-концевых повторов коллагена IV типа и видоспецифическая экспрессия генов коллагена альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV)» . J Биол Хим . 262 (19): 9231–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)48071-4 . ПМИД 2439508 .

[pmid3025878-6] Гриффин К.А., Эмануэль Б.С., Хансен-младший, Кавени В.К., Майерс Дж.К. (февраль 1987 г.). «Гены человеческого коллагена, кодирующие цепи альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV) базальной мембраны, расположены на дистальном длинном плече хромосомы 13» . Proc Natl Acad Sci США . 84 (2): 512–6. Бибкод : 1987PNAS...84..512G . дои : 10.1073/pnas.84.2.512 . ПМЦ 304239 . ПМИД 3025878 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL4A2, тип IV, альфа 2» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]