Субъединица ламина гамма-1

ЛАМЦ1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1KLO, 1NPE, 1TLE, 4AQT
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMC1 , LAMB2, ламинин, гамма 1, субъединица ламинина гамма 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 150290 ; МГИ : 99914 ; Гомологен : 1724 ; Генные карты : LAMC1 ; ОМА : LAMC1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1q25.3 Start 183,023,420 bp End 183,145,592 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 1 (mouse) Band 1 G3|1 65.3 cM Start 153,094,668 bp End 153,208,532 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in stromal cell of endometrium visceral pleura parietal pleura Achilles tendon sural nerve saphenous vein placenta gastric mucosa skin of hip urethra Top expressed in gastrula ascending aorta decidua aortic valve tail of embryo molar left lung lobe atrium yolk sac genital tubercle More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function extracellular matrix structural constituent extracellular matrix constituent conferring elasticity Cellular component extracellular matrix extracellular region basement membrane laminin-1 complex extracellular exosome laminin-10 complex laminin-11 complex extracellular space endoplasmic reticulum lumen collagen-containing extracellular matrix Biological process hemidesmosome assembly substrate adhesion-dependent cell spreading endoderm development cell adhesion extracellular matrix organization cell migration positive regulation of epithelial cell proliferation extracellular matrix disassembly post-translational protein modification protein-containing complex assembly animal organ morphogenesis tissue development organism system development basement membrane assembly Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3915 226519 Вместе ENSG00000135862 ENSMUSG00000026478 ЮниПрот P11047 P02468 RefSeq (мРНК) НМ_002293 НМ_010683 RefSeq (белок) НП_002284 н/д Местоположение (UCSC) Чр 1: 183.02 – 183.15 Мб Чр 1: 153.09 – 153.21 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ламинина гамма-1 представляет собой белок , который у человека кодируется LAMC1 геном .

Ламинины , семейство гликопротеинов внеклеточного матрикса , являются основным неколлагеновым компонентом базальных мембран . Они участвуют в широком спектре биологических процессов, включая клеточную адгезию, дифференцировку, миграцию, передачу сигналов, рост нейритов и метастазирование. Ламинины состоят из трех неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2 соответственно) и образуют крестообразную структуру, состоящую из трех коротких плеч, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинного плеча, состоящего из из всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой многодоменный белок, кодируемый отдельным геном . несколько изоформ Описано каждой цепи. Различные изомеры альфа-, бета- и гамма-цепей объединяются, образуя различные гетеротримерные изоформы ламинина, которые обозначены арабскими цифрами в порядке их открытия, т.е. гетеротример альфа1бета1гамма1 представляет собой ламинин 1. Биологические функции различных цепей и молекул тримеров в значительной степени неизвестны. , но было показано, что некоторые цепи различаются по распределению в тканях, предположительно отражая разнообразные функции in vivo. Этот ген кодирует изоформу гамма-цепи ламинина, гамма-1. Цепь гамма-1, ранее считавшаяся бета-цепью, содержит структурные домены, подобные бета-цепям, однако в ней отсутствует короткая альфа-область, разделяющая домены I и II. Структурная организация этого гена также предполагает, что он значительно отличается от генов бета-цепи. Эмбрионы трансгенных мышей, у которых оба аллеля гена цепи гамма-1 были инактивированы путем гомологичной рекомбинации, не имели базальных мембран, что указывает на то, что ламинин, цепь гамма-1 необходима для сборки гетеротримера ламинина. Это было сделано по аналогии с поразительно похожей последовательностью 3'-UTR в ламинине гамма 1 мыши. кДНК , что множественные сайты полиаденилирования используются у человека для генерации двух мРНК разного размера (5,5 и 7,5 т.п.н.), наблюдаемых в Нозерн-анализе.

Дальнейшее чтение

• Любимова Ю.Ю., Фудзита М., Хазензон Н.М. и др. (2006). «Изменения изоформ ламинина, связанные с инвазией опухоли головного мозга и ангиогенезом» . Передний. Биосци . 11 (1): 81–8. дои : 10.2741/1781 . ПМК   3506377 . ПМИД   16146715 .
• Сантос КЛ, Саббага Дж, Брентани Р (1992). «Различия в последовательностях ламинина B2 человека». Секв. ДНК . 1 (4): 275–7. дои : 10.3109/10425179109020782 . ПМИД   1806043 .
• Каллунки Т., Иконен Дж., Чоу Л.Т. и др. (1991). «Структура гена цепи ламинина B2 человека обнаруживает значительное отличие от гена цепи ламинина B1» . Ж. Биол. Хим . 266 (1): 221–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)52424-8 . ПМИД   1985895 .
• Хантер Д.Д., Шах В., Мерли Дж.П., Санес-младший (1989). «Ламининподобный адгезивный белок, сконцентрированный в синаптической щели нервно-мышечного соединения». Природа . 338 (6212): 229–34. Бибкод : 1989Natur.338..229H . дои : 10.1038/338229a0 . ПМИД   2922051 . S2CID   4313384 .
• Пиккарайнен Т., Каллунки Т., Трюггвасон К. (1988). «Цепь ламинина B2 человека. Сравнение полной аминокислотной последовательности с цепью B1 выявляет изменчивость гомологии последовательностей между различными структурными доменами» . Ж. Биол. Хим . 263 (14): 6751–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)68707-1 . ПМИД   3360804 .
• Маттей М.Г., Вейл Д., Прибула-Конвей Д. и др. (1988). «Клонирование кДНК, экспрессия и картирование гена ламинина B2 человека на хромосоме 1q31». Хм. Жене . 79 (3): 235–41. дои : 10.1007/BF00366243 . ПМИД   3402995 . S2CID   8075171 .
• Дэвис Дж.М., Нарачи М.А., Алтон Н.К., Аракава Т. (1987). «Структура фактора некроза опухолей человека альфа, полученного из рекомбинантной ДНК». Биохимия . 26 (5): 1322–6. дои : 10.1021/bi00379a018 . ПМИД   3552045 .
• Вевер У.М., Гереке Д.Р., Дуркин М.Е. и др. (1995). «Человеческая бета-2-цепь ламинина (ранее S-цепь): клонирование кДНК, хромосомная локализация и экспрессия в карциномах». Геномика . 24 (2): 243–52. дои : 10.1006/geno.1994.1612 . ПМИД   7698745 .
• Бергесон Р.Э., Шике М., Дойцманн Р. и др. (1994). «Новая номенклатура ламининов». Матрица Биол . 14 (3): 209–11. дои : 10.1016/0945-053X(94)90184-8 . ПМИД   7921537 .
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД   8889548 .
• О'Грейди П., Тай ТК, Сайто Х (1998). «Комплекс ламинин-нидоген является лигандом специфической сплайсинговой изоформы трансмембранной протеинтирозинфосфатазы LAR» . Дж. Клеточная Биол . 141 (7): 1675–84. дои : 10.1083/jcb.141.7.1675 . ПМК   2133008 . ПМИД   9647658 .
• Кофельдт Э., Сасаки Т., Геринг В., Тимпл Р. (1998). «Нидоген-2: новый белок базальной мембраны с разнообразными связывающими свойствами». Дж. Мол. Биол . 282 (1): 99–109. дои : 10.1006/jmbi.1998.2004 . ПМИД   9733643 .
• Сузуки Х., Денисенко О.Н., Сузуки Ю. и др. (1998). «Индуцируемая транскрипционная активность элемента bcn-1 из промотора гена гамма1-цепи ламинина в почечных и непочечных клетках». Являюсь. Дж. Физиол . 275 (4 ч. 2): F518–26. дои : 10.1152/ajprenal.1998.275.4.F518 . ПМИД   9755123 . S2CID   4380343 .
• Смит Н., Ватансевер Х.С., Мюррей П. и др. (1999). «Отсутствие базальных мембран после воздействия на ген LAMC1 приводит к эмбриональной смертности из-за невозможности дифференцировки эндодермы» . Дж. Клеточная Биол . 144 (1): 151–60. дои : 10.1083/jcb.144.1.151 . ПМК   2148127 . ПМИД   9885251 .
• Киккава Ю., Санзен Н., Фудзивара Х. и др. (2000). «Специфичность связывания ламинина-10/11 с интегрином: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа-3-бета-1, альфа-6-бета-1 и альфа-6-бета-4». Дж. Клеточная наука . 113. (Часть 5) (5): 869–76. дои : 10.1242/jcs.113.5.869 . ПМИД   10671376 .
• Шамплио М.Ф., Виртанен И., Тайгер К.Ф. и др. (2000). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета-/гамма-цепей цепей ламинина альфа1 и альфа5 человека: очистка ламинина-3 из плаценты». Эксп. Сотовый Res . 259 (2): 326–35. дои : 10.1006/excr.2000.4980 . ПМИД   10964500 .
• Педраса С., Геберхивот Т., Ингерпуу С. и др. (2000). «Моноцитарные клетки синтезируют, прикрепляются и мигрируют на ламинине-8 (альфа 4 бета 1 гамма 1)» . Дж. Иммунол . 165 (10): 5831–8. дои : 10.4049/jimmunol.165.10.5831 . ПМИД   11067943 .
• Парсонс С.Ф., Ли Дж., Спринг Ф.А. и др. (2001). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий цепь альфа5, с высоким сродством» . Кровь . 97 (1): 312–20. дои : 10.1182/blood.V97.1.312 . ПМИД   11133776 . S2CID   10715366 .
• Макартур КП, Ван Й, Херут Д, Густафсон С (2001). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнной железы человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Арх. Оральная биол . 46 (6): 545–55. дои : 10.1016/S0003-9969(01)00014-0 . ПМИД   11311202 .