Коллаген типа XVI, альфа 1

COL16A1
Идентификаторы
Псевдонимы	COL16A1 , 447AA, FP1572, коллаген типа XVI альфа 1, цепь коллагена типа XVI альфа 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 120326 ; МГИ : 1095396 ; Гомологен : 1397 ; Генные карты : COL16A1 ; OMA : COL16A1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	31,704,319 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	129,993,076 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; cartilage tissue; ; left ovary; ; canal of the cervix; ; sural nerve; ; C1 segment; ; right ovary; ; right coronary artery; ; body of uterus; ; periodontal fiber;
	Top expressed in
	body of femur; ; belly cord; ; calvaria; ; vas deferens; ; seminiferous tubule; ; uterus; ; lip; ; spermatocyte; ; efferent ductule; ; dermis;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	integrin binding; protein binding; extracellular matrix structural constituent; extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Cellular component	extracellular region; collagen type XVI trimer; collagen; endoplasmic reticulum lumen; extracellular matrix; extracellular space; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	cellular response to amino acid stimulus; integrin-mediated signaling pathway; female pregnancy; positive regulation of focal adhesion assembly; integrin activation; cell adhesion; extracellular matrix organization; cell adhesion mediated by integrin;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1307
	107581
	ENSG00000084636
	ENSMUSG00000040690
	Q07092
	Q8BLX7
	НМ_001856
	НМ_028266
	НП_001847
	НП_082542 ; НП_001391281 ; НП_001391282
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-1(XVI) представляет собой белок , который у человека кодируется COL16A1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует альфа-цепь коллагена типа XVI, члена семейства коллагенов FACIT (коллагены, связанные с фибриллами, с прерывистыми спиралями). Члены этого семейства коллагенов встречаются в сочетании с коллагенами, образующими фибриллы, такими как тип I и II, и служат для поддержания целостности внеклеточного матрикса . Высокие уровни коллагена типа XVI были обнаружены в фибробластах и кератиноцитах , а также в гладких мышцах и амнионе . ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000084636 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040690 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пан Т.К., Чжан Р.З., Маттей М.Г., Тимпл Р., Чу М.Л. (август 1992 г.). «Клонирование и хромосомное расположение коллагена альфа 1 (XVI) человека» . Proc Natl Acad Sci США . 89 (14): 6565–9. Бибкод : 1992PNAS...89.6565P . дои : 10.1073/pnas.89.14.6565 . ПМЦ 49542 . ПМИД 1631157 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL16A1, тип XVI, альфа 1» .

Дальнейшее чтение

Ямагути Н., Кимура С., МакБрайд О.В., Хори Х., Ямада Ю., Канамори Т., Ямакоши Х., Нагай Ю. (1993). «Молекулярное клонирование и частичная характеристика новой коллагеновой цепи альфа 1 (XVI), состоящей из повторяющихся коллагеновых доменов и цистеинсодержащих неколлагеновых сегментов». Дж. Биохим . 112 (6): 856–63. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123989 . ПМИД 1284248 .
Ратцингер С., Грассель С., Довейко А., Райхерт Т.Е., Бауэр Р.Дж. (2011). «Индукция экспрессии коллагена типа XVI способствует пролиферации раковых клеток полости рта». Матричная биология . 30 (2): 118–25. дои : 10.1016/j.matbio.2011.01.001 . ПМИД 21251976 .
Сайрес У.И., Дублет Б., Обер-Фуше Э., ван дер Рест М., Велгус Х.Г. (1995). «Деградация домена COL1 коллагена типа XIV желатиназой 92 кДа» . Ж. Биол. Хим . 270 (3): 1062–7. дои : 10.1074/jbc.270.3.1062 . ПМИД 7836360 .
Тилле Э., Манн К., Ништ Р., Пан Т.К., Чу М.Л., Тимпл Р. (1995). «Рекомбинантный анализ коллагена альфа 1 (XVI) человека. Доказательства процессинга N-концевого глобулярного домена». Евро. Дж. Биохим . 228 (1): 160–8. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20245.x . ПМИД 7882999 .
Грассель С., Тимпл Р., Тан Э.М., Чу М.Л. (1997). «Биосинтез и переработка коллагена типа XVI в фибробластах и гладкомышечных клетках человека» . Евро. Дж. Биохим . 242 (3): 576–84. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0576r.x . ПМИД 9022684 .
Ратцингер С., Грассель С., Довейко А., Райхерт Т.Е., Бауэр Р.Дж. (март 2011 г.). «Индукция экспрессии коллагена типа XVI способствует пролиферации раковых клеток полости рта». Матричная биология . 30 (2): 118–25. дои : 10.1016/j.matbio.2011.01.001 . ПМИД 21251976 .
Касснер А., Хансен У., Миосге Н., Рейнхардт Д.П., Айгнер Т., Брукнер-Тудерман Л., Брукнер П., Грассель С. (2004). «Дискретная интеграция коллагена XVI в тканеспецифичные коллагеновые фибриллы или микрофибриллы из бусин». Матрица Биол . 22 (2): 131–43. дои : 10.1016/S0945-053X(03)00008-8 . ПМИД 12782140 .
Касснер А., Тидеманн К., Нотбом Х., Людвиг Т., Мергелин М., Рейнхардт Д.П., Чу М.Л., Брукнер П., Грассель С. (2004). «Молекулярная структура и взаимодействие рекомбинантного человеческого коллагена XVI типа». Дж. Мол. Биол . 339 (4): 835–53. дои : 10.1016/j.jmb.2004.03.042 . PMID 15165854 .
Эбле Дж.А., Касснер А., Ниланд С., Мергелин М., Грифка Дж., Грассель С. (2006). «Коллаген XVI содержит сайт узнавания интегрина альфа1-бета1 в своих С-концевых доменах» . Ж. Биол. Химия 281 (35): 25745–56. дои : 10.1074/jbc.M509942200 . ПМИД 16754661 .

Внешние ссылки

«COL16A1 (коллаген, тип XVI, альфа 1)» .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000084636 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040690 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1631157-5] Пан Т.К., Чжан Р.З., Маттей М.Г., Тимпл Р., Чу М.Л. (август 1992 г.). «Клонирование и хромосомное расположение коллагена альфа 1 (XVI) человека» . Proc Natl Acad Sci США . 89 (14): 6565–9. Бибкод : 1992PNAS...89.6565P . дои : 10.1073/pnas.89.14.6565 . ПМЦ 49542 . ПМИД 1631157 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL16A1, тип XVI, альфа 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]