Коллаген XXV типа, альфа 1

COL25A1
Идентификаторы
Псевдонимы	COL25A1 , AMY, CLAC, CLAC-P, CLACP, CFEOM5, коллаген, тип XXV, альфа 1, коллаген типа XXV альфа 1, коллаген типа XXV альфа 1 цепь
Внешние идентификаторы	Опустить : 610004 ; МГИ : 1924268 ; Гомологен : 57111 ; Генные карты : COL25A1 ; OMA : COL25A1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	109,302,752 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	130,393,526 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; left testis; ; right testis; ; jejunal mucosa; ; buccal mucosa cell; ; testicle; ; Achilles tendon; ; subcutaneous adipose tissue; ; anterior pituitary; ; sural nerve;
	Top expressed in
	median eminence; ; lateral septal nucleus; ; medial dorsal nucleus; ; arcuate nucleus; ; substantia nigra; ; habenula; ; superior colliculus; ; lateral geniculate nucleus; ; anterior amygdaloid area; ; lateral hypothalamus;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	heparin binding; amyloid-beta binding; extracellular matrix structural constituent; extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Cellular component	integral component of membrane; extracellular region; plasma membrane; collagen; endoplasmic reticulum lumen; membrane; extracellular space; integral component of plasma membrane; extracellular matrix; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	axonogenesis involved in innervation; extracellular matrix organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84570
	77018
	ENSG00000188517
	ENSMUSG00000058897
	Q9BXS0
	Q99MQ5
	НМ_001256074 ; НМ_032518 ; НМ_198721
	НМ_001244952 ; НМ_029838 ; НМ_198711
	НП_001243003 ; НП_115907 ; НП_942014
	НП_001231881 ; НП_084114 ; НП_942004
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-1(XXV) представляет собой белок , который у человека кодируется COL25A1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

COL25A1 представляет собой мембраносвязанный коллаген, специфичный для мозга. Протеолитический процессинг высвобождает CLAC, растворимую форму COL25A1, содержащую внеклеточные коллагеновые домены, которые связываются со старческими бляшками при болезни Альцгеймера (AD; MIM 104300) головного мозга (Osada et al., 2005). [предоставлено OMIM] ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что коллаген типа XXV, альфа 1 взаимодействует с белком-предшественником амилоида . ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000188517 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000058897 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Хасимото Т., Вакабаяши Т., Ватанабэ А., Кова Х., Хосода Р., Накамура А., Канадзава И., Араи Т., Такио К., Манн Д.М., Ивацубо Т. (апрель 2002 г.). «CLAC: новый компонент амилоидных бляшек при болезни Альцгеймера, полученный из трансмембранного предшественника CLAC-P/коллагена типа XXV» . ЭМБО Дж. 21 (7): 1524–34. дои : 10.1093/emboj/21.7.1524 . ПМЦ 125364 . ПМИД 11927537 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL25A1, тип XXV, альфа 1» .

Дальнейшее чтение

Какуяма Х., Седерберг Л., Хоригоме К. и др. (2006). «CLAC связывается с агрегированными фрагментами Абета и Абета и ослабляет удлинение фибрилл». Биохимия . 44 (47): 15602–9. дои : 10.1021/bi051263e . ПМИД 16300410 .
Седерберг Л., Дальквист С., Какуяма Х. и др. (2005). «Коллагеновый компонент амилоидных бляшек Альцгеймера собирает амилоидные фибриллы в агрегаты, устойчивые к протеазам». ФЕБС Дж . 272 (9): 2231–6. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.04647.x . hdl : 10616/39314 . ПМИД 15853808 . S2CID 26505595 .
Осада Ю., Хашимото Т., Нисимура А. и др. (2005). «CLAC связывается с бета-амилоидными пептидами через положительно заряженный аминокислотный кластер внутри коллагенового домена 1 и ингибирует образование амилоидных фибрилл» . Ж. Биол. Хим . 280 (9): 8596–605. дои : 10.1074/jbc.M413340200 . ПМИД 15615705 .
Седерберг Л., Какуяма Х., Мёллер А. и др. (2005). «Характеристика белка CLAC, связанного с болезнью Альцгеймера, и идентификация сайта связывания бета-пептида амилоида» . Ж. Биол. Хим . 280 (2): 1007–15. дои : 10.1074/jbc.M403628200 . ПМИД 15522881 .
Кова Х., Сакакура Т., Мацуура Ю. и др. (2004). «В основном отдельные распределения CLAC- и Abeta40- или тиофлавин-S-реактивности в сенильных бляшках выявляют две отдельные субпопуляции отложений бета-амилоида» . Являюсь. Дж. Патол . 165 (1): 273–81. дои : 10.1016/s0002-9440(10)63295-6 . ПМК 1618534 . ПМИД 15215182 .
Седерберг Л., Жукарева В., Богданович Н. и др. (2004). «Молекулярная идентификация AMY, белка, связанного с амилоидом болезни Альцгеймера» . Дж. Нейропатол. Эксп. Нейрол . 62 (11): 1108–17. дои : 10.1093/jnen/62.11.1108 . ПМИД 14656069 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .

статья о гене на хромосоме 4 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000188517 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000058897 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11927537-5] Jump up to: ^а ^б Хасимото Т., Вакабаяши Т., Ватанабэ А., Кова Х., Хосода Р., Накамура А., Канадзава И., Араи Т., Такио К., Манн Д.М., Ивацубо Т. (апрель 2002 г.). «CLAC: новый компонент амилоидных бляшек при болезни Альцгеймера, полученный из трансмембранного предшественника CLAC-P/коллагена типа XXV» . ЭМБО Дж. 21 (7): 1524–34. дои : 10.1093/emboj/21.7.1524 . ПМЦ 125364 . ПМИД 11927537 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: коллаген COL25A1, тип XXV, альфа 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]